88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_2236 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_2236  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 322 aa  639    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3404  NUDIX hydrolase  57.04 
 
 		 273 aa  281  1e-74  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.707971  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2739  NUDIX hydrolase  55.96 
 
 		 273 aa  278  7e-74  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.275113  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3467  NUDIX hydrolase  56.32 
 
 		 289 aa  275  5e-73  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.431608 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5387  NUDIX hydrolase  50.87 
 
 		 283 aa  254  1.0000000000000001e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.503936 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3852  NUDIX hydrolase  51.7 
 
 		 272 aa  226  3e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1874  hypothetical protein  35.23 
 
 		 267 aa  97.8  2e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0332068  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1753  NUDIX hydrolase  36.08 
 
 		 284 aa  95.5  1e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.871193 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0945  NUDIX hydrolase  30.69 
 
 		 277 aa  93.6  4e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2075  NUDIX hydrolase  38.69 
 
 		 284 aa  93.2  6e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.758839  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0897  NUDIX hydrolase  28.93 
 
 		 277 aa  89.4  7e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.22115  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3504  NUDIX domain-containing protein  36.25 
 
 		 192 aa  87.8  2e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.433269  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0335  NUDIX hydrolase  32.47 
 
 		 282 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_46967  thiamine pyrophosphokinase  30.16 
 
 		 316 aa  84  0.000000000000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.934951  normal  0.22285 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2237  NUDIX hydrolase  34.2 
 
 		 283 aa  83.2  0.000000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.841467  normal  0.0550571 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2212  NUDIX hydrolase  34.55 
 
 		 280 aa  80.9  0.00000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0979723  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4113  putative NTP pyrophosphohydrolases including oxidative damage repair enzymes  31.05 
 
 		 282 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2168  NUDIX hydrolase  33.52 
 
 		 288 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0606  nudix hydrolase  34.12 
 
 		 285 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2782  NUDIX hydrolase  33.52 
 
 		 288 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.378837  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0775  NUDIX domain-containing protein  34.12 
 
 		 285 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2951  nudix hydrolase  34.12 
 
 		 285 aa  77  0.0000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.88626  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0590  nudix hydrolase  34.12 
 
 		 285 aa  77  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.890428  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0067  thiamin pyrophosphokinase-related protein  34.12 
 
 		 285 aa  77  0.0000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1523  thiamin pyrophosphokinase-related protein  34.12 
 
 		 285 aa  77  0.0000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3098  thiamin pyrophosphokinase-related protein  34.12 
 
 		 285 aa  77  0.0000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2793  NUDIX hydrolase  32.97 
 
 		 288 aa  76.6  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.335799 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0605  NUDIX hydrolase  30.26 
 
 		 287 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0159393 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2700  NUDIX hydrolase  32.96 
 
 		 285 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.170389 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4043  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  84.78 
 
 		 527 aa  74.7  0.000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0056  inositol 2-dehydrogenase  82.61 
 
 		 389 aa  74.3  0.000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0533  NUDIX hydrolase  32.4 
 
 		 285 aa  73.9  0.000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.336062  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4830  multi-sensor signal transduction histidine kinase  84.44 
 
 		 848 aa  73.9  0.000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.356174  normal  0.508218 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0495  thiamin pyrophosphokinase-related protein  33.14 
 
 		 283 aa  73.2  0.000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0856896  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6112  NUDIX hydrolase  32.2 
 
 		 288 aa  72.8  0.000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.663998  normal  0.430005 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2842  NUDIX hydrolase  32.4 
 
 		 285 aa  72  0.00000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4778  cobyric acid synthase CobQ  82.61 
 
 		 628 aa  72  0.00000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.316992 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0904  alcohol dehydrogenase  84.78 
 
 		 197 aa  71.2  0.00000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.758946 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2749  NUDIX hydrolase  26.95 
 
 		 285 aa  71.6  0.00000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0763  hypothetical protein  81.63 
 
 		 149 aa  70.5  0.00000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.791123  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4296  cobalamin synthesis protein, P47K  71.93 
 
 		 366 aa  70.5  0.00000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.385806 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2933  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  78 
 
 		 351 aa  70.1  0.00000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.497281  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00193  thiamin pyrophosphokinase-related protein (AFU_orthologue; AFUA_5G11110)  26.78 
 
 		 319 aa  67.8  0.0000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.415075 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_5001  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding  80.43 
 
 		 828 aa  67.8  0.0000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4031  hypothetical protein  78.26 
 
 		 361 aa  66.6  0.0000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.282109  normal  0.713722 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2944  hypothetical protein  82.93 
 
 		 227 aa  66.2  0.0000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.234718  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2376  NUDIX hydrolase  32.69 
 
 		 197 aa  66.2  0.0000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.278695  normal  0.316272 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07239  conserved hypothetical protein  30.89 
 
 		 232 aa  64.7  0.000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006680  CNK02400  conserved hypothetical protein  30.81 
 
 		 357 aa  64.3  0.000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0516  hypothetical protein  73.91 
 
 		 202 aa  63.5  0.000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0335528  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4764  hypothetical protein  76.09 
 
 		 318 aa  62.8  0.000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.966578 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_87640  predicted protein  28.4 
 
 		 299 aa  62.8  0.000000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1976  NUDIX hydrolase  30.24 
 
 		 312 aa  60.5  0.00000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.620391  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5561  hypothetical protein  37 
 
 		 178 aa  60.5  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.546979  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0214  MutT/nudix family protein  28.36 
 
 		 292 aa  60.1  0.00000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0853597  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3299  NUDIX hydrolase  28.74 
 
 		 288 aa  59.7  0.00000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0961007 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64010  hypothetical protein  37.93 
 
 		 178 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0625  NUDIX hydrolase  37.21 
 
 		 185 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_14808  predicted protein  27.27 
 
 		 229 aa  54.7  0.000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.147852  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4379  NUDIX hydrolase  36.05 
 
 		 181 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.312753  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3533  ABC transporter related  85.71 
 
 		 522 aa  53.5  0.000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.909049 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0936  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  79.41 
 
 		 365 aa  53.1  0.000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0868  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysW  66.67 
 
 		 332 aa  52.8  0.000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0610  NUDIX hydrolase  36.84 
 
 		 178 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0690731 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0565  NUDIX hydrolase  35 
 
 		 177 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4840  mutT/nudix family protein  34.88 
 
 		 180 aa  52  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0725  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 178 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0604  NUDIX hydrolase  35 
 
 		 177 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3251  NUDIX hydrolase  38.33 
 
 		 178 aa  50.8  0.00003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000109349  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4600  NUDIX hydrolase  34.88 
 
 		 178 aa  50.1  0.00005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0447936 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07000  NUDIX hydrolase  32.56 
 
 		 177 aa  49.7  0.00007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0990  NUDIX hydrolase  34.67 
 
 		 173 aa  48.9  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000363849  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1914  isochorismatase hydrolase  95.65 
 
 		 222 aa  46.6  0.0005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.652638  normal  0.010767 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1205  hypothetical protein  35.23 
 
 		 182 aa  46.2  0.0007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000418064 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1279  major facilitator superfamily transporter  84.62 
 
 		 493 aa  45.4  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4417  C-methyltransferase  84.62 
 
 		 438 aa  45.8  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.482278 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1553  NUDIX hydrolase  24.47 
 
 		 182 aa  44.3  0.003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2237  NUDIX hydrolase  34.48 
 
 		 169 aa  44.3  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0632516  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1754  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, type 1  29.47 
 
 		 191 aa  43.9  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.202271  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2826  NUDIX hydrolase  29.55 
 
 		 185 aa  43.9  0.004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1126  dimethyladenosine transferase  29.89 
 
 		 459 aa  43.9  0.004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0870793  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3389  NUDIX hydrolase  32.58 
 
 		 181 aa  43.1  0.006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4475  hypothetical protein  62.16 
 
 		 86 aa  42.7  0.009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3426  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  86.96 
 
 		 375 aa  42.7  0.009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.604906  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3375  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  28.42 
 
 		 181 aa  42.4  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.923272  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3195  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  28.42 
 
 		 181 aa  42.4  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.376007  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3207  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  28.42 
 
 		 181 aa  42.4  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.321651 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3270  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  28.42 
 
 		 181 aa  42.4  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>