More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B2090 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B2090  NUDIX hydrolase  100 
 
 
141 aa  294  3e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.147471  normal  0.280778 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4001  NUDIX hydrolase  85.71 
 
 
141 aa  250  4.0000000000000004e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.543097  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4365  NUDIX hydrolase  85.71 
 
 
141 aa  250  4.0000000000000004e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3522  NUDIX hydrolase  85 
 
 
141 aa  248  2e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.478841 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3407  NUDIX hydrolase  83.57 
 
 
140 aa  248  3e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.107532 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3914  NUDIX hydrolase  82.14 
 
 
140 aa  244  4e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.434564 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4812  NUDIX hydrolase  61.21 
 
 
140 aa  157  5e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.5658 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1638  NUDIX hydrolase  57.14 
 
 
140 aa  155  2e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0477053 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1184  NUDIX hydrolase  57.14 
 
 
140 aa  155  2e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1664  NUDIX hydrolase  57.14 
 
 
140 aa  155  2e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.731684  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1582  NUDIX hydrolase  53.44 
 
 
142 aa  154  4e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.4234  normal  0.299083 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1563  NUDIX hydrolase  55.56 
 
 
142 aa  154  5.0000000000000005e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1577  NUDIX hydrolase  60.18 
 
 
137 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.479976  normal  0.0612307 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5518  NUDIX hydrolase  50 
 
 
183 aa  123  9e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.434768 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1264  putative MutT/Nudix family protein  53.78 
 
 
132 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0696899 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1837  MutT/NUDIX family hydrolase  51.26 
 
 
158 aa  118  3e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.158104  normal  0.782631 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6546  NUDIX hydrolase  48.12 
 
 
185 aa  114  3e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.293619  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1285  NUDIX hydrolase  48.12 
 
 
185 aa  114  3e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.270966  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2944  NUDIX hydrolase  46.61 
 
 
140 aa  114  3.9999999999999997e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.948773 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5852  NUDIX hydrolase  46.61 
 
 
122 aa  114  3.9999999999999997e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6153  NUDIX hydrolase  47.37 
 
 
185 aa  113  8.999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.292779 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4233  NUDIX hydrolase  45.76 
 
 
135 aa  107  5e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.257262  normal  0.463125 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2696  mutT/nudix family protein  47.37 
 
 
128 aa  105  2e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0531307  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5170  NUDIX hydrolase  43.97 
 
 
124 aa  103  7e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.140908  normal  0.555587 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6007  NUDIX hydrolase  41.03 
 
 
165 aa  102  2e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2430  NUDIX hydrolase  48.25 
 
 
132 aa  101  3e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.709971  normal  0.0238883 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2082  NUDIX hydrolase  43.97 
 
 
146 aa  99.8  1e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.494024 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4759  NUDIX hydrolase  46.43 
 
 
203 aa  97.8  5e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.420324 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4397  NUDIX hydrolase  40 
 
 
126 aa  94.7  4e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0874525  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2939  NUDIX hydrolase  42.06 
 
 
130 aa  93.2  1e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3290  NUDIX hydrolase  42.48 
 
 
120 aa  92.8  1e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2492  NUDIX hydrolase  41.44 
 
 
132 aa  89  2e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3268  MutT/nudix family protein  40.54 
 
 
132 aa  88.2  4e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5533  NUDIX hydrolase  40.95 
 
 
147 aa  87  8e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00579175 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3967  MutT/nudix family protein  44.21 
 
 
146 aa  79.3  0.00000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.447658  normal  0.0696331 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0401  hydrolase NUDIX family domain-containing protein  41.82 
 
 
758 aa  77  0.00000000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.932196  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1428  NUDIX hydrolase  37.01 
 
 
170 aa  63.9  0.0000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.516023  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1197  NUDIX hydrolase  31.75 
 
 
216 aa  60.8  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0094  hypothetical protein  39.73 
 
 
132 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1191  NUDIX hydrolase  33.64 
 
 
211 aa  57.8  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4483  NUDIX hydrolase  39.78 
 
 
153 aa  57.4  0.00000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1768  NUDIX hydrolase  28.8 
 
 
136 aa  56.6  0.0000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1656  NUDIX hydrolase  32.77 
 
 
152 aa  56.6  0.0000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.632067  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6695  NUDIX hydrolase  39.58 
 
 
175 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.412462  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0783  NUDIX hydrolase  29.91 
 
 
139 aa  56.6  0.0000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0156175  normal  0.134596 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3328  NUDIX hydrolase  34.45 
 
 
160 aa  55.8  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.672481  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4130  mutT/nudix family protein  29.37 
 
 
149 aa  54.7  0.0000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000966346  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1347  NUDIX hydrolase  34.65 
 
 
269 aa  55.1  0.0000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000244652 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3219  NUDIX hydrolase  35.4 
 
 
149 aa  54.7  0.0000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.223702  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1108  mutT/nudix family protein  29.37 
 
 
149 aa  53.9  0.0000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.979518  normal  0.39926 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2976  NUDIX hydrolase  41.03 
 
 
106 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.505456  normal  0.467098 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2529  NUDIX hydrolase  32.8 
 
 
143 aa  53.5  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.412332  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0433  NUDIX hydrolase  30.56 
 
 
140 aa  53.1  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.942987  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4077  mutT/nudix family protein  27.78 
 
 
185 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.811281  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4044  mutT/nudix family protein  27.78 
 
 
149 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8260  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
303 aa  52.8  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7346  hypothetical protein  31.29 
 
 
173 aa  52.8  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3766  MutT/Nudix family protein  27.78 
 
 
161 aa  52.4  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3781  MutT/Nudix family protein  27.78 
 
 
161 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0710  NUDIX hydrolase  35.29 
 
 
154 aa  52.4  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.409696 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1059  NUDIX hydrolase  34.86 
 
 
195 aa  52.4  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0110  NUDIX hydrolase  36.44 
 
 
136 aa  52  0.000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4151  mutT/nudix family protein  27.78 
 
 
149 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0315306  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1523  NUDIX hydrolase  30.83 
 
 
158 aa  52  0.000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3933  mutT/nudix family protein  27.78 
 
 
161 aa  52  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4241  mutT/nudix family protein  27.78 
 
 
161 aa  52  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.602945  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7559  NUDIX hydrolase  35.71 
 
 
237 aa  51.6  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5080  NUDIX hydrolase  29.31 
 
 
158 aa  52  0.000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.498453  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3707  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
150 aa  51.6  0.000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000425242  hitchhiker  0.000000974348 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0011  NUDIX hydrolase  35.24 
 
 
144 aa  51.2  0.000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.695589  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0105  NUDIX hydrolase  34.91 
 
 
154 aa  51.2  0.000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3853  NUDIX hydrolase  27.78 
 
 
149 aa  51.2  0.000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.785148  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0604  NUDIX hydrolase  41.86 
 
 
187 aa  51.2  0.000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0701215  normal  0.289612 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6207  putative NUDIX hydrolase  31.73 
 
 
322 aa  51.2  0.000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.109267  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1690  NUDIX hydrolase  32.52 
 
 
184 aa  50.8  0.000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000764223 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7955  hypothetical protein  32.33 
 
 
172 aa  50.8  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14240  ADP-ribose pyrophosphatase  35.8 
 
 
182 aa  50.1  0.000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.336684  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0341  NUDIX hydrolase  29.69 
 
 
186 aa  50.4  0.000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.849135  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2439  NUDIX hydrolase  37.65 
 
 
181 aa  49.7  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000635517  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2116  NUDIX hydrolase  29.41 
 
 
136 aa  50.1  0.00001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2616  NUDIX hydrolase  31.16 
 
 
146 aa  49.7  0.00001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2004  NUDIX hydrolase  30.77 
 
 
162 aa  49.7  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2285  NUDIX hydrolase  45.76 
 
 
178 aa  49.3  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5398  NUDIX hydrolase  30.61 
 
 
151 aa  49.3  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2057  NUDIX hydrolase  41.94 
 
 
168 aa  49.3  0.00002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000169928  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2072  NUDIX hydrolase  33.94 
 
 
281 aa  48.9  0.00002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.453494  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1218  NUDIX hydrolase  31.34 
 
 
194 aa  49.3  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.843116 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4942  mutT/nudix family protein  40 
 
 
159 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0672  MutT/nudix family protein  26.77 
 
 
147 aa  48.5  0.00003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.959271  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4683  mutT/nudix family protein  40 
 
 
159 aa  48.5  0.00003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4522  MutT family pyrophosphohydrolase  40 
 
 
159 aa  48.5  0.00003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.986145  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0330  antimutator 8-oxo-(dGTP/GTP)ase  40 
 
 
159 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4541  MutT/NUDIX family pyrophosphohydrolase  40 
 
 
159 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0666  MutT/nudix family protein  27.56 
 
 
147 aa  48.5  0.00003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.613905  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4620  nucleoside triphosphatase YtkD  40 
 
 
159 aa  48.5  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4907  antimutator 8-oxo-(dGTP/GTP)ase  40 
 
 
159 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5043  mutT/nudix family protein  40 
 
 
159 aa  48.5  0.00003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.672649  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14570  ADP-ribose pyrophosphatase  35 
 
 
180 aa  48.9  0.00003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0320056  normal  0.156017 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4567  NUDIX hydrolase  29.51 
 
 
158 aa  48.5  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.790014  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4908  antimutator 8-oxo-(dGTP/GTP)ase  40 
 
 
159 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>