More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_2069 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_2069  GntR domain-containing protein  100 
 
 		 225 aa  446  1.0000000000000001e-124  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.354488  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3321  GntR domain-containing protein  38.36 
 
 		 240 aa  133  1.9999999999999998e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.580884  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4031  GntR domain-containing protein  36.87 
 
 		 243 aa  126  2.0000000000000002e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3584  GntR-like  33.63 
 
 		 275 aa  122  4e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.532256  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4745  GntR domain-containing protein  34.53 
 
 		 249 aa  115  3.9999999999999997e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00100625 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1804  GntR family transcriptional regulator  38.39 
 
 		 247 aa  115  6e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00283289  hitchhiker  0.0098314 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1636  GntR domain-containing protein  33.77 
 
 		 266 aa  114  7.999999999999999e-25  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000195276  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2818  GntR domain-containing protein  37.1 
 
 		 249 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.325191  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2313  GntR domain-containing protein  37.1 
 
 		 249 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.146544  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1428  GntR family transcriptional regulator  34.08 
 
 		 245 aa  111  7.000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.138717  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1078  transcriptional regulatory DNA-binding transcription regulator protein  35.62 
 
 		 255 aa  111  9e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3603  GntR family transcriptional regulator  36.65 
 
 		 254 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.180217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3102  GntR domain-containing protein  36.65 
 
 		 249 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.616915  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4228  transcriptional regulator GntR  36.77 
 
 		 249 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4435  GntR domain-containing protein  33.79 
 
 		 229 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4862  GntR domain protein  37.95 
 
 		 247 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.105448 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0823  GntR family transcriptional regulator  36.77 
 
 		 274 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.691508  normal  0.984606 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4274  GntR domain protein  32.88 
 
 		 229 aa  109  3e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.556367 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6525  GntR domain-containing protein  36.16 
 
 		 253 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.223773  normal  0.0260964 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4550  transcriptional regulator, GntR family  36.77 
 
 		 249 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2473  GntR family transcriptional regulator  36.94 
 
 		 240 aa  109  4.0000000000000004e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6442  GntR domain protein  33.33 
 
 		 254 aa  108  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.143546 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3305  GntR family transcriptional regulator  37.44 
 
 		 251 aa  107  2e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0023  GntR family transcriptional regulator  34.47 
 
 		 246 aa  106  3e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0020  GntR family transcriptional regulator  34.47 
 
 		 246 aa  106  3e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6265  GntR domain protein  33.33 
 
 		 254 aa  106  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.610791 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0253  GntR domain-containing protein  36.36 
 
 		 262 aa  105  6e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.6565  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1010  GntR domain protein  34.7 
 
 		 251 aa  105  7e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5177  regulatory protein GntR HTH  36.36 
 
 		 238 aa  105  7e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.835231  normal  0.258028 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5703  transcriptional regulator GntR family  34.26 
 
 		 246 aa  104  1e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0833  GntR family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 272 aa  104  1e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0464324 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1834  GntR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 247 aa  104  1e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0450394  normal  0.0643045 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1795  GntR domain protein  37.13 
 
 		 272 aa  104  1e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.02855  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1995  GntR family transcriptional regulator  37.13 
 
 		 268 aa  104  1e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.00626171  normal  0.663234 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0945  GntR domain protein  34.25 
 
 		 251 aa  103  2e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.280817  normal  0.0677412 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3118  transcriptional regulator GntR  36.24 
 
 		 237 aa  103  2e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5446  GntR domain protein  36.36 
 
 		 237 aa  103  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0117781 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3177  GntR family transcriptional regulator  32.59 
 
 		 251 aa  101  8e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3714  GntR family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 247 aa  101  9e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.421261  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3110  GntR family transcriptional regulator  34.6 
 
 		 268 aa  101  1e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.371117  normal  0.954276 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3283  transcriptional regulator, GntR family  34.93 
 
 		 237 aa  100  2e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2815  GntR domain-containing protein  35.56 
 
 		 264 aa  100  2e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.336695  normal  0.311573 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4155  GntR domain-containing protein  36.36 
 
 		 240 aa  100  2e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0585899  normal  0.800121 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1157  GntR-like  33.19 
 
 		 252 aa  100  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.00396004  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1727  GntR domain protein  34.12 
 
 		 273 aa  100  3e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  unclonable  0.000000957079  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1996  GntR domain protein  36.2 
 
 		 250 aa  100  3e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.482445  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2589  GntR family transcriptional regulator  36.16 
 
 		 270 aa  100  3e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.000313005  normal  0.0123827 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8124  GntR domain protein  31.96 
 
 		 250 aa  99.4  4e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1590  GntR domain-containing protein  34.6 
 
 		 273 aa  98.6  7e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.884635  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3501  GntR domain-containing protein  34.76 
 
 		 234 aa  98.6  8e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.378835 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1948  GntR family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 255 aa  97.8  1e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0263216  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1469  GntR domain protein  31.96 
 
 		 250 aa  97.4  2e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.934444  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5082  GntR domain-containing protein  35.24 
 
 		 250 aa  97.1  2e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.992616  normal  1 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4518  GntR family transcriptional regulator  35.41 
 
 		 234 aa  97.1  2e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1624  GntR domain-containing protein  35.02 
 
 		 238 aa  96.3  4e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.276308  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3981  GntR domain-containing protein  37.5 
 
 		 233 aa  95.5  5e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5932  GntR domain protein  34.67 
 
 		 234 aa  94.4  1e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0971  GntR family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 248 aa  94.4  1e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0558982  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0554  GntR family transcriptional regulator  36.7 
 
 		 252 aa  94.4  1e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00161353  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5148  GntR domain protein  35.43 
 
 		 258 aa  93.6  2e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.178203  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5539  regulatory protein GntR HTH  31.22 
 
 		 237 aa  94  2e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3405  GntR family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 239 aa  93.6  2e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4100  GntR domain protein  34.22 
 
 		 236 aa  94  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05190  Transcriptional regulatory protein, GntR family  36.87 
 
 		 252 aa  93.6  2e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0661  GntR domain-containing protein  34.95 
 
 		 232 aa  93.6  2e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.2652  normal  0.118681 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3050  GntR domain-containing protein  31.96 
 
 		 239 aa  93.6  2e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0593714 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3372  GntR domain-containing protein  35.24 
 
 		 299 aa  93.2  3e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2173  GntR family transcriptional regulator  34.22 
 
 		 234 aa  93.2  3e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.727858  normal  0.299603 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6605  GntR domain protein  35.05 
 
 		 246 aa  91.7  7e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00449422 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1275  GntR domain protein  31.4 
 
 		 241 aa  91.3  1e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1140  GntR domain-containing protein  32.6 
 
 		 249 aa  91.3  1e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0685  GntR-like  32.6 
 
 		 249 aa  91.3  1e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5064  regulatory protein GntR HTH  34.58 
 
 		 242 aa  90.9  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1164  GntR domain-containing protein  32.6 
 
 		 249 aa  91.3  1e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5347  transcriptional regulator GntR family  32 
 
 		 242 aa  90.5  2e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4276  GntR family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 253 aa  90.5  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0786169  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4519  GntR domain protein  32.39 
 
 		 240 aa  90.1  2e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5664  GntR domain protein  34.42 
 
 		 248 aa  90.9  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.0098751  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3731  GntR domain protein  33.77 
 
 		 238 aa  89.7  3e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3408  GntR domain protein  33.77 
 
 		 253 aa  89.7  3e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1310  GntR family transcriptional regulator  33.48 
 
 		 249 aa  89.7  3e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.168144  normal  0.307204 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0447  GntR-like  32.67 
 
 		 264 aa  89.7  3e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2141  GntR domain-containing protein  31.86 
 
 		 253 aa  89  6e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2484  GntR domain-containing protein  34.15 
 
 		 238 aa  88.6  7e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.120596  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3254  transcriptional regulator, GntR family  32.85 
 
 		 244 aa  88.6  7e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.785  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1359  GntR family transcriptional regulator  33.48 
 
 		 240 aa  88.2  8e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0317585 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1626  GntR family transcriptional regulator  34.82 
 
 		 241 aa  87.4  1e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000858772  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1043  GntR domain-containing protein  32.61 
 
 		 253 aa  87.4  1e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0031  GntR family transcriptional regulator  35.58 
 
 		 230 aa  88.2  1e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1046  GntR domain-containing protein  32.61 
 
 		 253 aa  87.4  1e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1975  GntR domain protein  28.33 
 
 		 233 aa  86.7  2e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.64094  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2385  GntR family transcriptional regulator  35.68 
 
 		 259 aa  87  2e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.655367  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5742  GntR domain protein  30.36 
 
 		 233 aa  86.7  3e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.343946  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0346  GntR family transcriptional regulator  33.63 
 
 		 238 aa  85.9  4e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0393  GntR domain protein  29.33 
 
 		 238 aa  86.3  4e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3824  GntR family transcriptional regulator  33.63 
 
 		 262 aa  85.9  5e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1885  GntR domain-containing protein  30.63 
 
 		 248 aa  85.5  6e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4851  DNA-binding transcriptional repressor UxuR  32.54 
 
 		 257 aa  85.5  6e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5344  GntR domain protein  33.03 
 
 		 242 aa  85.1  7e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.509013 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7351  transcriptional regulator GntR family  36.55 
 
 		 284 aa  85.5  7e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.307061  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>