42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc1874 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc1874  hypothetical protein  100 
 
 		 267 aa  528  1e-149  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0332068  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1753  NUDIX hydrolase  76.47 
 
 		 284 aa  395  1e-109  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.871193 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2075  NUDIX hydrolase  75.37 
 
 		 284 aa  387  1e-106  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.758839  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2212  NUDIX hydrolase  50.78 
 
 		 280 aa  235  5.0000000000000005e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0979723  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0335  NUDIX hydrolase  48.63 
 
 		 282 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0533  NUDIX hydrolase  50 
 
 		 285 aa  231  9e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.336062  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4113  putative NTP pyrophosphohydrolases including oxidative damage repair enzymes  47.84 
 
 		 282 aa  229  2e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2237  NUDIX hydrolase  49.61 
 
 		 283 aa  229  3e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.841467  normal  0.0550571 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2793  NUDIX hydrolase  47.91 
 
 		 288 aa  227  2e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.335799 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6112  NUDIX hydrolase  48.29 
 
 		 288 aa  226  3e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.663998  normal  0.430005 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2168  NUDIX hydrolase  47.15 
 
 		 288 aa  225  5.0000000000000005e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2782  NUDIX hydrolase  47.15 
 
 		 288 aa  225  5.0000000000000005e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.378837  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0605  NUDIX hydrolase  46.54 
 
 		 287 aa  224  1e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0159393 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0495  thiamin pyrophosphokinase-related protein  47.76 
 
 		 283 aa  222  4.9999999999999996e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0856896  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2951  nudix hydrolase  49.02 
 
 		 285 aa  221  7e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.88626  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0590  nudix hydrolase  49.02 
 
 		 285 aa  221  7e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.890428  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1523  thiamin pyrophosphokinase-related protein  49.02 
 
 		 285 aa  221  7e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3098  thiamin pyrophosphokinase-related protein  49.02 
 
 		 285 aa  221  7e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0067  thiamin pyrophosphokinase-related protein  49.02 
 
 		 285 aa  221  7e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0775  NUDIX domain-containing protein  50.21 
 
 		 285 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0606  nudix hydrolase  50.21 
 
 		 285 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2700  NUDIX hydrolase  46.92 
 
 		 285 aa  216  2e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.170389 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2842  NUDIX hydrolase  46.92 
 
 		 285 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0214  MutT/nudix family protein  37.79 
 
 		 292 aa  146  4.0000000000000006e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0853597  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_87640  predicted protein  35.71 
 
 		 299 aa  139  3.9999999999999997e-32  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2749  NUDIX hydrolase  32.55 
 
 		 285 aa  139  3.9999999999999997e-32  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3504  NUDIX domain-containing protein  46.91 
 
 		 192 aa  130  3e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.433269  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0897  NUDIX hydrolase  33.72 
 
 		 277 aa  122  7e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.22115  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0945  NUDIX hydrolase  35.58 
 
 		 277 aa  109  6e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_14808  predicted protein  34.62 
 
 		 229 aa  103  3e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.147852  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3299  NUDIX hydrolase  36.41 
 
 		 288 aa  99.4  6e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0961007 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5387  NUDIX hydrolase  33.07 
 
 		 283 aa  97.8  1e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.503936 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2236  NUDIX hydrolase  34.64 
 
 		 322 aa  92  9e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_46967  thiamine pyrophosphokinase  31.18 
 
 		 316 aa  90.9  2e-17  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.934951  normal  0.22285 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1976  NUDIX hydrolase  31.97 
 
 		 312 aa  89.4  6e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.620391  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3852  NUDIX hydrolase  30.96 
 
 		 272 aa  88.2  1e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3404  NUDIX hydrolase  34.88 
 
 		 273 aa  87  3e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.707971  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2739  NUDIX hydrolase  34.3 
 
 		 273 aa  87  3e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.275113  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00193  thiamin pyrophosphokinase-related protein (AFU_orthologue; AFUA_5G11110)  31.1 
 
 		 319 aa  82.8  0.000000000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.415075 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3467  NUDIX hydrolase  32.77 
 
 		 289 aa  80.9  0.00000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.431608 
 
 
-
 
NC_006680  CNK02400  conserved hypothetical protein  28.86 
 
 		 357 aa  74.7  0.000000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07239  conserved hypothetical protein  27.83 
 
 		 232 aa  71.2  0.00000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>