More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_4339 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_4339  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 208 aa  417  1e-116  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.975502  normal  0.0924805 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5012  NUDIX hydrolase  79.81 
 
 		 208 aa  320  9.000000000000001e-87  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.615251  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4234  NUDIX hydrolase  87.5 
 
 		 208 aa  299  2e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0154099  normal  0.59978 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0933  hypothetical protein  62.68 
 
 		 209 aa  226  2e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.825014 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1556  NUDIX hydrolase  56.46 
 
 		 206 aa  213  1.9999999999999998e-54  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5641  NUDIX hydrolase  57.06 
 
 		 239 aa  177  9e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5262  NUDIX hydrolase  57.06 
 
 		 240 aa  177  9e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5351  NUDIX hydrolase  57.06 
 
 		 239 aa  177  9e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5787  NUDIX hydrolase  55.83 
 
 		 238 aa  173  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1043  NUDIX hydrolase  55.21 
 
 		 238 aa  168  4e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1713  NUDIX hydrolase  47.76 
 
 		 203 aa  165  5.9999999999999996e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.108614  normal  0.043111 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2054  NUDIX hydrolase  49.22 
 
 		 226 aa  161  5.0000000000000005e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.762923  normal  0.0850915 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1198  NUDIX hydrolase  50.28 
 
 		 201 aa  159  4e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.639623  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2649  NUDIX hydrolase  44.83 
 
 		 209 aa  122  3e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0213367  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4064  NUDIX hydrolase  37.62 
 
 		 206 aa  102  5e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.305578  normal  0.120697 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0694  NUDIX hydrolase  38.82 
 
 		 214 aa  100  2e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.496821  normal  0.528067 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0599  NUDIX hydrolase  46.62 
 
 		 223 aa  100  2e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0172735  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0115  NUDIX hydrolase  36.84 
 
 		 201 aa  96.7  2e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1459  NUDIX hydrolase  45.11 
 
 		 227 aa  95.5  5e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.74222  normal  0.52562 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0776  NUDIX hydrolase  36.69 
 
 		 219 aa  95.5  5e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.304967  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1739  NUDIX hydrolase  46.27 
 
 		 227 aa  95.1  7e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.881669  normal  0.05892 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1462  NUDIX hydrolase  46.27 
 
 		 226 aa  94.7  8e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.205145  normal  0.0719668 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1022  NUDIX hydrolase  47.79 
 
 		 204 aa  88.6  5e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1611  NUDIX hydrolase  38.73 
 
 		 207 aa  86.7  2e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.404735  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2177  NUDIX hydrolase  38.01 
 
 		 211 aa  86.7  3e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0319  NUDIX hydrolase  39.05 
 
 		 243 aa  85.5  5e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0342181  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0521  NUDIX hydrolase  36.2 
 
 		 245 aa  84  0.000000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.661222  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1554  MutT/nudix family protein  46.55 
 
 		 168 aa  83.2  0.000000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.607858  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0367  NUDIX hydrolase  37.5 
 
 		 243 aa  83.6  0.000000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0775578  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1502  MutT/nudix family protein  46.55 
 
 		 168 aa  83.2  0.000000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.73233  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1585  NUDIX hydrolase  35.58 
 
 		 199 aa  82.8  0.000000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.254951  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2273  NUDIX hydrolase  38.51 
 
 		 210 aa  82  0.000000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.456189 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0727  NUDIX hydrolase  35.67 
 
 		 210 aa  82  0.000000000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0696  nucleotide phosphate derivative pyrophosphohydrolases, MutT/nudix family protein  36.36 
 
 		 197 aa  82  0.000000000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1694  NUDIX hydrolase  45.54 
 
 		 235 aa  80.5  0.00000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2968  NUDIX hydrolase  32.95 
 
 		 216 aa  80.1  0.00000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.713083  normal  0.0271269 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3351  NUDIX hydrolase  46.85 
 
 		 244 aa  79  0.00000000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.162982 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5341  NUDIX hydrolase  47.32 
 
 		 242 aa  78.6  0.00000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2699  NUDIX hydrolase  45.95 
 
 		 222 aa  77.4  0.0000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.663503  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0068  NUDIX hydrolase  35.53 
 
 		 194 aa  77.8  0.0000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.979316 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2790  NUDIX hydrolase  42.24 
 
 		 216 aa  77.8  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.235631 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3054  NUDIX hydrolase  37.5 
 
 		 216 aa  76.6  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0331862 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3615  MutT/nudix family protein  38.98 
 
 		 191 aa  76.6  0.0000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3024  NUDIX hydrolase  37.9 
 
 		 198 aa  77  0.0000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.43822  normal  0.894324 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00778  MutT/nudix family protein  37.04 
 
 		 285 aa  75.9  0.0000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.025286  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0788  NUDIX hydrolase  37.32 
 
 		 220 aa  75.5  0.0000000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.101011 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1465  NUDIX hydrolase  43.75 
 
 		 237 aa  75.1  0.0000000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.720683 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0685  NUDIX hydrolase  38.46 
 
 		 235 aa  75.1  0.0000000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.997472 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2921  NUDIX hydrolase  33.72 
 
 		 193 aa  75.1  0.0000000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0185259  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2536  NUDIX hydrolase  41.38 
 
 		 226 aa  73.9  0.000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.299915  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4241  NUDIX hydrolase  45.05 
 
 		 219 aa  74.7  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1318  protein of unknown function DUF1289  35.5 
 
 		 267 aa  74.3  0.000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.196513  normal  0.297563 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4112  NUDIX hydrolase  44.83 
 
 		 219 aa  73.6  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0690871  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1477  NUDIX hydrolase  40.16 
 
 		 239 aa  73.6  0.000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.867637  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2224  hypothetical protein  32.56 
 
 		 197 aa  72.8  0.000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.888042  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1986  hypothetical protein  37.21 
 
 		 217 aa  72.8  0.000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01910  hypothetical protein  31.25 
 
 		 199 aa  72  0.000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2018  hypothetical protein  33.54 
 
 		 203 aa  71.6  0.000000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1929  hypothetical protein  32.56 
 
 		 197 aa  71.6  0.000000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1108  hypothetical protein  42.57 
 
 		 227 aa  71.2  0.000000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0110  NUDIX hydrolase  42.11 
 
 		 201 aa  71.6  0.000000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.04219  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3526  NUDIX hydrolase  29.84 
 
 		 187 aa  71.6  0.000000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2167  NUDIX hydrolase  31.87 
 
 		 191 aa  71.6  0.000000000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2481  NUDIX hydrolase  35 
 
 		 195 aa  70.9  0.00000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00475153  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5174  NUDIX hydrolase  40.3 
 
 		 222 aa  70.9  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.666814  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3375  mutT/nudix family protein  33.55 
 
 		 171 aa  70.1  0.00000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0778  NUDIX hydrolase  36 
 
 		 200 aa  70.1  0.00000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0080  NUDIX hydrolase  39.82 
 
 		 195 aa  70.5  0.00000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0985  NUDIX hydrolase  37.39 
 
 		 211 aa  69.7  0.00000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.585985  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0752  NUDIX hydrolase  40.68 
 
 		 244 aa  69.7  0.00000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0421  NUDIX hydrolase  42.74 
 
 		 233 aa  69.7  0.00000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.218959  normal  0.150506 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1032  NUDIX hydrolase  36.8 
 
 		 228 aa  68.9  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2628  NUDIX hydrolase  31.87 
 
 		 200 aa  69.3  0.00000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.130048  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0879  NUDIX hydrolase  38.26 
 
 		 234 aa  68.9  0.00000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.29016  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0594  NUDIX hydrolase  36.8 
 
 		 228 aa  68.9  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0812937  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2867  NUDIX hydrolase  37.5 
 
 		 195 aa  69.3  0.00000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.321324  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1073  NUDIX hydrolase  36.8 
 
 		 228 aa  68.9  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.398605  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0808  NUDIX hydrolase  38.26 
 
 		 234 aa  68.9  0.00000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.655823  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2126  NUDIX hydrolase  36 
 
 		 195 aa  68.6  0.00000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000453697  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2304  NUDIX hydrolase  36 
 
 		 195 aa  68.9  0.00000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000460151  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2230  NUDIX hydrolase  38.4 
 
 		 228 aa  68.6  0.00000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.251821  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2644  NUDIX hydrolase  37.5 
 
 		 195 aa  68.2  0.00000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.688454  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4847  NUDIX hydrolase  46.39 
 
 		 203 aa  68.2  0.00000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2202  NUDIX hydrolase  36.8 
 
 		 195 aa  68.2  0.00000000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000103843  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2220  MutT/nudix family protein  36.51 
 
 		 195 aa  67.8  0.0000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4187  NUDIX hydrolase  38.26 
 
 		 228 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.351171  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0937  hypothetical protein  39.13 
 
 		 202 aa  67.4  0.0000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0131467 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4290  NUDIX hydrolase  42.24 
 
 		 300 aa  67  0.0000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8861  NUDIX hydrolase  41.96 
 
 		 239 aa  66.6  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2111  NUDIX hydrolase  39.47 
 
 		 194 aa  67  0.0000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.108274  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1345  NUDIX hydrolase  36.7 
 
 		 202 aa  67  0.0000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2574  NUDIX hydrolase  40.16 
 
 		 195 aa  67.4  0.0000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.536286  normal  0.595154 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1206  putative phosphohydrolase (mutT/nudix family protein)  36.67 
 
 		 195 aa  66.2  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  hitchhiker  0.00244192  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1378  NUDIX hydrolase  39.13 
 
 		 225 aa  66.2  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.441727  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1637  hypothetical protein  32.9 
 
 		 199 aa  66.6  0.0000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3592  NUDIX hydrolase  29.8 
 
 		 177 aa  66.6  0.0000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2354  hypothetical protein  32.9 
 
 		 199 aa  66.6  0.0000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.921184  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2809  hypothetical protein  32.28 
 
 		 192 aa  66.6  0.0000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0459341 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2450  hypothetical protein  32.9 
 
 		 199 aa  66.6  0.0000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1686  MutT/nudix family protein  33.04 
 
 		 202 aa  66.2  0.0000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.231925  normal  0.379553 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>