54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnec_0945 on replicon NC_010531
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010531  Pnec_0945  NUDIX hydrolase  100 
 
 
277 aa  571  1.0000000000000001e-162  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0897  NUDIX hydrolase  82.31 
 
 
277 aa  481  1e-135  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.22115  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0335  NUDIX hydrolase  36.17 
 
 
282 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4113  putative NTP pyrophosphohydrolases including oxidative damage repair enzymes  39.39 
 
 
282 aa  122  8e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2212  NUDIX hydrolase  37.24 
 
 
280 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0979723  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0605  NUDIX hydrolase  41.18 
 
 
287 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0159393 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2075  NUDIX hydrolase  38.58 
 
 
284 aa  120  3e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.758839  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6112  NUDIX hydrolase  33.2 
 
 
288 aa  119  6e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.663998  normal  0.430005 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2237  NUDIX hydrolase  39.49 
 
 
283 aa  119  7.999999999999999e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.841467  normal  0.0550571 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1753  NUDIX hydrolase  38.19 
 
 
284 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.871193 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0495  thiamin pyrophosphokinase-related protein  36.67 
 
 
283 aa  116  5e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0856896  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3852  NUDIX hydrolase  31.67 
 
 
272 aa  115  8.999999999999998e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0067  thiamin pyrophosphokinase-related protein  36.67 
 
 
285 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1523  thiamin pyrophosphokinase-related protein  36.67 
 
 
285 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0590  nudix hydrolase  36.67 
 
 
285 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.890428  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0606  nudix hydrolase  36.67 
 
 
285 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0775  NUDIX domain-containing protein  36.67 
 
 
285 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2951  nudix hydrolase  36.67 
 
 
285 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.88626  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3098  thiamin pyrophosphokinase-related protein  36.67 
 
 
285 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_87640  predicted protein  31.84 
 
 
299 aa  111  1.0000000000000001e-23  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2793  NUDIX hydrolase  34.26 
 
 
288 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.335799 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0533  NUDIX hydrolase  35.64 
 
 
285 aa  110  3e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.336062  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3504  NUDIX domain-containing protein  39.02 
 
 
192 aa  110  3e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.433269  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2168  NUDIX hydrolase  33.8 
 
 
288 aa  110  3e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2782  NUDIX hydrolase  33.8 
 
 
288 aa  110  3e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.378837  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1874  hypothetical protein  35.58 
 
 
267 aa  109  6e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0332068  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2749  NUDIX hydrolase  35.14 
 
 
285 aa  108  7.000000000000001e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2700  NUDIX hydrolase  34.27 
 
 
285 aa  107  1e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.170389 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2842  NUDIX hydrolase  34.27 
 
 
285 aa  108  1e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5387  NUDIX hydrolase  32.82 
 
 
283 aa  103  3e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.503936 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0214  MutT/nudix family protein  32.86 
 
 
292 aa  103  5e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0853597  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2739  NUDIX hydrolase  31.49 
 
 
273 aa  100  3e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.275113  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3299  NUDIX hydrolase  37.87 
 
 
288 aa  99  8e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0961007 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3404  NUDIX hydrolase  31.46 
 
 
273 aa  97.1  3e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.707971  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1976  NUDIX hydrolase  34.91 
 
 
312 aa  95.5  8e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.620391  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00193  thiamin pyrophosphokinase-related protein (AFU_orthologue; AFUA_5G11110)  31.88 
 
 
319 aa  95.5  9e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.415075 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3467  NUDIX hydrolase  31.46 
 
 
289 aa  92.8  5e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.431608 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2236  NUDIX hydrolase  31.61 
 
 
322 aa  90.9  2e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006680  CNK02400  conserved hypothetical protein  32.67 
 
 
357 aa  87.8  2e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_46967  thiamine pyrophosphokinase  31.89 
 
 
316 aa  84.3  0.000000000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.934951  normal  0.22285 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_14808  predicted protein  31.86 
 
 
229 aa  83.6  0.000000000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.147852  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07239  conserved hypothetical protein  31.02 
 
 
232 aa  75.9  0.0000000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0625  NUDIX hydrolase  36.05 
 
 
185 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4379  NUDIX hydrolase  35.05 
 
 
181 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.312753  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2848  NUDIX hydrolase  39.33 
 
 
184 aa  47  0.0003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.00000000562976  normal  0.434056 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0725  NUDIX hydrolase  32.18 
 
 
178 aa  46.2  0.0005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5561  hypothetical protein  34.88 
 
 
178 aa  46.6  0.0005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.546979  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4840  mutT/nudix family protein  34.02 
 
 
180 aa  45.1  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64010  hypothetical protein  34.07 
 
 
178 aa  44.3  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2826  NUDIX hydrolase  31.87 
 
 
185 aa  43.5  0.003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07000  NUDIX hydrolase  33.72 
 
 
177 aa  43.5  0.004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0604  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
177 aa  43.1  0.004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0176  NUDIX hydrolase  35.14 
 
 
173 aa  42.7  0.007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0982781  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3389  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
181 aa  42.4  0.009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>