More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_3268 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_3268  MutT/nudix family protein  100 
 
 		 132 aa  271  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2492  NUDIX hydrolase  93.18 
 
 		 132 aa  257  3e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2696  mutT/nudix family protein  44.07 
 
 		 128 aa  96.7  9e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0531307  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2430  NUDIX hydrolase  48.45 
 
 		 132 aa  88.2  3e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.709971  normal  0.0238883 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2090  NUDIX hydrolase  40.54 
 
 		 141 aa  88.2  4e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.147471  normal  0.280778 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3914  NUDIX hydrolase  40.54 
 
 		 140 aa  88.2  4e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.434564 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3290  NUDIX hydrolase  45.63 
 
 		 120 aa  87.4  6e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3407  NUDIX hydrolase  40.54 
 
 		 140 aa  87.4  6e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.107532 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4365  NUDIX hydrolase  37.84 
 
 		 141 aa  83.6  8e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4001  NUDIX hydrolase  37.84 
 
 		 141 aa  83.6  8e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.543097  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1638  NUDIX hydrolase  39.09 
 
 		 140 aa  83.6  9e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0477053 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1184  NUDIX hydrolase  39.09 
 
 		 140 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1664  NUDIX hydrolase  39.09 
 
 		 140 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.731684  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2939  NUDIX hydrolase  37.4 
 
 		 130 aa  80.9  0.000000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1563  NUDIX hydrolase  38.18 
 
 		 142 aa  80.5  0.000000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1582  NUDIX hydrolase  38.18 
 
 		 142 aa  80.5  0.000000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.4234  normal  0.299083 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3522  NUDIX hydrolase  36.04 
 
 		 141 aa  79.3  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.478841 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4812  NUDIX hydrolase  36.28 
 
 		 140 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.5658 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2082  NUDIX hydrolase  37.21 
 
 		 146 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.494024 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5852  NUDIX hydrolase  38.83 
 
 		 122 aa  73.6  0.0000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1577  NUDIX hydrolase  39.22 
 
 		 137 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.479976  normal  0.0612307 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3967  MutT/nudix family protein  40.38 
 
 		 146 aa  71.6  0.000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.447658  normal  0.0696331 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4233  NUDIX hydrolase  40 
 
 		 135 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.257262  normal  0.463125 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2944  NUDIX hydrolase  42.11 
 
 		 140 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.948773 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5518  NUDIX hydrolase  37.86 
 
 		 183 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.434768 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5170  NUDIX hydrolase  39.58 
 
 		 124 aa  64.7  0.0000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.140908  normal  0.555587 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1285  NUDIX hydrolase  40.78 
 
 		 185 aa  64.3  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.270966  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6546  NUDIX hydrolase  40.78 
 
 		 185 aa  64.3  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.293619  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6153  NUDIX hydrolase  40.78 
 
 		 185 aa  63.5  0.0000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.292779 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6007  NUDIX hydrolase  36.19 
 
 		 165 aa  62.4  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5533  NUDIX hydrolase  34.82 
 
 		 147 aa  62  0.000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00579175 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1837  MutT/NUDIX family hydrolase  33.04 
 
 		 158 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.158104  normal  0.782631 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4759  NUDIX hydrolase  39.18 
 
 		 203 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.420324 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0710  NUDIX hydrolase  35.63 
 
 		 154 aa  57.4  0.00000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.409696 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1656  NUDIX hydrolase  31.62 
 
 		 152 aa  56.6  0.0000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.632067  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1678  hypothetical protein  54.35 
 
 		 306 aa  55.1  0.0000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.552334  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2076  NUDIX hydrolase  37.76 
 
 		 141 aa  55.1  0.0000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.963545 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3562  NUDIX hydrolase  37.21 
 
 		 135 aa  54.7  0.0000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0467  NUDIX hydrolase  37.21 
 
 		 135 aa  54.3  0.0000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2614  NUDIX hydrolase  48.48 
 
 		 152 aa  53.9  0.0000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.349258  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4397  NUDIX hydrolase  38.78 
 
 		 126 aa  54.3  0.0000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0874525  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2044  NUDIX hydrolase  32.23 
 
 		 147 aa  54.3  0.0000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00490099 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4483  NUDIX hydrolase  35.78 
 
 		 153 aa  53.9  0.0000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0620  NUDIX hydrolase  44.93 
 
 		 282 aa  53.1  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.253457 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4976  NUDIX hydrolase  48.15 
 
 		 197 aa  53.1  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00200112 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0833  NUDIX hydrolase  32.99 
 
 		 155 aa  52  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0297624  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0463  NUDIX hydrolase  36.05 
 
 		 135 aa  52.8  0.000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0105  NUDIX hydrolase  37.5 
 
 		 154 aa  52  0.000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3208  NUDIX hydrolase  41.86 
 
 		 168 aa  51.2  0.000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.135414  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1047  NUDIX hydrolase  31.4 
 
 		 158 aa  51.2  0.000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0464  MutT/nudix family protein  36.05 
 
 		 135 aa  51.2  0.000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1261  NUDIX hydrolase  37.61 
 
 		 147 aa  51.2  0.000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.394929  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0924  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 133 aa  50.8  0.000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0027  NUDIX hydrolase  35.78 
 
 		 281 aa  51.2  0.000005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.130084  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2957  MutT/nudix family protein  40.79 
 
 		 159 aa  50.8  0.000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2640  MutT/nudix family protein  40.79 
 
 		 159 aa  50.8  0.000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0434568  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2902  NUDIX hydrolase  33.05 
 
 		 219 aa  50.8  0.000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00219034  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0058  NUDIX hydrolase  34.58 
 
 		 183 aa  50.8  0.000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.993982  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1264  putative MutT/Nudix family protein  33.64 
 
 		 132 aa  50.8  0.000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0696899 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5641  NUDIX hydrolase  46.15 
 
 		 239 aa  50.4  0.000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1221  NUDIX hydrolase  48.15 
 
 		 221 aa  50.4  0.000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.365989  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5262  NUDIX hydrolase  46.15 
 
 		 240 aa  50.4  0.000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5351  NUDIX hydrolase  46.15 
 
 		 239 aa  50.4  0.000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2616  NUDIX hydrolase  58.7 
 
 		 146 aa  50.4  0.000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0299  mutator mutT protein  35.56 
 
 		 139 aa  50.1  0.00001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0361617  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0011  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 144 aa  49.7  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.695589  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7955  hypothetical protein  41.12 
 
 		 172 aa  49.7  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1932  NUDIX hydrolase  50 
 
 		 221 aa  50.1  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00450491 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7346  hypothetical protein  41.18 
 
 		 173 aa  49.7  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1483  NUDIX hydrolase  35.96 
 
 		 210 aa  49.7  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.163061 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2381  putative Nudix hydrolase family protein  35.43 
 
 		 139 aa  50.1  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.489337 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1467  NUDIX hydrolase  30.43 
 
 		 135 aa  50.1  0.00001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1523  NUDIX hydrolase  34.38 
 
 		 158 aa  49.3  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2439  NUDIX hydrolase  39.29 
 
 		 181 aa  49.3  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000635517  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0613  NUDIX hydrolase  32.32 
 
 		 171 aa  48.9  0.00002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5787  NUDIX hydrolase  45.28 
 
 		 238 aa  48.9  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0502  nucleotide phosphate derivative pyrophosphohydrolases, MutT/nudix family protein  40 
 
 		 181 aa  49.3  0.00002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0414588 
 
 
-
 
NC_004310  BR0672  MutT/nudix family protein  45.16 
 
 		 147 aa  48.5  0.00003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.959271  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1350  NUDIX hydrolase  50 
 
 		 143 aa  48.5  0.00003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.246365  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2976  NUDIX hydrolase  37.66 
 
 		 106 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.505456  normal  0.467098 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0877  MutT-like protein  39.34 
 
 		 144 aa  48.5  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2785  nucleoside triphosphatase YtkD  38.16 
 
 		 153 aa  48.9  0.00003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0783  NUDIX hydrolase  38.1 
 
 		 139 aa  48.1  0.00004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0156175  normal  0.134596 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4942  mutT/nudix family protein  40.98 
 
 		 159 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0632  NUDIX hydrolase  32.26 
 
 		 205 aa  47.8  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.224471 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4683  mutT/nudix family protein  40.98 
 
 		 159 aa  48.1  0.00004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4522  MutT family pyrophosphohydrolase  40.98 
 
 		 159 aa  48.1  0.00004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.986145  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4541  MutT/NUDIX family pyrophosphohydrolase  40.98 
 
 		 159 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0069  NUDIX hydrolase  52 
 
 		 147 aa  48.1  0.00004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.806669  hitchhiker  0.0000000185063 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0251  mutator mutT protein  33.94 
 
 		 130 aa  48.1  0.00004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4907  antimutator 8-oxo-(dGTP/GTP)ase  40.98 
 
 		 159 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5043  mutT/nudix family protein  40.98 
 
 		 159 aa  48.1  0.00004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.672649  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4928  antimutator 8-oxo-(dGTP/GTP)ase  40.98 
 
 		 159 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4620  nucleoside triphosphatase YtkD  40.98 
 
 		 159 aa  48.1  0.00004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4908  antimutator 8-oxo-(dGTP/GTP)ase  40.98 
 
 		 159 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0330  antimutator 8-oxo-(dGTP/GTP)ase  40.98 
 
 		 159 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0513  NUDIX hydrolase  36.76 
 
 		 138 aa  48.1  0.00004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.117627  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0415  NUDIX hydrolase  33.75 
 
 		 154 aa  48.1  0.00004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1197  NUDIX hydrolase  51.79 
 
 		 216 aa  47.8  0.00005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3770  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  35.05 
 
 		 131 aa  47.8  0.00005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0756732  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>