56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_0897 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009379  Pnuc_0897  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 277 aa  576  1.0000000000000001e-163  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.22115  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0945  NUDIX hydrolase  82.31 
 
 		 277 aa  481  1e-135  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2237  NUDIX hydrolase  39.25 
 
 		 283 aa  131  1.0000000000000001e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.841467  normal  0.0550571 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2212  NUDIX hydrolase  39.8 
 
 		 280 aa  131  1.0000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0979723  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2075  NUDIX hydrolase  35.63 
 
 		 284 aa  126  4.0000000000000003e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.758839  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0335  NUDIX hydrolase  35.47 
 
 		 282 aa  125  5e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1753  NUDIX hydrolase  37.09 
 
 		 284 aa  125  7e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.871193 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1874  hypothetical protein  33.72 
 
 		 267 aa  122  8e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0332068  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6112  NUDIX hydrolase  36.59 
 
 		 288 aa  120  3e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.663998  normal  0.430005 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4113  putative NTP pyrophosphohydrolases including oxidative damage repair enzymes  38.38 
 
 		 282 aa  120  3e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0605  NUDIX hydrolase  35.56 
 
 		 287 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0159393 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3098  thiamin pyrophosphokinase-related protein  38.69 
 
 		 285 aa  117  3e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0067  thiamin pyrophosphokinase-related protein  38.69 
 
 		 285 aa  117  3e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1523  thiamin pyrophosphokinase-related protein  38.69 
 
 		 285 aa  117  3e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0590  nudix hydrolase  38.69 
 
 		 285 aa  116  3e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.890428  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0606  nudix hydrolase  38.69 
 
 		 285 aa  116  3e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0775  NUDIX domain-containing protein  38.69 
 
 		 285 aa  116  3e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2951  nudix hydrolase  38.69 
 
 		 285 aa  117  3e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.88626  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0495  thiamin pyrophosphokinase-related protein  39.7 
 
 		 283 aa  115  8.999999999999998e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0856896  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2749  NUDIX hydrolase  30.62 
 
 		 285 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3504  NUDIX domain-containing protein  39.63 
 
 		 192 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.433269  normal  1 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_87640  predicted protein  31.3 
 
 		 299 aa  112  9e-24  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2793  NUDIX hydrolase  35.12 
 
 		 288 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.335799 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2168  NUDIX hydrolase  34.63 
 
 		 288 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2782  NUDIX hydrolase  34.63 
 
 		 288 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.378837  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0533  NUDIX hydrolase  34.8 
 
 		 285 aa  110  3e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.336062  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2842  NUDIX hydrolase  35.15 
 
 		 285 aa  108  1e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2700  NUDIX hydrolase  35.15 
 
 		 285 aa  107  2e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.170389 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3852  NUDIX hydrolase  29.15 
 
 		 272 aa  107  2e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0214  MutT/nudix family protein  32.34 
 
 		 292 aa  101  1e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0853597  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3299  NUDIX hydrolase  37.87 
 
 		 288 aa  101  1e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0961007 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2739  NUDIX hydrolase  29.28 
 
 		 273 aa  97.4  2e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.275113  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5387  NUDIX hydrolase  31.05 
 
 		 283 aa  94.7  1e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.503936 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1976  NUDIX hydrolase  36.02 
 
 		 312 aa  94.4  2e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.620391  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3404  NUDIX hydrolase  29.21 
 
 		 273 aa  93.6  3e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.707971  normal  1 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_14808  predicted protein  33 
 
 		 229 aa  92.4  7e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.147852  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00193  thiamin pyrophosphokinase-related protein (AFU_orthologue; AFUA_5G11110)  28.57 
 
 		 319 aa  90.1  4e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.415075 
 
 
-
 
NC_006680  CNK02400  conserved hypothetical protein  31.98 
 
 		 357 aa  88.2  1e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3467  NUDIX hydrolase  29.21 
 
 		 289 aa  87  3e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.431608 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2236  NUDIX hydrolase  29.61 
 
 		 322 aa  84  0.000000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_46967  thiamine pyrophosphokinase  28.11 
 
 		 316 aa  80.5  0.00000000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.934951  normal  0.22285 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07239  conserved hypothetical protein  29.79 
 
 		 232 aa  73.6  0.000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0625  NUDIX hydrolase  40.7 
 
 		 185 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4379  NUDIX hydrolase  39.53 
 
 		 181 aa  53.1  0.000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.312753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0725  NUDIX hydrolase  35.63 
 
 		 178 aa  52  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5561  hypothetical protein  39.53 
 
 		 178 aa  52  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.546979  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4840  mutT/nudix family protein  38.37 
 
 		 180 aa  49.7  0.00006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0604  NUDIX hydrolase  37.93 
 
 		 177 aa  49.3  0.00007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64010  hypothetical protein  39.08 
 
 		 178 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4600  NUDIX hydrolase  37.93 
 
 		 178 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0447936 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0565  NUDIX hydrolase  36.78 
 
 		 177 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0610  NUDIX hydrolase  36.78 
 
 		 178 aa  47.4  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0690731 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07000  NUDIX hydrolase  38.37 
 
 		 177 aa  47.4  0.0003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2848  NUDIX hydrolase  39.33 
 
 		 184 aa  46.6  0.0005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.00000000562976  normal  0.434056 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3389  NUDIX hydrolase  35.63 
 
 		 181 aa  44.7  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2408  NUDIX hydrolase  31.13 
 
 		 238 aa  42.4  0.009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.668213  normal  0.23616 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>