120 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SAG0626 on replicon NC_004116
Organism: Streptococcus agalactiae 2603V/R



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004116  SAG0626  MutT/nudix family protein  100 
 
 
161 aa  334  3.9999999999999995e-91  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000112131  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0732  hydrolase, NUDIX family  40.24 
 
 
163 aa  100  6e-21  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00265713 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0396  NUDIX hydrolase  36.05 
 
 
171 aa  78.2  0.00000000000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000159718  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0990  NUDIX hydrolase  41.86 
 
 
173 aa  77.8  0.00000000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000363849  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1536  NUDIX hydrolase  27.33 
 
 
331 aa  67.4  0.00000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.137745  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1742  NUDIX hydrolase  29.94 
 
 
166 aa  66.2  0.0000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.445003  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17300  ADP-ribose pyrophosphatase  29.2 
 
 
172 aa  55.5  0.0000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.197919  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1867  NUDIX hydrolase  27.54 
 
 
183 aa  54.3  0.0000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4438  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  37.93 
 
 
199 aa  53.1  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37240  ADP-ribose pyrophosphatase  36.36 
 
 
136 aa  53.5  0.000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1593  NUDIX hydrolase  31.87 
 
 
189 aa  52.8  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3318  NUDIX hydrolase  28.86 
 
 
185 aa  52.4  0.000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.000000000044442  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0346  NUDIX hydrolase  35.96 
 
 
182 aa  52.4  0.000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0239643 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2237  NUDIX hydrolase  28.33 
 
 
169 aa  51.6  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0632516  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0419  Isopentenyl-diphosphate Delta-isomerase  25.77 
 
 
187 aa  51.6  0.000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl471  nucleoside diphosphate (nudix) hydrolase  30.68 
 
 
174 aa  51.2  0.000005  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00345431  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1499  Mut/nudix family protein, putative isopentenyl-diphosphate isomerase  31.78 
 
 
170 aa  51.2  0.000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  9.38166e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0080  NUDIX hydrolase  33.64 
 
 
195 aa  50.8  0.000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1126  dimethyladenosine transferase  27.45 
 
 
459 aa  50.8  0.000007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0870793  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3659  hypothetical protein  30.37 
 
 
316 aa  50.8  0.000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.817347  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0674  NUDIX family hydrolase  33.33 
 
 
177 aa  50.1  0.00001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1205  hypothetical protein  29.03 
 
 
182 aa  50.4  0.00001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000418064 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1991  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  35.62 
 
 
184 aa  49.7  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5451  NUDIX hydrolase  30.26 
 
 
161 aa  49.3  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3270  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  30.36 
 
 
181 aa  49.3  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3207  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  30.36 
 
 
181 aa  49.3  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.321651 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3195  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  30.36 
 
 
181 aa  49.3  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.376007  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3375  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  30.36 
 
 
181 aa  49.3  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.923272  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2726  Isopentenyl-diphosphate Delta-isomerase  29.33 
 
 
216 aa  49.3  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.546258  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1959  NUDIX hydrolase  28.95 
 
 
196 aa  49.3  0.00002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.372281  normal  0.231683 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3706  hypothetical protein  25.76 
 
 
314 aa  48.1  0.00005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.461385 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0610  NUDIX hydrolase  28.45 
 
 
178 aa  48.1  0.00005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0690731 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0565  NUDIX hydrolase  28.45 
 
 
177 aa  47.8  0.00007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0604  NUDIX hydrolase  28.45 
 
 
177 aa  47.8  0.00007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64010  hypothetical protein  26.9 
 
 
178 aa  47.4  0.00009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0523  NUDIX hydrolase  32.37 
 
 
133 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.23727 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2826  NUDIX hydrolase  29.82 
 
 
185 aa  46.6  0.0001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1185  NUDIX hydrolase  31.52 
 
 
187 aa  47  0.0001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0774  Isopentenyl-diphosphate Delta-isomerase  28.38 
 
 
186 aa  47  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2029  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, type 1  35.06 
 
 
210 aa  47  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0672691  hitchhiker  0.00592267 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1568  Isopentenyl-diphosphate Delta-isomerase  29.33 
 
 
203 aa  46.6  0.0001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.331903 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0625  NUDIX hydrolase  23.7 
 
 
185 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1166  NTP pyrophosphohydrolase  32.17 
 
 
132 aa  46.2  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0393  NUDIX hydrolase  29.45 
 
 
151 aa  46.6  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0143853  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3251  NUDIX hydrolase  31.54 
 
 
178 aa  46.2  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000109349  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2828  mutator MutT protein  32.17 
 
 
132 aa  46.2  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.623153  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3273  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  29.46 
 
 
181 aa  46.6  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2848  NUDIX hydrolase  27.08 
 
 
184 aa  45.4  0.0003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.00000000562976  normal  0.434056 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5570  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  32.05 
 
 
227 aa  45.4  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4600  NUDIX hydrolase  31.03 
 
 
178 aa  45.8  0.0003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0447936 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3745  NAD(+) diphosphatase  22.48 
 
 
303 aa  45.4  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00545287  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0820  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  25.38 
 
 
182 aa  45.1  0.0004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0725  NUDIX hydrolase  32.97 
 
 
178 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2043  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, type 1  25.2 
 
 
172 aa  44.7  0.0006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.82849  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1826  phosphohydrolase  34.85 
 
 
161 aa  44.7  0.0006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07000  NUDIX hydrolase  26.02 
 
 
177 aa  44.3  0.0006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1582  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  33.33 
 
 
181 aa  44.3  0.0007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.196336  normal  0.154748 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3048  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  25.38 
 
 
182 aa  44.3  0.0007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2376  NUDIX hydrolase  30.12 
 
 
197 aa  44.3  0.0007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.278695  normal  0.316272 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1120  NUDIX hydrolase  35.59 
 
 
178 aa  44.3  0.0008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2586  NUDIX hydrolase  30.43 
 
 
138 aa  43.9  0.0008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0292  mutator mutT protein  31.53 
 
 
128 aa  43.5  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.476279 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2441  mutator MutT protein  28.66 
 
 
329 aa  43.5  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5561  hypothetical protein  25.52 
 
 
178 aa  43.5  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.546979  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3022  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  24.62 
 
 
182 aa  43.5  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1754  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, type 1  26.23 
 
 
191 aa  43.5  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.202271  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1708  NUDIX hydrolase  31.43 
 
 
170 aa  43.5  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02721  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  24.81 
 
 
182 aa  42.7  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.304436  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0803  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, type 1  25.89 
 
 
182 aa  43.1  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.010723  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8547  NUDIX hydrolase  26.67 
 
 
156 aa  42.7  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00677981  hitchhiker  0.000239658 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0595  NUDIX hydrolase  28.16 
 
 
156 aa  43.1  0.002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.652543 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4928  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  32.95 
 
 
199 aa  42.7  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.358749  normal  0.255355 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2241  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
202 aa  43.1  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0585336  normal  0.241237 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2636  mutator MutT protein (7,8-dihydro-8-oxoguanine-triphosphatase)  37.36 
 
 
133 aa  43.1  0.002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02684  hypothetical protein  24.81 
 
 
166 aa  42.7  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.406743  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4840  mutT/nudix family protein  31.75 
 
 
180 aa  42.4  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1662  MutT/Nudix family protein  36.36 
 
 
161 aa  42.4  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.824241  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2967  NUDIX hydrolase  30.61 
 
 
142 aa  42  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.668202  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1553  NUDIX hydrolase  28.18 
 
 
182 aa  42.4  0.003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0387  NUDIX hydrolase  30.56 
 
 
129 aa  42.4  0.003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.724674  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2431  NUDIX hydrolase  29.51 
 
 
132 aa  42.4  0.003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00584965  normal  0.262781 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2065  NUDIX family hydrolase  34.02 
 
 
176 aa  42.4  0.003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.862102  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1779  adp-ribose pyrophosphatase  39.39 
 
 
176 aa  42  0.003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1506  NUDIX hydrolase  24.55 
 
 
390 aa  42.4  0.003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3308  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  24.81 
 
 
182 aa  42.4  0.003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3516  phosphohydrolase  38.98 
 
 
145 aa  42.4  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2458  NUDIX hydrolase  33.87 
 
 
138 aa  42.4  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0533  NUDIX hydrolase  38.98 
 
 
140 aa  42  0.004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0228598  normal  0.521082 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6228  NUDIX hydrolase  28.57 
 
 
208 aa  41.6  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.833986  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0110  NUDIX hydrolase  30.15 
 
 
133 aa  42  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0482  NUDIX hydrolase  30.22 
 
 
150 aa  42  0.004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2968  NAD(+) diphosphatase  25.76 
 
 
303 aa  41.6  0.004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4678  mutT/nudix family protein  28.04 
 
 
140 aa  41.6  0.004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  1.1477999999999999e-21 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3976  NTP pyrophosphohydrolase MutT family  29.09 
 
 
135 aa  42  0.004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.495493  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_13493  predicted protein  28.32 
 
 
256 aa  41.6  0.005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3215  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  25 
 
 
182 aa  41.6  0.005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2448  NUDIX hydrolase  42.19 
 
 
137 aa  41.6  0.005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0479485  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2284  NUDIX hydrolase  32.22 
 
 
195 aa  41.6  0.005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.151549  normal  0.0451993 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4179  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  25 
 
 
182 aa  41.6  0.005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2559  NUDIX hydrolase  32.22 
 
 
195 aa  41.6  0.005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.599331  normal  0.115662 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>