More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BcerKBAB4_0496 on replicon NC_010184
Organism: Bacillus weihenstephanensis KBAB4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003909  BCE_0646  GntR family transcriptional regulator  82.62 
 
 
473 aa  808    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0551  GntR family transcriptional regulator  83.26 
 
 
466 aa  819    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0493  GntR family transcriptional regulator  82.19 
 
 
466 aa  810    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.393759  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0495  GntR family transcriptional regulator  82.62 
 
 
466 aa  809    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4719  transcriptional regulator, GntR family  84.55 
 
 
466 aa  830    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0638  transcriptional regulator, GntR family  81.76 
 
 
466 aa  806    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0582  GntR family transcriptional regulator  83.26 
 
 
466 aa  819    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.915495  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0496  transcriptional regulator  100 
 
 
466 aa  960    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0708  transcriptional regulator, GntR family  83.05 
 
 
466 aa  812    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0620  transcriptional regulator, GntR family  84.12 
 
 
466 aa  826    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2769  transcriptional regulator  45.97 
 
 
463 aa  429  1e-119  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1937  GntR family transcriptional regulator  46.11 
 
 
466 aa  412  1e-114  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1567  GntR family transcriptional regulator  46.2 
 
 
473 aa  409  1e-113  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2170  GntR family transcriptional regulator  46.27 
 
 
466 aa  408  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.662886  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1938  GntR family transcriptional regulator  45.11 
 
 
466 aa  403  1e-111  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.363116  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2085  GntR family transcriptional regulator  45.11 
 
 
466 aa  403  1e-111  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.249037  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1890  GntR family transcriptional regulator  45.42 
 
 
466 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0766739  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2116  transcriptional regulator, GntR family  45.11 
 
 
466 aa  402  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2184  transcriptional regulator, GntR family  45.45 
 
 
466 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1900  GntR family transcriptional regulator  45.63 
 
 
466 aa  398  1e-109  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000823779  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3230  transcriptional regulator, GntR family  44.85 
 
 
471 aa  395  1e-109  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.539443 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2075  transcriptional regulator, GntR family  45.06 
 
 
471 aa  397  1e-109  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1952  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  41.42 
 
 
465 aa  382  1e-105  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00720437  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0090  aminotransferase, MocR-like  41.01 
 
 
463 aa  353  2.9999999999999997e-96  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2363  GntR family transcriptional regulator  41.81 
 
 
459 aa  353  4e-96  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0222  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  38.96 
 
 
464 aa  347  3e-94  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1162  transcriptional regulator, GntR family  39.32 
 
 
479 aa  344  2e-93  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00200277  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3005  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  35.98 
 
 
486 aa  342  1e-92  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3060  putative transcriptional regulator, GntR family  40.31 
 
 
464 aa  340  2.9999999999999998e-92  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0205  transcriptional regulator, GntR family  39.39 
 
 
463 aa  337  2.9999999999999997e-91  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000146418 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0077  GntR family transcriptional regulator  36.74 
 
 
484 aa  336  3.9999999999999995e-91  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.994833  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0157  GntR family transcriptional regulator  38.5 
 
 
454 aa  333  3e-90  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.790011  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1297  GntR family transcriptional regulator  37.77 
 
 
480 aa  332  7.000000000000001e-90  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1076  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  38.7 
 
 
472 aa  321  1.9999999999999998e-86  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000690216  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0554  regulatory protein GntR HTH  36.64 
 
 
460 aa  311  1e-83  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0540  GntR family transcriptional regulator  36.64 
 
 
460 aa  311  1e-83  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1933  GntR family transcriptional regulator  35.05 
 
 
490 aa  304  3.0000000000000004e-81  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.100433  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2327  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  36.54 
 
 
474 aa  300  5e-80  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07570  transcriptional regulator with HTH domain and aminotransferase domain  34.44 
 
 
491 aa  291  2e-77  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.716498  normal  0.392489 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5633  GntR family transcriptional regulator  31.67 
 
 
517 aa  289  8e-77  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000615538  normal  0.236104 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0989  transcriptional regulator  35.85 
 
 
473 aa  288  1e-76  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0129526  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5504  transcriptional regulator, GntR family  31.82 
 
 
520 aa  287  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2022  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  30.99 
 
 
593 aa  287  2.9999999999999996e-76  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5251  GntR family transcriptional regulator  33.47 
 
 
509 aa  286  4e-76  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.519291 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5342  GntR family transcriptional regulator  33.27 
 
 
509 aa  285  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  unclonable  0.000000722465 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3365  transcriptional regulator  33.06 
 
 
503 aa  283  5.000000000000001e-75  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.987625  normal  0.688219 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5117  transcriptional regulator  32.93 
 
 
508 aa  282  1e-74  Pseudomonas putida W619  Bacteria  unclonable  0.0000000208159  normal  0.0731219 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5391  transcriptional regulator  32.8 
 
 
509 aa  281  1e-74  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.253395  normal  0.0145041 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0136  GntR family transcriptional regulator  31.6 
 
 
496 aa  281  2e-74  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5240  transcriptional regulator  33.26 
 
 
502 aa  281  2e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0281  GntR family transcriptional regulator  33.2 
 
 
503 aa  280  3e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4710  GntR family transcriptional regulator  33.06 
 
 
502 aa  280  4e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.991475  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0130  GntR family transcriptional regulator  31.69 
 
 
490 aa  279  1e-73  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4910  transcriptional regulator  32.85 
 
 
502 aa  278  2e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3006  GntR family transcriptional regulator  32.85 
 
 
502 aa  278  2e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5360  GntR family transcriptional regulator  32.85 
 
 
502 aa  278  2e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.881059  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4852  transcriptional regulator  32.85 
 
 
523 aa  274  3e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.791352 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5056  regulatory protein, GntR  31.5 
 
 
520 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.0000152055  normal  0.949132 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4520  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  31.61 
 
 
501 aa  269  5.9999999999999995e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0835  GntR family transcriptional regulator  31.21 
 
 
501 aa  270  5.9999999999999995e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.255171 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4619  transcriptional regulator  30.82 
 
 
520 aa  269  1e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.232866 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2172  GntR family transcriptional regulator  31.91 
 
 
477 aa  268  1e-70  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2171  GntR family transcriptional regulator  31.03 
 
 
507 aa  267  4e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.164401  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0569  transcriptional regulator  34.62 
 
 
499 aa  265  8.999999999999999e-70  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0345  transcriptional regulator, GntR family  33.04 
 
 
470 aa  265  2e-69  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.469578  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1478.1  GntR family transcriptional regulator  31.03 
 
 
546 aa  264  2e-69  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0495  transcriptional regulator  31.03 
 
 
561 aa  264  2e-69  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.885427  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18480  transcriptional regulator with HTH domain and aminotransferase domain  32.24 
 
 
488 aa  265  2e-69  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.423474  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2128  GntR family transcriptional regulator  31.03 
 
 
564 aa  264  2e-69  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.203472  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0811  GntR family transcriptional regulator  31.03 
 
 
564 aa  264  2e-69  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.482303  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2364  GntR family transcriptional regulator  30.8 
 
 
506 aa  264  3e-69  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0684851  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2224  transcriptional regulator  33.76 
 
 
510 aa  264  3e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0182275 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0817  GntR family transcriptional regulator  30.8 
 
 
506 aa  264  3e-69  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.389843  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4666  transcriptional regulator  30.63 
 
 
511 aa  264  3e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4307  transcriptional regulator  33.62 
 
 
488 aa  264  3e-69  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0430  GntR family transcriptional regulator  31.04 
 
 
506 aa  263  4e-69  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1809  GntR family transcriptional regulator  31.04 
 
 
506 aa  263  4e-69  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2503  GntR family transcriptional regulator  31.04 
 
 
506 aa  263  4e-69  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0480  GntR family transcriptional regulator  31.04 
 
 
509 aa  263  4e-69  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.320093  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3811  transcriptional regulator  31.3 
 
 
507 aa  263  6.999999999999999e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3295  GntR family transcriptional regulator  31.3 
 
 
507 aa  262  8e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.761418 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1609  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
569 aa  262  1e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0318445  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0937  GntR family transcriptional regulator  32.4 
 
 
486 aa  261  2e-68  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2118  GntR family transcriptional regulator  31.38 
 
 
562 aa  261  2e-68  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0506592  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71680  GntR family transcriptional regulator  32.78 
 
 
491 aa  261  2e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3610  transcriptional regulator  30.75 
 
 
507 aa  260  3e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.530067  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4449  GntR family transcriptional regulator  30.75 
 
 
507 aa  260  3e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3917  GntR family transcriptional regulator  30.75 
 
 
507 aa  260  3e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4320  transcriptional regulator  30.5 
 
 
521 aa  260  5.0000000000000005e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.268323 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0641  GntR family transcriptional regulator  30.4 
 
 
506 aa  259  6e-68  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.371693  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0801  regulatory protein GntR, HTH  31.95 
 
 
508 aa  259  9e-68  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0129569  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6219  putative transcriptional regulator  32.15 
 
 
491 aa  256  4e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0989  GntR family transcriptional regulator  31.25 
 
 
485 aa  256  6e-67  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0397  transcriptional regulator  31.03 
 
 
564 aa  256  8e-67  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.493491  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1824  GntR family transcriptional regulator  31.03 
 
 
564 aa  256  8e-67  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3352  GntR family transcriptional regulator  31.18 
 
 
485 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1334  transcriptional regulator  33.99 
 
 
501 aa  254  2.0000000000000002e-66  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3858  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  32.16 
 
 
491 aa  254  3e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2546  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  34.56 
 
 
497 aa  254  3e-66  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.474867  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1217  GntR family transcriptional regulator  33.99 
 
 
501 aa  254  3e-66  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>