42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_2168 on replicon NC_008060
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008542  Bcen2424_2782  NUDIX hydrolase  100 
 
 
288 aa  576  1.0000000000000001e-163  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.378837  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2168  NUDIX hydrolase  100 
 
 
288 aa  576  1.0000000000000001e-163  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2793  NUDIX hydrolase  98.96 
 
 
288 aa  570  1e-161  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.335799 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6112  NUDIX hydrolase  92.01 
 
 
288 aa  530  1e-150  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.663998  normal  0.430005 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2700  NUDIX hydrolase  90.97 
 
 
285 aa  489  1e-137  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.170389 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2842  NUDIX hydrolase  90.28 
 
 
285 aa  488  1e-137  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0533  NUDIX hydrolase  87.15 
 
 
285 aa  486  1e-136  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.336062  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0495  thiamin pyrophosphokinase-related protein  78.32 
 
 
283 aa  437  1e-121  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0856896  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0775  NUDIX domain-containing protein  78.32 
 
 
285 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0590  nudix hydrolase  77.97 
 
 
285 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.890428  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0606  nudix hydrolase  77.97 
 
 
285 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2951  nudix hydrolase  77.62 
 
 
285 aa  414  1e-114  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.88626  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1523  thiamin pyrophosphokinase-related protein  77.62 
 
 
285 aa  414  1e-114  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3098  thiamin pyrophosphokinase-related protein  77.62 
 
 
285 aa  414  1e-114  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0067  thiamin pyrophosphokinase-related protein  77.62 
 
 
285 aa  414  1e-114  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4113  putative NTP pyrophosphohydrolases including oxidative damage repair enzymes  67.48 
 
 
282 aa  387  1e-106  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0605  NUDIX hydrolase  66.78 
 
 
287 aa  380  1e-104  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0159393 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0335  NUDIX hydrolase  66.43 
 
 
282 aa  379  1e-104  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1874  hypothetical protein  47.15 
 
 
267 aa  225  5.0000000000000005e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0332068  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2075  NUDIX hydrolase  46.77 
 
 
284 aa  221  1.9999999999999999e-56  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.758839  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1753  NUDIX hydrolase  46.42 
 
 
284 aa  219  3.9999999999999997e-56  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.871193 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2212  NUDIX hydrolase  45.09 
 
 
280 aa  199  5e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0979723  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2237  NUDIX hydrolase  43.12 
 
 
283 aa  193  3e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.841467  normal  0.0550571 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0214  MutT/nudix family protein  36.4 
 
 
292 aa  160  3e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0853597  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2749  NUDIX hydrolase  35.29 
 
 
285 aa  154  1e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3504  NUDIX domain-containing protein  45.45 
 
 
192 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.433269  normal 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_87640  predicted protein  34.98 
 
 
299 aa  131  2.0000000000000002e-29  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1976  NUDIX hydrolase  40.53 
 
 
312 aa  127  2.0000000000000002e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.620391  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_14808  predicted protein  38.83 
 
 
229 aa  124  2e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.147852  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_46967  thiamine pyrophosphokinase  35.35 
 
 
316 aa  110  2.0000000000000002e-23  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.934951  normal  0.22285 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0897  NUDIX hydrolase  34.63 
 
 
277 aa  110  2.0000000000000002e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.22115  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0945  NUDIX hydrolase  33.8 
 
 
277 aa  110  4.0000000000000004e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3299  NUDIX hydrolase  35.83 
 
 
288 aa  108  1e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0961007 
 
 
-
 
NC_006680  CNK02400  conserved hypothetical protein  32.77 
 
 
357 aa  107  2e-22  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00193  thiamin pyrophosphokinase-related protein (AFU_orthologue; AFUA_5G11110)  31.54 
 
 
319 aa  105  1e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.415075 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07239  conserved hypothetical protein  33.8 
 
 
232 aa  94  3e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2739  NUDIX hydrolase  33.87 
 
 
273 aa  78.2  0.0000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.275113  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3852  NUDIX hydrolase  32.62 
 
 
272 aa  77  0.0000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3404  NUDIX hydrolase  34.41 
 
 
273 aa  76.6  0.0000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.707971  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2236  NUDIX hydrolase  32.92 
 
 
322 aa  72.8  0.000000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5387  NUDIX hydrolase  32.81 
 
 
283 aa  72  0.00000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.503936 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3467  NUDIX hydrolase  30.85 
 
 
289 aa  63.2  0.000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.431608 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>