More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_0794 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013517  Sterm_0794  transcriptional regulator, GntR family  100 
 
 		 219 aa  435  1e-121  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.133446  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0790  transcriptional regulator, GntR family  50.23 
 
 		 215 aa  192  4e-48  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0783  transcriptional regulator, GntR family  45.66 
 
 		 219 aa  183  2.0000000000000003e-45  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0694  transcriptional regulator, GntR family  36.11 
 
 		 215 aa  125  7e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0059  GntR family transcriptional regulator  29.33 
 
 		 229 aa  82  0.000000000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0600  GntR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 225 aa  80.1  0.00000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0095  GntR family transcriptional regulator  29.33 
 
 		 230 aa  79  0.00000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0855  transcriptional regulator, GntR family  28.02 
 
 		 238 aa  77.8  0.0000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.894475  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3095  GntR family transcriptional regulator  27.36 
 
 		 222 aa  75.9  0.0000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000525729  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0551  transcriptional regulator, GntR family  27.45 
 
 		 219 aa  72.4  0.000000000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2096  transcriptional regulator, GntR family  26.51 
 
 		 237 aa  72  0.000000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0073  GntR family transcriptional regulator  25.96 
 
 		 232 aa  72  0.000000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0202  transcriptional regulator, GntR family  26.92 
 
 		 233 aa  71.2  0.00000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0023081  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2175  transcriptional regulator, GntR family  27.23 
 
 		 223 aa  70.1  0.00000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000546644  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0088  transcriptional regulator, GntR family  27.78 
 
 		 239 aa  68.6  0.00000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6860  GntR family transcriptional regulator  25.14 
 
 		 242 aa  67.8  0.0000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0023  transcriptional regulator, GntR family  24.86 
 
 		 230 aa  67.4  0.0000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.697058  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0022  GntR domain-containing protein  24.86 
 
 		 228 aa  67.4  0.0000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1537  transcriptional regulator, GntR family  24.88 
 
 		 226 aa  67  0.0000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000150611  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0280  GntR family transcriptional regulator  23.5 
 
 		 233 aa  67.4  0.0000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0095071 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0450  GntR family transcriptional regulator  25.46 
 
 		 222 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4198  GntR domain protein  33 
 
 		 212 aa  66.6  0.0000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.241008  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3148  transcriptional regulator, GntR family  24.59 
 
 		 222 aa  65.9  0.0000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2569  GntR family transcriptional regulator  19.27 
 
 		 227 aa  65.9  0.0000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.107235 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0405  transcriptional regulator, GntR family  33.33 
 
 		 219 aa  65.5  0.0000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4544  GntR family transcriptional regulator  23.38 
 
 		 260 aa  65.5  0.0000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.377364 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2737  transcriptional regulator, GntR family  28.57 
 
 		 231 aa  65.5  0.0000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.224257 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2775  transcriptional regulator, GntR family  28.45 
 
 		 232 aa  65.1  0.0000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0065  GntR family transcriptional regulator  26.98 
 
 		 235 aa  65.1  0.0000000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0261299  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0930  transcriptional regulator, GntR family  26.24 
 
 		 213 aa  65.1  0.0000000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.491637 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3766  GntR family transcriptional regulator  23.08 
 
 		 234 aa  64.3  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2211  transcriptional regulator, GntR family  30.61 
 
 		 222 aa  64.3  0.000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0153172  decreased coverage  0.00038585 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0611  GntR family transcriptional regulator  22.89 
 
 		 222 aa  64.7  0.000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000000176506  normal  0.0227892 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3628  GntR family transcriptional regulator  23.76 
 
 		 262 aa  64.7  0.000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0316  GntR family transcriptional regulator  23.76 
 
 		 262 aa  64.7  0.000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6599  GntR family transcriptional regulator  24.02 
 
 		 225 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0043  transcriptional regulator, GntR family  24.59 
 
 		 231 aa  63.9  0.000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0169991 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0165  GntR family transcriptional regulator  22.95 
 
 		 222 aa  63.5  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.108309  decreased coverage  0.00499675 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4139  transcriptional regulator, GntR family  24.15 
 
 		 238 aa  63.5  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.773243 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0874  transcriptional regulator, GntR family  24.86 
 
 		 226 aa  63.5  0.000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.917982  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6702  GntR family transcriptional regulator  24.75 
 
 		 220 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.78486 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0790  GntR family transcriptional regulator  23.29 
 
 		 229 aa  63.9  0.000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3389  GntR family transcriptional regulator  26.17 
 
 		 223 aa  63.9  0.000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1861  GntR family transcriptional regulator  25.82 
 
 		 264 aa  63.5  0.000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4175  GntR family transcriptional regulator  25.48 
 
 		 241 aa  63.5  0.000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003675  predicted regulator PutR for proline utilization GntR family  25.98 
 
 		 224 aa  63.2  0.000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1896  transcriptional regulator, GntR family  24.08 
 
 		 204 aa  63.2  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.280079  normal  0.637354 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3643  GntR family transcriptional regulator  23.27 
 
 		 255 aa  63.2  0.000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6280  transcriptional regulator, GntR family  22.87 
 
 		 233 aa  63.2  0.000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  unclonable  0.00000068764  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4139  GntR family transcriptional regulator  23.27 
 
 		 255 aa  63.2  0.000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2970  GntR family transcriptional regulator  24.87 
 
 		 229 aa  63.2  0.000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1158  transcriptional regulator, GntR family  25.84 
 
 		 227 aa  63.5  0.000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.511472 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0346  GntR family transcriptional regulator  23.27 
 
 		 238 aa  62.8  0.000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2295  GntR family transcriptional regulator  26.5 
 
 		 241 aa  62.8  0.000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000972767  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2016  GntR family transcriptional regulator  24.4 
 
 		 230 aa  62.8  0.000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0125173 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0481  GntR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 214 aa  62.8  0.000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0496  GntR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 214 aa  62.4  0.000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.118787  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2314  transcriptional regulator, GntR family  26.37 
 
 		 252 aa  62.4  0.000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5836  GntR family transcriptional regulator  24.46 
 
 		 230 aa  62  0.000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3959  GntR family transcriptional regulator  32.38 
 
 		 219 aa  62  0.000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.426708  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4341  transcriptional regulator, GntR family  21.47 
 
 		 221 aa  62.4  0.000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.341994 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1379  transcriptional regulator, GntR family  26.6 
 
 		 227 aa  62.4  0.000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.163127  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3193  transcriptional regulator, GntR family  40.22 
 
 		 225 aa  62  0.000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.367816  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1218  GntR domain-containing protein  26.6 
 
 		 250 aa  62  0.000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.415589 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5579  GntR family transcriptional regulator  23.76 
 
 		 220 aa  62  0.000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5943  GntR family transcriptional regulator  23.76 
 
 		 220 aa  62  0.000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.441915 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3824  GntR family transcriptional regulator  23.27 
 
 		 262 aa  62  0.000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4142  GntR family transcriptional regulator  26.53 
 
 		 222 aa  61.6  0.000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.209682  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3944  transcriptional regulator, GntR family  22.77 
 
 		 258 aa  61.6  0.000000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4322  GntR family transcriptional regulator  23.79 
 
 		 252 aa  61.6  0.000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4020  GntR family transcriptional regulator  22.77 
 
 		 255 aa  61.6  0.000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4046  GntR family transcriptional regulator  22.77 
 
 		 255 aa  61.6  0.000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4024  GntR family transcriptional regulator  21.46 
 
 		 239 aa  60.8  0.00000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.466546  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4283  GntR family transcriptional regulator  23.78 
 
 		 222 aa  60.8  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0724479  normal  0.899409 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1421  GntR family transcriptional regulator  29.47 
 
 		 217 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00674258  normal  0.128717 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6303  GntR family transcriptional regulator  24.03 
 
 		 221 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6445  GntR family transcriptional regulator  24.26 
 
 		 220 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0106  transcriptional regulator, GntR family  21.9 
 
 		 225 aa  61.2  0.00000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0518218  normal  0.0388223 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5984  GntR family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 226 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0745493  normal  0.107513 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5188  GntR family transcriptional regulator  22.16 
 
 		 216 aa  60.8  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.948488  normal  0.0144297 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2404  GntR family transcriptional regulator  25.68 
 
 		 230 aa  60.8  0.00000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5881  GntR family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 226 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.453374  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5170  transcriptional regulator, GntR family  23.5 
 
 		 269 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0589  GntR domain protein  38.36 
 
 		 216 aa  60.5  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1855  GntR family transcriptional regulator  24.31 
 
 		 231 aa  60.8  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.98691 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5099  GntR family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 240 aa  60.5  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.408259  normal  0.367137 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2365  GntR family transcriptional regulator  27.96 
 
 		 223 aa  60.5  0.00000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000273195  normal  0.0972309 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2852  GntR family transcriptional regulator  27.55 
 
 		 223 aa  60.1  0.00000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4090  GntR family transcriptional regulator  28.33 
 
 		 224 aa  59.7  0.00000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0081  GntR family transcriptional regulator  21.47 
 
 		 240 aa  60.1  0.00000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0384322 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0441  GntR family transcriptional regulator  19.81 
 
 		 233 aa  59.7  0.00000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4343  GntR family transcriptional regulator  23.76 
 
 		 218 aa  59.7  0.00000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4862  transcriptional regulator, GntR family  23.39 
 
 		 236 aa  60.1  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.556045  normal  0.353938 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2458  GntR family transcriptional regulator  26.17 
 
 		 235 aa  59.7  0.00000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3350  transcriptional regulator, GntR family  23.53 
 
 		 234 aa  60.1  0.00000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.398966  normal  0.021988 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1712  transcriptional regulator, GntR family  22.96 
 
 		 204 aa  60.1  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3145  GntR family transcriptional regulator  26.37 
 
 		 220 aa  59.3  0.00000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6120  GntR family transcriptional regulator  31.46 
 
 		 226 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.105627  normal  0.0219652 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2922  GntR family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 221 aa  59.7  0.00000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0278565  normal  0.64241 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3196  transcriptional regulator, GntR family  22.56 
 
 		 237 aa  59.7  0.00000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.594143 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>