280 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_1198 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_1198  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 201 aa  401  1e-111  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.639623  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5787  NUDIX hydrolase  45.22 
 
 		 238 aa  182  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5262  NUDIX hydrolase  44.16 
 
 		 240 aa  174  7e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5641  NUDIX hydrolase  44.16 
 
 		 239 aa  174  8e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5351  NUDIX hydrolase  44.16 
 
 		 239 aa  174  8e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1043  NUDIX hydrolase  44.78 
 
 		 238 aa  171  5.999999999999999e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1713  NUDIX hydrolase  50.75 
 
 		 203 aa  168  5e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.108614  normal  0.043111 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1556  NUDIX hydrolase  47.98 
 
 		 206 aa  164  6.9999999999999995e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0933  hypothetical protein  46.04 
 
 		 209 aa  148  5e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.825014 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5012  NUDIX hydrolase  50.3 
 
 		 208 aa  144  1e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.615251  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2054  NUDIX hydrolase  47.47 
 
 		 226 aa  141  7e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.762923  normal  0.0850915 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4339  NUDIX hydrolase  49.15 
 
 		 208 aa  124  9e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.975502  normal  0.0924805 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4064  NUDIX hydrolase  42.08 
 
 		 206 aa  121  5e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.305578  normal  0.120697 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2649  NUDIX hydrolase  39.49 
 
 		 209 aa  112  4.0000000000000004e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0213367  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4234  NUDIX hydrolase  44.29 
 
 		 208 aa  108  6e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0154099  normal  0.59978 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1022  NUDIX hydrolase  44.54 
 
 		 204 aa  88.2  8e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0694  NUDIX hydrolase  40.32 
 
 		 214 aa  81.3  0.000000000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.496821  normal  0.528067 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2574  NUDIX hydrolase  42.73 
 
 		 195 aa  80.1  0.00000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.536286  normal  0.595154 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2111  NUDIX hydrolase  33.16 
 
 		 194 aa  78.6  0.00000000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.108274  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4241  NUDIX hydrolase  37.82 
 
 		 219 aa  78.2  0.00000000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1318  protein of unknown function DUF1289  33.12 
 
 		 267 aa  77.8  0.0000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.196513  normal  0.297563 
 
 
-
 
NC_004310  BR1554  MutT/nudix family protein  42.02 
 
 		 168 aa  75.1  0.0000000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.607858  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1502  MutT/nudix family protein  42.02 
 
 		 168 aa  75.1  0.0000000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.73233  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4112  NUDIX hydrolase  38.4 
 
 		 219 aa  74.7  0.0000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0690871  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1611  NUDIX hydrolase  41.18 
 
 		 207 aa  74.3  0.000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.404735  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0319  NUDIX hydrolase  39.06 
 
 		 243 aa  72.8  0.000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0342181  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0115  NUDIX hydrolase  35.8 
 
 		 201 aa  72.4  0.000000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0599  NUDIX hydrolase  38.4 
 
 		 223 aa  71.6  0.000000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0172735  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0788  NUDIX hydrolase  42.16 
 
 		 220 aa  70.9  0.00000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.101011 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1901  NUDIX hydrolase  37.12 
 
 		 231 aa  70.1  0.00000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.576777  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2360  NUDIX hydrolase  30.16 
 
 		 189 aa  69.3  0.00000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000190371  hitchhiker  0.00362317 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1956  NUDIX hydrolase  35.48 
 
 		 200 aa  69.7  0.00000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00026609  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3024  NUDIX hydrolase  35.17 
 
 		 198 aa  68.9  0.00000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.43822  normal  0.894324 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0721  NUDIX hydrolase  40.34 
 
 		 234 aa  68.9  0.00000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0727  NUDIX hydrolase  38.46 
 
 		 210 aa  68.9  0.00000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0165  NUDIX hydrolase  42.05 
 
 		 196 aa  68.6  0.00000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0176  NUDIX hydrolase  42.05 
 
 		 196 aa  68.6  0.00000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1477  NUDIX hydrolase  38.76 
 
 		 239 aa  68.9  0.00000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.867637  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00778  MutT/nudix family protein  34.76 
 
 		 285 aa  68.6  0.00000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.025286  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4847  NUDIX hydrolase  42.57 
 
 		 203 aa  68.6  0.00000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1108  hypothetical protein  38.21 
 
 		 227 aa  68.2  0.00000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0879  NUDIX hydrolase  34.51 
 
 		 234 aa  67.8  0.00000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.29016  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1462  NUDIX hydrolase  32.7 
 
 		 226 aa  67.4  0.0000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.205145  normal  0.0719668 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0778  NUDIX hydrolase  40.74 
 
 		 200 aa  66.6  0.0000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0808  NUDIX hydrolase  37.61 
 
 		 234 aa  67.4  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.655823  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0158  NUDIX hydrolase  42.05 
 
 		 196 aa  67  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.226319  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1199  NUDIX hydrolase  36.13 
 
 		 178 aa  67  0.0000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1739  NUDIX hydrolase  32.7 
 
 		 227 aa  67  0.0000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.881669  normal  0.05892 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2167  NUDIX hydrolase  35.71 
 
 		 191 aa  66.6  0.0000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2867  NUDIX hydrolase  36.51 
 
 		 195 aa  67  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.321324  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0776  NUDIX hydrolase  36.63 
 
 		 219 aa  65.9  0.0000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.304967  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2126  NUDIX hydrolase  36.36 
 
 		 195 aa  65.9  0.0000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000453697  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0937  hypothetical protein  35.21 
 
 		 202 aa  65.9  0.0000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0131467 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1459  NUDIX hydrolase  32.7 
 
 		 227 aa  65.9  0.0000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.74222  normal  0.52562 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2009  NUDIX hydrolase  36.21 
 
 		 197 aa  65.9  0.0000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.958398  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1694  NUDIX hydrolase  36 
 
 		 235 aa  65.9  0.0000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2304  NUDIX hydrolase  36.36 
 
 		 195 aa  65.9  0.0000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000460151  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01947  NTP pyrophosphohydrolase, NUDIX family protein  32.58 
 
 		 190 aa  65.5  0.0000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00222276  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0685  NUDIX hydrolase  40.3 
 
 		 235 aa  65.5  0.0000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.997472 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49679  predicted protein  34.75 
 
 		 430 aa  65.5  0.0000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.943315  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3165  NUDIX hydrolase  38 
 
 		 225 aa  65.5  0.0000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.036982 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1986  hypothetical protein  34.59 
 
 		 217 aa  65.1  0.0000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0521  NUDIX hydrolase  35.43 
 
 		 245 aa  65.1  0.0000000007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.661222  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1585  NUDIX hydrolase  32.32 
 
 		 199 aa  65.1  0.0000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.254951  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2699  NUDIX hydrolase  39.67 
 
 		 222 aa  64.7  0.0000000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.663503  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2220  MutT/nudix family protein  36.36 
 
 		 195 aa  64.3  0.000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0367  NUDIX hydrolase  37.1 
 
 		 243 aa  63.9  0.000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0775578  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0080  NUDIX hydrolase  31.08 
 
 		 195 aa  63.5  0.000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2644  NUDIX hydrolase  35.9 
 
 		 195 aa  63.5  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.688454  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8861  NUDIX hydrolase  34.27 
 
 		 239 aa  63.5  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2202  NUDIX hydrolase  35.54 
 
 		 195 aa  63.5  0.000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000103843  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2036  NUDIX hydrolase  32.9 
 
 		 197 aa  63.5  0.000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000390793  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1686  MutT/nudix family protein  30.97 
 
 		 202 aa  63.5  0.000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.231925  normal  0.379553 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2225  NUDIX hydrolase  31.45 
 
 		 189 aa  63.9  0.000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000124127  hitchhiker  0.00567873 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3351  NUDIX hydrolase  40.87 
 
 		 244 aa  63.5  0.000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.162982 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2177  NUDIX hydrolase  35.65 
 
 		 211 aa  62.8  0.000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5341  NUDIX hydrolase  40 
 
 		 242 aa  62.8  0.000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3615  MutT/nudix family protein  32.23 
 
 		 191 aa  62.4  0.000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01910  hypothetical protein  32.58 
 
 		 199 aa  62.4  0.000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1289  NUDIX hydrolase  35.54 
 
 		 196 aa  62  0.000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1032  NUDIX hydrolase  38.89 
 
 		 228 aa  62.4  0.000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0594  NUDIX hydrolase  38.89 
 
 		 228 aa  62.4  0.000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0812937  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2018  hypothetical protein  35.19 
 
 		 203 aa  62.4  0.000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1073  NUDIX hydrolase  38.89 
 
 		 228 aa  62.4  0.000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.398605  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1465  NUDIX hydrolase  37.39 
 
 		 237 aa  62.4  0.000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.720683 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0421  NUDIX hydrolase  39.66 
 
 		 233 aa  62  0.000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.218959  normal  0.150506 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2230  NUDIX hydrolase  40 
 
 		 228 aa  61.6  0.000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.251821  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1888  NUDIX hydrolase  38.28 
 
 		 241 aa  61.6  0.000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.00118194  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1193  NUDIX hydrolase  34.48 
 
 		 196 aa  61.2  0.000000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.253169  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2465  NUDIX hydrolase  28.75 
 
 		 288 aa  61.2  0.000000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.316655 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2809  hypothetical protein  36 
 
 		 192 aa  61.2  0.00000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0459341 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0119  hypothetical protein  32.47 
 
 		 221 aa  60.8  0.00000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1626  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 197 aa  60.8  0.00000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.706755  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2382  hypothetical protein  36.29 
 
 		 192 aa  60.1  0.00000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2536  NUDIX hydrolase  35.21 
 
 		 226 aa  60.1  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.299915  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1206  putative phosphohydrolase (mutT/nudix family protein)  34.92 
 
 		 195 aa  60.5  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  hitchhiker  0.00244192  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3409  NUDIX hydrolase  34.72 
 
 		 201 aa  60.1  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.227802  normal  0.542448 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0470  hypothetical protein  35.9 
 
 		 213 aa  60.1  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.779717 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4187  NUDIX hydrolase  38.89 
 
 		 228 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.351171  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0110  NUDIX hydrolase  41.12 
 
 		 201 aa  59.7  0.00000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.04219  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>