65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_3467 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_3467  NUDIX hydrolase  100 
 
 
289 aa  568  1e-161  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.431608 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2739  NUDIX hydrolase  59.72 
 
 
273 aa  292  5e-78  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.275113  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3404  NUDIX hydrolase  60.07 
 
 
273 aa  285  9e-76  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.707971  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2236  NUDIX hydrolase  56.32 
 
 
322 aa  283  2.0000000000000002e-75  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5387  NUDIX hydrolase  54.45 
 
 
283 aa  266  2.9999999999999995e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.503936 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3852  NUDIX hydrolase  50.55 
 
 
272 aa  231  1e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0945  NUDIX hydrolase  32.14 
 
 
277 aa  104  2e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0897  NUDIX hydrolase  29.15 
 
 
277 aa  95.1  1e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.22115  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3504  NUDIX domain-containing protein  36.2 
 
 
192 aa  91.3  2e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.433269  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1753  NUDIX hydrolase  33.84 
 
 
284 aa  84  0.000000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.871193 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2075  NUDIX hydrolase  35.67 
 
 
284 aa  83.2  0.000000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.758839  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2237  NUDIX hydrolase  36.84 
 
 
283 aa  82.8  0.000000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.841467  normal  0.0550571 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1874  hypothetical protein  34.15 
 
 
267 aa  82  0.00000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0332068  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00193  thiamin pyrophosphokinase-related protein (AFU_orthologue; AFUA_5G11110)  31.19 
 
 
319 aa  79.3  0.00000000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.415075 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4113  putative NTP pyrophosphohydrolases including oxidative damage repair enzymes  33.85 
 
 
282 aa  79.3  0.00000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0335  NUDIX hydrolase  32.47 
 
 
282 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0606  nudix hydrolase  34.69 
 
 
285 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0775  NUDIX domain-containing protein  34.69 
 
 
285 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1523  thiamin pyrophosphokinase-related protein  34.69 
 
 
285 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2951  nudix hydrolase  34.69 
 
 
285 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.88626  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0067  thiamin pyrophosphokinase-related protein  34.69 
 
 
285 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0590  nudix hydrolase  34.69 
 
 
285 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.890428  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3098  thiamin pyrophosphokinase-related protein  34.69 
 
 
285 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0605  NUDIX hydrolase  31.47 
 
 
287 aa  72.4  0.000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0159393 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2212  NUDIX hydrolase  32.28 
 
 
280 aa  72.4  0.000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0979723  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0495  thiamin pyrophosphokinase-related protein  34.18 
 
 
283 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0856896  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_46967  thiamine pyrophosphokinase  26.52 
 
 
316 aa  67.4  0.0000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.934951  normal  0.22285 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2782  NUDIX hydrolase  31.5 
 
 
288 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.378837  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2168  NUDIX hydrolase  31.5 
 
 
288 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2793  NUDIX hydrolase  31 
 
 
288 aa  66.2  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.335799 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2749  NUDIX hydrolase  27.03 
 
 
285 aa  66.2  0.0000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0533  NUDIX hydrolase  32.49 
 
 
285 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.336062  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6112  NUDIX hydrolase  33 
 
 
288 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.663998  normal  0.430005 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2700  NUDIX hydrolase  31.66 
 
 
285 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.170389 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_87640  predicted protein  29.06 
 
 
299 aa  62.8  0.000000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006680  CNK02400  conserved hypothetical protein  29.7 
 
 
357 aa  62.8  0.000000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2842  NUDIX hydrolase  31.16 
 
 
285 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3299  NUDIX hydrolase  27.69 
 
 
288 aa  58.2  0.0000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0961007 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2376  NUDIX hydrolase  35.16 
 
 
197 aa  57  0.0000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.278695  normal  0.316272 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07239  conserved hypothetical protein  27.42 
 
 
232 aa  56.6  0.0000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1976  NUDIX hydrolase  32.65 
 
 
312 aa  54.3  0.000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.620391  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0214  MutT/nudix family protein  29.9 
 
 
292 aa  54.3  0.000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0853597  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0625  NUDIX hydrolase  31.37 
 
 
185 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3251  NUDIX hydrolase  25.76 
 
 
178 aa  50.8  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000109349  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4379  NUDIX hydrolase  32.26 
 
 
181 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.312753  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64010  hypothetical protein  31.58 
 
 
178 aa  50.1  0.00004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5561  hypothetical protein  32.63 
 
 
178 aa  50.1  0.00005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.546979  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1708  NUDIX hydrolase  29.65 
 
 
170 aa  49.3  0.00007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3117  NUDIX hydrolase  35.63 
 
 
178 aa  49.3  0.00008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.129541  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1499  Mut/nudix family protein, putative isopentenyl-diphosphate isomerase  26.28 
 
 
170 aa  48.5  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  9.38166e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4840  mutT/nudix family protein  31.96 
 
 
180 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1126  dimethyladenosine transferase  27.91 
 
 
459 aa  47.4  0.0003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0870793  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0674  NUDIX family hydrolase  32.32 
 
 
177 aa  46.6  0.0005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4600  NUDIX hydrolase  31.4 
 
 
178 aa  46.2  0.0006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0447936 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1205  hypothetical protein  31.25 
 
 
182 aa  46.2  0.0006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000418064 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0610  NUDIX hydrolase  30.69 
 
 
178 aa  45.8  0.0008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0690731 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0990  NUDIX hydrolase  33.65 
 
 
173 aa  45.8  0.0008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000363849  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0604  NUDIX hydrolase  32.43 
 
 
177 aa  45.4  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07000  NUDIX hydrolase  28.97 
 
 
177 aa  45.1  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0565  NUDIX hydrolase  32.43 
 
 
177 aa  45.1  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2672  NUDIX hydrolase  32.99 
 
 
158 aa  44.3  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0408434 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2253  NUDIX hydrolase  42.11 
 
 
187 aa  42.7  0.006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3458  mutator MutT protein  38.1 
 
 
141 aa  42.7  0.008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.432135  hitchhiker  0.00028908 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0725  NUDIX hydrolase  31.96 
 
 
178 aa  42.7  0.008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0346  NUDIX hydrolase  30.23 
 
 
182 aa  42.4  0.009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0239643 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>