87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_1010 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_1010  NUDIX hydrolase  100 
 
 
181 aa  348  3e-95  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25510  ADP-ribose pyrophosphatase  59.15 
 
 
165 aa  165  2.9999999999999998e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0162353  normal  0.120334 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1229  septum formation protein Maf  47.16 
 
 
475 aa  144  6e-34  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000255715 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1136  NUDIX hydrolase  52.84 
 
 
335 aa  144  6e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.472078  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2308  NUDIX hydrolase  48.8 
 
 
167 aa  142  4e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.000433057  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0837  NUDIX hydrolase  49.7 
 
 
176 aa  139  1.9999999999999998e-32  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.172365  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1609  Nucleotide-binding protein  45.35 
 
 
484 aa  135  4e-31  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1033  NUDIX hydrolase  52.73 
 
 
161 aa  134  7.000000000000001e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.997989 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2056  NUDIX hydrolase  47.43 
 
 
165 aa  132  3e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000128394 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0099  NUDIX hydrolase  45.68 
 
 
291 aa  123  1e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.474769  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0097  hypothetical protein  42.94 
 
 
299 aa  120  9.999999999999999e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10418  mutator protein mutT3  43.75 
 
 
217 aa  117  9e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0449167  normal  0.708231 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4393  NUDIX hydrolase  47.83 
 
 
160 aa  115  1.9999999999999998e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4360  NUDIX hydrolase  44.44 
 
 
153 aa  115  3e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.11563  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24850  ADP-ribose pyrophosphatase  46.3 
 
 
305 aa  114  5e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.203973  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0188  hypothetical protein  44.72 
 
 
287 aa  114  7.999999999999999e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.626289  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5298  NUDIX hydrolase  44.72 
 
 
170 aa  106  2e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0543  NUDIX hydrolase  46.58 
 
 
174 aa  105  3e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.643343  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0555  NUDIX hydrolase  46.58 
 
 
174 aa  105  3e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.51062  normal  0.852901 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0533  NUDIX hydrolase  46.58 
 
 
174 aa  105  3e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3752  NUDIX hydrolase  42.77 
 
 
156 aa  100  1e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3604  NUDIX hydrolase  38.51 
 
 
292 aa  94.7  6e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.763493  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0706  NUDIX hydrolase  46.15 
 
 
179 aa  93.6  1e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0747129 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0199  NUDIX hydrolase  44.87 
 
 
180 aa  91.7  5e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2026  NUDIX hydrolase  42.22 
 
 
152 aa  73.6  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0458229  normal  0.665559 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1428  NUDIX hydrolase  34.51 
 
 
170 aa  50.4  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.516023  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2649  NUDIX hydrolase  38.37 
 
 
209 aa  48.5  0.00005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0213367  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2716  MutT/NUDIX family protein  33.64 
 
 
137 aa  48.1  0.00008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1901  NUDIX hydrolase  48.08 
 
 
231 aa  47  0.0001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.576777  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0922  NUDIX hydrolase  45.33 
 
 
136 aa  47  0.0002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1523  NUDIX hydrolase  31.25 
 
 
158 aa  46.2  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1318  protein of unknown function DUF1289  43.02 
 
 
267 aa  45.4  0.0005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.196513  normal  0.297563 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0937  hypothetical protein  48.15 
 
 
202 aa  45.1  0.0005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0131467 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2973  putative mutT-like protein  30 
 
 
158 aa  45.1  0.0006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1798  LacI family transcription regulator  34.58 
 
 
473 aa  45.1  0.0006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.651793 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5333  NUDIX hydrolase  30.63 
 
 
156 aa  44.7  0.0008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.66797  normal  0.0715353 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0080  NUDIX hydrolase  36.19 
 
 
195 aa  44.7  0.0008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8698  ADP-ribose pyrophosphatase-like protein  30.36 
 
 
159 aa  43.9  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4112  NUDIX hydrolase  37.97 
 
 
219 aa  43.9  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0690871  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1319  NUDIX hydrolase  31.58 
 
 
143 aa  44.3  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3483  NUDIX hydrolase  28.28 
 
 
186 aa  44.3  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4759  NUDIX hydrolase  30.08 
 
 
203 aa  44.3  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.420324 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1156  mutator MutT protein  38.78 
 
 
126 aa  44.3  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000464506  normal  0.12144 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1914  NUDIX hydrolase  29.91 
 
 
149 aa  43.5  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.592421  normal  0.977797 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0260  ADP-ribose diphosphatase NudE  28 
 
 
188 aa  43.1  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0135852 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8672  ADP-ribose pyrophosphatase-like protein  31.82 
 
 
158 aa  43.1  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2041  8-oxo-dGTPase  33.96 
 
 
162 aa  43.1  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1389  NUDIX hydrolase  32.54 
 
 
324 aa  43.1  0.002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.524565  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3165  NUDIX hydrolase  48.15 
 
 
225 aa  43.5  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.036982 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0275  ADP-ribose diphosphatase NudE  28 
 
 
188 aa  43.1  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1522  hydrolase NUDIX family domain-containing protein  33.98 
 
 
151 aa  43.5  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.596031  normal  0.175565 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0933  hypothetical protein  41.25 
 
 
209 aa  42.7  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.825014 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2686  hydrolase NUDIX family domain-containing protein  34.12 
 
 
151 aa  43.5  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000310131  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2765  NUDIX hydrolase  33.98 
 
 
151 aa  43.5  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000000522672  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4130  mutT/nudix family protein  27.07 
 
 
149 aa  42.7  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000966346  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1108  mutT/nudix family protein  27.07 
 
 
149 aa  42.4  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.979518  normal  0.39926 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1135  NUDIX hydrolase  29.73 
 
 
156 aa  42.7  0.003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0641209  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4950  ADP-ribose diphosphatase NudE  29.63 
 
 
188 aa  42.7  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.247052  hitchhiker  0.0000179344 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2121  NUDIX hydrolase  27.66 
 
 
140 aa  42.4  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.575199  decreased coverage  0.00514227 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4241  NUDIX hydrolase  44.23 
 
 
219 aa  42  0.004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3853  NUDIX hydrolase  27.07 
 
 
149 aa  42  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.785148  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0879  NUDIX hydrolase  42.59 
 
 
234 aa  42.4  0.004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.29016  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0808  NUDIX hydrolase  42.59 
 
 
234 aa  42.4  0.004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.655823  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4431  NUDIX hydrolase  32.08 
 
 
164 aa  42  0.004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4077  mutT/nudix family protein  27.07 
 
 
185 aa  42.4  0.004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.811281  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2644  NUDIX hydrolase  34.04 
 
 
195 aa  42.4  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.688454  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1103  nudix hydrolase  36.46 
 
 
524 aa  42  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.426954 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0721  NUDIX hydrolase  44 
 
 
234 aa  42  0.005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0732  hydrolase, NUDIX family  26.27 
 
 
163 aa  42  0.005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00265713 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0833  NUDIX hydrolase  39.22 
 
 
155 aa  42  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0297624  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2466  hypothetical protein  34.78 
 
 
136 aa  42  0.005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3766  MutT/Nudix family protein  27.07 
 
 
161 aa  41.6  0.006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3781  MutT/Nudix family protein  27.07 
 
 
161 aa  41.6  0.006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4044  mutT/nudix family protein  27.07 
 
 
149 aa  41.6  0.006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4151  mutT/nudix family protein  27.07 
 
 
149 aa  41.6  0.006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0315306  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3933  mutT/nudix family protein  27.07 
 
 
161 aa  41.6  0.007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4241  mutT/nudix family protein  27.07 
 
 
161 aa  41.6  0.007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.602945  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5262  NUDIX hydrolase  40.38 
 
 
240 aa  41.2  0.008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01947  NTP pyrophosphohydrolase, NUDIX family protein  30.69 
 
 
190 aa  41.2  0.008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00222276  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5351  NUDIX hydrolase  40.38 
 
 
239 aa  41.2  0.008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5641  NUDIX hydrolase  40.38 
 
 
239 aa  41.2  0.008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0285  ADP-ribose diphosphatase NudE  28.97 
 
 
188 aa  40.8  0.009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4270  NUDIX hydrolase  50 
 
 
247 aa  40.8  0.009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.52337  normal  0.33973 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0306  hypothetical protein  33.98 
 
 
321 aa  40.8  0.01  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1273  NUDIX hydrolase  36 
 
 
198 aa  40.8  0.01  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2845  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  32.76 
 
 
315 aa  40.8  0.01  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1730  NUDIX hydrolase  38.64 
 
 
137 aa  40.8  0.01  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.324696 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>