92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_2726 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013922  Nmag_2726  Isopentenyl-diphosphate Delta-isomerase  100 
 
 		 216 aa  444  1.0000000000000001e-124  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.546258  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0774  Isopentenyl-diphosphate Delta-isomerase  84.18 
 
 		 186 aa  312  2.9999999999999996e-84  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0419  Isopentenyl-diphosphate Delta-isomerase  75.14 
 
 		 187 aa  288  5.0000000000000004e-77  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1568  Isopentenyl-diphosphate Delta-isomerase  72.22 
 
 		 203 aa  271  4.0000000000000004e-72  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.331903 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1959  NUDIX hydrolase  69.66 
 
 		 196 aa  266  2.9999999999999995e-70  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.372281  normal  0.231683 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20640  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, type 1  35.09 
 
 		 213 aa  100  2e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0313  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  36.21 
 
 		 216 aa  99.8  3e-20  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.814228 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9366  Isopentenyl-diphosphate Delta-isomerase  31.07 
 
 		 193 aa  94  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.706923 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3569  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, type 1  33.78 
 
 		 197 aa  90.5  2e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.863637 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5925  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, type 1  33.1 
 
 		 181 aa  89.7  3e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0950734 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11763  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  30.61 
 
 		 203 aa  88.2  8e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00483885 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2043  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, type 1  33.92 
 
 		 172 aa  84.3  0.000000000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.82849  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5294  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  33.78 
 
 		 190 aa  84  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2276  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, type 1  32.2 
 
 		 176 aa  82.4  0.000000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00103129 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5942  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, type 1  33.53 
 
 		 176 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.934933  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4731  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, type 1  30.51 
 
 		 171 aa  79.7  0.00000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.291133  decreased coverage  0.0000344266 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1582  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  32.88 
 
 		 181 aa  79  0.00000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.196336  normal  0.154748 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3375  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  30.86 
 
 		 181 aa  78.6  0.00000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.923272  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3195  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  30.86 
 
 		 181 aa  78.6  0.00000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.376007  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3207  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  30.86 
 
 		 181 aa  78.6  0.00000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.321651 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3270  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  30.86 
 
 		 181 aa  78.6  0.00000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5570  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  29.17 
 
 		 227 aa  77.8  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00579  Isopentenyl diphosphate isomerasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q874I0]  30.6 
 
 		 268 aa  77.8  0.0000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.590564 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13638  putative isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  31.07 
 
 		 174 aa  77.8  0.0000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.279506  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4299  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, type 1  29.69 
 
 		 197 aa  77.8  0.0000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.651923  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0343  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, type 1  27.87 
 
 		 198 aa  76.3  0.0000000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.447974  normal  0.157249 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0674  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  29.89 
 
 		 177 aa  75.5  0.0000000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.90735  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3273  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  30.25 
 
 		 181 aa  75.1  0.0000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1842  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  30.61 
 
 		 181 aa  75.1  0.0000000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.743042  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2032  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, type 1  32.14 
 
 		 171 aa  74.7  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0720  diphosphomevalonate decarboxylase/isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  31.75 
 
 		 503 aa  72.8  0.000000000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0013091  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1754  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, type 1  28.82 
 
 		 191 aa  72.4  0.000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.202271  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0619  diphosphomevalonate decarboxylase  32.8 
 
 		 503 aa  71.6  0.000000000007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04480  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  29.9 
 
 		 200 aa  70.9  0.00000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4438  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  38.19 
 
 		 199 aa  71.2  0.00000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3991  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  28.76 
 
 		 186 aa  70.5  0.00000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.189435  normal  0.153938 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2029  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, type 1  30.91 
 
 		 210 aa  69.7  0.00000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0672691  hitchhiker  0.00592267 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12740  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  30 
 
 		 196 aa  69.7  0.00000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.251434  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0269  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, type 1  35 
 
 		 175 aa  69.7  0.00000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2201  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, type 1  29.41 
 
 		 179 aa  69.3  0.00000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.43573  hitchhiker  0.00000497991 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1548  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, type 1  29.24 
 
 		 179 aa  69.3  0.00000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.51389  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2914  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, type 1  29.24 
 
 		 179 aa  67  0.0000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3308  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  28.47 
 
 		 182 aa  67  0.0000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3527  isopentenyl-diphosphate Delta-isomerase  33.96 
 
 		 176 aa  66.2  0.0000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.750561 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0969  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  31.55 
 
 		 191 aa  65.5  0.0000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0417204 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4928  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  30.6 
 
 		 199 aa  65.5  0.0000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.358749  normal  0.255355 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1382  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, type 1  34.56 
 
 		 190 aa  65.5  0.0000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02721  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  27.78 
 
 		 182 aa  64.7  0.000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.304436  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1623  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, type 1  28.9 
 
 		 175 aa  64.7  0.000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02684  hypothetical protein  27.78 
 
 		 166 aa  64.3  0.000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.406743  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0168  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  29.89 
 
 		 176 aa  64.3  0.000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_12533  predicted protein  29.15 
 
 		 222 aa  64.3  0.000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.673219  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3022  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  27.78 
 
 		 182 aa  63.9  0.000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4188  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  29.09 
 
 		 219 aa  63.2  0.000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37460  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  30.53 
 
 		 212 aa  62.8  0.000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.50041  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24100  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, type 1  30 
 
 		 197 aa  62.4  0.000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13780  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  30.11 
 
 		 180 aa  62  0.000000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.201595  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0820  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  27.08 
 
 		 182 aa  62  0.000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4179  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  27.78 
 
 		 182 aa  62  0.000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3215  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  27.78 
 
 		 182 aa  62  0.000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3307  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  26.06 
 
 		 183 aa  61.6  0.000000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.995091 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2543  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, type 1  27.88 
 
 		 181 aa  60.8  0.00000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.188971  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_13493  predicted protein  27.68 
 
 		 256 aa  60.5  0.00000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4870  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, type 1  29.81 
 
 		 185 aa  60.5  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0257995  normal  0.425035 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0276  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  32.5 
 
 		 177 aa  59.7  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0803  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, type 1  27.08 
 
 		 182 aa  59.7  0.00000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.010723  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1919  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, type 1  32.5 
 
 		 181 aa  59.7  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.353354 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1019  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, type 1  31.45 
 
 		 181 aa  58.5  0.00000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.123527  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4564  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  35.71 
 
 		 196 aa  58.5  0.00000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.669276  hitchhiker  0.00145949 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_68990  isopentenyl diphosphate:dimethylallyl diphosphate isomerase (IPP isomerase)  27.27 
 
 		 286 aa  58.5  0.00000008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3442  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  32.7 
 
 		 184 aa  58.5  0.00000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.580017  normal  1 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_12972  predicted protein  27.23 
 
 		 247 aa  58.5  0.00000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3048  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  26.39 
 
 		 182 aa  57.4  0.0000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3045  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, type 1  29.88 
 
 		 180 aa  57.4  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21260  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  32.46 
 
 		 209 aa  56.6  0.0000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.682268  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA02550  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, putative  28.82 
 
 		 265 aa  55.8  0.0000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2618  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, type 1  28.75 
 
 		 199 aa  49.3  0.00005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0277117  normal  0.0125903 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0626  MutT/nudix family protein  29.33 
 
 		 161 aa  48.9  0.00006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000112131  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1536  NUDIX hydrolase  26.47 
 
 		 331 aa  48.1  0.00009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.137745  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3251  NUDIX hydrolase  29.2 
 
 		 178 aa  47.8  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000109349  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2376  NUDIX hydrolase  35.37 
 
 		 197 aa  47  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.278695  normal  0.316272 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4600  NUDIX hydrolase  29.82 
 
 		 178 aa  45.8  0.0005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0447936 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1708  NUDIX hydrolase  35.71 
 
 		 170 aa  45.4  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0396  NUDIX hydrolase  28.67 
 
 		 171 aa  45.1  0.0009  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000159718  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1499  Mut/nudix family protein, putative isopentenyl-diphosphate isomerase  26.5 
 
 		 170 aa  44.7  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  9.38166e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1991  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  26.92 
 
 		 184 aa  44.7  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0565  NUDIX hydrolase  30.09 
 
 		 177 aa  44.7  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0346  NUDIX hydrolase  32.79 
 
 		 182 aa  45.1  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0239643 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0610  NUDIX hydrolase  30.97 
 
 		 178 aa  45.1  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0690731 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0604  NUDIX hydrolase  30.09 
 
 		 177 aa  44.7  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2550  hypothetical protein  30.28 
 
 		 203 aa  43.1  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.159383  normal  0.669028 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3117  NUDIX hydrolase  28.72 
 
 		 178 aa  41.6  0.008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.129541  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>