103 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_1593 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_1593  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 189 aa  390  1e-108  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1205  hypothetical protein  32 
 
 		 182 aa  77  0.0000000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000418064 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0990  NUDIX hydrolase  32.18 
 
 		 173 aa  74.7  0.0000000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000363849  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2376  NUDIX hydrolase  29.95 
 
 		 197 aa  74.3  0.000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.278695  normal  0.316272 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2765  NUDIX hydrolase  30.13 
 
 		 209 aa  72.8  0.000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1126  dimethyladenosine transferase  35.22 
 
 		 459 aa  72.4  0.000000000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0870793  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2070  mutT/nudix family protein  33.06 
 
 		 202 aa  66.2  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000173279  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2049  mutT/nudix family protein  33.06 
 
 		 202 aa  66.2  0.0000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00026256  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1831  NUDIX hydrolase  35.64 
 
 		 202 aa  66.2  0.0000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000890359  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1781  MutT/Nudix family protein  33.06 
 
 		 202 aa  65.9  0.0000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.893185  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1968  mutT/nudix family protein  36.63 
 
 		 202 aa  65.9  0.0000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0475736  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3359  mutT/nudix family protein  31.29 
 
 		 202 aa  65.5  0.0000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.039473  hitchhiker  0.00000000000000713164 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1823  mutT/nudix family protein  33.06 
 
 		 202 aa  65.5  0.0000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00460593  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1798  MutT/Nudix family protein  33.06 
 
 		 202 aa  65.5  0.0000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.840162  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1964  mutT/nudix family protein  33.06 
 
 		 202 aa  65.5  0.0000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000761489  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2000  mutT/nudix family protein  33.06 
 
 		 202 aa  65.5  0.0000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.7905499999999994e-43 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0396  NUDIX hydrolase  32.32 
 
 		 171 aa  65.1  0.0000000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000159718  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1499  Mut/nudix family protein, putative isopentenyl-diphosphate isomerase  41.18 
 
 		 170 aa  64.3  0.000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  9.38166e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1536  NUDIX hydrolase  27.78 
 
 		 331 aa  64.3  0.000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.137745  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_26905  predicted protein  35 
 
 		 216 aa  63.2  0.000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0375733  normal  0.0729725 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1991  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  37.36 
 
 		 184 aa  62.4  0.000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl471  nucleoside diphosphate (nudix) hydrolase  28.22 
 
 		 174 aa  62.4  0.000000004  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00345431  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0346  NUDIX hydrolase  39.36 
 
 		 182 aa  59.7  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0239643 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07000  NUDIX hydrolase  29.17 
 
 		 177 aa  60.1  0.00000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4928  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  26.46 
 
 		 199 aa  58.2  0.00000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.358749  normal  0.255355 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1742  NUDIX hydrolase  26.35 
 
 		 166 aa  57.8  0.00000009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.445003  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64010  hypothetical protein  27.78 
 
 		 178 aa  57.4  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0625  NUDIX hydrolase  33.61 
 
 		 185 aa  56.2  0.0000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3318  NUDIX hydrolase  28.66 
 
 		 185 aa  55.1  0.0000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.000000000044442  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5561  hypothetical protein  36.67 
 
 		 178 aa  54.7  0.0000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.546979  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2201  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, type 1  26.55 
 
 		 179 aa  53.9  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.43573  hitchhiker  0.00000497991 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0725  NUDIX hydrolase  38.82 
 
 		 178 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1436  NUDIX family hydrolase  31.01 
 
 		 182 aa  53.5  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000974563  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0345  NUDIX family hydrolase  31.01 
 
 		 182 aa  53.5  0.000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.00000000116771  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1545  NUDIX hydrolase  31.01 
 
 		 182 aa  53.5  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.0000000233987  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3117  NUDIX hydrolase  25.32 
 
 		 178 aa  53.1  0.000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.129541  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0626  MutT/nudix family protein  31.87 
 
 		 161 aa  52.8  0.000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000112131  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2826  NUDIX hydrolase  27.54 
 
 		 185 aa  52.8  0.000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3251  NUDIX hydrolase  32.34 
 
 		 178 aa  53.1  0.000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000109349  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2043  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, type 1  30.85 
 
 		 172 aa  52.8  0.000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.82849  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2914  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, type 1  32.32 
 
 		 179 aa  52.8  0.000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0674  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  34.07 
 
 		 177 aa  52.4  0.000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.90735  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2848  NUDIX hydrolase  28.21 
 
 		 184 aa  52.4  0.000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.00000000562976  normal  0.434056 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1867  NUDIX hydrolase  33.68 
 
 		 183 aa  52.4  0.000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1120  NUDIX hydrolase  25.61 
 
 		 178 aa  50.4  0.00001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3991  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  24.12 
 
 		 186 aa  51.2  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.189435  normal  0.153938 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1553  NUDIX hydrolase  30.85 
 
 		 182 aa  50.4  0.00001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3045  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, type 1  35.56 
 
 		 180 aa  50.8  0.00001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0565  NUDIX hydrolase  34.41 
 
 		 177 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0604  NUDIX hydrolase  34.41 
 
 		 177 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0610  NUDIX hydrolase  34.41 
 
 		 178 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0690731 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2877  NUDIX hydrolase  36.99 
 
 		 211 aa  50.4  0.00002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4840  mutT/nudix family protein  33.61 
 
 		 180 aa  49.7  0.00003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4379  NUDIX hydrolase  32.79 
 
 		 181 aa  49.7  0.00003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.312753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4438  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  27.65 
 
 		 199 aa  49.7  0.00003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1548  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, type 1  34.88 
 
 		 179 aa  49.3  0.00003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.51389  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45381  predicted protein  29.66 
 
 		 451 aa  48.9  0.00004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.22287  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24100  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, type 1  31.11 
 
 		 197 aa  48.9  0.00004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0619  diphosphomevalonate decarboxylase  29.11 
 
 		 503 aa  48.5  0.00005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0720  diphosphomevalonate decarboxylase/isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  29.11 
 
 		 503 aa  48.9  0.00005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0013091  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2237  NUDIX hydrolase  26.09 
 
 		 169 aa  48.9  0.00005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0632516  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5294  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  26.88 
 
 		 190 aa  48.9  0.00005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4600  NUDIX hydrolase  31.11 
 
 		 178 aa  48.1  0.00007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0447936 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1708  NUDIX hydrolase  32 
 
 		 170 aa  48.1  0.00007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0269  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, type 1  26.44 
 
 		 175 aa  48.1  0.00008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22000  NTP pyrophosphohydrolase  26.43 
 
 		 156 aa  48.1  0.00008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0313  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  26.44 
 
 		 216 aa  47.4  0.0001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.814228 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02684  hypothetical protein  30.21 
 
 		 166 aa  47.4  0.0001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.406743  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1383  NUDIX hydrolase  29.94 
 
 		 203 aa  47.4  0.0001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000123288  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9366  Isopentenyl-diphosphate Delta-isomerase  26.09 
 
 		 193 aa  47.8  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.706923 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02721  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  30.21 
 
 		 182 aa  47  0.0002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.304436  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1408  NUDIX hydrolase  43.75 
 
 		 178 aa  46.6  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.797387  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0820  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  30.21 
 
 		 182 aa  47  0.0002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3022  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  30.21 
 
 		 182 aa  47  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5041  NUDIX hydrolase  48.98 
 
 		 148 aa  46.6  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.216707 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3308  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  30.21 
 
 		 182 aa  46.2  0.0003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2398  NUDIX hydrolase  26.79 
 
 		 177 aa  46.2  0.0003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.10425  normal  0.260078 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2561  NUDIX hydrolase  29.56 
 
 		 201 aa  45.4  0.0004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.000000630284  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0803  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, type 1  30.21 
 
 		 182 aa  45.4  0.0005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.010723  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1185  NUDIX hydrolase  32.26 
 
 		 187 aa  45.4  0.0005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2782  NUDIX hydrolase  29.56 
 
 		 216 aa  45.4  0.0005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000698062  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3215  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  30.21 
 
 		 182 aa  45.1  0.0006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4179  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  30.21 
 
 		 182 aa  45.1  0.0006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1481  NUDIX hydrolase  29.38 
 
 		 216 aa  45.1  0.0006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.0000381919  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3048  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  30.21 
 
 		 182 aa  45.1  0.0007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_12972  predicted protein  23.78 
 
 		 247 aa  44.7  0.0009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3270  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  33.33 
 
 		 181 aa  43.5  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3207  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  33.33 
 
 		 181 aa  43.5  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.321651 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3195  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  33.33 
 
 		 181 aa  43.9  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.376007  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3375  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  33.33 
 
 		 181 aa  43.5  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.923272  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3389  NUDIX hydrolase  24.24 
 
 		 181 aa  43.5  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2666  NUDIX hydrolase  29.79 
 
 		 182 aa  42.7  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.167572 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0674  NUDIX family hydrolase  21.56 
 
 		 177 aa  42.7  0.004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0575  MutT/nudix family protein  29.52 
 
 		 149 aa  42  0.005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_7007  predicted protein  32.22 
 
 		 184 aa  42  0.005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1991  deoxyribose-phosphate aldolase  28.46 
 
 		 424 aa  42  0.005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.306707  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_14808  predicted protein  30.86 
 
 		 229 aa  42  0.006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.147852  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0168  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  35 
 
 		 176 aa  41.6  0.007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2032  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, type 1  30.86 
 
 		 171 aa  41.6  0.007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2212  NUDIX hydrolase  31.18 
 
 		 280 aa  41.2  0.008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0979723  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>