More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_2649 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_2649  NUDIX hydrolase  100 
 
 
209 aa  407  1e-113  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0213367  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4064  NUDIX hydrolase  53.65 
 
 
206 aa  162  4.0000000000000004e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.305578  normal  0.120697 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1556  NUDIX hydrolase  42.29 
 
 
206 aa  133  1.9999999999999998e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0933  hypothetical protein  43.26 
 
 
209 aa  128  5.0000000000000004e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.825014 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2054  NUDIX hydrolase  46.79 
 
 
226 aa  121  9.999999999999999e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.762923  normal  0.0850915 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5012  NUDIX hydrolase  45.16 
 
 
208 aa  116  3e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.615251  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1198  NUDIX hydrolase  39.49 
 
 
201 aa  112  4.0000000000000004e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.639623  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1713  NUDIX hydrolase  43.16 
 
 
203 aa  109  3e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.108614  normal  0.043111 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5262  NUDIX hydrolase  45.51 
 
 
240 aa  108  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5641  NUDIX hydrolase  45.51 
 
 
239 aa  108  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5351  NUDIX hydrolase  45.51 
 
 
239 aa  108  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4339  NUDIX hydrolase  44.83 
 
 
208 aa  103  2e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.975502  normal  0.0924805 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5787  NUDIX hydrolase  42.95 
 
 
238 aa  99.4  3e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1043  NUDIX hydrolase  41.67 
 
 
238 aa  96.3  3e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4234  NUDIX hydrolase  45.1 
 
 
208 aa  88.6  6e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0154099  normal  0.59978 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0115  NUDIX hydrolase  38.36 
 
 
201 aa  82.4  0.000000000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0599  NUDIX hydrolase  41.1 
 
 
223 aa  80.5  0.00000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0172735  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1318  protein of unknown function DUF1289  40.74 
 
 
267 aa  77  0.0000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.196513  normal  0.297563 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0696  nucleotide phosphate derivative pyrophosphohydrolases, MutT/nudix family protein  36.15 
 
 
197 aa  74.3  0.000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1611  NUDIX hydrolase  38.79 
 
 
207 aa  73.6  0.000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.404735  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0776  NUDIX hydrolase  34.1 
 
 
219 aa  73.6  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.304967  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1554  MutT/nudix family protein  38.79 
 
 
168 aa  72.4  0.000000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.607858  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1502  MutT/nudix family protein  38.79 
 
 
168 aa  72.4  0.000000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.73233  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4241  NUDIX hydrolase  37.29 
 
 
219 aa  71.6  0.000000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1022  NUDIX hydrolase  39.66 
 
 
204 aa  70.9  0.00000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2921  NUDIX hydrolase  42.15 
 
 
193 aa  70.1  0.00000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0185259  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1462  NUDIX hydrolase  40.87 
 
 
226 aa  69.7  0.00000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.205145  normal  0.0719668 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1739  NUDIX hydrolase  40.87 
 
 
227 aa  69.3  0.00000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.881669  normal  0.05892 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0367  NUDIX hydrolase  36.75 
 
 
243 aa  69.3  0.00000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0775578  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0727  NUDIX hydrolase  36.21 
 
 
210 aa  68.9  0.00000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2273  NUDIX hydrolase  44.44 
 
 
210 aa  68.9  0.00000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.456189 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1694  NUDIX hydrolase  41.59 
 
 
235 aa  68.6  0.00000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1956  NUDIX hydrolase  30.94 
 
 
200 aa  68.2  0.00000000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00026609  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0239  hypothetical protein  32.18 
 
 
197 aa  67.8  0.0000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003157  hypothetical nudix hydrolase YeaB  34.4 
 
 
199 aa  67.8  0.0000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1986  hypothetical protein  36.23 
 
 
217 aa  67.4  0.0000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2642  NUDIX hydrolase  37.96 
 
 
207 aa  67.8  0.0000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2536  NUDIX hydrolase  34.69 
 
 
226 aa  67  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.299915  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2111  NUDIX hydrolase  38.21 
 
 
194 aa  66.6  0.0000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.108274  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2790  NUDIX hydrolase  38.79 
 
 
216 aa  66.2  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.235631 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3054  NUDIX hydrolase  41.03 
 
 
216 aa  66.2  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0331862 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1465  NUDIX hydrolase  40.91 
 
 
237 aa  66.6  0.0000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.720683 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2018  hypothetical protein  36.72 
 
 
203 aa  66.2  0.0000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1364  hypothetical protein  33.33 
 
 
203 aa  65.5  0.0000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.980357  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2968  NUDIX hydrolase  36.22 
 
 
216 aa  65.5  0.0000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.713083  normal  0.0271269 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15860  hypothetical protein  33.33 
 
 
203 aa  65.9  0.0000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0480396 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1459  NUDIX hydrolase  39.13 
 
 
227 aa  65.5  0.0000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.74222  normal  0.52562 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0319  NUDIX hydrolase  42.61 
 
 
243 aa  65.5  0.0000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0342181  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0879  NUDIX hydrolase  35.25 
 
 
234 aa  65.1  0.0000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.29016  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0808  NUDIX hydrolase  37.07 
 
 
234 aa  65.1  0.0000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.655823  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2177  NUDIX hydrolase  38.46 
 
 
211 aa  65.1  0.0000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3018  NUDIX hydrolase  39.82 
 
 
208 aa  64.3  0.000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.391362  normal  0.0253624 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0685  NUDIX hydrolase  37.3 
 
 
235 aa  64.3  0.000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.997472 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1265  NUDIX hydrolase  36.36 
 
 
183 aa  64.3  0.000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2450  hypothetical protein  34.82 
 
 
199 aa  64.3  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2644  NUDIX hydrolase  33.86 
 
 
213 aa  64.3  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0920  MutT/nudix family protein  33.33 
 
 
204 aa  64.3  0.000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000137822  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1637  hypothetical protein  34.82 
 
 
199 aa  64.3  0.000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2354  hypothetical protein  34.82 
 
 
199 aa  64.3  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.921184  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1022  NUDIX hydrolase  33.57 
 
 
208 aa  64.3  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0568169  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2890  NUDIX hydrolase  36.07 
 
 
199 aa  63.9  0.000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0985  NUDIX hydrolase  34.62 
 
 
211 aa  63.5  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.585985  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0068  NUDIX hydrolase  32.86 
 
 
194 aa  63.5  0.000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.979316 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0080  NUDIX hydrolase  41.05 
 
 
195 aa  63.9  0.000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00778  MutT/nudix family protein  38.17 
 
 
285 aa  63.5  0.000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.025286  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3351  NUDIX hydrolase  42.37 
 
 
244 aa  62.4  0.000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.162982 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01910  hypothetical protein  34.85 
 
 
199 aa  62.8  0.000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5341  NUDIX hydrolase  37.34 
 
 
242 aa  62  0.000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0815  NUDIX hydrolase  38.71 
 
 
190 aa  62  0.000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0521  NUDIX hydrolase  33.12 
 
 
245 aa  62  0.000000007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.661222  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4112  NUDIX hydrolase  40.7 
 
 
219 aa  61.6  0.000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0690871  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36090  ADP-ribose pyrophosphatase  33.75 
 
 
229 aa  61.6  0.000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.453332  normal  0.430111 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0882  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  24.5 
 
 
216 aa  62  0.000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1585  NUDIX hydrolase  36.11 
 
 
199 aa  61.6  0.000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.254951  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2661  NUDIX hydrolase  37.17 
 
 
207 aa  61.6  0.000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.975355  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1477  NUDIX hydrolase  34.1 
 
 
239 aa  61.6  0.000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.867637  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2950  NUDIX hydrolase  35.51 
 
 
226 aa  60.8  0.00000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.972193  normal  0.639343 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0937  hypothetical protein  38.46 
 
 
202 aa  60.8  0.00000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0131467 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2699  NUDIX hydrolase  41.53 
 
 
222 aa  60.8  0.00000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.663503  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39620  NUDIX hydrolase  37.61 
 
 
200 aa  60.8  0.00000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4187  NUDIX hydrolase  36.07 
 
 
228 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.351171  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0953  NUDIX hydrolase  35.9 
 
 
228 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0994513  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1464  mutT/nudix family protein  35.82 
 
 
198 aa  60.5  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3165  NUDIX hydrolase  31.61 
 
 
225 aa  60.1  0.00000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.036982 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2126  NUDIX hydrolase  35.65 
 
 
195 aa  60.5  0.00000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000453697  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2167  NUDIX hydrolase  31.65 
 
 
191 aa  60.5  0.00000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2304  NUDIX hydrolase  35.65 
 
 
195 aa  60.5  0.00000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000460151  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2574  NUDIX hydrolase  45.54 
 
 
195 aa  60.5  0.00000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.536286  normal  0.595154 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1108  hypothetical protein  39.13 
 
 
227 aa  60.5  0.00000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3024  NUDIX hydrolase  35.4 
 
 
198 aa  59.7  0.00000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.43822  normal  0.894324 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25380  ADP-ribose pyrophosphatase  38.35 
 
 
212 aa  60.1  0.00000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0864  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  23.5 
 
 
216 aa  59.7  0.00000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000108978  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0949  NUDIX hydrolase  35.9 
 
 
228 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2628  NUDIX hydrolase  36.21 
 
 
200 aa  59.7  0.00000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.130048  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2225  NUDIX hydrolase  32.76 
 
 
189 aa  59.3  0.00000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000124127  hitchhiker  0.00567873 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2809  hypothetical protein  32.86 
 
 
192 aa  59.3  0.00000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0459341 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2230  NUDIX hydrolase  36.69 
 
 
228 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.251821  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2465  NUDIX hydrolase  37.07 
 
 
288 aa  59.3  0.00000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.316655 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0788  NUDIX hydrolase  35.94 
 
 
220 aa  58.9  0.00000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.101011 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1032  hypothetical protein  32.06 
 
 
214 aa  59.3  0.00000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>