More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_0933 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_0933  hypothetical protein  100 
 
 		 209 aa  416  9.999999999999999e-116  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.825014 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5012  NUDIX hydrolase  66.18 
 
 		 208 aa  239  2.9999999999999997e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.615251  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4339  NUDIX hydrolase  64.59 
 
 		 208 aa  217  1e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.975502  normal  0.0924805 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4234  NUDIX hydrolase  65.69 
 
 		 208 aa  200  9.999999999999999e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0154099  normal  0.59978 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1556  NUDIX hydrolase  54.85 
 
 		 206 aa  197  1.0000000000000001e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5641  NUDIX hydrolase  46.06 
 
 		 239 aa  185  5e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5351  NUDIX hydrolase  46.06 
 
 		 239 aa  185  5e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5262  NUDIX hydrolase  46.41 
 
 		 240 aa  183  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5787  NUDIX hydrolase  45.83 
 
 		 238 aa  180  2e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1043  NUDIX hydrolase  44.96 
 
 		 238 aa  171  5.999999999999999e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2054  NUDIX hydrolase  54.12 
 
 		 226 aa  161  8.000000000000001e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.762923  normal  0.0850915 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1198  NUDIX hydrolase  46.04 
 
 		 201 aa  159  2e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.639623  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1713  NUDIX hydrolase  46.63 
 
 		 203 aa  141  5e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.108614  normal  0.043111 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2649  NUDIX hydrolase  45.51 
 
 		 209 aa  134  9.999999999999999e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0213367  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4064  NUDIX hydrolase  40.2 
 
 		 206 aa  115  5e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.305578  normal  0.120697 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0599  NUDIX hydrolase  39.55 
 
 		 223 aa  91.7  7e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0172735  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0694  NUDIX hydrolase  39.41 
 
 		 214 aa  89.7  3e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.496821  normal  0.528067 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0115  NUDIX hydrolase  39.88 
 
 		 201 aa  87.4  1e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1739  NUDIX hydrolase  42.07 
 
 		 227 aa  86.3  3e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.881669  normal  0.05892 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1462  NUDIX hydrolase  42.07 
 
 		 226 aa  86.3  3e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.205145  normal  0.0719668 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1459  NUDIX hydrolase  37.72 
 
 		 227 aa  83.6  0.000000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.74222  normal  0.52562 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0727  NUDIX hydrolase  40.69 
 
 		 210 aa  80.9  0.00000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0776  NUDIX hydrolase  35.09 
 
 		 219 aa  79.7  0.00000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.304967  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1611  NUDIX hydrolase  40.77 
 
 		 207 aa  79.7  0.00000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.404735  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1585  NUDIX hydrolase  37.04 
 
 		 199 aa  79  0.00000000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.254951  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1022  NUDIX hydrolase  45.95 
 
 		 204 aa  78.2  0.00000000000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1554  MutT/nudix family protein  40.28 
 
 		 168 aa  77.8  0.0000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.607858  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2968  NUDIX hydrolase  33.74 
 
 		 216 aa  77.4  0.0000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.713083  normal  0.0271269 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0110  NUDIX hydrolase  45.45 
 
 		 201 aa  77.8  0.0000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.04219  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1502  MutT/nudix family protein  40.28 
 
 		 168 aa  77.8  0.0000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.73233  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1694  NUDIX hydrolase  42.37 
 
 		 235 aa  76.6  0.0000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3351  NUDIX hydrolase  48 
 
 		 244 aa  76.6  0.0000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.162982 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2699  NUDIX hydrolase  48 
 
 		 222 aa  76.3  0.0000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.663503  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2921  NUDIX hydrolase  36.67 
 
 		 193 aa  75.9  0.0000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0185259  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8861  NUDIX hydrolase  41.56 
 
 		 239 aa  75.5  0.0000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1318  protein of unknown function DUF1289  35 
 
 		 267 aa  75.5  0.0000000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.196513  normal  0.297563 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0367  NUDIX hydrolase  37.89 
 
 		 243 aa  75.1  0.0000000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0775578  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0696  nucleotide phosphate derivative pyrophosphohydrolases, MutT/nudix family protein  30.23 
 
 		 197 aa  74.7  0.000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4241  NUDIX hydrolase  46.15 
 
 		 219 aa  74.3  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4112  NUDIX hydrolase  41.23 
 
 		 219 aa  74.3  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0690871  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2111  NUDIX hydrolase  39.52 
 
 		 194 aa  73.6  0.000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.108274  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2790  NUDIX hydrolase  36.36 
 
 		 216 aa  73.9  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.235631 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3054  NUDIX hydrolase  33.73 
 
 		 216 aa  72.8  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0331862 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3024  NUDIX hydrolase  35.82 
 
 		 198 aa  73.2  0.000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.43822  normal  0.894324 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2177  NUDIX hydrolase  34.13 
 
 		 211 aa  73.2  0.000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0788  NUDIX hydrolase  38.89 
 
 		 220 aa  72  0.000000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.101011 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0752  NUDIX hydrolase  36.24 
 
 		 244 aa  72  0.000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1465  NUDIX hydrolase  42.61 
 
 		 237 aa  72  0.000000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.720683 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0319  NUDIX hydrolase  45.45 
 
 		 243 aa  71.6  0.000000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0342181  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0937  hypothetical protein  39.5 
 
 		 202 aa  71.6  0.000000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0131467 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2536  NUDIX hydrolase  38.33 
 
 		 226 aa  71.2  0.000000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.299915  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0808  NUDIX hydrolase  38.3 
 
 		 234 aa  70.9  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.655823  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0879  NUDIX hydrolase  38.3 
 
 		 234 aa  70.9  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.29016  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5341  NUDIX hydrolase  47 
 
 		 242 aa  70.9  0.00000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00778  MutT/nudix family protein  36.53 
 
 		 285 aa  70.5  0.00000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.025286  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0815  NUDIX hydrolase  46.74 
 
 		 190 aa  70.1  0.00000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1194  NUDIX hydrolase  40.71 
 
 		 221 aa  69.7  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.860148  normal  0.422003 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01910  hypothetical protein  35.77 
 
 		 199 aa  69.3  0.00000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1297  NUDIX hydrolase  40.71 
 
 		 214 aa  69.3  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2220  MutT/nudix family protein  37.5 
 
 		 195 aa  68.9  0.00000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1378  NUDIX hydrolase  42.2 
 
 		 225 aa  68.6  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.441727  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1986  hypothetical protein  35.95 
 
 		 217 aa  68.6  0.00000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0080  NUDIX hydrolase  39.8 
 
 		 195 aa  68.2  0.00000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1686  MutT/nudix family protein  33.07 
 
 		 202 aa  68.2  0.00000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.231925  normal  0.379553 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2624  NUDIX hydrolase  37.59 
 
 		 221 aa  68.2  0.00000000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.918126 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2360  NUDIX hydrolase  39.5 
 
 		 189 aa  67.8  0.0000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000190371  hitchhiker  0.00362317 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0918  NUDIX hydrolase  42.02 
 
 		 221 aa  67.4  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01947  NTP pyrophosphohydrolase, NUDIX family protein  37.06 
 
 		 190 aa  67.8  0.0000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00222276  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2202  NUDIX hydrolase  36.67 
 
 		 195 aa  67.8  0.0000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000103843  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2273  NUDIX hydrolase  36.97 
 
 		 210 aa  67.4  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.456189 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3615  MutT/nudix family protein  35.29 
 
 		 191 aa  66.6  0.0000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0533  NUDIX hydrolase  31.43 
 
 		 202 aa  66.6  0.0000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0466336  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2481  NUDIX hydrolase  34.09 
 
 		 195 aa  67  0.0000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00475153  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2126  NUDIX hydrolase  35.83 
 
 		 195 aa  67  0.0000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000453697  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2224  hypothetical protein  34.01 
 
 		 197 aa  67  0.0000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.888042  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4847  NUDIX hydrolase  48.45 
 
 		 203 aa  67  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2304  NUDIX hydrolase  35.83 
 
 		 195 aa  67  0.0000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000460151  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1477  NUDIX hydrolase  35.37 
 
 		 239 aa  66.6  0.0000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.867637  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1929  hypothetical protein  40.59 
 
 		 197 aa  66.2  0.0000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1108  hypothetical protein  38.83 
 
 		 227 aa  65.5  0.0000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0521  NUDIX hydrolase  38.66 
 
 		 245 aa  65.1  0.0000000007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.661222  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2273  putative NUDIX hydrolase  40.87 
 
 		 211 aa  65.1  0.0000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.20194  normal  0.495948 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2225  NUDIX hydrolase  34.29 
 
 		 189 aa  65.1  0.0000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000124127  hitchhiker  0.00567873 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1956  NUDIX hydrolase  34.65 
 
 		 200 aa  65.1  0.0000000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00026609  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49679  predicted protein  39.13 
 
 		 430 aa  64.7  0.0000000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.943315  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39620  NUDIX hydrolase  40.35 
 
 		 200 aa  64.7  0.0000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4735  NUDIX hydrolase  37.7 
 
 		 187 aa  63.9  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0687682  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1464  mutT/nudix family protein  36.52 
 
 		 198 aa  63.5  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003157  hypothetical nudix hydrolase YeaB  31.06 
 
 		 199 aa  63.9  0.000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0721  NUDIX hydrolase  39.83 
 
 		 234 aa  63.5  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0685  NUDIX hydrolase  34.88 
 
 		 235 aa  63.2  0.000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.997472 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1637  hypothetical protein  39.5 
 
 		 199 aa  63.2  0.000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2450  hypothetical protein  39.5 
 
 		 199 aa  63.2  0.000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2628  NUDIX hydrolase  35.34 
 
 		 200 aa  62.8  0.000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.130048  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2354  hypothetical protein  39.5 
 
 		 199 aa  63.2  0.000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.921184  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1364  hypothetical protein  35.71 
 
 		 203 aa  62.8  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.980357  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2973  NUDIX hydrolase  43.14 
 
 		 242 aa  62.4  0.000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.233103  normal  0.0737984 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1406  NUDIX hydrolase  41 
 
 		 233 aa  62.8  0.000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0773  NUDIX hydrolase  41 
 
 		 235 aa  62.4  0.000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.104693 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0949  NUDIX hydrolase  38.66 
 
 		 228 aa  62.4  0.000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>