92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_13780 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_13780  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  100 
 
 		 180 aa  363  1e-99  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.201595  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12740  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  53.25 
 
 		 196 aa  177  4.999999999999999e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.251434  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04480  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  55.36 
 
 		 200 aa  167  7e-41  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4870  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, type 1  50.85 
 
 		 185 aa  164  4e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0257995  normal  0.425035 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0969  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  56.36 
 
 		 191 aa  164  5.9999999999999996e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0417204 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2543  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, type 1  49.41 
 
 		 181 aa  158  5e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.188971  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0343  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, type 1  49.4 
 
 		 198 aa  156  1e-37  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.447974  normal  0.157249 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1842  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  51.18 
 
 		 181 aa  154  7e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.743042  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5294  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  49.11 
 
 		 190 aa  152  2.9999999999999998e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5925  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, type 1  47.34 
 
 		 181 aa  150  5.9999999999999996e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0950734 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4188  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  47.62 
 
 		 219 aa  150  7e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1582  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  49.14 
 
 		 181 aa  150  8e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.196336  normal  0.154748 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3307  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  47.88 
 
 		 183 aa  145  3e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.995091 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9366  Isopentenyl-diphosphate Delta-isomerase  49.69 
 
 		 193 aa  145  3e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.706923 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3207  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  45.45 
 
 		 181 aa  140  8e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.321651 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3195  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  45.45 
 
 		 181 aa  140  8e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.376007  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3991  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  46.47 
 
 		 186 aa  140  8e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.189435  normal  0.153938 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3270  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  45.45 
 
 		 181 aa  140  8e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3375  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  45.45 
 
 		 181 aa  140  8e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.923272  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3569  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, type 1  45.73 
 
 		 197 aa  140  9.999999999999999e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.863637 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5570  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  45.29 
 
 		 227 aa  139  1.9999999999999998e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1382  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, type 1  50.3 
 
 		 190 aa  139  3e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3273  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  44.85 
 
 		 181 aa  138  4.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0820  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  42.94 
 
 		 182 aa  137  7.999999999999999e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0803  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, type 1  44.85 
 
 		 182 aa  137  1e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.010723  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3022  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  42.37 
 
 		 182 aa  136  2e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3215  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  42.37 
 
 		 182 aa  136  2e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4179  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  42.37 
 
 		 182 aa  136  2e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02721  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  42.37 
 
 		 182 aa  135  2e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.304436  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21260  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  48.31 
 
 		 209 aa  135  3.0000000000000003e-31  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.682268  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02684  hypothetical protein  44.24 
 
 		 166 aa  134  6.0000000000000005e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.406743  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11763  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  46.95 
 
 		 203 aa  134  7.000000000000001e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00483885 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3308  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  41.81 
 
 		 182 aa  134  9e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3048  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  42.37 
 
 		 182 aa  132  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37460  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  45.29 
 
 		 212 aa  132  3e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.50041  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1754  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, type 1  45.73 
 
 		 191 aa  125  3e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.202271  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2029  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, type 1  41.67 
 
 		 210 aa  120  9.999999999999999e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0672691  hitchhiker  0.00592267 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4928  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  39.29 
 
 		 199 aa  101  4e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.358749  normal  0.255355 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4438  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  41.92 
 
 		 199 aa  99.4  2e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3045  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, type 1  43.92 
 
 		 180 aa  98.6  4e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2201  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, type 1  34.34 
 
 		 179 aa  97.8  7e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.43573  hitchhiker  0.00000497991 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1623  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, type 1  34.12 
 
 		 175 aa  93.6  1e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2032  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, type 1  32.73 
 
 		 171 aa  90.1  2e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20640  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, type 1  35.9 
 
 		 213 aa  89.7  2e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4564  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  36.02 
 
 		 196 aa  88.6  4e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.669276  hitchhiker  0.00145949 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24100  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, type 1  41.03 
 
 		 197 aa  89  4e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13638  putative isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  31.48 
 
 		 174 aa  87.8  7e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.279506  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0168  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  37.68 
 
 		 176 aa  87.8  7e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1019  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, type 1  38.85 
 
 		 181 aa  85.1  5e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.123527  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2043  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, type 1  33.33 
 
 		 172 aa  84  0.000000000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.82849  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4731  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, type 1  33.33 
 
 		 171 aa  83.6  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.291133  decreased coverage  0.0000344266 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2276  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, type 1  32.52 
 
 		 176 aa  84  0.000000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00103129 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0313  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  31.58 
 
 		 216 aa  82.4  0.000000000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.814228 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2618  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, type 1  43.54 
 
 		 199 aa  81.6  0.000000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0277117  normal  0.0125903 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0269  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, type 1  30.86 
 
 		 175 aa  81.3  0.000000000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1919  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, type 1  37.41 
 
 		 181 aa  80.5  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.353354 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0276  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  37.41 
 
 		 177 aa  80.5  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1548  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, type 1  30.95 
 
 		 179 aa  79.7  0.00000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.51389  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3442  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  38.13 
 
 		 184 aa  78.6  0.00000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.580017  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3527  isopentenyl-diphosphate Delta-isomerase  37.41 
 
 		 176 aa  77.8  0.00000000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.750561 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0619  diphosphomevalonate decarboxylase  31.64 
 
 		 503 aa  77.8  0.00000000000009  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0720  diphosphomevalonate decarboxylase/isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  31.07 
 
 		 503 aa  76.3  0.0000000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0013091  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4299  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, type 1  30.86 
 
 		 197 aa  76.6  0.0000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.651923  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5942  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, type 1  31.48 
 
 		 176 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.934933  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2914  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, type 1  30.95 
 
 		 179 aa  75.9  0.0000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00579  Isopentenyl diphosphate isomerasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q874I0]  28.36 
 
 		 268 aa  74.7  0.0000000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.590564 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0674  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  29.09 
 
 		 177 aa  73.9  0.000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.90735  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1568  Isopentenyl-diphosphate Delta-isomerase  33.57 
 
 		 203 aa  73.6  0.000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.331903 
 
 
-
 
NC_006670  CNA02550  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, putative  30.26 
 
 		 265 aa  72  0.000000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1959  NUDIX hydrolase  29.87 
 
 		 196 aa  68.6  0.00000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.372281  normal  0.231683 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0774  Isopentenyl-diphosphate Delta-isomerase  32.84 
 
 		 186 aa  67.4  0.0000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_68990  isopentenyl diphosphate:dimethylallyl diphosphate isomerase (IPP isomerase)  28.5 
 
 		 286 aa  67  0.0000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_13493  predicted protein  31.79 
 
 		 256 aa  65.9  0.0000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_12972  predicted protein  30.81 
 
 		 247 aa  65.9  0.0000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_12533  predicted protein  30.56 
 
 		 222 aa  62.4  0.000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.673219  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2726  Isopentenyl-diphosphate Delta-isomerase  30.11 
 
 		 216 aa  62.4  0.000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.546258  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0419  Isopentenyl-diphosphate Delta-isomerase  30.15 
 
 		 187 aa  61.2  0.000000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0346  NUDIX hydrolase  32.14 
 
 		 182 aa  52.4  0.000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0239643 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3251  NUDIX hydrolase  29.89 
 
 		 178 aa  50.8  0.000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000109349  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1126  dimethyladenosine transferase  33.72 
 
 		 459 aa  50.1  0.00002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0870793  normal  1 
 
 
-
 
NC_006680  CNK02400  conserved hypothetical protein  27.27 
 
 		 357 aa  48.1  0.00007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2376  NUDIX hydrolase  26.67 
 
 		 197 aa  46.2  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.278695  normal  0.316272 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1408  NUDIX hydrolase  30 
 
 		 178 aa  45.1  0.0005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.797387  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1205  hypothetical protein  27.27 
 
 		 182 aa  45.1  0.0006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000418064 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1499  Mut/nudix family protein, putative isopentenyl-diphosphate isomerase  31.08 
 
 		 170 aa  44.3  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  9.38166e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2550  hypothetical protein  27.66 
 
 		 203 aa  43.1  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.159383  normal  0.669028 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3117  NUDIX hydrolase  28.95 
 
 		 178 aa  43.1  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.129541  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0565  NUDIX hydrolase  32.56 
 
 		 177 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0610  NUDIX hydrolase  32.56 
 
 		 178 aa  42.7  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0690731 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2237  NUDIX hydrolase  28.48 
 
 		 169 aa  42.4  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0632516  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1991  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  30.23 
 
 		 184 aa  41.6  0.005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0604  NUDIX hydrolase  31.4 
 
 		 177 aa  41.2  0.008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>