114 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_1185 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008578  Acel_1185  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 187 aa  366  1e-100  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1867  NUDIX hydrolase  52.63 
 
 		 183 aa  124  8.000000000000001e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3389  NUDIX hydrolase  44.81 
 
 		 181 aa  119  3e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2237  NUDIX hydrolase  46.5 
 
 		 169 aa  117  9.999999999999999e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0632516  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2826  NUDIX hydrolase  41.46 
 
 		 185 aa  107  7.000000000000001e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07000  NUDIX hydrolase  44.09 
 
 		 177 aa  92.8  2e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1708  NUDIX hydrolase  35.9 
 
 		 170 aa  92.8  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4600  NUDIX hydrolase  38.56 
 
 		 178 aa  87  1e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0447936 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0604  NUDIX hydrolase  39.47 
 
 		 177 aa  86.7  2e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0565  NUDIX hydrolase  38.82 
 
 		 177 aa  84.7  7e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64010  hypothetical protein  37.25 
 
 		 178 aa  84.3  8e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0610  NUDIX hydrolase  38.82 
 
 		 178 aa  84.3  8e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0690731 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3318  NUDIX hydrolase  35.9 
 
 		 185 aa  82.8  0.000000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.000000000044442  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0625  NUDIX hydrolase  34.16 
 
 		 185 aa  81.6  0.000000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0725  NUDIX hydrolase  34.18 
 
 		 178 aa  80.1  0.00000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5561  hypothetical protein  35.95 
 
 		 178 aa  79.7  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.546979  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2848  NUDIX hydrolase  37.42 
 
 		 184 aa  79.3  0.00000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.00000000562976  normal  0.434056 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4379  NUDIX hydrolase  32.53 
 
 		 181 aa  78.6  0.00000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.312753  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2376  NUDIX hydrolase  34.48 
 
 		 197 aa  75.9  0.0000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.278695  normal  0.316272 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4840  mutT/nudix family protein  34.46 
 
 		 180 aa  73.6  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1383  NUDIX hydrolase  36.13 
 
 		 203 aa  72.4  0.000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000123288  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2533  nudix hydrolase 3  36.77 
 
 		 184 aa  71.6  0.000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.0000206294  normal  0.801308 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2587  nudix hydrolase 3  36.77 
 
 		 184 aa  71.6  0.000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.0000345832  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2487  nudix hydrolase 3  36.77 
 
 		 184 aa  71.6  0.000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000530906  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2696  nudix hydrolase 3  36.77 
 
 		 184 aa  71.6  0.000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.000172824  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2561  NUDIX hydrolase  37.18 
 
 		 201 aa  71.2  0.000000000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.000000630284  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1481  NUDIX hydrolase  36.13 
 
 		 216 aa  69.7  0.00000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.0000381919  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1436  NUDIX family hydrolase  34.38 
 
 		 182 aa  70.1  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000974563  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0345  NUDIX family hydrolase  34.38 
 
 		 182 aa  70.1  0.00000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.00000000116771  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1545  NUDIX hydrolase  34.38 
 
 		 182 aa  70.1  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.0000000233987  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2575  nudix hydrolase 3  36.13 
 
 		 184 aa  70.5  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.00000332741  normal  0.705838 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2782  NUDIX hydrolase  36.13 
 
 		 216 aa  69.7  0.00000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000698062  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3117  NUDIX hydrolase  31.79 
 
 		 178 aa  67  0.0000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.129541  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_7007  predicted protein  30.9 
 
 		 184 aa  67  0.0000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02224  predicted NUDIX hydrolase  35.48 
 
 		 180 aa  66.6  0.0000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000212424  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1357  NUDIX hydrolase  35.48 
 
 		 180 aa  66.6  0.0000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  2.43085e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2449  NUDIX family hydrolase  35.48 
 
 		 180 aa  66.6  0.0000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  2.25281e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2593  NUDIX family hydrolase  35.48 
 
 		 180 aa  66.6  0.0000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000583084  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1353  NUDIX hydrolase  35.48 
 
 		 180 aa  66.6  0.0000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000000289722  normal  0.985207 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2455  NUDIX family hydrolase  35.48 
 
 		 180 aa  66.6  0.0000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.000000000626304  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2675  hydrolase, NUDIX family protein  35.48 
 
 		 180 aa  66.6  0.0000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  9.90885e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3439  hydrolase, NUDIX family protein  35.48 
 
 		 180 aa  66.6  0.0000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000227212  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02184  hypothetical protein  35.48 
 
 		 180 aa  66.6  0.0000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000358279  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45381  predicted protein  30.19 
 
 		 451 aa  65.5  0.0000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.22287  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1991  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  33.56 
 
 		 184 aa  65.5  0.0000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0346  NUDIX hydrolase  40.7 
 
 		 182 aa  64.7  0.0000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0239643 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3251  NUDIX hydrolase  33.6 
 
 		 178 aa  61.2  0.000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000109349  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1126  dimethyladenosine transferase  27.59 
 
 		 459 aa  60.8  0.00000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0870793  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3991  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  30.25 
 
 		 186 aa  57.4  0.0000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.189435  normal  0.153938 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1408  NUDIX hydrolase  30.94 
 
 		 178 aa  54.3  0.000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.797387  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5925  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, type 1  37.89 
 
 		 181 aa  54.3  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0950734 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1553  NUDIX hydrolase  29.35 
 
 		 182 aa  51.2  0.000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1120  NUDIX hydrolase  26.09 
 
 		 178 aa  50.8  0.00001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_14191  predicted protein  33.85 
 
 		 238 aa  50.1  0.00002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.144173  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04480  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  34.35 
 
 		 200 aa  50.1  0.00002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2758  NUDIX hydrolase  35.29 
 
 		 132 aa  49.3  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24100  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, type 1  31.71 
 
 		 197 aa  48.9  0.00004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1499  Mut/nudix family protein, putative isopentenyl-diphosphate isomerase  31.68 
 
 		 170 aa  48.5  0.00005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  9.38166e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0830  NUDIX hydrolase  40.91 
 
 		 291 aa  48.5  0.00005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2736  hypothetical protein  37.65 
 
 		 196 aa  48.1  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.155618  normal  0.467171 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1166  NTP pyrophosphohydrolase  36.54 
 
 		 132 aa  47.8  0.0001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0029  NUDIX hydrolase  33.96 
 
 		 137 aa  47.4  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.999066 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1582  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  34.04 
 
 		 181 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.196336  normal  0.154748 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2828  mutator MutT protein  36.54 
 
 		 132 aa  47.8  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.623153  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0626  MutT/nudix family protein  31.52 
 
 		 161 aa  47  0.0002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000112131  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0110  NUDIX hydrolase  33.96 
 
 		 133 aa  47  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4870  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, type 1  34.41 
 
 		 185 aa  45.8  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0257995  normal  0.425035 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0934  hypothetical protein  37.78 
 
 		 313 aa  46.2  0.0003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.268176 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1593  NUDIX hydrolase  32.26 
 
 		 189 aa  45.4  0.0005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0597  NUDIX hydrolase  33.96 
 
 		 133 aa  45.1  0.0005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2032  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, type 1  25 
 
 		 171 aa  45.4  0.0005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0393  NUDIX hydrolase  36.67 
 
 		 151 aa  45.1  0.0006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0143853  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4299  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, type 1  27.27 
 
 		 197 aa  45.1  0.0006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.651923  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2043  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, type 1  26.8 
 
 		 172 aa  45.1  0.0006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.82849  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12740  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  32.11 
 
 		 196 aa  44.7  0.0008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.251434  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13370  hypothetical protein  43.06 
 
 		 313 aa  44.7  0.0008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2596  mutator MutT protein  33.98 
 
 		 132 aa  44.7  0.0009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.202287  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0523  NUDIX hydrolase  42.11 
 
 		 133 aa  43.9  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.23727 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2266  mutator MutT protein  35.64 
 
 		 138 aa  43.9  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.97404 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3404  NUDIX hydrolase  31.91 
 
 		 273 aa  44.3  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.707971  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4971  hypothetical protein  37.23 
 
 		 315 aa  44.3  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4811  NUDIX hydrolase  36.84 
 
 		 138 aa  43.9  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.304627  decreased coverage  0.0000674364 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3569  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, type 1  33.71 
 
 		 197 aa  44.3  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.863637 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0168  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  30.77 
 
 		 176 aa  43.1  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7592  putative mutator protein mutT  33.02 
 
 		 136 aa  43.1  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0886771 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2586  NUDIX hydrolase  37.21 
 
 		 138 aa  43.1  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1939  mutator mutT protein, putative  36.05 
 
 		 138 aa  42.7  0.003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2550  hypothetical protein  22.01 
 
 		 203 aa  42.7  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.159383  normal  0.669028 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3582  NUDIX hydrolase  29.41 
 
 		 154 aa  42.7  0.003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1019  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, type 1  34.18 
 
 		 181 aa  42.7  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.123527  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1866  putative mutator mutT protein  36.05 
 
 		 138 aa  42.7  0.003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.452444  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2201  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, type 1  22.67 
 
 		 179 aa  42.7  0.003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.43573  hitchhiker  0.00000497991 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5570  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  31.94 
 
 		 227 aa  42.4  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0428  NUDIX hydrolase  31.09 
 
 		 138 aa  42.7  0.003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.834318  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2519  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 133 aa  42.7  0.003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4397  mutT/nudix family protein  35.56 
 
 		 316 aa  42.4  0.004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2914  mutator mutT protein  33.33 
 
 		 136 aa  42.4  0.004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.262626  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57190  hypothetical protein  37.23 
 
 		 315 aa  42.4  0.004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5942  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, type 1  25.29 
 
 		 176 aa  42.4  0.004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.934933  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2029  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, type 1  33.71 
 
 		 210 aa  42.4  0.004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0672691  hitchhiker  0.00592267 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>