More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_0896 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_0896  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 208 aa  415  9.999999999999999e-116  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.22169  normal  0.286804 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14240  ADP-ribose pyrophosphatase  49.14 
 
 		 182 aa  167  8e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.336684  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0341  NUDIX hydrolase  50 
 
 		 186 aa  164  5.9999999999999996e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.849135  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2439  NUDIX hydrolase  51.15 
 
 		 181 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000635517  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0703  putative ADP-ribose pyrophosphatase  46.78 
 
 		 186 aa  163  2.0000000000000002e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.6378 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1278  NUDIX hydrolase  50.28 
 
 		 185 aa  161  6e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4804  NUDIX hydrolase  48.02 
 
 		 188 aa  159  4e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.483514 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2153  NUDIX hydrolase  47.65 
 
 		 176 aa  155  4e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.399297 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1579  NUDIX hydrolase  46.24 
 
 		 172 aa  151  7e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.904804  normal  0.0162238 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4483  NUDIX hydrolase  41.14 
 
 		 176 aa  115  3e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0724  NUDIX hydrolase  26.51 
 
 		 169 aa  85.1  7e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.983328  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2474  MutT/nudix family protein  31.64 
 
 		 182 aa  85.1  7e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.131904  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1694  NUDIX hydrolase  29.45 
 
 		 177 aa  81.6  0.000000000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.204755  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0597  NUDIX hydrolase  30.25 
 
 		 184 aa  81.6  0.000000000000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1901  NUDIX hydrolase  26.47 
 
 		 178 aa  81.3  0.00000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1716  NUDIX hydrolase  28.48 
 
 		 171 aa  81.3  0.00000000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0743315 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2209  NUDIX hydrolase  32.95 
 
 		 184 aa  80.1  0.00000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.022301  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2794  NUDIX hydrolase  32.95 
 
 		 181 aa  79.7  0.00000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4063  NUDIX hydrolase  30.86 
 
 		 228 aa  79.3  0.00000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0818284  normal  0.284545 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0745  NUDIX hydrolase  31.97 
 
 		 175 aa  78.6  0.00000000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0447  NUDIX hydrolase  34.16 
 
 		 180 aa  78.2  0.00000000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2896  NUDIX hydrolase  28.57 
 
 		 166 aa  77.4  0.0000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1886  NUDIX hydrolase  37.5 
 
 		 172 aa  76.3  0.0000000000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.556059 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1638  NUDIX hydrolase  29.52 
 
 		 179 aa  75.5  0.0000000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0414  NTP pyrophosphohydrolase  31.9 
 
 		 171 aa  72.8  0.000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.136585  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1673  NUDIX hydrolase  29.59 
 
 		 175 aa  72.4  0.000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00542994 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1325  NUDIX hydrolase  32.52 
 
 		 177 aa  72.4  0.000000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1504  NUDIX hydrolase  27.33 
 
 		 178 aa  72  0.000000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06830  ADP-ribose pyrophosphatase  29.27 
 
 		 176 aa  72  0.000000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2029  NUDIX hydrolase  30.46 
 
 		 184 aa  71.2  0.00000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.40025  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3624  NUDIX hydrolase  31.29 
 
 		 173 aa  71.2  0.00000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3558  NUDIX hydrolase  31.29 
 
 		 173 aa  70.9  0.00000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1552  NUDIX hydrolase  27.27 
 
 		 179 aa  70.9  0.00000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2822  NUDIX hydrolase  30.34 
 
 		 210 aa  70.1  0.00000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.38785  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2826  pyrophosphohydrolase related protein  28.49 
 
 		 192 aa  70.5  0.00000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2928  NUDIX hydrolase  27.43 
 
 		 189 aa  70.1  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0471  NUDIX hydrolase  27.47 
 
 		 184 aa  70.1  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.115783  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0333  MutT/nudix family protein  30.41 
 
 		 189 aa  69.7  0.00000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0452702  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15030  NTP pyrophosphohydrolase  34.32 
 
 		 181 aa  69.7  0.00000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.202896  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1026  NUDIX hydrolase  25.15 
 
 		 183 aa  69.7  0.00000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1342  NUDIX hydrolase  26.09 
 
 		 183 aa  69.3  0.00000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000039196  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1066  NUDIX hydrolase  30.11 
 
 		 201 aa  68.6  0.00000000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.133388  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1429  NUDIX hydrolase  36.36 
 
 		 176 aa  68.6  0.00000000007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.742876  normal  0.0486947 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1024  NUDIX hydrolase  29.45 
 
 		 180 aa  67.8  0.0000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00585419  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1062  MutT/nudix family protein  28.92 
 
 		 180 aa  67.8  0.0000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.20499  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13740  NTP pyrophosphohydrolase  31.44 
 
 		 215 aa  67.8  0.0000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3753  NUDIX hydrolase  28.9 
 
 		 206 aa  67.4  0.0000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.641661  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2211  NUDIX hydrolase  31.4 
 
 		 164 aa  67.8  0.0000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0819  NUDIX hydrolase  30.97 
 
 		 180 aa  66.6  0.0000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2771  NUDIX hydrolase  26.11 
 
 		 192 aa  66.6  0.0000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0674  NUDIX hydrolase  25.45 
 
 		 182 aa  66.6  0.0000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0138639  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1556  NUDIX hydrolase  26.06 
 
 		 180 aa  66.6  0.0000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1921  NUDIX hydrolase  31.1 
 
 		 201 aa  66.6  0.0000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.137486 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0970  NUDIX hydrolase  36.89 
 
 		 220 aa  66.6  0.0000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0227  NUDIX hydrolase  32.76 
 
 		 185 aa  66.6  0.0000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.282406  normal  0.264577 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0271  NUDIX hydrolase  29.14 
 
 		 180 aa  66.6  0.0000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.443042  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1587  NUDIX hydrolase  26.06 
 
 		 180 aa  66.6  0.0000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.356936  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1905  NUDIX hydrolase  27.33 
 
 		 179 aa  65.1  0.0000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000619655  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1912  NUDIX hydrolase  30.72 
 
 		 201 aa  65.5  0.0000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.255381  hitchhiker  0.000304952 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2429  NUDIX hydrolase  25.71 
 
 		 182 aa  65.1  0.0000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0417103 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1779  adp-ribose pyrophosphatase  25 
 
 		 176 aa  65.1  0.0000000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0830  NUDIX hydrolase  31.03 
 
 		 177 aa  65.1  0.0000000008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.66661  normal  0.255619 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1808  NUDIX hydrolase  34.92 
 
 		 193 aa  64.7  0.0000000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.801107  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0027  NUDIX hydrolase  29.59 
 
 		 281 aa  64.3  0.000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.130084  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2512  NUDIX hydrolase  26.99 
 
 		 172 aa  64.3  0.000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.335914  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0362  NUDIX hydrolase  26.54 
 
 		 186 aa  64.3  0.000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_398  MutT/nudix, ADP-ribose pyrophosphatase  30.59 
 
 		 176 aa  64.3  0.000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.148699  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4146  NUDIX hydrolase  29.61 
 
 		 180 aa  63.9  0.000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1344  hypothetical protein  28.08 
 
 		 265 aa  63.5  0.000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.321071  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0285  NUDIX hydrolase  36.21 
 
 		 164 aa  63.9  0.000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.1016 
 
 
-
 
NC_002936  DET0456  MutT/nudix family protein  28.74 
 
 		 176 aa  63.2  0.000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0404799  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0213  NUDIX hydrolase  25.86 
 
 		 178 aa  63.2  0.000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0378357  normal  0.391369 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0157  NUDIX hydrolase  30.95 
 
 		 180 aa  63.2  0.000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0179624  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0603  NUDIX hydrolase  29.19 
 
 		 188 aa  62.4  0.000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0913378  normal  0.29293 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1336  NUDIX hydrolase  33.9 
 
 		 171 aa  62.4  0.000000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.723792 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3049  NUDIX hydrolase  26.26 
 
 		 182 aa  62.4  0.000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2486  NUDIX hydrolase  32.33 
 
 		 193 aa  62.4  0.000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.253943  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2263  NUDIX hydrolase  23.98 
 
 		 186 aa  62  0.000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2793  NUDIX hydrolase  25.77 
 
 		 179 aa  62  0.000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3582  NUDIX hydrolase  27.68 
 
 		 205 aa  62  0.000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0705  MutT/nudix family protein  29.11 
 
 		 185 aa  61.2  0.000000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1200  hypothetical protein  30.33 
 
 		 207 aa  61.2  0.00000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.552549  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8603  transcriptional regulator, GntR family  27.84 
 
 		 268 aa  60.8  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.195942  normal  0.233283 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4204  mutT/nudix family protein  26.16 
 
 		 179 aa  60.8  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.365752  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2078  NUDIX family hydrolase  29.41 
 
 		 194 aa  60.8  0.00000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1033  mutT/nudix family protein  26.16 
 
 		 179 aa  60.8  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.851694  normal  0.721154 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0219  NUDIX hydrolase  25.57 
 
 		 184 aa  61.2  0.00000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.772066 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1488  NUDIX hydrolase  32.82 
 
 		 212 aa  60.5  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.587819  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1754  NUDIX hydrolase  28.39 
 
 		 175 aa  60.5  0.00000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2065  NUDIX family hydrolase  23.64 
 
 		 176 aa  60.1  0.00000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.862102  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1133  NUDIX hydrolase  32.85 
 
 		 225 aa  60.1  0.00000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3925  NUDIX hydrolase  25.58 
 
 		 179 aa  59.7  0.00000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.161416  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5410  NUDIX hydrolase  31.94 
 
 		 208 aa  59.7  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.999676 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1662  NUDIX hydrolase  28.65 
 
 		 201 aa  59.7  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3282  NUDIX hydrolase  27.84 
 
 		 211 aa  59.7  0.00000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1124  NUDIX hydrolase  26.95 
 
 		 195 aa  59.3  0.00000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00244763 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1194  NUDIX family hydrolase  25.15 
 
 		 187 aa  59.3  0.00000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3837  ADP-ribose diphosphatase  28.91 
 
 		 179 aa  58.9  0.00000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3851  ADP-ribose diphosphatase  28.91 
 
 		 179 aa  58.9  0.00000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2090  NUDIX hydrolase  36.63 
 
 		 141 aa  58.9  0.00000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.147471  normal  0.280778 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>