More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_0195 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_0195  putative transcriptional regulator  100 
 
 		 228 aa  449  1e-125  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.361489  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01470  putative transcriptional regulator  97.8 
 
 		 228 aa  419  1e-116  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.763826 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4879  GntR family transcriptional regulator  55.26 
 
 		 234 aa  248  4e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1728  GntR domain-containing protein  55.25 
 
 		 234 aa  231  5e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.177351  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3484  GntR domain-containing protein  54.21 
 
 		 232 aa  230  1e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0607093  normal  0.647045 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2254  GntR family transcriptional regulator  54.21 
 
 		 232 aa  229  2e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.385472  normal  0.0729055 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1885  GntR domain-containing protein  54.63 
 
 		 234 aa  230  2e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.219739  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2102  transcription regulator protein  35.4 
 
 		 254 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0212  GntR family transcriptional regulator  35.4 
 
 		 255 aa  109  4.0000000000000004e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1915  GntR domain-containing protein  35.47 
 
 		 227 aa  108  6e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.249377 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0011  GntR domain protein  34.62 
 
 		 254 aa  103  3e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1428  GntR family transcriptional regulator  34.08 
 
 		 245 aa  102  6e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.138717  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0016  GntR domain protein  34.62 
 
 		 254 aa  101  8e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2597  GntR domain-containing protein  30.88 
 
 		 230 aa  99  6e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000130942 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5458  GntR family transcriptional regulator  35.78 
 
 		 235 aa  98.2  1e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0202698 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5244  transcriptional regulator, GntR family  35.05 
 
 		 234 aa  97.1  2e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1834  GntR family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 247 aa  95.5  6e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0450394  normal  0.0643045 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0231  GntR domain-containing protein  34.08 
 
 		 268 aa  94.4  1e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0299  transcriptional regulator GntR  35.38 
 
 		 234 aa  94.4  1e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1202  GntR family transcriptional regulator  31.72 
 
 		 230 aa  94.4  1e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3424  GntR family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 230 aa  93.6  2e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.332431  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0381  GntR family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 230 aa  93.6  2e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2462  GntR family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 230 aa  93.6  2e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3731  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 230 aa  94  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.069841  normal  0.381268 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3459  GntR family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 230 aa  93.6  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1242  GntR family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 230 aa  93.6  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3389  GntR domain protein  30.59 
 
 		 230 aa  93.6  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.422325  hitchhiker  0.000247854 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3324  GntR family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 230 aa  93.6  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0307  GntR family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 234 aa  93.2  3e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1852  GntR family transcriptional regulator  34.3 
 
 		 238 aa  93.2  3e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0567  GntR family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 234 aa  92.8  4e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.837361  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1975  GntR domain protein  31.73 
 
 		 233 aa  92.4  5e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.64094  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2741  GntR domain-containing protein  33.04 
 
 		 240 aa  92  6e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0412292  normal  0.462713 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5075  GntR domain-containing protein  31.8 
 
 		 262 aa  92  6e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.805672  normal  0.0518495 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3461  GntR family transcriptional regulator  30.87 
 
 		 230 aa  92  6e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.488404  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0566  GntR domain-containing protein  33.48 
 
 		 239 aa  91.3  1e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0821673  normal  0.241322 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0540  GntR domain-containing protein  33.48 
 
 		 239 aa  91.3  1e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0230635  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1578  GntR domain protein  30.84 
 
 		 230 aa  89.7  4e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00244066  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0645  GntR domain-containing protein  32.46 
 
 		 230 aa  89  6e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0162  GntR-like  32.46 
 
 		 291 aa  88.2  8e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.496913  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3118  transcriptional regulator GntR  31.72 
 
 		 237 aa  87.8  1e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0612  GntR domain-containing protein  32.31 
 
 		 240 aa  88.2  1e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.151617  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1362  GntR domain protein  29.17 
 
 		 231 aa  87  2e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.971171  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3283  transcriptional regulator, GntR family  30.84 
 
 		 237 aa  85.9  4e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1626  GntR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 241 aa  85.5  7e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000858772  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1636  GntR domain-containing protein  25.44 
 
 		 266 aa  85.5  7e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000195276  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5932  GntR domain protein  34.51 
 
 		 234 aa  85.1  7e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1244  GntR family transcriptional regulator  29.86 
 
 		 231 aa  85.1  8e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03226  transcriptional regulator of pyruvate dehydrogenase complex  30.41 
 
 		 248 aa  85.1  8e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.226211  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1626  GntR family transcriptional regulator  34.47 
 
 		 241 aa  84.7  0.000000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.60188  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2173  GntR family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 234 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.727858  normal  0.299603 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2928  transcriptional regulator  29.63 
 
 		 249 aa  84.3  0.000000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0871114  normal  0.303622 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3068  transcriptional regulator NanR  30.09 
 
 		 235 aa  83.6  0.000000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2645  GntR domain protein  30.9 
 
 		 254 aa  83.6  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4247  GntR domain-containing protein  31.88 
 
 		 216 aa  83.6  0.000000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0929  GntR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 232 aa  83.6  0.000000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0628731  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1008  GntR domain-containing protein  31.65 
 
 		 216 aa  83.2  0.000000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.19227  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0527  GntR domain-containing protein  31.5 
 
 		 258 aa  82.8  0.000000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.914747  normal  0.270736 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0969  GntR family transcriptional regulator  32.57 
 
 		 216 aa  82.8  0.000000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3501  GntR domain-containing protein  33.48 
 
 		 234 aa  82.8  0.000000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.378835 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3725  transcriptional regulator NanR  31.48 
 
 		 237 aa  82.8  0.000000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.235628  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3963  GntR family transcriptional regulator  30.92 
 
 		 269 aa  82.8  0.000000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0554  GntR family transcriptional regulator  30.66 
 
 		 252 aa  82.8  0.000000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00161353  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1948  GntR family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 255 aa  82.8  0.000000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0263216  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0749  GntR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 236 aa  82.4  0.000000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4862  GntR domain protein  34.63 
 
 		 247 aa  82.4  0.000000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.105448 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6346  GntR domain-containing protein  32.87 
 
 		 233 aa  82.4  0.000000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.385639  normal  0.289379 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1804  GntR family transcriptional regulator  34.63 
 
 		 247 aa  82  0.000000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00283289  hitchhiker  0.0098314 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0976  GntR domain-containing protein  32.42 
 
 		 216 aa  81.6  0.000000000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.664678  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21660  transcriptional regulator, GntR family  29.82 
 
 		 235 aa  81.6  0.000000000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.716798 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0554  GntR family transcriptional regulator  28.07 
 
 		 239 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1432  GntR family transcriptional regulator  28.07 
 
 		 239 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1175  GntR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 248 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.621986  normal  0.19706 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2283  GntR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 255 aa  81.6  0.00000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.666323  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0457  GntR family transcriptional regulator  28.07 
 
 		 239 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05160  transcriptional regulator, GntR family  31.16 
 
 		 253 aa  80.9  0.00000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5432  GntR domain protein  26.82 
 
 		 248 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.622945  normal  0.658298 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1872  GntR family transcriptional regulator  28.05 
 
 		 318 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.345922  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5612  GntR domain protein  30 
 
 		 271 aa  80.5  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.100575  normal  0.179295 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0375  GntR domain protein  31.25 
 
 		 234 aa  80.5  0.00000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.400874  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0020  GntR family transcriptional regulator  28.09 
 
 		 256 aa  80.1  0.00000000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.321852  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0158  GntR domain-containing protein  28.24 
 
 		 239 aa  80.9  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2818  GntR domain-containing protein  33.33 
 
 		 249 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.325191  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2181  GntR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 228 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.79016  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0923  GntR domain protein  28.17 
 
 		 230 aa  80.1  0.00000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0612567  normal  0.0530485 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0156  GntR domain protein  27.7 
 
 		 230 aa  80.9  0.00000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.108623 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2500  GntR transcriptional regulators family  25.57 
 
 		 243 aa  80.1  0.00000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2075  GntR domain-containing protein  31.65 
 
 		 255 aa  79.3  0.00000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5316  GntR domain protein  31.44 
 
 		 239 aa  79.3  0.00000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.173644  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3110  GntR family transcriptional regulator  30.49 
 
 		 268 aa  79.3  0.00000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.371117  normal  0.954276 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0071  GntR domain-containing protein  28.44 
 
 		 258 aa  79.3  0.00000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2081  GntR family transcriptional regulator  28.05 
 
 		 366 aa  79  0.00000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2132  GntR family transcriptional regulator  29.86 
 
 		 246 aa  79.3  0.00000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2670  GntR domain-containing protein  28.44 
 
 		 243 aa  79  0.00000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.015323  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3603  GntR family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 254 aa  78.6  0.00000000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.180217  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2313  GntR domain-containing protein  33.33 
 
 		 249 aa  78.6  0.00000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.146544  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5344  GntR domain protein  30.18 
 
 		 242 aa  78.6  0.00000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.509013 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0095  transcriptional regulator NanR  29.95 
 
 		 237 aa  78.6  0.00000000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3102  GntR domain-containing protein  32.89 
 
 		 249 aa  78.6  0.00000000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.616915  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5064  regulatory protein GntR HTH  31.6 
 
 		 242 aa  78.2  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>