43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNK02400 on replicon NC_006680
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006680  CNK02400  conserved hypothetical protein  100 
 
 
357 aa  735    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00193  thiamin pyrophosphokinase-related protein (AFU_orthologue; AFUA_5G11110)  43.67 
 
 
319 aa  202  8e-51  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.415075 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_46967  thiamine pyrophosphokinase  43.05 
 
 
316 aa  194  2e-48  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.934951  normal  0.22285 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07239  conserved hypothetical protein  39.04 
 
 
232 aa  150  4e-35  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0214  MutT/nudix family protein  36.51 
 
 
292 aa  140  3e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0853597  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_87640  predicted protein  37.33 
 
 
299 aa  138  2e-31  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2749  NUDIX hydrolase  37.21 
 
 
285 aa  138  2e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_14808  predicted protein  32.11 
 
 
229 aa  116  6e-25  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.147852  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0495  thiamin pyrophosphokinase-related protein  35.24 
 
 
283 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0856896  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0335  NUDIX hydrolase  35.61 
 
 
282 aa  110  3e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0590  nudix hydrolase  36.67 
 
 
285 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.890428  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2951  nudix hydrolase  36.67 
 
 
285 aa  110  5e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.88626  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0533  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
285 aa  110  5e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.336062  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0067  thiamin pyrophosphokinase-related protein  36.67 
 
 
285 aa  110  5e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1523  thiamin pyrophosphokinase-related protein  36.67 
 
 
285 aa  110  5e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3098  thiamin pyrophosphokinase-related protein  36.67 
 
 
285 aa  110  5e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3299  NUDIX hydrolase  37.57 
 
 
288 aa  109  7.000000000000001e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0961007 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2700  NUDIX hydrolase  35.71 
 
 
285 aa  109  9.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.170389 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2842  NUDIX hydrolase  35.71 
 
 
285 aa  109  9.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2793  NUDIX hydrolase  33.05 
 
 
288 aa  107  2e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.335799 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6112  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
288 aa  107  3e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.663998  normal  0.430005 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0606  nudix hydrolase  36.19 
 
 
285 aa  107  3e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0775  NUDIX domain-containing protein  36.19 
 
 
285 aa  107  3e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2782  NUDIX hydrolase  33.48 
 
 
288 aa  106  6e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.378837  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2168  NUDIX hydrolase  33.48 
 
 
288 aa  106  6e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4113  putative NTP pyrophosphohydrolases including oxidative damage repair enzymes  35.61 
 
 
282 aa  104  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1976  NUDIX hydrolase  35.1 
 
 
312 aa  103  3e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.620391  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3504  NUDIX domain-containing protein  37.65 
 
 
192 aa  102  1e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.433269  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0605  NUDIX hydrolase  35.44 
 
 
287 aa  100  3e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0159393 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2212  NUDIX hydrolase  31.43 
 
 
280 aa  96.3  8e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0979723  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2237  NUDIX hydrolase  33 
 
 
283 aa  90.5  4e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.841467  normal  0.0550571 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0897  NUDIX hydrolase  31.98 
 
 
277 aa  88.6  2e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.22115  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0945  NUDIX hydrolase  32.67 
 
 
277 aa  87.8  2e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1753  NUDIX hydrolase  28.69 
 
 
284 aa  77.8  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.871193 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2075  NUDIX hydrolase  29.9 
 
 
284 aa  75.5  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.758839  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1874  hypothetical protein  28.86 
 
 
267 aa  75.1  0.000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0332068  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2236  NUDIX hydrolase  30.81 
 
 
322 aa  65.9  0.000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3467  NUDIX hydrolase  29.7 
 
 
289 aa  63.9  0.000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.431608 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5387  NUDIX hydrolase  29.94 
 
 
283 aa  63.5  0.000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.503936 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3404  NUDIX hydrolase  27.55 
 
 
273 aa  61.2  0.00000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.707971  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3852  NUDIX hydrolase  28.28 
 
 
272 aa  61.6  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2739  NUDIX hydrolase  28.25 
 
 
273 aa  60.8  0.00000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.275113  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13780  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  28.68 
 
 
180 aa  48.1  0.0002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.201595  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>