More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_1150 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_1150  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 257 aa  502  1e-141  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.587484 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1647  GntR family transcriptional regulator  51.14 
 
 		 289 aa  215  5e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0375672 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5838  GntR domain-containing protein  50.46 
 
 		 220 aa  180  2e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0918  GntR domain-containing protein  42.13 
 
 		 262 aa  147  2.0000000000000003e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4197  GntR family transcriptional regulator  31.02 
 
 		 255 aa  100  2e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.675851  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5598  GntR domain protein  36.11 
 
 		 256 aa  94  2e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0977  GntR family transcriptional regulator  34.11 
 
 		 219 aa  93.6  3e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1275  GntR domain protein  30.09 
 
 		 241 aa  92.8  5e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3742  GntR domain-containing protein  31.36 
 
 		 269 aa  91.7  1e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1023  GntR domain-containing protein  28.43 
 
 		 215 aa  89.7  4e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1163  GntR domain protein  34.75 
 
 		 230 aa  89.7  4e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.613431 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1996  GntR domain protein  31.86 
 
 		 250 aa  88.6  9e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.482445  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3991  transcriptional regulator, GntR family  27.94 
 
 		 218 aa  88.2  1e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.401302  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2197  GntR domain-containing protein  30 
 
 		 239 aa  87.4  2e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000963165  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1353  transcriptional regulator, GntR family  27.94 
 
 		 218 aa  87.8  2e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2304  GntR family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 233 aa  87  2e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0204  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  32.09 
 
 		 257 aa  87  2e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.502813 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4519  GntR domain protein  29.05 
 
 		 240 aa  87.4  2e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1948  GntR family transcriptional regulator  31.17 
 
 		 255 aa  87.4  2e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0263216  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1415  GntR family transcriptional regulator  27.94 
 
 		 218 aa  86.3  4e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1455  transcriptional regulator, GntR family  27.94 
 
 		 218 aa  86.3  4e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5064  regulatory protein GntR HTH  33.78 
 
 		 242 aa  85.9  5e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0393  GntR domain protein  27.43 
 
 		 238 aa  86.3  5e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1195  GntR family transcriptional regulator  27.94 
 
 		 218 aa  85.5  9e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.187106  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1215  GntR family transcriptional regulator  27.94 
 
 		 218 aa  84.7  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0659277  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1193  GntR family transcriptional regulator  27.94 
 
 		 218 aa  84.7  0.000000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1314  GntR family transcriptional regulator  27.94 
 
 		 218 aa  84.7  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1084  regulatory protein GntR HTH  34.39 
 
 		 226 aa  84.7  0.000000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00753008  hitchhiker  0.00000253482 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1391  transcriptional regulator, GntR family  27.94 
 
 		 218 aa  84.7  0.000000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2815  GntR domain-containing protein  30.95 
 
 		 264 aa  84  0.000000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.336695  normal  0.311573 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5347  transcriptional regulator GntR family  32.26 
 
 		 242 aa  83.6  0.000000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1217  GntR domain-containing protein  27.45 
 
 		 218 aa  83.6  0.000000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10060  transcriptional regulator, GntR family  32 
 
 		 226 aa  82.8  0.000000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0815539  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5344  GntR domain protein  31.8 
 
 		 242 aa  82.4  0.000000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.509013 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1141  GntR family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 233 aa  82  0.000000000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.536549  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6133  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  31.16 
 
 		 251 aa  81.3  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70710  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  31.16 
 
 		 251 aa  81.6  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.996223  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1727  GntR domain protein  32.74 
 
 		 273 aa  81.3  0.00000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  unclonable  0.000000957079  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5703  transcriptional regulator GntR family  29.55 
 
 		 246 aa  81.6  0.00000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02849  DNA-binding transcriptional dual regulator, glycolate-binding  28.97 
 
 		 254 aa  80.9  0.00000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0051984  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0716  GntR domain protein  28.97 
 
 		 254 aa  80.9  0.00000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3258  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  28.97 
 
 		 256 aa  80.9  0.00000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02799  hypothetical protein  28.97 
 
 		 254 aa  80.9  0.00000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00647704  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0720  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  28.97 
 
 		 254 aa  80.9  0.00000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6391  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  27.49 
 
 		 255 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3153  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  28.97 
 
 		 254 aa  80.9  0.00000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3440  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  28.97 
 
 		 254 aa  80.9  0.00000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5880  GntR domain protein  34.95 
 
 		 223 aa  80.1  0.00000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3744  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  30.36 
 
 		 263 aa  79.7  0.00000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2160  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  29.78 
 
 		 254 aa  79.7  0.00000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.167061  normal  0.198333 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0366  GntR family transcriptional regulator  29.56 
 
 		 288 aa  79.7  0.00000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2188  GntR domain-containing protein  27.73 
 
 		 240 aa  79  0.00000000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.030411  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2307  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  27.88 
 
 		 259 aa  79  0.00000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.672341  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5644  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  29.76 
 
 		 263 aa  79  0.00000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.181455  normal  0.540253 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2019  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  30.36 
 
 		 254 aa  79  0.00000000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.230363  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1877  GntR domain protein  29.46 
 
 		 236 aa  79  0.00000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.380896  normal  0.264595 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0399  GntR domain protein  32.86 
 
 		 224 aa  79  0.00000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3404  GntR domain protein  26.15 
 
 		 245 aa  77.8  0.0000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000285286  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1157  GntR domain protein  29.86 
 
 		 255 aa  78.2  0.0000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4937  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  28.15 
 
 		 256 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.100111 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4399  GntR domain protein  31.56 
 
 		 250 aa  78.2  0.0000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5490  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  28.15 
 
 		 256 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.290272  hitchhiker  0.000168771 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2203  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  29.78 
 
 		 255 aa  77.4  0.0000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.861815 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6525  GntR domain-containing protein  30.95 
 
 		 253 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.223773  normal  0.0260964 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8203  transcriptional regulator, GntR family  29.86 
 
 		 224 aa  77  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43340  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  28.12 
 
 		 259 aa  77  0.0000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.180109  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26860  GntR family regulatory protein  30.36 
 
 		 241 aa  77  0.0000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0447  GntR-like  30.58 
 
 		 264 aa  76.6  0.0000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2218  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  29.38 
 
 		 255 aa  76.6  0.0000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0409255  hitchhiker  0.007316 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0391  GntR domain-containing protein  28.24 
 
 		 285 aa  76.6  0.0000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.35489  normal  0.643361 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2187  GntR domain-containing protein  27.75 
 
 		 239 aa  76.6  0.0000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00327996  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1428  GntR family transcriptional regulator  31.84 
 
 		 245 aa  75.9  0.0000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.138717  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0034  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  26.84 
 
 		 256 aa  76.3  0.0000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2589  GntR family transcriptional regulator  29.49 
 
 		 255 aa  76.3  0.0000000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00059476 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1313  regulatory protein GntR HTH  25.23 
 
 		 232 aa  75.9  0.0000000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1834  GntR family transcriptional regulator  31.84 
 
 		 247 aa  75.9  0.0000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0450394  normal  0.0643045 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1453  GntR domain protein  29.17 
 
 		 231 aa  75.5  0.0000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3405  GntR domain protein  26.27 
 
 		 239 aa  75.5  0.0000000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  8.69353e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4413  GntR domain protein  26.96 
 
 		 241 aa  75.5  0.0000000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1626  GntR family transcriptional regulator  25.79 
 
 		 241 aa  75.1  0.000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000858772  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3757  GntR domain-containing protein  32.18 
 
 		 235 aa  74.7  0.000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.560097  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1464  GntR domain protein  29.08 
 
 		 249 aa  74.7  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.232072 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6461  GntR domain protein  27.78 
 
 		 257 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0712738  hitchhiker  0.00000516822 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0158  GntR domain-containing protein  27.62 
 
 		 239 aa  74.7  0.000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1691  GntR domain protein  29.02 
 
 		 236 aa  75.1  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.148925  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4257  transcriptional regulator, GntR family  25.46 
 
 		 226 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00030759 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1578  GntR domain protein  27.36 
 
 		 230 aa  74.7  0.000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00244066  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4324  GntR domain-containing protein  34 
 
 		 260 aa  75.1  0.000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.133049 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0194  GntR domain-containing protein  29.28 
 
 		 255 aa  73.9  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2607  GntR domain protein  33.03 
 
 		 234 aa  74.7  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0794563 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2365  GntR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 251 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0740393  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4247  GntR domain-containing protein  29.86 
 
 		 216 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1263  GntR domain protein  26.51 
 
 		 229 aa  74.3  0.000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1078  transcriptional regulatory DNA-binding transcription regulator protein  29.11 
 
 		 255 aa  73.6  0.000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1908  GntR domain protein  32.34 
 
 		 261 aa  73.2  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.287646  normal  0.900413 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3177  GntR family transcriptional regulator  31.7 
 
 		 251 aa  73.2  0.000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0272  GntR domain protein  32.57 
 
 		 232 aa  73.2  0.000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.554263 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1362  GntR domain protein  27.83 
 
 		 231 aa  72.8  0.000000000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.971171  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3006  GntR domain protein  32.74 
 
 		 243 aa  72.4  0.000000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.137902  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2695  GntR domain-containing protein  28.83 
 
 		 255 aa  72.4  0.000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0648967 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>