42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A0214 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A0214  MutT/nudix family protein  100 
 
 		 292 aa  597  1e-170  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0853597  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2749  NUDIX hydrolase  47.69 
 
 		 285 aa  268  7e-71  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_87640  predicted protein  40.07 
 
 		 299 aa  202  6e-51  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3299  NUDIX hydrolase  39.58 
 
 		 288 aa  181  2e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0961007 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0533  NUDIX hydrolase  39.15 
 
 		 285 aa  176  3e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.336062  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2700  NUDIX hydrolase  38.43 
 
 		 285 aa  170  2e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.170389 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2842  NUDIX hydrolase  38.43 
 
 		 285 aa  170  3e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1976  NUDIX hydrolase  49.19 
 
 		 312 aa  169  5e-41  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.620391  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0495  thiamin pyrophosphokinase-related protein  39.37 
 
 		 283 aa  167  1e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0856896  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0590  nudix hydrolase  38.58 
 
 		 285 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.890428  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2951  nudix hydrolase  38.58 
 
 		 285 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.88626  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1523  thiamin pyrophosphokinase-related protein  38.58 
 
 		 285 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3098  thiamin pyrophosphokinase-related protein  38.58 
 
 		 285 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0067  thiamin pyrophosphokinase-related protein  38.58 
 
 		 285 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2793  NUDIX hydrolase  36.43 
 
 		 288 aa  161  1e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.335799 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0606  nudix hydrolase  38.87 
 
 		 285 aa  160  2e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1753  NUDIX hydrolase  41.55 
 
 		 284 aa  160  2e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.871193 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2075  NUDIX hydrolase  42.4 
 
 		 284 aa  160  2e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.758839  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0775  NUDIX domain-containing protein  38.87 
 
 		 285 aa  160  2e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_14808  predicted protein  41.7 
 
 		 229 aa  160  2e-38  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.147852  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2782  NUDIX hydrolase  36.43 
 
 		 288 aa  159  3e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.378837  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2168  NUDIX hydrolase  36.43 
 
 		 288 aa  159  3e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6112  NUDIX hydrolase  36.78 
 
 		 288 aa  160  3e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.663998  normal  0.430005 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0335  NUDIX hydrolase  38.8 
 
 		 282 aa  158  1e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4113  putative NTP pyrophosphohydrolases including oxidative damage repair enzymes  37.45 
 
 		 282 aa  157  2e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0605  NUDIX hydrolase  37.12 
 
 		 287 aa  155  8e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0159393 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1874  hypothetical protein  37.79 
 
 		 267 aa  146  5e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0332068  normal  1 
 
 
-
 
NC_006680  CNK02400  conserved hypothetical protein  36.51 
 
 		 357 aa  141  9.999999999999999e-33  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00193  thiamin pyrophosphokinase-related protein (AFU_orthologue; AFUA_5G11110)  36.14 
 
 		 319 aa  137  2e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.415075 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2237  NUDIX hydrolase  37.79 
 
 		 283 aa  136  4e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.841467  normal  0.0550571 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2212  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 280 aa  132  1.0000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0979723  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_46967  thiamine pyrophosphokinase  33.22 
 
 		 316 aa  122  6e-27  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.934951  normal  0.22285 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07239  conserved hypothetical protein  33.64 
 
 		 232 aa  105  1e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3504  NUDIX domain-containing protein  35.64 
 
 		 192 aa  103  4e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.433269  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0945  NUDIX hydrolase  32.86 
 
 		 277 aa  103  5e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0897  NUDIX hydrolase  32.34 
 
 		 277 aa  101  1e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.22115  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3852  NUDIX hydrolase  28.48 
 
 		 272 aa  62.8  0.000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2236  NUDIX hydrolase  28.36 
 
 		 322 aa  55.8  0.0000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3404  NUDIX hydrolase  30.08 
 
 		 273 aa  52  0.00001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.707971  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2739  NUDIX hydrolase  29.32 
 
 		 273 aa  51.6  0.00001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.275113  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3467  NUDIX hydrolase  30.43 
 
 		 289 aa  50.4  0.00004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.431608 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5387  NUDIX hydrolase  26.76 
 
 		 283 aa  45.1  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.503936 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>