114 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aasi_1205 on replicon NC_010830
Organism: Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010830  Aasi_1205  hypothetical protein  100 
 
 		 182 aa  379  1e-104  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000418064 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1126  dimethyladenosine transferase  46.43 
 
 		 459 aa  79  0.00000000000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0870793  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1593  NUDIX hydrolase  32 
 
 		 189 aa  77  0.0000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3251  NUDIX hydrolase  33.83 
 
 		 178 aa  69.3  0.00000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000109349  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1991  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  40.22 
 
 		 184 aa  69.3  0.00000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4564  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  30.72 
 
 		 196 aa  67  0.0000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.669276  hitchhiker  0.00145949 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2376  NUDIX hydrolase  33.59 
 
 		 197 aa  66.2  0.0000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.278695  normal  0.316272 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1499  Mut/nudix family protein, putative isopentenyl-diphosphate isomerase  31.54 
 
 		 170 aa  65.1  0.0000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  9.38166e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4928  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  30 
 
 		 199 aa  65.1  0.0000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.358749  normal  0.255355 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0396  NUDIX hydrolase  31.13 
 
 		 171 aa  60.5  0.00000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000159718  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4438  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  25.97 
 
 		 199 aa  60.1  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl471  nucleoside diphosphate (nudix) hydrolase  25.66 
 
 		 174 aa  57  0.0000001  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00345431  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0168  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  24.1 
 
 		 176 aa  57.4  0.0000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1536  NUDIX hydrolase  28.06 
 
 		 331 aa  56.2  0.0000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.137745  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0990  NUDIX hydrolase  28.68 
 
 		 173 aa  56.2  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000363849  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1548  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, type 1  32.2 
 
 		 179 aa  55.1  0.0000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.51389  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2049  mutT/nudix family protein  33.88 
 
 		 202 aa  54.7  0.0000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00026256  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0346  NUDIX hydrolase  49.15 
 
 		 182 aa  54.7  0.0000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0239643 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2550  hypothetical protein  36.08 
 
 		 203 aa  54.7  0.0000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.159383  normal  0.669028 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3442  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  29.91 
 
 		 184 aa  54.7  0.0000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.580017  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2914  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, type 1  29.31 
 
 		 179 aa  53.9  0.000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5925  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, type 1  27.52 
 
 		 181 aa  53.5  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0950734 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1742  NUDIX hydrolase  26.88 
 
 		 166 aa  52.8  0.000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.445003  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0674  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  28.28 
 
 		 177 aa  53.1  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.90735  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1582  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  24.71 
 
 		 181 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.196336  normal  0.154748 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_26905  predicted protein  36.71 
 
 		 216 aa  53.1  0.000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0375733  normal  0.0729725 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2201  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, type 1  27.97 
 
 		 179 aa  53.1  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.43573  hitchhiker  0.00000497991 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3569  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, type 1  25.28 
 
 		 197 aa  52.4  0.000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.863637 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2765  NUDIX hydrolase  35.14 
 
 		 209 aa  52.4  0.000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3117  NUDIX hydrolase  35.56 
 
 		 178 aa  51.6  0.000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.129541  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5570  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  25 
 
 		 227 aa  51.6  0.000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0626  MutT/nudix family protein  29.03 
 
 		 161 aa  50.4  0.00001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000112131  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1823  mutT/nudix family protein  26.55 
 
 		 202 aa  50.1  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00460593  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1964  mutT/nudix family protein  26.55 
 
 		 202 aa  50.1  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000761489  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0674  NUDIX family hydrolase  25.15 
 
 		 177 aa  49.7  0.00002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3359  mutT/nudix family protein  29.14 
 
 		 202 aa  50.1  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.039473  hitchhiker  0.00000000000000713164 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20640  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, type 1  32.91 
 
 		 213 aa  49.7  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11763  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  29.41 
 
 		 203 aa  49.3  0.00003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00483885 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1831  NUDIX hydrolase  27.49 
 
 		 202 aa  49.7  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000890359  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0610  NUDIX hydrolase  29.17 
 
 		 178 aa  49.3  0.00003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0690731 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1968  mutT/nudix family protein  24.86 
 
 		 202 aa  49.3  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0475736  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0565  NUDIX hydrolase  29.17 
 
 		 177 aa  48.9  0.00004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1798  MutT/Nudix family protein  25.99 
 
 		 202 aa  48.9  0.00004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.840162  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0604  NUDIX hydrolase  28.85 
 
 		 177 aa  48.9  0.00004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2000  mutT/nudix family protein  25.99 
 
 		 202 aa  48.9  0.00004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.7905499999999994e-43 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1781  MutT/Nudix family protein  25.99 
 
 		 202 aa  48.5  0.00005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.893185  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5561  hypothetical protein  30.39 
 
 		 178 aa  48.5  0.00005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.546979  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2237  NUDIX hydrolase  26.45 
 
 		 169 aa  48.5  0.00005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0632516  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1019  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, type 1  27.35 
 
 		 181 aa  48.1  0.00006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.123527  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24100  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, type 1  31.13 
 
 		 197 aa  48.1  0.00006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9366  Isopentenyl-diphosphate Delta-isomerase  26.97 
 
 		 193 aa  48.1  0.00008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.706923 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3270  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  34.15 
 
 		 181 aa  47.8  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3207  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  34.15 
 
 		 181 aa  47.8  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.321651 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3195  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  34.15 
 
 		 181 aa  47.8  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.376007  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3375  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  34.15 
 
 		 181 aa  47.8  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.923272  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2739  NUDIX hydrolase  40.28 
 
 		 273 aa  47.8  0.00008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.275113  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4600  NUDIX hydrolase  28.12 
 
 		 178 aa  47.8  0.00009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0447936 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3273  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  34.15 
 
 		 181 aa  47.8  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4840  mutT/nudix family protein  29.55 
 
 		 180 aa  47  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3404  NUDIX hydrolase  41.67 
 
 		 273 aa  47.4  0.0001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.707971  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3045  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, type 1  27.97 
 
 		 180 aa  47.4  0.0001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2070  mutT/nudix family protein  25.42 
 
 		 202 aa  47.4  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000173279  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2043  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, type 1  30.77 
 
 		 172 aa  47  0.0001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.82849  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4188  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  28.89 
 
 		 219 aa  46.2  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3467  NUDIX hydrolase  31.58 
 
 		 289 aa  46.2  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.431608 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3527  isopentenyl-diphosphate Delta-isomerase  23.21 
 
 		 176 aa  47  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.750561 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2861  NUDIX hydrolase  34.12 
 
 		 142 aa  45.8  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.510666  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2236  NUDIX hydrolase  34.12 
 
 		 322 aa  46.2  0.0003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5942  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, type 1  35.94 
 
 		 176 aa  45.8  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.934933  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2032  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, type 1  26 
 
 		 171 aa  45.8  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4731  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, type 1  25.25 
 
 		 171 aa  45.8  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.291133  decreased coverage  0.0000344266 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0625  NUDIX hydrolase  31.25 
 
 		 185 aa  45.8  0.0004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0276  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  24.67 
 
 		 177 aa  45.8  0.0004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1919  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, type 1  24.67 
 
 		 181 aa  45.4  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.353354 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2543  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, type 1  35.23 
 
 		 181 aa  45.4  0.0004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.188971  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2029  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, type 1  26.32 
 
 		 210 aa  45.4  0.0005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0672691  hitchhiker  0.00592267 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13780  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  27.27 
 
 		 180 aa  45.1  0.0006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.201595  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3852  NUDIX hydrolase  28.46 
 
 		 272 aa  44.7  0.0007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02684  hypothetical protein  32 
 
 		 166 aa  44.7  0.0007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.406743  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02721  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  32 
 
 		 182 aa  44.7  0.0008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.304436  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3022  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  32 
 
 		 182 aa  44.7  0.0008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0820  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  32 
 
 		 182 aa  44.3  0.0009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0346  NUDIX hydrolase  31.25 
 
 		 169 aa  43.9  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.408953  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3123  NUDIX hydrolase  30.85 
 
 		 141 aa  43.9  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0687463 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1867  NUDIX hydrolase  36.26 
 
 		 183 aa  44.3  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5387  NUDIX hydrolase  33.75 
 
 		 283 aa  43.9  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.503936 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2276  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, type 1  24.51 
 
 		 176 aa  44.3  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00103129 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0504  NUDIX hydrolase  42.42 
 
 		 101 aa  43.1  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.163605  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5294  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  24.32 
 
 		 190 aa  43.5  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0666  NUDIX hydrolase  34.85 
 
 		 173 aa  43.5  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000195734  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0343  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, type 1  25.16 
 
 		 198 aa  43.5  0.002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.447974  normal  0.157249 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1553  NUDIX hydrolase  34.33 
 
 		 182 aa  43.5  0.002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0803  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, type 1  31.08 
 
 		 182 aa  42.7  0.003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.010723  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3215  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  31.08 
 
 		 182 aa  42.7  0.003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3318  NUDIX hydrolase  25 
 
 		 185 aa  42.7  0.003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.000000000044442  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4179  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  31.08 
 
 		 182 aa  42.7  0.003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07000  NUDIX hydrolase  28.95 
 
 		 177 aa  42.7  0.003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64010  hypothetical protein  26.32 
 
 		 178 aa  42.4  0.004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3444  mutator MutT protein  32.94 
 
 		 129 aa  42.4  0.004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.013842 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1382  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, type 1  21.97 
 
 		 190 aa  42.4  0.004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>