108 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HMPREF0424_0732 on replicon NC_013721
Organism: Gardnerella vaginalis 409-05



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013721  HMPREF0424_0732  hydrolase, NUDIX family  100 
 
 		 163 aa  335  1.9999999999999998e-91  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00265713 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0626  MutT/nudix family protein  40.24 
 
 		 161 aa  100  6e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000112131  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0990  NUDIX hydrolase  33.79 
 
 		 173 aa  70.9  0.000000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000363849  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1536  NUDIX hydrolase  33.79 
 
 		 331 aa  68.9  0.00000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.137745  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0396  NUDIX hydrolase  28.86 
 
 		 171 aa  60.1  0.00000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000159718  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1742  NUDIX hydrolase  30.13 
 
 		 166 aa  57.8  0.00000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.445003  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17300  ADP-ribose pyrophosphatase  29.45 
 
 		 172 aa  52.8  0.000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.197919  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3564  mutator MutT protein  32.14 
 
 		 132 aa  51.6  0.000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0674  NUDIX family hydrolase  35.16 
 
 		 177 aa  50.8  0.000007  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1564  Mutator protein MutT  31.58 
 
 		 134 aa  48.9  0.00003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1420  Mutator protein MutT  31.58 
 
 		 134 aa  48.1  0.00004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2360  putative mutator MutT protein  34.38 
 
 		 150 aa  48.5  0.00004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3976  NTP pyrophosphohydrolase MutT family  33.33 
 
 		 135 aa  48.5  0.00004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.495493  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0937  mutator MutT protein  36.71 
 
 		 134 aa  48.1  0.00005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.655368 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3010  mutator MutT protein  30.91 
 
 		 137 aa  47.8  0.00006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl471  nucleoside diphosphate (nudix) hydrolase  28.67 
 
 		 174 aa  47.4  0.00008  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00345431  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1939  mutator mutT protein, putative  33.33 
 
 		 138 aa  47.4  0.00009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1866  putative mutator mutT protein  33.33 
 
 		 138 aa  47.4  0.00009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.452444  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0837  NUDIX hydrolase  25.22 
 
 		 176 aa  47.4  0.00009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.172365  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1166  NTP pyrophosphohydrolase  29.09 
 
 		 132 aa  47  0.0001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2828  mutator MutT protein  29.09 
 
 		 132 aa  47  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.623153  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0397  mutator MutT protein  31.4 
 
 		 347 aa  47  0.0001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.527818 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3536  mutator MutT protein  32.43 
 
 		 142 aa  47  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3827  mutator MutT protein  32.43 
 
 		 137 aa  47  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.9578  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3582  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  41.82 
 
 		 131 aa  46.6  0.0001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000334964  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0292  mutator mutT protein  29.09 
 
 		 128 aa  45.8  0.0003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.476279 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1662  NUDIX hydrolase  44.12 
 
 		 201 aa  45.4  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2514  NUDIX hydrolase  30.97 
 
 		 135 aa  45.4  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.348957 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1025  mutator MutT protein  29.82 
 
 		 138 aa  45.8  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0393  NUDIX hydrolase  31.3 
 
 		 151 aa  45.1  0.0004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0143853  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2914  mutator mutT protein  30.91 
 
 		 136 aa  45.1  0.0004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.262626  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2596  mutator MutT protein  29.09 
 
 		 132 aa  45.1  0.0004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.202287  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2758  NUDIX hydrolase  28.18 
 
 		 132 aa  45.1  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0614  NUDIX hydrolase  32 
 
 		 135 aa  45.1  0.0004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0852421  normal  0.976562 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1733  mutator MutT protein  29.46 
 
 		 144 aa  45.4  0.0004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4393  NUDIX hydrolase  24.78 
 
 		 160 aa  45.1  0.0004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1486  NUDIX hydrolase  31.9 
 
 		 131 aa  44.7  0.0006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00282357  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0555  NUDIX hydrolase  40.62 
 
 		 177 aa  44.3  0.0006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00848301  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0011  NUDIX hydrolase  31.58 
 
 		 144 aa  44.7  0.0006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.695589  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2230  hypothetical protein  40 
 
 		 310 aa  44.3  0.0007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.328266  normal  0.270342 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0099  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  43.94 
 
 		 396 aa  44.3  0.0008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0722569  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2519  NUDIX hydrolase  31.07 
 
 		 133 aa  43.5  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0978  NUDIX hydrolase  29.77 
 
 		 189 aa  43.9  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2237  NUDIX hydrolase  34.33 
 
 		 169 aa  43.5  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0632516  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1991  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  33.33 
 
 		 184 aa  42.7  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28290  hypothetical protein  30.65 
 
 		 136 aa  42.7  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00379954  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5561  hypothetical protein  30.09 
 
 		 178 aa  43.1  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.546979  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2042  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 129 aa  43.1  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000547499 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0612  hypothetical protein  27.21 
 
 		 318 aa  43.1  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.362633  normal  0.329408 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1395  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  40.32 
 
 		 138 aa  42.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0511972 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5187  NUDIX hydrolase  28.23 
 
 		 171 aa  43.1  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.466723  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0219  NUDIX hydrolase  38.81 
 
 		 184 aa  42.7  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.772066 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2179  hypothetical protein  36.76 
 
 		 314 aa  42.4  0.003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.299804  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2826  pyrophosphohydrolase related protein  51.28 
 
 		 192 aa  42  0.003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3658  mutator MutT protein  32.04 
 
 		 135 aa  42.4  0.003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.236932  normal  0.362443 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1428  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  38.71 
 
 		 138 aa  42  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.522134  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1874  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  38.71 
 
 		 138 aa  42.4  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.400032  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2045  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  38.71 
 
 		 138 aa  42  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3659  hypothetical protein  40.38 
 
 		 316 aa  42  0.003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.817347  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1712  NUDIX hydrolase  30.3 
 
 		 138 aa  42.4  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.148507  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01728  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  37.5 
 
 		 135 aa  41.6  0.004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.10262  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1883  NUDIX hydrolase  37.5 
 
 		 135 aa  41.6  0.004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.410943  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0099  NUDIX hydrolase  28.7 
 
 		 291 aa  42  0.004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.474769  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1775  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 129 aa  42  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.296323  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2266  mutator MutT protein  35.9 
 
 		 138 aa  42  0.004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.97404 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0674  NUDIX hydrolase  38.37 
 
 		 182 aa  42  0.004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0138639  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1687  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  37.88 
 
 		 140 aa  41.6  0.004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1547  NUDIX hydrolase  33.72 
 
 		 334 aa  42  0.004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1716  NUDIX hydrolase  33 
 
 		 171 aa  42  0.004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0743315 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1873  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  37.5 
 
 		 135 aa  41.6  0.004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.440168  hitchhiker  0.000083786 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1010  NUDIX hydrolase  26.27 
 
 		 181 aa  42  0.004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01716  hypothetical protein  37.5 
 
 		 135 aa  41.6  0.004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.15744  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1983  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  37.5 
 
 		 135 aa  41.6  0.005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000136061  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0388  mutator MutT protein  27.88 
 
 		 138 aa  41.6  0.005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.616604 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2636  mutator MutT protein (7,8-dihydro-8-oxoguanine-triphosphatase)  31.4 
 
 		 133 aa  41.6  0.005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4529  A/G-specific adenine glycosylase  33.72 
 
 		 363 aa  41.6  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.593144 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0029  NUDIX hydrolase  32.56 
 
 		 137 aa  41.2  0.006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.999066 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0364  mutator mutT protein  29.59 
 
 		 137 aa  41.2  0.006  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2333  NUDIX hydrolase  30.51 
 
 		 143 aa  41.2  0.006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0725  NUDIX hydrolase  29.25 
 
 		 178 aa  41.2  0.006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1977  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  39.68 
 
 		 128 aa  41.2  0.006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000101182  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2586  NUDIX hydrolase  25.44 
 
 		 138 aa  41.2  0.006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2341  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  39.68 
 
 		 128 aa  41.2  0.006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000814495  normal  0.025223 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2086  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  39.68 
 
 		 128 aa  41.2  0.006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.16532  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1412  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  38.71 
 
 		 138 aa  41.2  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.559865  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1553  NUDIX hydrolase  27.84 
 
 		 182 aa  41.2  0.006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0387  NUDIX hydrolase  28.33 
 
 		 129 aa  40.8  0.007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.724674  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0143  Mutator MutT  34.69 
 
 		 352 aa  40.8  0.007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0673  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  29.84 
 
 		 360 aa  41.2  0.007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.21066  normal  0.501858 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0058  NUDIX hydrolase  34.67 
 
 		 183 aa  41.2  0.007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.993982  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3753  NUDIX hydrolase  32.26 
 
 		 206 aa  41.2  0.007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.641661  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0471  NUDIX hydrolase  37.5 
 
 		 184 aa  40.8  0.007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.115783  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3770  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  25.6 
 
 		 131 aa  41.2  0.007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0756732  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0705  MutT/nudix family protein  30.85 
 
 		 185 aa  40.8  0.008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1843  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  37.5 
 
 		 135 aa  40.8  0.008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.910246  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1430  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  37.5 
 
 		 135 aa  40.8  0.008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.166534  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1170  NUDIX hydrolase  23.73 
 
 		 137 aa  40.8  0.009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000110534  normal  0.0271169 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1905  NUDIX hydrolase  32.86 
 
 		 179 aa  40.4  0.009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000619655  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1577  NUDIX hydrolase  32.67 
 
 		 137 aa  40.8  0.009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.479976  normal  0.0612307 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13370  hypothetical protein  31.48 
 
 		 313 aa  40.8  0.009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>