287 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_0396 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013171  Apre_0396  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 171 aa  348  1e-95  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000159718  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0990  NUDIX hydrolase  47.53 
 
 		 173 aa  152  2e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000363849  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1536  NUDIX hydrolase  43.29 
 
 		 331 aa  144  8.000000000000001e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.137745  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl471  nucleoside diphosphate (nudix) hydrolase  42.77 
 
 		 174 aa  137  6e-32  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00345431  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17300  ADP-ribose pyrophosphatase  30.19 
 
 		 172 aa  78.2  0.00000000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.197919  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0626  MutT/nudix family protein  36.05 
 
 		 161 aa  78.2  0.00000000000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000112131  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1742  NUDIX hydrolase  30.83 
 
 		 166 aa  69.7  0.00000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.445003  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0674  NUDIX family hydrolase  27.44 
 
 		 177 aa  68.2  0.00000000006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3251  NUDIX hydrolase  31.54 
 
 		 178 aa  67.4  0.00000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000109349  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1593  NUDIX hydrolase  32.32 
 
 		 189 aa  65.1  0.0000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1866  putative mutator mutT protein  36.59 
 
 		 138 aa  60.8  0.000000009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.452444  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1939  mutator mutT protein, putative  36.59 
 
 		 138 aa  60.8  0.000000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2514  NUDIX hydrolase  35.37 
 
 		 135 aa  60.8  0.000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.348957 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3010  mutator MutT protein  34.58 
 
 		 137 aa  60.1  0.00000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1205  hypothetical protein  31.13 
 
 		 182 aa  60.5  0.00000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000418064 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0732  hydrolase, NUDIX family  28.86 
 
 		 163 aa  60.1  0.00000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00265713 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3536  mutator MutT protein  33.64 
 
 		 142 aa  59.3  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2596  mutator MutT protein  37.8 
 
 		 132 aa  60.1  0.00000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.202287  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2237  NUDIX hydrolase  27.01 
 
 		 169 aa  59.7  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0632516  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0937  mutator MutT protein  32.48 
 
 		 134 aa  58.5  0.00000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.655368 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2758  NUDIX hydrolase  36.59 
 
 		 132 aa  58.5  0.00000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0614  NUDIX hydrolase  33.62 
 
 		 135 aa  58.2  0.00000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0852421  normal  0.976562 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3564  mutator MutT protein  37.8 
 
 		 132 aa  57.8  0.00000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2376  NUDIX hydrolase  32.39 
 
 		 197 aa  57.8  0.00000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.278695  normal  0.316272 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3976  NTP pyrophosphohydrolase MutT family  35.37 
 
 		 135 aa  57  0.0000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.495493  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3827  mutator MutT protein  32.71 
 
 		 137 aa  57  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.9578  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0612  hypothetical protein  43.48 
 
 		 318 aa  56.6  0.0000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.362633  normal  0.329408 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2266  mutator MutT protein  35.37 
 
 		 138 aa  56.6  0.0000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.97404 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3444  mutator MutT protein  31.78 
 
 		 129 aa  56.2  0.0000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.013842 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1025  mutator MutT protein  34.15 
 
 		 138 aa  55.8  0.0000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1547  NUDIX hydrolase  32.17 
 
 		 334 aa  55.5  0.0000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0393  NUDIX hydrolase  35.37 
 
 		 151 aa  55.5  0.0000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0143853  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0292  mutator mutT protein  36.59 
 
 		 128 aa  55.1  0.0000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.476279 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2914  mutator mutT protein  36.59 
 
 		 136 aa  54.7  0.0000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.262626  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1166  NTP pyrophosphohydrolase  34.15 
 
 		 132 aa  54.3  0.0000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2828  mutator MutT protein  34.15 
 
 		 132 aa  54.3  0.0000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.623153  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1792  NUDIX hydrolase  37.04 
 
 		 142 aa  54.3  0.0000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1733  mutator MutT protein  31.78 
 
 		 144 aa  54.3  0.0000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0397  mutator MutT protein  29.2 
 
 		 347 aa  54.3  0.0000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.527818 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4840  mutT/nudix family protein  27.87 
 
 		 180 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09350  dihydrofolate reductase  24.34 
 
 		 337 aa  52.8  0.000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.32591  normal  0.990964 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1764  A/G-specific adenine glycosylase  27.33 
 
 		 360 aa  53.5  0.000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4928  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  27.14 
 
 		 199 aa  53.5  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.358749  normal  0.255355 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13638  putative isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  30.08 
 
 		 174 aa  52.4  0.000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.279506  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1120  NUDIX hydrolase  29.57 
 
 		 178 aa  52.4  0.000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5561  hypothetical protein  26.72 
 
 		 178 aa  52  0.000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.546979  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0388  mutator MutT protein  31.82 
 
 		 138 aa  52.4  0.000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.616604 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4438  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  27.4 
 
 		 199 aa  52  0.000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0465  hypothetical protein  45 
 
 		 320 aa  52  0.000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0029  NUDIX hydrolase  34.15 
 
 		 137 aa  52  0.000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.999066 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37240  ADP-ribose pyrophosphatase  29.79 
 
 		 136 aa  52  0.000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0574  mutator MutT protein  34.91 
 
 		 139 aa  51.6  0.000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.37378  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0110  NUDIX hydrolase  34.15 
 
 		 133 aa  51.6  0.000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0364  mutator mutT protein  32.56 
 
 		 137 aa  51.6  0.000005  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0523  NUDIX hydrolase  35.37 
 
 		 133 aa  51.2  0.000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.23727 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3117  NUDIX hydrolase  31.91 
 
 		 178 aa  51.6  0.000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.129541  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4940  NUDIX hydrolase  35.21 
 
 		 146 aa  51.2  0.000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000317059 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0597  NUDIX hydrolase  35.37 
 
 		 133 aa  51.6  0.000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0405  hypothetical protein  45 
 
 		 320 aa  51.6  0.000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0312  mutator MutT protein  32.04 
 
 		 138 aa  50.8  0.000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.672809  normal  0.370797 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0356  mutator MutT protein  32.04 
 
 		 138 aa  50.8  0.000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0223709  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0387  NUDIX hydrolase  35.37 
 
 		 129 aa  51.2  0.000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.724674  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1582  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  27.88 
 
 		 181 aa  50.8  0.000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.196336  normal  0.154748 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0565  NUDIX hydrolase  40 
 
 		 177 aa  50.4  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3039  Protein of unknown function DUF2029  42.37 
 
 		 570 aa  50.4  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2201  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, type 1  27.68 
 
 		 179 aa  50.4  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.43573  hitchhiker  0.00000497991 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2043  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, type 1  29.08 
 
 		 172 aa  50.4  0.00001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.82849  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4811  NUDIX hydrolase  34.38 
 
 		 138 aa  50.8  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.304627  decreased coverage  0.0000674364 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64010  hypothetical protein  27.88 
 
 		 178 aa  50.4  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0604  NUDIX hydrolase  40 
 
 		 177 aa  50.4  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0610  NUDIX hydrolase  40 
 
 		 178 aa  50.4  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0690731 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1623  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, type 1  27.08 
 
 		 175 aa  50.4  0.00001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2914  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, type 1  25.33 
 
 		 179 aa  50.1  0.00002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04356  hypothetical protein  45.28 
 
 		 302 aa  49.3  0.00002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1126  dimethyladenosine transferase  27.95 
 
 		 459 aa  50.1  0.00002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0870793  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1712  NUDIX hydrolase  35.21 
 
 		 138 aa  48.9  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.148507  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0346  NUDIX hydrolase  29.91 
 
 		 182 aa  48.9  0.00003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0239643 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7592  putative mutator protein mutT  31.46 
 
 		 136 aa  49.3  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0886771 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1907  NUDIX hydrolase  29.17 
 
 		 149 aa  48.9  0.00003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.397506  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2042  NUDIX hydrolase  33.94 
 
 		 129 aa  48.9  0.00003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000547499 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4600  NUDIX hydrolase  28.07 
 
 		 178 aa  48.5  0.00004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0447936 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1991  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  39.66 
 
 		 184 aa  48.5  0.00004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1930  NUDIX hydrolase  28.3 
 
 		 151 aa  48.9  0.00004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.104334  normal  0.229344 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0513  NUDIX hydrolase  29.91 
 
 		 138 aa  48.5  0.00004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.117627  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27463  predicted protein  33.01 
 
 		 274 aa  48.5  0.00004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00352572 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_25489  predicted protein  33.01 
 
 		 274 aa  48.5  0.00004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0283789 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2586  NUDIX hydrolase  31.71 
 
 		 138 aa  48.1  0.00005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4091  hypothetical protein  42.86 
 
 		 316 aa  48.5  0.00005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3658  mutator MutT protein  36.23 
 
 		 135 aa  48.5  0.00005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.236932  normal  0.362443 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1867  NUDIX hydrolase  28.87 
 
 		 183 aa  48.5  0.00005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3569  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, type 1  25.88 
 
 		 197 aa  48.1  0.00005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.863637 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1106  NUDIX hydrolase  40 
 
 		 139 aa  48.5  0.00005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000361121  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5942  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, type 1  26.89 
 
 		 176 aa  48.1  0.00006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.934933  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0625  NUDIX hydrolase  31.17 
 
 		 185 aa  48.1  0.00006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1499  Mut/nudix family protein, putative isopentenyl-diphosphate isomerase  30.09 
 
 		 170 aa  48.1  0.00006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  9.38166e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9366  Isopentenyl-diphosphate Delta-isomerase  25 
 
 		 193 aa  48.1  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.706923 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2519  NUDIX hydrolase  34.15 
 
 		 133 aa  48.1  0.00006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0428  NUDIX hydrolase  31.96 
 
 		 138 aa  48.1  0.00006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.834318  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4181  A/G-specific adenine glycosylase  28.97 
 
 		 386 aa  47.8  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.215625  normal  0.631474 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4376  hypothetical protein  36.99 
 
 		 314 aa  47.8  0.00008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0336257 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>