More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_2976 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_2976  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 106 aa  216  6e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.505456  normal  0.467098 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2939  NUDIX hydrolase  79.81 
 
 		 130 aa  172  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2696  mutT/nudix family protein  48.72 
 
 		 128 aa  80.9  0.000000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0531307  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3522  NUDIX hydrolase  37.86 
 
 		 141 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.478841 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3914  NUDIX hydrolase  42.31 
 
 		 140 aa  74.3  0.0000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.434564 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4365  NUDIX hydrolase  37.86 
 
 		 141 aa  73.9  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4001  NUDIX hydrolase  37.86 
 
 		 141 aa  73.9  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.543097  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3407  NUDIX hydrolase  42.31 
 
 		 140 aa  73.9  0.0000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.107532 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2430  NUDIX hydrolase  48.19 
 
 		 132 aa  72  0.000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.709971  normal  0.0238883 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3290  NUDIX hydrolase  42.31 
 
 		 120 aa  70.9  0.000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2090  NUDIX hydrolase  35.92 
 
 		 141 aa  67  0.00000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.147471  normal  0.280778 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5518  NUDIX hydrolase  37.97 
 
 		 183 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.434768 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1638  NUDIX hydrolase  39.74 
 
 		 140 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0477053 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1184  NUDIX hydrolase  39.74 
 
 		 140 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1664  NUDIX hydrolase  39.74 
 
 		 140 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.731684  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4812  NUDIX hydrolase  39.74 
 
 		 140 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.5658 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2082  NUDIX hydrolase  38.46 
 
 		 146 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.494024 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4759  NUDIX hydrolase  33.96 
 
 		 203 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.420324 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2492  NUDIX hydrolase  38.96 
 
 		 132 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1582  NUDIX hydrolase  38.46 
 
 		 142 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.4234  normal  0.299083 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1563  NUDIX hydrolase  38.46 
 
 		 142 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1577  NUDIX hydrolase  38.46 
 
 		 137 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.479976  normal  0.0612307 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3268  MutT/nudix family protein  37.66 
 
 		 132 aa  61.2  0.000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5533  NUDIX hydrolase  38.46 
 
 		 147 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00579175 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6153  NUDIX hydrolase  35.44 
 
 		 185 aa  60.5  0.000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.292779 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1837  MutT/NUDIX family hydrolase  35.06 
 
 		 158 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.158104  normal  0.782631 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5852  NUDIX hydrolase  36.71 
 
 		 122 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1285  NUDIX hydrolase  34.18 
 
 		 185 aa  57.8  0.00000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.270966  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6546  NUDIX hydrolase  34.18 
 
 		 185 aa  57.8  0.00000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.293619  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6007  NUDIX hydrolase  30.93 
 
 		 165 aa  57.4  0.00000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5170  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 124 aa  55.5  0.0000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.140908  normal  0.555587 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3967  MutT/nudix family protein  34.12 
 
 		 146 aa  55.1  0.0000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.447658  normal  0.0696331 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2044  NUDIX hydrolase  36.78 
 
 		 147 aa  51.6  0.000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00490099 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3508  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  36.17 
 
 		 128 aa  50.4  0.000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.116101  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3377  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  36.17 
 
 		 128 aa  50.4  0.000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0382964  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2908  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  36.17 
 
 		 128 aa  50.4  0.000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0055236  normal  0.908985 
 
 
-
 
NC_004310  BR0672  MutT/nudix family protein  58.97 
 
 		 147 aa  50.4  0.000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.959271  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1678  hypothetical protein  66.67 
 
 		 306 aa  49.7  0.00001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.552334  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0659  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  38.89 
 
 		 134 aa  50.1  0.00001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0666  MutT/nudix family protein  58.97 
 
 		 147 aa  49.3  0.00002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.613905  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4233  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 135 aa  49.3  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.257262  normal  0.463125 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3582  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  50.91 
 
 		 131 aa  48.5  0.00003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000334964  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2614  NUDIX hydrolase  36.84 
 
 		 152 aa  48.5  0.00003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.349258  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4397  NUDIX hydrolase  30.95 
 
 		 126 aa  48.5  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0874525  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1264  putative MutT/Nudix family protein  38.1 
 
 		 132 aa  47.8  0.00005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0696899 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3510  mutator MutT protein  42.19 
 
 		 130 aa  47.8  0.00006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.39786  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4066  mutator MutT protein  32.94 
 
 		 130 aa  47.4  0.00007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.29399 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39610  ADP-ribose pyrophosphatase  33.67 
 
 		 169 aa  47.4  0.00007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1194  NUDIX hydrolase  33.73 
 
 		 126 aa  47.4  0.00007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.317663  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3873  mutator MutT protein  32.94 
 
 		 130 aa  47.4  0.00007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000107436 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0620  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  36.11 
 
 		 132 aa  47  0.00008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00509721  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2944  NUDIX hydrolase  32.91 
 
 		 140 aa  47  0.00008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.948773 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3770  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  50.91 
 
 		 131 aa  47  0.00008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0756732  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2084  hypothetical protein  57.14 
 
 		 319 aa  47  0.00009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.498942 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0363  mutator MutT protein  57.14 
 
 		 131 aa  47  0.00009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000739307 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1971  mutator MutT protein  63.64 
 
 		 132 aa  46.2  0.0001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.027425  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0732  hydrolase, NUDIX family  32.71 
 
 		 163 aa  46.6  0.0001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00265713 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0251  mutator mutT protein  53.85 
 
 		 130 aa  46.6  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0673  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  35.44 
 
 		 360 aa  46.6  0.0001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.21066  normal  0.501858 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06372  hypothetical protein  35.48 
 
 		 132 aa  46.2  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2766  NUDIX hydrolase  65.52 
 
 		 144 aa  46.2  0.0001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1156  mutator MutT protein  35.82 
 
 		 126 aa  46.6  0.0001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000464506  normal  0.12144 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0504  NUDIX hydrolase  36.11 
 
 		 101 aa  45.8  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.163605  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4453  mutator mutT protein  40.58 
 
 		 144 aa  45.4  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0347377  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0597  NUDIX hydrolase  54.29 
 
 		 133 aa  45.4  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4224  NUDIX hydrolase  32.32 
 
 		 302 aa  46.2  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4226  NUDIX hydrolase  57.14 
 
 		 162 aa  45.8  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0029  NUDIX hydrolase  54.29 
 
 		 137 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.999066 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0110  NUDIX hydrolase  54.29 
 
 		 133 aa  45.4  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3948  mutator MutT protein  55.56 
 
 		 130 aa  45.8  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1138  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 140 aa  45.8  0.0002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0933  hypothetical protein  55.56 
 
 		 209 aa  45.8  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.825014 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3925  mutator MutT protein  55.56 
 
 		 130 aa  45.8  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3444  mutator MutT protein  59.38 
 
 		 129 aa  45.1  0.0003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.013842 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03249  mutator mutT protein  40 
 
 		 127 aa  45.4  0.0003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3106  NUDIX hydrolase  27.27 
 
 		 153 aa  45.1  0.0003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0830625 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0771  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  66.67 
 
 		 134 aa  45.1  0.0003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.012976  normal  0.720455 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1007  NUDIX hydrolase  47.73 
 
 		 144 aa  45.1  0.0003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.175488  hitchhiker  0.000423095 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5398  NUDIX hydrolase  33.7 
 
 		 151 aa  45.1  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7346  hypothetical protein  39.66 
 
 		 173 aa  45.1  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1185  ADP-ribose pyrophosphatase  30.17 
 
 		 164 aa  45.4  0.0003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.792217  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2698  A/G-specific adenine glycosylase  40.62 
 
 		 396 aa  45.4  0.0003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.265639 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0397  mutator MutT protein  45.61 
 
 		 347 aa  44.7  0.0004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.527818 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2230  hypothetical protein  63.33 
 
 		 310 aa  44.7  0.0004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.328266  normal  0.270342 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1757  NUDIX hydrolase  35.23 
 
 		 144 aa  44.3  0.0005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.207601  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0614  NUDIX hydrolase  58.82 
 
 		 135 aa  44.3  0.0005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0852421  normal  0.976562 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1486  NUDIX hydrolase  64.52 
 
 		 131 aa  44.3  0.0005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00282357  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0419  mutator MutT protein  56.25 
 
 		 129 aa  44.7  0.0005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000293063 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0364  mutator mutT protein  66.67 
 
 		 137 aa  44.3  0.0005  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1656  NUDIX hydrolase  50 
 
 		 152 aa  44.3  0.0005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.632067  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13370  hypothetical protein  65.62 
 
 		 313 aa  44.3  0.0005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3429  mutator MutT protein  56.25 
 
 		 134 aa  44.3  0.0006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0858  hypothetical protein  48.08 
 
 		 317 aa  44.3  0.0006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6062  NUDIX hydrolase  36.67 
 
 		 268 aa  44.3  0.0006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.107373 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0299  mutator MutT protein  56.25 
 
 		 134 aa  44.3  0.0006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7080  NUDIX hydrolase  33.02 
 
 		 174 aa  43.9  0.0007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1301  MutT/nudix family protein  30.48 
 
 		 163 aa  43.9  0.0007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.308038  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4181  A/G-specific adenine glycosylase  45.76 
 
 		 386 aa  43.9  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.215625  normal  0.631474 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2380  NUDIX hydrolase  34.88 
 
 		 169 aa  43.9  0.0007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0414  mutator MutT protein  56.25 
 
 		 132 aa  43.9  0.0007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>