More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_3635 on replicon NC_009050
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009050  Rsph17029_3635  regulatory protein GntR, HTH  100 
 
 		 248 aa  503  1e-141  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0356922  normal  0.468942 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3347  regulatory protein GntR HTH  40.87 
 
 		 255 aa  162  5.0000000000000005e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.140801 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1106  GntR domain-containing protein  43.98 
 
 		 251 aa  153  2e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2324  regulatory protein  36.8 
 
 		 242 aa  122  5e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.127616  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1447  GntR family transcriptional regulator  36.65 
 
 		 243 aa  115  5e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.384199 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2385  GntR family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 259 aa  112  4.0000000000000004e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.655367  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0427  GntR family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 277 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0142  GntR domain protein  33.19 
 
 		 278 aa  82.8  0.000000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01758  hypothetical protein  32.95 
 
 		 266 aa  82.4  0.000000000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3282  GntR family transcriptional regulator  26.48 
 
 		 261 aa  79.3  0.00000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3457  GntR domain protein  32.24 
 
 		 320 aa  79  0.00000000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.429076  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5531  putative GntR family transcriptional regulator  28.76 
 
 		 303 aa  78.6  0.00000000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2695  GntR domain-containing protein  31.42 
 
 		 255 aa  77.4  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0648967 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1034  GntR family transcriptional regulator  31.42 
 
 		 255 aa  77.4  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.369271  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05160  transcriptional regulator, GntR family  31.74 
 
 		 253 aa  76.6  0.0000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6022  GntR domain-containing protein  35.62 
 
 		 338 aa  76.6  0.0000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13020  transcriptional regulator, GntR family  33.12 
 
 		 230 aa  76.3  0.0000000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00181332  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1994  GntR domain-containing protein  30.51 
 
 		 268 aa  76.3  0.0000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.255259  normal  0.0993193 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0754  GntR family transcriptional regulator  30.09 
 
 		 255 aa  75.1  0.0000000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.393325  normal  0.323423 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4749  GntR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 273 aa  74.7  0.000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2283  GntR family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 255 aa  75.1  0.000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.666323  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0194  GntR domain-containing protein  30.38 
 
 		 255 aa  73.6  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1996  GntR domain protein  30.56 
 
 		 250 aa  73.6  0.000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.482445  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3213  regulatory protein GntR HTH  31.15 
 
 		 248 aa  73.2  0.000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1157  GntR domain protein  29.51 
 
 		 255 aa  72.8  0.000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6575  GntR domain protein  32.57 
 
 		 282 aa  72.8  0.000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00288971  hitchhiker  0.00502555 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5449  GntR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 247 aa  72.4  0.000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.179216  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4734  GntR family transcriptional regulator  30.17 
 
 		 255 aa  71.2  0.00000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.315584  hitchhiker  0.00963759 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4600  GntR domain-containing protein  30.17 
 
 		 255 aa  71.6  0.00000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.487729  normal  0.0576497 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4471  GntR family transcriptional regulator  31.14 
 
 		 242 aa  70.9  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.788198 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4268  GntR domain-containing protein  31.21 
 
 		 264 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000808968  hitchhiker  0.000533508 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1767  GntR family transcriptional regulator  32.4 
 
 		 255 aa  70.9  0.00000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3833  GntR domain protein  29.63 
 
 		 279 aa  70.5  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4765  GntR family transcriptional regulator  31.14 
 
 		 242 aa  70.9  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1175  GntR family transcriptional regulator  27.35 
 
 		 248 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.621986  normal  0.19706 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4910  GntR domain protein  29.63 
 
 		 279 aa  70.5  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.393149  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5438  transcriptional regulator GntR family  31.49 
 
 		 251 aa  70.5  0.00000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4603  GntR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 278 aa  70.9  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000349921  normal  0.014071 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5224  GntR domain protein  30.72 
 
 		 244 aa  70.5  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4384  GntR family transcriptional regulator  31.14 
 
 		 242 aa  70.9  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1705  regulatory protein GntR HTH  28.33 
 
 		 256 aa  70.5  0.00000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0259893  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0697  GntR domain-containing protein  29.91 
 
 		 255 aa  70.1  0.00000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.601248  hitchhiker  0.0000378938 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2567  GntR family transcriptional regulator  32 
 
 		 281 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.827705 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4735  GntR domain-containing protein  30.17 
 
 		 255 aa  70.1  0.00000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1666  GntR family transcriptional regulator  29.07 
 
 		 255 aa  69.7  0.00000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.115082  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1787  GntR family transcriptional regulator  30.49 
 
 		 239 aa  69.7  0.00000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0160831  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5532  putative GntR family transcriptional regulator  27.94 
 
 		 267 aa  68.9  0.00000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0177  GntR family transcriptional regulator  27.85 
 
 		 270 aa  67.8  0.0000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.285008  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0156  GntR family regulatory protein  27.85 
 
 		 270 aa  68.2  0.0000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  unclonable  0.000005482  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4214  GntR domain-containing protein  32.06 
 
 		 266 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.827392 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3643  GntR domain-containing protein  31.36 
 
 		 260 aa  68.2  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.702528  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2589  GntR family transcriptional regulator  30.09 
 
 		 255 aa  68.2  0.0000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00059476 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0447  GntR-like  33.33 
 
 		 264 aa  67.4  0.0000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4343  GntR family transcriptional regulator  27.7 
 
 		 246 aa  67.4  0.0000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3026  pyruvate dehydrogenase complex repressor  27.51 
 
 		 255 aa  66.6  0.0000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.509676  normal  0.414999 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2669  GntR domain-containing protein  29.88 
 
 		 237 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3930  GntR domain-containing protein  34.3 
 
 		 252 aa  67  0.0000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.263067  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43060  GntR family transcriptional regulator  30.29 
 
 		 258 aa  66.6  0.0000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.145133  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5729  GntR-like  31.77 
 
 		 285 aa  67  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2802  GntR domain-containing protein  29.88 
 
 		 237 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6093  GntR domain-containing protein  31.77 
 
 		 285 aa  67  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.297598  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4809  transcriptional regulator PdhR  31.71 
 
 		 263 aa  66.6  0.0000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0403  GntR family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 261 aa  66.2  0.0000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0391  GntR domain-containing protein  27.4 
 
 		 285 aa  66.2  0.0000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.35489  normal  0.643361 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3007  GntR domain-containing protein  27.04 
 
 		 270 aa  66.2  0.0000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.012307  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1141  GntR family transcriptional regulator  30.98 
 
 		 233 aa  65.9  0.0000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.536549  normal  1 
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0035  GntR family transcriptional regulator  27.63 
 
 		 233 aa  65.9  0.0000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.840145  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0660  regulatory protein GntR, HTH  27.84 
 
 		 259 aa  65.9  0.0000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.519359  normal  0.0398641 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4745  GntR domain-containing protein  27.93 
 
 		 249 aa  65.9  0.0000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00100625 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6576  GntR domain-containing protein  31.77 
 
 		 285 aa  65.9  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0880698  normal  0.0348714 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0620  GntR family transcriptional regulator  27.84 
 
 		 254 aa  65.5  0.0000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0506786  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0666  regulatory protein GntR HTH  27.84 
 
 		 259 aa  65.5  0.0000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4063  GntR family transcriptional regulator  38.21 
 
 		 242 aa  65.1  0.0000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0763  GntR domain-containing protein  29.41 
 
 		 254 aa  65.1  0.000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3401  GntR domain-containing protein  28.37 
 
 		 235 aa  65.1  0.000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19880  transcriptional regulator  30.86 
 
 		 256 aa  65.1  0.000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1321  regulatory protein GntR HTH  29.86 
 
 		 240 aa  64.7  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  2.57427e-29 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2815  GntR domain-containing protein  29.78 
 
 		 264 aa  63.9  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.336695  normal  0.311573 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2904  GntR domain protein  29.86 
 
 		 240 aa  63.9  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00111996  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4157  GntR family transcriptional regulator  26.01 
 
 		 261 aa  64.3  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4311  GntR family transcriptional regulator  26.01 
 
 		 261 aa  64.3  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.173639  normal  0.524632 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0453  regulatory protein GntR HTH  28.63 
 
 		 246 aa  63.9  0.000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0156183  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3418  transcriptional regulator PdhR  32.94 
 
 		 250 aa  64.3  0.000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.530869  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5900  GntR family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 232 aa  63.9  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.540308 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4081  GntR family transcriptional regulator  26.01 
 
 		 261 aa  64.3  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5432  GntR domain protein  26.23 
 
 		 248 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.622945  normal  0.658298 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4617  GntR domain protein  31.36 
 
 		 257 aa  64.3  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00680  transcriptional regulator, GntR family  30.82 
 
 		 230 aa  63.9  0.000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2670  GntR domain-containing protein  27.6 
 
 		 243 aa  64.3  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.015323  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1626  GntR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 241 aa  63.5  0.000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000858772  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3396  GntR family transcriptional regulator  26.27 
 
 		 238 aa  63.2  0.000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5379  GntR domain-containing protein  28.76 
 
 		 234 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.791423  normal  0.648453 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4148  GntR family transcriptional regulator  28.83 
 
 		 246 aa  63.5  0.000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5756  GntR domain protein  28.69 
 
 		 236 aa  63.5  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.294858  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2626  transcriptional regulator PdhR  34.06 
 
 		 256 aa  63.5  0.000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2961  GntR domain-containing protein  29.63 
 
 		 259 aa  63.5  0.000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5550  putative GntR family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 240 aa  63.9  0.000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3206  regulatory protein GntR, HTH  29.15 
 
 		 236 aa  63.9  0.000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6080  GntR family transcriptional regulator  30.52 
 
 		 238 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.348599 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5932  GntR domain protein  32.6 
 
 		 234 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>