141 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_2826 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007963  Csal_2826  NUDIX hydrolase  100 
 
 
185 aa  381  1e-105  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0625  NUDIX hydrolase  44.94 
 
 
185 aa  124  1e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4379  NUDIX hydrolase  43.12 
 
 
181 aa  121  6e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.312753  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4840  mutT/nudix family protein  41.11 
 
 
180 aa  115  3e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0725  NUDIX hydrolase  43.04 
 
 
178 aa  114  6e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07000  NUDIX hydrolase  45 
 
 
177 aa  114  1.0000000000000001e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4600  NUDIX hydrolase  41.48 
 
 
178 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0447936 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5561  hypothetical protein  44.14 
 
 
178 aa  110  9e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.546979  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0565  NUDIX hydrolase  40.78 
 
 
177 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64010  hypothetical protein  43.75 
 
 
178 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0610  NUDIX hydrolase  40.91 
 
 
178 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0690731 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0604  NUDIX hydrolase  40.78 
 
 
177 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1185  NUDIX hydrolase  41.46 
 
 
187 aa  107  7.000000000000001e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3318  NUDIX hydrolase  39.62 
 
 
185 aa  105  3e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.000000000044442  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2848  NUDIX hydrolase  42.11 
 
 
184 aa  104  9e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.00000000562976  normal  0.434056 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2561  NUDIX hydrolase  42.77 
 
 
201 aa  102  3e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.000000630284  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1383  NUDIX hydrolase  41.51 
 
 
203 aa  100  8e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000123288  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3389  NUDIX hydrolase  39.73 
 
 
181 aa  96.7  2e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1120  NUDIX hydrolase  37.72 
 
 
178 aa  94.4  8e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2782  NUDIX hydrolase  39.76 
 
 
216 aa  94.4  8e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000698062  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02224  predicted NUDIX hydrolase  42.76 
 
 
180 aa  94.4  9e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000212424  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1357  NUDIX hydrolase  42.76 
 
 
180 aa  94.4  9e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  2.43085e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1481  NUDIX hydrolase  39.76 
 
 
216 aa  94.4  9e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.0000381919  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2449  NUDIX family hydrolase  42.76 
 
 
180 aa  94.4  9e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  2.25281e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2593  NUDIX family hydrolase  42.76 
 
 
180 aa  94.4  9e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000583084  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1353  NUDIX hydrolase  42.76 
 
 
180 aa  94.4  9e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000000289722  normal  0.985207 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2455  NUDIX family hydrolase  42.76 
 
 
180 aa  94.4  9e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.000000000626304  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2675  hydrolase, NUDIX family protein  42.76 
 
 
180 aa  94.4  9e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  9.90885e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02184  hypothetical protein  42.76 
 
 
180 aa  94.4  9e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000358279  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3439  hydrolase, NUDIX family protein  42.76 
 
 
180 aa  94.4  9e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000227212  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2533  nudix hydrolase 3  42.11 
 
 
184 aa  92.4  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.0000206294  normal  0.801308 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2587  nudix hydrolase 3  42.11 
 
 
184 aa  92.4  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.0000345832  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2575  nudix hydrolase 3  42.11 
 
 
184 aa  92  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.00000332741  normal  0.705838 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2487  nudix hydrolase 3  42.11 
 
 
184 aa  92.4  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000530906  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2696  nudix hydrolase 3  42.11 
 
 
184 aa  92.4  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.000172824  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2237  NUDIX hydrolase  37.13 
 
 
169 aa  91.3  7e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0632516  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1436  NUDIX family hydrolase  37.8 
 
 
182 aa  90.9  9e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000974563  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0345  NUDIX family hydrolase  37.8 
 
 
182 aa  90.9  9e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.00000000116771  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1545  NUDIX hydrolase  37.8 
 
 
182 aa  90.9  9e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.0000000233987  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1867  NUDIX hydrolase  43.23 
 
 
183 aa  89.7  2e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1708  NUDIX hydrolase  35.76 
 
 
170 aa  84.7  7e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1126  dimethyladenosine transferase  32.09 
 
 
459 aa  74.3  0.0000000000008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0870793  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2376  NUDIX hydrolase  32.1 
 
 
197 aa  72  0.000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.278695  normal  0.316272 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_7007  predicted protein  33.13 
 
 
184 aa  69.7  0.00000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0346  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
182 aa  68.6  0.00000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0239643 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1536  NUDIX hydrolase  33.61 
 
 
331 aa  67.4  0.0000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.137745  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3117  NUDIX hydrolase  30.87 
 
 
178 aa  64.3  0.000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.129541  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3251  NUDIX hydrolase  30.16 
 
 
178 aa  62.4  0.000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000109349  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1408  NUDIX hydrolase  36.94 
 
 
178 aa  61.6  0.000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.797387  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3307  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  30.72 
 
 
183 aa  60.8  0.000000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.995091 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02721  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  28.39 
 
 
182 aa  59.3  0.00000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.304436  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1991  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  39.33 
 
 
184 aa  59.7  0.00000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02684  hypothetical protein  28.39 
 
 
166 aa  59.3  0.00000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.406743  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2201  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, type 1  29.5 
 
 
179 aa  59.3  0.00000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.43573  hitchhiker  0.00000497991 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1499  Mut/nudix family protein, putative isopentenyl-diphosphate isomerase  32.32 
 
 
170 aa  58.2  0.00000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  9.38166e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3215  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  29.11 
 
 
182 aa  58.5  0.00000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4179  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  29.11 
 
 
182 aa  58.5  0.00000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0803  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, type 1  29.11 
 
 
182 aa  58.2  0.00000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.010723  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2736  hypothetical protein  38.24 
 
 
196 aa  58.2  0.00000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.155618  normal  0.467171 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3022  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  28.39 
 
 
182 aa  58.2  0.00000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3308  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  28.39 
 
 
182 aa  58.2  0.00000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2043  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, type 1  29.93 
 
 
172 aa  58.2  0.00000008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.82849  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0820  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  28.39 
 
 
182 aa  58.2  0.00000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20640  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, type 1  30.99 
 
 
213 aa  58.2  0.00000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3048  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  28.39 
 
 
182 aa  57.8  0.00000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2914  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, type 1  30.07 
 
 
179 aa  57.8  0.0000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3270  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  27.74 
 
 
181 aa  57.8  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3207  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  27.74 
 
 
181 aa  57.8  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.321651 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3195  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  27.74 
 
 
181 aa  57.8  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.376007  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3375  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  27.74 
 
 
181 aa  57.8  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.923272  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13638  putative isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  26.22 
 
 
174 aa  55.8  0.0000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.279506  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3273  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  27.1 
 
 
181 aa  55.1  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1553  NUDIX hydrolase  29.2 
 
 
182 aa  53.9  0.000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45381  predicted protein  31.43 
 
 
451 aa  54.3  0.000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.22287  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5570  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  30.34 
 
 
227 aa  53.5  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0969  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  33.09 
 
 
191 aa  52.4  0.000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0417204 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1548  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, type 1  28.1 
 
 
179 aa  52.4  0.000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.51389  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1593  NUDIX hydrolase  27.54 
 
 
189 aa  52.8  0.000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04480  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  29.41 
 
 
200 aa  52.4  0.000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1754  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, type 1  32.12 
 
 
191 aa  52.4  0.000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.202271  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24100  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, type 1  30.07 
 
 
197 aa  52  0.000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4299  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, type 1  31.25 
 
 
197 aa  52  0.000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.651923  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2543  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, type 1  26.45 
 
 
181 aa  51.6  0.000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.188971  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4928  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  30.92 
 
 
199 aa  51.2  0.000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.358749  normal  0.255355 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5294  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  30.28 
 
 
190 aa  50.4  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_26905  predicted protein  43.75 
 
 
216 aa  50.4  0.00001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0375733  normal  0.0729725 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl471  nucleoside diphosphate (nudix) hydrolase  25.83 
 
 
174 aa  50.4  0.00002  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00345431  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5518  NUDIX hydrolase  33.09 
 
 
183 aa  50.1  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.434768 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0990  NUDIX hydrolase  28.47 
 
 
173 aa  50.1  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000363849  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3569  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, type 1  31.33 
 
 
197 aa  48.9  0.00004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.863637 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3045  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, type 1  32.89 
 
 
180 aa  48.5  0.00005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4438  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  34.13 
 
 
199 aa  48.1  0.00007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5942  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, type 1  30.57 
 
 
176 aa  48.1  0.00007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.934933  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0343  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, type 1  30.4 
 
 
198 aa  48.1  0.00007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.447974  normal  0.157249 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4188  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  28.78 
 
 
219 aa  47.8  0.00009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_14191  predicted protein  30.98 
 
 
238 aa  47.4  0.0001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.144173  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0269  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, type 1  25.97 
 
 
175 aa  47.4  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0626  MutT/nudix family protein  29.82 
 
 
161 aa  46.6  0.0002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000112131  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3442  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  35.71 
 
 
184 aa  46.6  0.0002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.580017  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12740  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  25.58 
 
 
196 aa  47  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.251434  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>