43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_1753 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_1753  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 284 aa  564  1e-160  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.871193 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2075  NUDIX hydrolase  88.34 
 
 		 284 aa  499  1e-140  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.758839  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1874  hypothetical protein  76.47 
 
 		 267 aa  395  1e-109  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0332068  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2212  NUDIX hydrolase  50.19 
 
 		 280 aa  237  2e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0979723  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0335  NUDIX hydrolase  48.84 
 
 		 282 aa  235  5.0000000000000005e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4113  putative NTP pyrophosphohydrolases including oxidative damage repair enzymes  48.84 
 
 		 282 aa  232  4.0000000000000004e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2237  NUDIX hydrolase  48.33 
 
 		 283 aa  225  6e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.841467  normal  0.0550571 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0605  NUDIX hydrolase  48.09 
 
 		 287 aa  224  1e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0159393 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0533  NUDIX hydrolase  48.85 
 
 		 285 aa  224  1e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.336062  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0606  nudix hydrolase  49.59 
 
 		 285 aa  223  2e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0590  nudix hydrolase  49.59 
 
 		 285 aa  223  2e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.890428  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0775  NUDIX domain-containing protein  49.59 
 
 		 285 aa  223  3e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3098  thiamin pyrophosphokinase-related protein  49.59 
 
 		 285 aa  223  3e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2951  nudix hydrolase  49.59 
 
 		 285 aa  223  3e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.88626  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1523  thiamin pyrophosphokinase-related protein  49.59 
 
 		 285 aa  223  3e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0067  thiamin pyrophosphokinase-related protein  49.59 
 
 		 285 aa  223  3e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0495  thiamin pyrophosphokinase-related protein  48.06 
 
 		 283 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0856896  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2793  NUDIX hydrolase  47.17 
 
 		 288 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.335799 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2168  NUDIX hydrolase  46.42 
 
 		 288 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2782  NUDIX hydrolase  46.42 
 
 		 288 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.378837  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6112  NUDIX hydrolase  46.79 
 
 		 288 aa  218  7e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.663998  normal  0.430005 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2700  NUDIX hydrolase  45.8 
 
 		 285 aa  207  1e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.170389 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2842  NUDIX hydrolase  45.8 
 
 		 285 aa  207  2e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0214  MutT/nudix family protein  41.55 
 
 		 292 aa  160  2e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0853597  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2749  NUDIX hydrolase  34.24 
 
 		 285 aa  141  9.999999999999999e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_87640  predicted protein  35.42 
 
 		 299 aa  139  6e-32  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3504  NUDIX domain-containing protein  47.34 
 
 		 192 aa  136  3.0000000000000003e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.433269  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0897  NUDIX hydrolase  37.09 
 
 		 277 aa  125  7e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.22115  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0945  NUDIX hydrolase  38.19 
 
 		 277 aa  117  1.9999999999999998e-25  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_14808  predicted protein  34.63 
 
 		 229 aa  109  4.0000000000000004e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.147852  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3299  NUDIX hydrolase  40.46 
 
 		 288 aa  108  1e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0961007 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1976  NUDIX hydrolase  33.73 
 
 		 312 aa  102  7e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.620391  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_46967  thiamine pyrophosphokinase  28.97 
 
 		 316 aa  97.1  3e-19  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.934951  normal  0.22285 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2739  NUDIX hydrolase  36 
 
 		 273 aa  94  2e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.275113  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3404  NUDIX hydrolase  36.57 
 
 		 273 aa  93.6  4e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.707971  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2236  NUDIX hydrolase  36.26 
 
 		 322 aa  92.4  7e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5387  NUDIX hydrolase  32.92 
 
 		 283 aa  90.1  4e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.503936 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00193  thiamin pyrophosphokinase-related protein (AFU_orthologue; AFUA_5G11110)  29.91 
 
 		 319 aa  86.7  4e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.415075 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3852  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 272 aa  86.3  5e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3467  NUDIX hydrolase  33.7 
 
 		 289 aa  80.9  0.00000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.431608 
 
 
-
 
NC_006680  CNK02400  conserved hypothetical protein  28.69 
 
 		 357 aa  77.8  0.0000000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07239  conserved hypothetical protein  28.95 
 
 		 232 aa  73.2  0.000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3251  NUDIX hydrolase  41.94 
 
 		 178 aa  42.4  0.008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000109349  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>