48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A2212 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007347  Reut_A2212  NUDIX hydrolase  100 
 
 
280 aa  561  1.0000000000000001e-159  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0979723  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2237  NUDIX hydrolase  71.59 
 
 
283 aa  380  1e-104  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.841467  normal  0.0550571 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1753  NUDIX hydrolase  50.19 
 
 
284 aa  237  2e-61  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.871193 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1874  hypothetical protein  50.78 
 
 
267 aa  235  5.0000000000000005e-61  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0332068  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2075  NUDIX hydrolase  50.36 
 
 
284 aa  234  9e-61  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.758839  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0335  NUDIX hydrolase  44.7 
 
 
282 aa  207  1e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4113  putative NTP pyrophosphohydrolases including oxidative damage repair enzymes  43.94 
 
 
282 aa  206  3e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0605  NUDIX hydrolase  42.75 
 
 
287 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0159393 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0533  NUDIX hydrolase  44.98 
 
 
285 aa  199  5e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.336062  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0495  thiamin pyrophosphokinase-related protein  44.98 
 
 
283 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0856896  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2168  NUDIX hydrolase  45.02 
 
 
288 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2782  NUDIX hydrolase  45.02 
 
 
288 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.378837  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6112  NUDIX hydrolase  43.73 
 
 
288 aa  195  9e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.663998  normal  0.430005 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2793  NUDIX hydrolase  44.65 
 
 
288 aa  194  1e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.335799 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0067  thiamin pyrophosphokinase-related protein  45.45 
 
 
285 aa  192  4e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2951  nudix hydrolase  45.45 
 
 
285 aa  192  4e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.88626  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0590  nudix hydrolase  45.45 
 
 
285 aa  192  4e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.890428  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1523  thiamin pyrophosphokinase-related protein  45.45 
 
 
285 aa  192  4e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3098  thiamin pyrophosphokinase-related protein  45.45 
 
 
285 aa  192  4e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0775  NUDIX domain-containing protein  45.75 
 
 
285 aa  191  1e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0606  nudix hydrolase  45.75 
 
 
285 aa  191  1e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2700  NUDIX hydrolase  43.49 
 
 
285 aa  190  2e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.170389 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2842  NUDIX hydrolase  43.49 
 
 
285 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3504  NUDIX domain-containing protein  48.81 
 
 
192 aa  135  8e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.433269  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2749  NUDIX hydrolase  37.21 
 
 
285 aa  134  9.999999999999999e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_87640  predicted protein  34.09 
 
 
299 aa  132  5e-30  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0214  MutT/nudix family protein  33.33 
 
 
292 aa  132  9e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0853597  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0897  NUDIX hydrolase  39.8 
 
 
277 aa  131  1.0000000000000001e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.22115  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0945  NUDIX hydrolase  37.24 
 
 
277 aa  120  1.9999999999999998e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_14808  predicted protein  37.32 
 
 
229 aa  120  1.9999999999999998e-26  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.147852  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3299  NUDIX hydrolase  37.62 
 
 
288 aa  115  7.999999999999999e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0961007 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1976  NUDIX hydrolase  37.44 
 
 
312 aa  110  4.0000000000000004e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.620391  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00193  thiamin pyrophosphokinase-related protein (AFU_orthologue; AFUA_5G11110)  35.38 
 
 
319 aa  107  3e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.415075 
 
 
-
 
NC_006680  CNK02400  conserved hypothetical protein  31.43 
 
 
357 aa  95.9  7e-19  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_46967  thiamine pyrophosphokinase  29.54 
 
 
316 aa  92  1e-17  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.934951  normal  0.22285 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5387  NUDIX hydrolase  34.55 
 
 
283 aa  90.5  2e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.503936 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3852  NUDIX hydrolase  35.39 
 
 
272 aa  91.3  2e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3404  NUDIX hydrolase  36.05 
 
 
273 aa  80.9  0.00000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.707971  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2739  NUDIX hydrolase  36.42 
 
 
273 aa  79.3  0.00000000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.275113  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2236  NUDIX hydrolase  33.72 
 
 
322 aa  74.7  0.000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07239  conserved hypothetical protein  27.75 
 
 
232 aa  66.2  0.0000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3467  NUDIX hydrolase  31.07 
 
 
289 aa  65.9  0.0000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.431608 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2376  NUDIX hydrolase  28.03 
 
 
197 aa  45.4  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.278695  normal  0.316272 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64010  hypothetical protein  34.46 
 
 
178 aa  45.4  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5561  hypothetical protein  35.29 
 
 
178 aa  43.5  0.004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.546979  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1185  NUDIX hydrolase  31.2 
 
 
187 aa  42.4  0.008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07000  NUDIX hydrolase  29.89 
 
 
177 aa  42.4  0.008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2666  NUDIX hydrolase  48.84 
 
 
182 aa  42.4  0.008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.167572 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>