79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OEOE_0674 on replicon NC_008528
Organism: Oenococcus oeni PSU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008528  OEOE_0674  NUDIX family hydrolase  100 
 
 
177 aa  363  1e-100  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1536  NUDIX hydrolase  39.71 
 
 
331 aa  99.4  2e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.137745  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0990  NUDIX hydrolase  32.41 
 
 
173 aa  85.1  5e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000363849  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1742  NUDIX hydrolase  29.59 
 
 
166 aa  74.7  0.0000000000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.445003  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0396  NUDIX hydrolase  27.44 
 
 
171 aa  68.2  0.00000000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000159718  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl471  nucleoside diphosphate (nudix) hydrolase  30.28 
 
 
174 aa  65.5  0.0000000004  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00345431  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4600  NUDIX hydrolase  32.26 
 
 
178 aa  62.4  0.000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0447936 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0565  NUDIX hydrolase  32.26 
 
 
177 aa  60.8  0.00000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0604  NUDIX hydrolase  32.26 
 
 
177 aa  60.8  0.00000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0610  NUDIX hydrolase  30.95 
 
 
178 aa  60.1  0.00000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0690731 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5561  hypothetical protein  29.27 
 
 
178 aa  58.9  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.546979  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0725  NUDIX hydrolase  26.83 
 
 
178 aa  57  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3251  NUDIX hydrolase  29.91 
 
 
178 aa  55.8  0.0000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000109349  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64010  hypothetical protein  28.46 
 
 
178 aa  55.8  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07000  NUDIX hydrolase  26.98 
 
 
177 aa  55.5  0.0000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4840  mutT/nudix family protein  26.83 
 
 
180 aa  55.1  0.0000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4379  NUDIX hydrolase  23.98 
 
 
181 aa  54.3  0.0000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.312753  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1499  Mut/nudix family protein, putative isopentenyl-diphosphate isomerase  27.78 
 
 
170 aa  53.9  0.000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  9.38166e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2376  NUDIX hydrolase  31.46 
 
 
197 aa  53.1  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.278695  normal  0.316272 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17300  ADP-ribose pyrophosphatase  30 
 
 
172 aa  53.1  0.000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.197919  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3117  NUDIX hydrolase  33.7 
 
 
178 aa  52.4  0.000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.129541  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0732  hydrolase, NUDIX family  35.16 
 
 
163 aa  50.8  0.000009  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00265713 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1205  hypothetical protein  25.15 
 
 
182 aa  49.7  0.00002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000418064 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0626  MutT/nudix family protein  33.33 
 
 
161 aa  50.1  0.00002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000112131  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1991  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  30 
 
 
184 aa  48.9  0.00004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1553  NUDIX hydrolase  35.59 
 
 
182 aa  48.9  0.00004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0674  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  29.89 
 
 
177 aa  48.9  0.00004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.90735  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13638  putative isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  28.41 
 
 
174 aa  48.5  0.00005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.279506  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1831  NUDIX hydrolase  31.76 
 
 
202 aa  48.1  0.00006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000890359  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2276  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, type 1  29.35 
 
 
176 aa  47.8  0.00008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00103129 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1548  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, type 1  28.12 
 
 
179 aa  47  0.0001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.51389  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0346  NUDIX hydrolase  34.78 
 
 
182 aa  47  0.0002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0239643 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0625  NUDIX hydrolase  24.81 
 
 
185 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2739  NUDIX hydrolase  32.95 
 
 
273 aa  46.2  0.0002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.275113  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2826  NUDIX hydrolase  28.32 
 
 
185 aa  45.8  0.0003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3467  NUDIX hydrolase  32.95 
 
 
289 aa  45.1  0.0005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.431608 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3569  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, type 1  23.68 
 
 
197 aa  45.1  0.0006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.863637 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3359  mutT/nudix family protein  28.57 
 
 
202 aa  45.1  0.0006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.039473  hitchhiker  0.00000000000000713164 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2914  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, type 1  27.08 
 
 
179 aa  44.7  0.0007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2201  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, type 1  29.27 
 
 
179 aa  44.3  0.0008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.43573  hitchhiker  0.00000497991 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2049  mutT/nudix family protein  28.57 
 
 
202 aa  44.3  0.0008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00026256  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1781  MutT/Nudix family protein  28.57 
 
 
202 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.893185  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2000  mutT/nudix family protein  27.66 
 
 
202 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.7905499999999994e-43 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0363  mutator MutT protein  36.99 
 
 
131 aa  44.3  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  unclonable  0.00000739307 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4731  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, type 1  25.17 
 
 
171 aa  43.9  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.291133  decreased coverage  0.0000344266 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1798  MutT/Nudix family protein  27.66 
 
 
202 aa  43.5  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.840162  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1968  mutT/nudix family protein  29.17 
 
 
202 aa  44.3  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0475736  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2070  mutT/nudix family protein  27.55 
 
 
202 aa  43.9  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000173279  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3404  NUDIX hydrolase  32.95 
 
 
273 aa  43.9  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.707971  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1126  dimethyladenosine transferase  29.9 
 
 
459 aa  44.3  0.001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0870793  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3852  NUDIX hydrolase  48.84 
 
 
272 aa  43.5  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5387  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
283 aa  44.3  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.503936 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03249  mutator mutT protein  41.18 
 
 
127 aa  43.9  0.001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4564  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  28.57 
 
 
196 aa  44.3  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.669276  hitchhiker  0.00145949 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3639  NUDIX hydrolase  28 
 
 
142 aa  42.7  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2550  hypothetical protein  26.8 
 
 
203 aa  43.1  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.159383  normal  0.669028 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1867  NUDIX hydrolase  29.29 
 
 
183 aa  43.1  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1823  mutT/nudix family protein  28.57 
 
 
202 aa  42.7  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00460593  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1593  NUDIX hydrolase  21.56 
 
 
189 aa  42.7  0.003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7624  NUDIX hydrolase  42.37 
 
 
169 aa  42.7  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.299419  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1964  mutT/nudix family protein  28.57 
 
 
202 aa  42.7  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000761489  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2032  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, type 1  28.12 
 
 
171 aa  42  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2236  NUDIX hydrolase  30.34 
 
 
322 aa  42  0.004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0207  NUDIX hydrolase  29.6 
 
 
147 aa  42.4  0.004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000107343 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2042  MutT/Nudix family protein  31.16 
 
 
149 aa  42  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.585593  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24710  ADP-ribose pyrophosphatase  23.46 
 
 
255 aa  42  0.005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9366  Isopentenyl-diphosphate Delta-isomerase  28.92 
 
 
193 aa  41.6  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.706923 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2030  mutT/nudix family protein  28.7 
 
 
153 aa  41.6  0.006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.83484e-43 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1825  MutT/Nudix family protein  28.7 
 
 
153 aa  41.6  0.006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000200422  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0154  mutT/nudix family protein  26.53 
 
 
147 aa  41.6  0.006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1997  mutT/nudix family protein  28.7 
 
 
153 aa  41.6  0.007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000428877  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1854  mutT/nudix family protein  28.7 
 
 
153 aa  41.6  0.007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.443134  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3209  NUDIX hydrolase  42 
 
 
134 aa  41.2  0.007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.663648  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2094  mutT/nudix family protein  28.7 
 
 
153 aa  41.2  0.008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000267721  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1809  MutT/Nudix family protein  28.7 
 
 
153 aa  41.2  0.009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00380434  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3330  mutT/nudix family protein  28.7 
 
 
153 aa  41.2  0.009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000371651  unclonable  1.49498e-25 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3081  mutT/nudix family protein  30.15 
 
 
149 aa  41.2  0.009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000075135 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2289  mutT/nudix family protein  30.43 
 
 
149 aa  40.8  0.01  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.401788  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3045  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, type 1  30.61 
 
 
180 aa  40.8  0.01  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>