More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_0763 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_0763  transcriptional regulator, GntR family  100 
 
 		 242 aa  471  1e-132  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.747826  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5849  GntR family transcriptional regulator  69.58 
 
 		 241 aa  309  2.9999999999999997e-83  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.499759  normal  0.557144 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1287  GntR family transcriptional regulator  65.83 
 
 		 242 aa  305  5.0000000000000004e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4088  GntR family transcriptional regulator  68.6 
 
 		 242 aa  304  9.000000000000001e-82  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.199409  normal  0.0399057 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3824  GntR family transcriptional regulator  68.6 
 
 		 242 aa  301  6.000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.321657  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1317  GntR family transcriptional regulator  49.58 
 
 		 271 aa  218  1e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.193011  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4206  phophonate C-P lyase system transcriptional regulator PhnF, GntR family  50.42 
 
 		 249 aa  204  1e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0812  phophonate C-P lyase system transcriptional regulator PhnF, GntR family  46.35 
 
 		 240 aa  199  3e-50  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3858  GntR family transcriptional regulator  48.92 
 
 		 247 aa  197  9e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.21556  normal  0.95264 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2915  GntR family transcriptional regulator  49.17 
 
 		 249 aa  189  2e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4125  phophonate C-P lyase system transcriptional regulator PhnF, GntR family  43.83 
 
 		 245 aa  188  5.999999999999999e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2197  GntR family transcriptional regulator  42.55 
 
 		 256 aa  188  8e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.6507  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1100  GntR family transcriptional regulator  42.55 
 
 		 253 aa  186  3e-46  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1061  phosphonate metabolism transcriptional regulator PhnF  42.55 
 
 		 253 aa  186  3e-46  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.488956  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4439  phophonate C-P lyase system transcriptional regulator PhnF, GntR family  44.26 
 
 		 245 aa  176  3e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.879894 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4236  GntR family transcriptional regulator  44.26 
 
 		 243 aa  176  4e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.265926  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2399  GntR family transcriptional regulator  42.13 
 
 		 258 aa  174  8e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.720862  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2585  phosphonates metabolism transcriptional regulator PhnF  42.13 
 
 		 258 aa  174  8e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0315  phosphonates metabolism transcriptional regulator PhnF  42.13 
 
 		 258 aa  174  8e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1176  phosphonates metabolism transcriptional regulator PhnF  42.13 
 
 		 251 aa  174  8e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3357  phosphonates metabolism transcriptional regulator PhnF  42.13 
 
 		 272 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.568535  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3347  phosphonates metabolism transcriptional regulator PhnF  42.13 
 
 		 258 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.546924  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3313  phosphonates metabolism transcriptional regulator PhnF  42.13 
 
 		 258 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.906593  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2178  GntR family transcriptional regulator  40.43 
 
 		 252 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0464969 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5939  transcriptional regulator, GntR family  40 
 
 		 252 aa  171  1e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3772  GntR family transcriptional regulator  40 
 
 		 252 aa  170  2e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0266  phosphonates metabolism transcriptional regulator PhnF  40.43 
 
 		 245 aa  167  1e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0146  GntR family transcriptional regulator  39.27 
 
 		 252 aa  167  2e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4783  phosphonates metabolism transcriptional regulator PhnF  42.55 
 
 		 243 aa  164  2.0000000000000002e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.133972  normal  0.113518 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2856  GntR family transcriptional regulator  39.3 
 
 		 238 aa  155  7e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3704  GntR family transcriptional regulator  38.14 
 
 		 240 aa  150  2e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.317205 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4185  GntR family transcriptional regulator  38.63 
 
 		 249 aa  149  4e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.188072  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3327  GntR family transcriptional regulator  38.63 
 
 		 251 aa  148  7e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0767  GntR family transcriptional regulator  36.64 
 
 		 251 aa  147  1.0000000000000001e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4033  phosphonates metabolism transcriptional regulator PhnF  34.89 
 
 		 244 aa  133  3e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0213  phosphonates metabolism transcriptional regulator PhnF  34.89 
 
 		 244 aa  133  3e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6099  phophonate C-P lyase system transcriptional regulator PhnF, GntR family  35.34 
 
 		 260 aa  131  7.999999999999999e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2920  GntR family transcriptional regulator  37.24 
 
 		 245 aa  130  1.0000000000000001e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2925  phophonate C-P lyase system transcriptional regulator PhnF, GntR family  33.04 
 
 		 254 aa  123  3e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.608421  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0420  GntR family transcriptional regulator  33.76 
 
 		 238 aa  116  3.9999999999999997e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.330179  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0456  GntR family transcriptional regulator  33.76 
 
 		 238 aa  116  3.9999999999999997e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.598558  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2301  GntR family transcriptional regulator  34.18 
 
 		 242 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2215  transcriptional regulator, GntR family  30.34 
 
 		 247 aa  108  6e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3696  transcriptional regulator, GntR family protein  29.69 
 
 		 240 aa  107  2e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0968  GntR family transcriptional regulator  27.12 
 
 		 232 aa  106  3e-22  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0406  transcriptional regulator, GntR family  29.91 
 
 		 243 aa  105  6e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4120  GntR family transcriptional regulator  27.35 
 
 		 248 aa  102  5e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2752  GntR family transcriptional regulator  29.3 
 
 		 225 aa  102  5e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.792581  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3963  GntR family transcriptional regulator  27.35 
 
 		 243 aa  102  6e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.691414  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3794  GntR family transcriptional regulator  27.35 
 
 		 243 aa  102  6e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3809  GntR family transcriptional regulator  27.35 
 
 		 243 aa  102  6e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.467203  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3882  GntR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 243 aa  102  6e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.207693  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4272  GntR family transcriptional regulator  27.35 
 
 		 243 aa  102  6e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5874  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  31.36 
 
 		 245 aa  101  1e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.166435  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1664  GntR family transcriptional regulator  33.89 
 
 		 240 aa  101  1e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00697714  normal  0.132461 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2287  transcriptional regulator, GntR family  29.48 
 
 		 250 aa  100  2e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1934  transcriptional regulator, GntR family  29.48 
 
 		 250 aa  100  2e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.127514  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2634  GntR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 245 aa  99  6e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.900483  normal  0.864303 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2575  phophonate C-P lyase system transcriptional regulator PhnF, GntR family  30.04 
 
 		 243 aa  98.6  7e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34690  transcriptional regulator, GntR family  33.97 
 
 		 244 aa  98.6  8e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0368161  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2078  GntR family transcriptional regulator  26.07 
 
 		 243 aa  98.6  9e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4032  phosphonate metabolism transcriptional regulator PhnF  30.93 
 
 		 241 aa  97.4  2e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3693  phosphonate metabolism transcriptional regulator PhnF  30.93 
 
 		 241 aa  96.7  3e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.189097  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2695  phosphonate metabolism transcriptional regulator PhnF  32.64 
 
 		 239 aa  96.7  3e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0913  transcription regulator GntR family  26.69 
 
 		 232 aa  96.7  3e-19  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0175976  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3559  phosphonate metabolism transcriptional regulator PhnF  30.41 
 
 		 241 aa  95.5  6e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0522  phosphonate metabolism transcriptional regulator PhnF  29.81 
 
 		 242 aa  95.5  7e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.498003  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2586  transcriptional regulator, GntR family  33.05 
 
 		 241 aa  94  2e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0886  phosphonate metabolism transcriptional regulator PhnF  28.57 
 
 		 238 aa  92.4  6e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4060  transcriptional regulator, GntR family  29.61 
 
 		 245 aa  92  7e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.533333 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0306  phosphonate metabolism transcriptional regulator PhnF  27.71 
 
 		 241 aa  90.9  2e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.275672  normal  0.118863 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3786  transcriptional regulator, GntR family  26.05 
 
 		 255 aa  89.7  3e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2009  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  28.99 
 
 		 246 aa  90.1  3e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.378179  normal  0.0458399 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0114  transcriptional regulator  36.73 
 
 		 239 aa  90.1  3e-17  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.19312e-17 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1740  GntR family transcriptional regulator  25.94 
 
 		 232 aa  90.1  3e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.40989  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3837  transcriptional regulator, GntR family  26.05 
 
 		 255 aa  89.7  3e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.10255  normal  0.78635 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000412  transcriptional regulator of succinyl CoA synthetase operon  27.4 
 
 		 235 aa  89.7  4e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5461  GntR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 236 aa  89.4  4e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2475  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  32.79 
 
 		 255 aa  89.7  4e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.505105  normal  0.226466 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1526  GntR family transcriptional regulator  26.52 
 
 		 235 aa  89.7  4e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.059282  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2619  transcriptional regulator, GntR family  32.44 
 
 		 252 aa  89.4  5e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0913  GntR family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 241 aa  89  6e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0856  GntR family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 241 aa  89  6e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.333354  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1632  GntR family transcriptional regulator  25.94 
 
 		 232 aa  88.6  8e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.367647  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1647  GntR family transcriptional regulator  30.96 
 
 		 251 aa  88.6  9e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.771403 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4343  phosphonate metabolism transcriptional regulator PhnF  28.39 
 
 		 241 aa  88.6  9e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03974  predicted DNA-binding transcriptional regulator of phosphonate uptake and biodegradation  28.81 
 
 		 241 aa  88.2  1e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3889  phophonate C-P lyase system transcriptional regulator PhnF, GntR family  28.81 
 
 		 241 aa  88.2  1e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1179  GntR family transcriptional regulator  28.33 
 
 		 244 aa  88.2  1e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.330166  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1621  GntR family transcriptional regulator  26.05 
 
 		 239 aa  87.8  1e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00823964  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08770  transcriptional regulator, GntR family  27.27 
 
 		 244 aa  88.2  1e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000139729  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03934  hypothetical protein  28.81 
 
 		 241 aa  88.2  1e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7722  transcriptional regulator, GntR family  32.06 
 
 		 269 aa  87.8  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3924  phosphonate metabolism transcriptional regulator PhnF  28.81 
 
 		 241 aa  88.2  1e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4656  phosphonate metabolism transcriptional regulator PhnF  28.81 
 
 		 241 aa  88.2  1e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5615  phosphonate metabolism transcriptional regulator PhnF  28.39 
 
 		 241 aa  87.8  1e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0239  transcriptional regulator, GntR family  28.87 
 
 		 242 aa  87  2e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1419  GntR family transcriptional regulator  30.42 
 
 		 247 aa  87  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1330  transcriptional regulator, GntR family  24 
 
 		 240 aa  87.4  2e-16  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0283  GntR family transcriptional regulator  25 
 
 		 233 aa  86.7  3e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.696412  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>