More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_0830 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_0830  NUDIX hydrolase  100 
 
 
291 aa  574  1.0000000000000001e-163  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2929  NUDIX hydrolase  59.73 
 
 
163 aa  171  1e-41  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.106072  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34510  hypothetical protein  52.05 
 
 
156 aa  145  7.0000000000000006e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.22817  normal  0.594264 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5041  NUDIX hydrolase  48.82 
 
 
148 aa  107  2e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.216707 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4458  NUDIX hydrolase  43.55 
 
 
131 aa  87  3e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3209  NUDIX hydrolase  43.56 
 
 
134 aa  75.9  0.0000000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.663648  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3706  hypothetical protein  41.53 
 
 
314 aa  67.4  0.0000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.461385 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2175  NUDIX hydrolase  38.17 
 
 
133 aa  67  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.523963 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0937  mutator MutT protein  40.19 
 
 
134 aa  65.1  0.000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.655368 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2458  NUDIX hydrolase  35.88 
 
 
138 aa  64.7  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1166  NTP pyrophosphohydrolase  43.33 
 
 
132 aa  61.6  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2758  NUDIX hydrolase  43.33 
 
 
132 aa  61.2  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0356  mutator MutT protein  32.17 
 
 
136 aa  61.2  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2828  mutator MutT protein  43.33 
 
 
132 aa  61.6  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.623153  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2266  mutator MutT protein  42.22 
 
 
138 aa  61.2  0.00000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.97404 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0900  NUDIX hydrolase  38.46 
 
 
145 aa  60.1  0.00000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3564  mutator MutT protein  37.8 
 
 
132 aa  59.7  0.00000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3866  NUDIX hydrolase  35.61 
 
 
167 aa  59.3  0.00000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.190486  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1687  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  37.04 
 
 
140 aa  59.7  0.00000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0504  NUDIX hydrolase  41.18 
 
 
101 aa  59.3  0.00000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.163605  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3659  hypothetical protein  39.64 
 
 
316 aa  59.3  0.00000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.817347  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2230  hypothetical protein  45.98 
 
 
310 aa  58.9  0.00000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.328266  normal  0.270342 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0544  NUDIX hydrolase  36.94 
 
 
166 aa  58.9  0.00000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4091  hypothetical protein  41.18 
 
 
316 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0292  mutator mutT protein  37.8 
 
 
128 aa  58.5  0.0000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.476279 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0403  mutator MutT protein  40.21 
 
 
329 aa  58.2  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0220424 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2586  NUDIX hydrolase  35.88 
 
 
138 aa  58.5  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0575  MutT/nudix family protein  36.96 
 
 
149 aa  58.5  0.0000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0227  mutator mutT protein/thiamine-phosphate pyrophosphorylase family protein  40.21 
 
 
329 aa  58.2  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.199837  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2380  NUDIX hydrolase  37.5 
 
 
169 aa  58.5  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0299  mutator mutT protein  30.94 
 
 
139 aa  57.8  0.0000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0361617  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4425  hypothetical protein  41.11 
 
 
314 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2084  hypothetical protein  34.87 
 
 
319 aa  58.2  0.0000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.498942 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57190  hypothetical protein  38.46 
 
 
315 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0363  mutator MutT protein  28.57 
 
 
131 aa  57.8  0.0000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  unclonable  0.00000739307 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0029  NUDIX hydrolase  38.38 
 
 
137 aa  57  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.999066 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1733  mutator MutT protein  39.62 
 
 
144 aa  57  0.0000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2596  mutator MutT protein  37.8 
 
 
132 aa  57  0.0000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.202287  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4811  NUDIX hydrolase  36.67 
 
 
138 aa  57  0.0000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.304627  decreased coverage  0.0000674364 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1025  mutator MutT protein  41.11 
 
 
138 aa  57  0.0000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4397  mutT/nudix family protein  41.18 
 
 
316 aa  56.6  0.0000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1420  Mutator protein MutT  31.82 
 
 
134 aa  56.6  0.0000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1564  Mutator protein MutT  31.82 
 
 
134 aa  56.6  0.0000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2045  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  41.18 
 
 
138 aa  56.6  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1428  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  41.18 
 
 
138 aa  56.6  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.522134  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3611  mutator MutT protein  29.37 
 
 
132 aa  56.6  0.0000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3976  NTP pyrophosphohydrolase MutT family  42.22 
 
 
135 aa  56.6  0.0000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.495493  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3536  mutator MutT protein  37.12 
 
 
142 aa  56.2  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2116  NUDIX hydrolase  37.78 
 
 
136 aa  56.2  0.0000006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3827  mutator MutT protein  37.12 
 
 
137 aa  56.2  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.9578  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0387  NUDIX hydrolase  35.85 
 
 
129 aa  55.8  0.0000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.724674  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7592  putative mutator protein mutT  38.95 
 
 
136 aa  55.8  0.0000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0886771 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0614  NUDIX hydrolase  36.64 
 
 
135 aa  55.5  0.0000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0852421  normal  0.976562 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0419  mutator MutT protein  35.56 
 
 
129 aa  55.8  0.0000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000293063 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1412  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  41.18 
 
 
138 aa  55.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.559865  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4971  hypothetical protein  36.44 
 
 
315 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0831  NUDIX hydrolase  40.66 
 
 
166 aa  55.1  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.556383  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1395  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  41.18 
 
 
138 aa  55.5  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0511972 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0955  hypothetical protein  26.01 
 
 
314 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00910  hypothetical protein  33 
 
 
132 aa  55.1  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0397  mutator MutT protein  36.64 
 
 
347 aa  55.1  0.000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.527818 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1874  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  41.18 
 
 
138 aa  55.5  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.400032  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0741  NUDIX hydrolase  39.13 
 
 
151 aa  55.5  0.000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0431808 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0380  NUDIX hydrolase  38.46 
 
 
199 aa  55.1  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000301987  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1486  NUDIX hydrolase  30.08 
 
 
131 aa  55.5  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00282357  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2053  MutT/nudix family protein  29.75 
 
 
132 aa  54.7  0.000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.381111  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1939  mutator mutT protein, putative  40 
 
 
138 aa  54.7  0.000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1971  mutator MutT protein  32.97 
 
 
132 aa  54.3  0.000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.027425  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2666  NUDIX hydrolase  37.38 
 
 
182 aa  54.7  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.167572 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2514  NUDIX hydrolase  39.8 
 
 
135 aa  54.3  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.348957 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0523  NUDIX hydrolase  38.89 
 
 
133 aa  54.7  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.23727 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13370  hypothetical protein  40 
 
 
313 aa  54.7  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2914  mutator mutT protein  38.89 
 
 
136 aa  54.7  0.000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.262626  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1792  NUDIX hydrolase  37.4 
 
 
142 aa  54.3  0.000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3010  mutator MutT protein  40 
 
 
137 aa  55.1  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1866  putative mutator mutT protein  40 
 
 
138 aa  54.7  0.000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.452444  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0414  mutator MutT protein  28.57 
 
 
132 aa  54.3  0.000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0934  hypothetical protein  26.02 
 
 
313 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.268176 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2547  NUDIX hydrolase  34.31 
 
 
143 aa  53.9  0.000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0110  NUDIX hydrolase  36.36 
 
 
133 aa  53.9  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1259  hypothetical protein  40 
 
 
153 aa  53.5  0.000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0181  NUDIX hydrolase  39.77 
 
 
138 aa  53.5  0.000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.463444  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0634  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
143 aa  53.5  0.000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0482  NUDIX hydrolase  34.09 
 
 
150 aa  53.5  0.000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3444  mutator MutT protein  27.78 
 
 
129 aa  53.5  0.000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.013842 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4376  hypothetical protein  31.91 
 
 
314 aa  53.5  0.000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0336257 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0413  mutator MutT protein  27.78 
 
 
132 aa  53.5  0.000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00478582 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2189  thiamine monophosphate synthase  35.87 
 
 
315 aa  53.1  0.000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.988337  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1348  hypothetical protein  31.91 
 
 
314 aa  53.1  0.000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000350959 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1757  NUDIX hydrolase  53.12 
 
 
144 aa  53.1  0.000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.207601  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2831  7,8-dihydro-8-oxoguanine-triphosphatase  39.56 
 
 
153 aa  53.1  0.000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0396301  normal  0.239165 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0027  hypothetical protein  39.13 
 
 
312 aa  53.1  0.000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.132128 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2293  mutator MutT protein  33.33 
 
 
129 aa  53.1  0.000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.192428  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2431  NUDIX hydrolase  34.33 
 
 
132 aa  53.1  0.000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00584965  normal  0.262781 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0597  NUDIX hydrolase  37.78 
 
 
133 aa  53.1  0.000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1237  NUDIX hydrolase  36.27 
 
 
137 aa  53.1  0.000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3039  Protein of unknown function DUF2029  34.25 
 
 
570 aa  52.8  0.000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1300  NUDIX family hydrolase  40 
 
 
118 aa  53.1  0.000006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.898276  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2042  NUDIX hydrolase  35.65 
 
 
129 aa  52.8  0.000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000547499 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0325  NUDIX hydrolase  35.59 
 
 
129 aa  52.8  0.000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.849393  normal  0.626146 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>