More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_5072 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010552  BamMC406_5072  GntR domain-containing protein  100 
 
 		 234 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4549  GntR domain-containing protein  99.57 
 
 		 234 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.858524 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3501  GntR domain-containing protein  96.15 
 
 		 234 aa  432  1e-120  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.378835 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5125  GntR domain-containing protein  97.44 
 
 		 234 aa  417  1e-116  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0479  GntR family transcriptional regulator  96.58 
 
 		 234 aa  411  1e-114  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.558677  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3213  GntR-like  97.86 
 
 		 234 aa  395  1e-109  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5154  GntR domain-containing protein  97.86 
 
 		 234 aa  395  1e-109  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0978  GntR family transcriptional regulator  89.74 
 
 		 234 aa  374  1e-103  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2012  GntR family transcriptional regulator  88.03 
 
 		 234 aa  364  1e-100  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.888081  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0578  GntR family transcriptional regulator  88.03 
 
 		 234 aa  364  1e-100  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0437  GntR family transcriptional regulator  88.03 
 
 		 234 aa  364  1e-100  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0889  GntR family transcriptional regulator  88.03 
 
 		 234 aa  364  1e-100  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1919  GntR family transcriptional regulator  88.03 
 
 		 234 aa  364  1e-100  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1856  GntR family transcriptional regulator  88.03 
 
 		 234 aa  364  1e-100  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5932  GntR domain protein  81.2 
 
 		 234 aa  363  1e-100  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2173  GntR family transcriptional regulator  81.2 
 
 		 234 aa  363  1e-99  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.727858  normal  0.299603 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4422  GntR domain-containing protein  82.91 
 
 		 234 aa  350  8.999999999999999e-96  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.99346  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1428  GntR family transcriptional regulator  65.95 
 
 		 245 aa  305  3e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.138717  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1834  GntR family transcriptional regulator  65.95 
 
 		 247 aa  298  5e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0450394  normal  0.0643045 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3408  GntR domain protein  59.05 
 
 		 253 aa  252  3e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3731  GntR domain protein  59.05 
 
 		 238 aa  252  3e-66  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2815  GntR domain-containing protein  49.33 
 
 		 264 aa  196  3e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.336695  normal  0.311573 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0447  GntR-like  47.62 
 
 		 264 aa  175  5e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1636  GntR domain-containing protein  42.47 
 
 		 266 aa  173  1.9999999999999998e-42  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000195276  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5148  GntR domain protein  47.19 
 
 		 258 aa  172  2.9999999999999996e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.178203  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4884  GntR family transcriptional regulator  48.05 
 
 		 258 aa  172  2.9999999999999996e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5113  GntR family transcriptional regulator  46.7 
 
 		 274 aa  171  7.999999999999999e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5903  GntR family transcriptional regulator  44.75 
 
 		 288 aa  165  5e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.210517  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3757  GntR domain-containing protein  39.21 
 
 		 235 aa  153  2.9999999999999998e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.560097  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1624  GntR domain-containing protein  38.57 
 
 		 238 aa  150  1e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.276308  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3177  GntR family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 251 aa  149  4e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2484  GntR domain-containing protein  37.61 
 
 		 238 aa  139  3.9999999999999997e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.120596  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0023  GntR family transcriptional regulator  37.95 
 
 		 246 aa  126  3e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0020  GntR family transcriptional regulator  37.95 
 
 		 246 aa  126  3e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4745  GntR domain-containing protein  36.36 
 
 		 249 aa  125  8.000000000000001e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00100625 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1727  GntR domain protein  35.87 
 
 		 273 aa  124  1e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  unclonable  0.000000957079  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0971  GntR family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 248 aa  122  3e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0558982  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1948  GntR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 255 aa  122  5e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0263216  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4228  transcriptional regulator GntR  35.81 
 
 		 249 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0833  GntR family transcriptional regulator  37.89 
 
 		 272 aa  120  9.999999999999999e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0464324 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4550  transcriptional regulator, GntR family  35.81 
 
 		 249 aa  119  3e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4276  GntR family transcriptional regulator  38.26 
 
 		 253 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0786169  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6605  GntR domain protein  33.63 
 
 		 246 aa  119  3.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00449422 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0253  GntR domain-containing protein  37.32 
 
 		 262 aa  119  4.9999999999999996e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.6565  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2141  GntR domain-containing protein  37.83 
 
 		 253 aa  118  7.999999999999999e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0685  GntR-like  38.33 
 
 		 249 aa  118  7.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1164  GntR domain-containing protein  38.33 
 
 		 249 aa  118  7.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1140  GntR domain-containing protein  38.33 
 
 		 249 aa  118  7.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5664  GntR domain protein  33.79 
 
 		 248 aa  118  9e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.0098751  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0823  GntR family transcriptional regulator  35.81 
 
 		 274 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.691508  normal  0.984606 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3305  GntR family transcriptional regulator  36.28 
 
 		 251 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6525  GntR domain-containing protein  36.04 
 
 		 253 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.223773  normal  0.0260964 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1046  GntR domain-containing protein  37.39 
 
 		 253 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4447  GntR family transcriptional regulator  37.16 
 
 		 252 aa  114  8.999999999999998e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.614266  normal  0.249195 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5539  regulatory protein GntR HTH  35.74 
 
 		 237 aa  114  1.0000000000000001e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3714  GntR family transcriptional regulator  37.44 
 
 		 247 aa  114  1.0000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.421261  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1043  GntR domain-containing protein  37.39 
 
 		 253 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1010  GntR domain protein  36.09 
 
 		 251 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3603  GntR family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 254 aa  112  3e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.180217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3102  GntR domain-containing protein  35.37 
 
 		 249 aa  113  3e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.616915  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3110  GntR family transcriptional regulator  33.19 
 
 		 268 aa  112  4.0000000000000004e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.371117  normal  0.954276 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2818  GntR domain-containing protein  34.93 
 
 		 249 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.325191  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1078  transcriptional regulatory DNA-binding transcription regulator protein  35.27 
 
 		 255 aa  111  1.0000000000000001e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2313  GntR domain-containing protein  34.93 
 
 		 249 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.146544  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5082  GntR domain-containing protein  35.06 
 
 		 250 aa  110  2.0000000000000002e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.992616  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5742  GntR domain protein  35.81 
 
 		 233 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.343946  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1789  GntR family transcriptional regulator  36.32 
 
 		 232 aa  109  4.0000000000000004e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.612124  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1691  GntR domain protein  39.64 
 
 		 236 aa  109  4.0000000000000004e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.148925  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1877  GntR domain protein  39.19 
 
 		 236 aa  108  7.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.380896  normal  0.264595 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0945  GntR domain protein  34.36 
 
 		 251 aa  108  7.000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.280817  normal  0.0677412 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4031  GntR domain-containing protein  34.63 
 
 		 243 aa  107  1e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1995  GntR family transcriptional regulator  33.18 
 
 		 268 aa  106  2e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.00626171  normal  0.663234 
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0035  GntR family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 233 aa  107  2e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.840145  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4759  GntR family transcriptional regulator  37.67 
 
 		 259 aa  106  3e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.0000856086  hitchhiker  0.00798136 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4633  GntR domain-containing protein  38.12 
 
 		 233 aa  106  3e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.320715  hitchhiker  0.000883916 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1804  GntR family transcriptional regulator  34.18 
 
 		 247 aa  106  3e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00283289  hitchhiker  0.0098314 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2589  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 270 aa  106  3e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.000313005  normal  0.0123827 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5703  transcriptional regulator GntR family  34.86 
 
 		 246 aa  105  4e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4518  GntR family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 234 aa  106  4e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1342  GntR domain protein  32.3 
 
 		 229 aa  105  5e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00721185  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1275  GntR domain protein  30.8 
 
 		 241 aa  105  5e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4274  GntR domain protein  31.53 
 
 		 229 aa  105  5e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.556367 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4862  GntR domain protein  34.18 
 
 		 247 aa  105  6e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.105448 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4768  GntR domain-containing protein  37.67 
 
 		 233 aa  105  7e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.907496  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4519  GntR domain protein  30.18 
 
 		 240 aa  105  9e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1795  GntR domain protein  33.18 
 
 		 272 aa  104  1e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.02855  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0661  GntR domain-containing protein  35.94 
 
 		 232 aa  104  1e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.2652  normal  0.118681 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26860  GntR family regulatory protein  34.88 
 
 		 241 aa  104  1e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3584  GntR-like  33.78 
 
 		 275 aa  103  2e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.532256  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3283  transcriptional regulator, GntR family  33.18 
 
 		 237 aa  102  5e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3372  GntR domain-containing protein  35.59 
 
 		 299 aa  102  5e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1590  GntR domain-containing protein  32.3 
 
 		 273 aa  102  7e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.884635  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1308  GntR family transcriptional regulator  33.18 
 
 		 240 aa  101  8e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1260  GntR family transcriptional regulator  34.98 
 
 		 235 aa  101  9e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05190  Transcriptional regulatory protein, GntR family  34.35 
 
 		 252 aa  100  2e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3118  transcriptional regulator GntR  33.33 
 
 		 237 aa  99.8  3e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0034  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  32.33 
 
 		 256 aa  99.8  3e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1641  GntR-like  36.28 
 
 		 256 aa  99.8  3e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.655901  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0393  GntR domain protein  28.57 
 
 		 238 aa  100  3e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2075  GntR domain-containing protein  32.16 
 
 		 255 aa  99.4  4e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>