More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_2385 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007802  Jann_2385  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 259 aa  514  1.0000000000000001e-145  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.655367  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1447  GntR family transcriptional regulator  76.25 
 
 		 243 aa  363  1e-99  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.384199 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2324  regulatory protein  63.6 
 
 		 242 aa  288  6e-77  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.127616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3347  regulatory protein GntR HTH  45.21 
 
 		 255 aa  177  2e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.140801 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1106  GntR domain-containing protein  44.27 
 
 		 251 aa  145  7.0000000000000006e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3635  regulatory protein GntR, HTH  36.32 
 
 		 248 aa  105  6e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0356922  normal  0.468942 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4247  GntR domain-containing protein  34.34 
 
 		 216 aa  86.7  3e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1994  GntR domain-containing protein  33.64 
 
 		 268 aa  85.5  7e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.255259  normal  0.0993193 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4063  GntR family transcriptional regulator  34.32 
 
 		 242 aa  85.5  9e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3695  regulatory protein GntR, HTH  30.43 
 
 		 241 aa  82.8  0.000000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5532  putative GntR family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 267 aa  82.4  0.000000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0969  GntR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 216 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6337  GntR domain-containing protein  35.22 
 
 		 226 aa  81.3  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.0092025  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1008  GntR domain-containing protein  34.8 
 
 		 216 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.19227  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3176  regulatory protein GntR, HTH  32.33 
 
 		 242 aa  79.7  0.00000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.730979  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1972  putative pyruvate dehydrogenase complex repressor  35.14 
 
 		 260 aa  76.6  0.0000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0510687  normal  0.668194 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0976  GntR domain-containing protein  34.31 
 
 		 216 aa  76.6  0.0000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.664678  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1908  GntR domain protein  29.18 
 
 		 261 aa  76.6  0.0000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.287646  normal  0.900413 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3384  regulatory protein GntR, HTH  29.58 
 
 		 239 aa  76.3  0.0000000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.177964  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1321  regulatory protein GntR HTH  29.18 
 
 		 240 aa  75.9  0.0000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  2.57427e-29 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3068  transcriptional regulator NanR  28.26 
 
 		 235 aa  75.5  0.0000000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0977  GntR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 219 aa  74.7  0.000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1414  GntR domain-containing protein  30.81 
 
 		 241 aa  75.1  0.000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2670  GntR domain-containing protein  30.04 
 
 		 243 aa  74.7  0.000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.015323  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2500  GntR transcriptional regulators family  28.77 
 
 		 243 aa  73.9  0.000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1157  GntR domain protein  33.33 
 
 		 255 aa  73.9  0.000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1141  GntR family transcriptional regulator  36.71 
 
 		 233 aa  73.9  0.000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.536549  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2904  GntR domain protein  29.18 
 
 		 240 aa  73.9  0.000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00111996  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03670  transcriptional regulator, GntR family  32.13 
 
 		 268 aa  73.2  0.000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.99262 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3616  GntR domain-containing protein  31.78 
 
 		 252 aa  72.8  0.000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.760095 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1724  GntR domain protein  30.05 
 
 		 261 aa  72  0.000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.308508  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03578  predicted DNA-binding transcriptional regulator  29.36 
 
 		 229 aa  71.2  0.00000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.753742  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0008  GntR domain protein  29.36 
 
 		 229 aa  71.2  0.00000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0008  GntR domain-containing protein  29.36 
 
 		 229 aa  71.2  0.00000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4060  galactonate operon transcriptional repressor  29.36 
 
 		 229 aa  71.2  0.00000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4222  galactonate operon transcriptional repressor  29.82 
 
 		 229 aa  71.6  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4115  galactonate operon transcriptional repressor  29.82 
 
 		 229 aa  71.6  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2122  GntR family transcriptional regulator  34.1 
 
 		 255 aa  71.2  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1852  GntR family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 238 aa  71.2  0.00000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2589  GntR family transcriptional regulator  29.36 
 
 		 233 aa  71.2  0.00000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0339999  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4204  galactonate operon transcriptional repressor  29.36 
 
 		 229 aa  71.2  0.00000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.763278  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1154  regulatory protein GntR HTH  29.3 
 
 		 241 aa  71.6  0.00000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.161045  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4164  galactonate operon transcriptional repressor  29.82 
 
 		 229 aa  71.6  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.935326  normal  0.912647 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1098  galactonate operon transcriptional repressor  29.36 
 
 		 229 aa  71.2  0.00000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3907  galactonate operon transcriptional repressor  29.36 
 
 		 229 aa  71.2  0.00000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03522  hypothetical protein  29.36 
 
 		 229 aa  71.2  0.00000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.700459  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1705  regulatory protein GntR HTH  32.16 
 
 		 256 aa  70.9  0.00000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0259893  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4519  GntR domain protein  30.77 
 
 		 240 aa  71.2  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1624  GntR domain-containing protein  33.13 
 
 		 238 aa  70.9  0.00000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.276308  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4079  DNA-binding transcriptional repressor LldR  32.95 
 
 		 258 aa  70.1  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0693  GntR family transcriptional regulator  30.81 
 
 		 218 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.362471  normal  0.707531 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3972  DNA-binding transcriptional repressor LldR  32.95 
 
 		 258 aa  69.7  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.773658 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4017  DNA-binding transcriptional repressor LldR  32.95 
 
 		 258 aa  70.1  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1996  GntR domain protein  33.13 
 
 		 250 aa  69.7  0.00000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.482445  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4031  GntR domain-containing protein  31.02 
 
 		 243 aa  69.3  0.00000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1260  GntR family transcriptional regulator  37.58 
 
 		 235 aa  68.9  0.00000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5539  regulatory protein GntR HTH  30.77 
 
 		 237 aa  68.9  0.00000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2304  GntR family transcriptional regulator  29.39 
 
 		 233 aa  68.9  0.00000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0306  FCD domain-containing protein  24.15 
 
 		 228 aa  68.9  0.00000000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.438434  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3757  GntR domain-containing protein  32.09 
 
 		 235 aa  68.9  0.00000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.560097  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3894  DNA-binding transcriptional repressor LldR  32.95 
 
 		 258 aa  68.6  0.00000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.659933 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1414  GntR domain-containing protein  29.41 
 
 		 250 aa  68.6  0.00000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.455285  normal  0.0932364 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0271  GntR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 236 aa  68.6  0.00000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3396  GntR family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 238 aa  68.6  0.0000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3910  DNA-binding transcriptional repressor LldR  33.52 
 
 		 258 aa  68.2  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3401  GntR domain-containing protein  33.19 
 
 		 235 aa  68.6  0.0000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4745  GntR domain-containing protein  31.79 
 
 		 249 aa  68.2  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00100625 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3599  GntR domain-containing protein  27.73 
 
 		 251 aa  68.2  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.83049  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3177  GntR family transcriptional regulator  31.98 
 
 		 251 aa  68.2  0.0000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3282  GntR family transcriptional regulator  30.22 
 
 		 261 aa  68.2  0.0000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1078  transcriptional regulatory DNA-binding transcription regulator protein  32.91 
 
 		 255 aa  67.8  0.0000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3321  GntR domain-containing protein  31.38 
 
 		 240 aa  67.4  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.580884  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0041  GntR domain-containing protein  27.86 
 
 		 252 aa  67.4  0.0000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.340559 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3646  putative transcriptional regulator  29.65 
 
 		 215 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.305132  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2815  GntR domain-containing protein  31.33 
 
 		 264 aa  67.4  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.336695  normal  0.311573 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4763  transcriptional regulator NanR  28.05 
 
 		 235 aa  67.8  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.436481  normal  0.284781 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2241  GntR domain protein  30.85 
 
 		 227 aa  67.4  0.0000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.328409 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0301  hypothetical protein  24.37 
 
 		 228 aa  67.8  0.0000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19650  transcriptional regulator, GntR family  31.98 
 
 		 221 aa  67.8  0.0000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.230789  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4648  transcriptional regulator NanR  28.51 
 
 		 234 aa  67.4  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.462339  normal  0.769273 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0561  GntR family transcriptional regulator  33.93 
 
 		 225 aa  67.4  0.0000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0131  DNA-binding transcriptional repressor LldR  31.82 
 
 		 257 aa  67.8  0.0000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0923  GntR domain protein  27.89 
 
 		 230 aa  66.6  0.0000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0612567  normal  0.0530485 
 
 
-
 
NC_004310  BR0560  GntR family transcriptional regulator  33.93 
 
 		 337 aa  66.6  0.0000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.925079  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3213  regulatory protein GntR HTH  26.41 
 
 		 248 aa  66.6  0.0000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4412  GntR domain protein  31.34 
 
 		 243 aa  66.6  0.0000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.99492 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4555  regulatory protein GntR HTH  32.63 
 
 		 265 aa  67  0.0000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1602  GntR domain protein  31.21 
 
 		 222 aa  67  0.0000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0885  GntR family transcriptional regulator  28.91 
 
 		 239 aa  66.6  0.0000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4780  regulatory protein GntR HTH  34.08 
 
 		 259 aa  66.6  0.0000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1641  GntR-like  33.33 
 
 		 256 aa  66.6  0.0000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.655901  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2218  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  33.33 
 
 		 255 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0409255  hitchhiker  0.007316 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2069  GntR domain-containing protein  36.24 
 
 		 225 aa  66.6  0.0000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.354488  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2789  GntR family transcriptional regulator  34.4 
 
 		 241 aa  66.2  0.0000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.061235 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1578  GntR domain protein  26.63 
 
 		 230 aa  66.6  0.0000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00244066  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1794  GntR domain protein  31.25 
 
 		 224 aa  66.6  0.0000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.126744  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4621  GntR domain protein  34.13 
 
 		 225 aa  66.2  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.471492  normal  0.10805 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05190  Transcriptional regulatory protein, GntR family  36.42 
 
 		 252 aa  66.2  0.0000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3306  GntR domain-containing protein  30.7 
 
 		 253 aa  66.2  0.0000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6253  GntR domain protein  31.31 
 
 		 256 aa  66.2  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.783578 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>