293 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene STER_1300 on replicon NC_008532
Organism: Streptococcus thermophilus LMD-9



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008532  STER_1300  NUDIX family hydrolase  100 
 
 
118 aa  241  3e-63  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.898276  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0830  NUDIX hydrolase  40 
 
 
291 aa  53.1  0.000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2984  NUDIX hydrolase  34.74 
 
 
136 aa  53.1  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000021571  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5041  NUDIX hydrolase  40.91 
 
 
148 aa  52.4  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.216707 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1536  NUDIX hydrolase  34.75 
 
 
331 aa  52  0.000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.137745  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3209  NUDIX hydrolase  30.77 
 
 
134 aa  52.4  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.663648  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1237  NUDIX hydrolase  31.82 
 
 
137 aa  51.2  0.000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0356  mutator MutT protein  32.95 
 
 
136 aa  51.6  0.000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3053  NUDIX hydrolase  28.45 
 
 
128 aa  51.2  0.000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0321786  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1537  hypothetical protein  31.71 
 
 
162 aa  50.4  0.000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.156028  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3443  NUDIX hydrolase  51.22 
 
 
525 aa  50.8  0.000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00000281945  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0742  NUDIX hydrolase  27.68 
 
 
169 aa  49.7  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.478674 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2649  NUDIX hydrolase  45.83 
 
 
209 aa  49.7  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0213367  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2415  NUDIX hydrolase  29.35 
 
 
169 aa  49.3  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000842745  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1398  NUDIX hydrolase  43.55 
 
 
153 aa  49.7  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02177  predicted NUDIX hydrolase  29.27 
 
 
141 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.256653  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1407  NUDIX hydrolase  29.27 
 
 
141 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1398  NUDIX hydrolase  29.27 
 
 
141 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.708086  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02136  hypothetical protein  29.27 
 
 
141 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.284783  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3706  hypothetical protein  50 
 
 
314 aa  48.5  0.00003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.461385 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1775  NUDIX hydrolase  55.88 
 
 
166 aa  48.5  0.00003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.108748  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3838  NUDIX hydrolase  23.89 
 
 
144 aa  48.5  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0218718  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8547  NUDIX hydrolase  35.63 
 
 
156 aa  48.1  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00677981  hitchhiker  0.000239658 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1131  NUDIX hydrolase  28.26 
 
 
132 aa  48.1  0.00004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0202346 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1059  NUDIX hydrolase  37.65 
 
 
156 aa  48.1  0.00004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.891979  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1154  NUDIX hydrolase  31.46 
 
 
124 aa  48.1  0.00004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.271981  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2546  NUDIX family hydrolase  28.46 
 
 
141 aa  47.8  0.00005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2396  NUDIX family hydrolase  28.46 
 
 
141 aa  47.4  0.00006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.64074  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0771  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  26.37 
 
 
134 aa  47.4  0.00006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.012976  normal  0.720455 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0058  NUDIX hydrolase  35.38 
 
 
183 aa  47.8  0.00006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.993982  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0620  NUDIX hydrolase  28.81 
 
 
282 aa  47.4  0.00007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.253457 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0533  NUDIX hydrolase  28.3 
 
 
140 aa  47  0.00009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0228598  normal  0.521082 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3231  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
140 aa  47  0.00009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000311334 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3377  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  26.25 
 
 
128 aa  46.6  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0382964  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5226  NUDIX hydrolase  28.57 
 
 
150 aa  46.2  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0916804  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2908  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  26.25 
 
 
128 aa  46.6  0.0001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0055236  normal  0.908985 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0193  NUDIX hydrolase  38.18 
 
 
136 aa  47  0.0001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0578  mutT/nudix family protein  30.7 
 
 
153 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000245736  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0237  NUDIX hydrolase  32.95 
 
 
146 aa  46.2  0.0001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.135862 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8468  NUDIX hydrolase  22.81 
 
 
130 aa  46.6  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.410235  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3508  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  26.25 
 
 
128 aa  46.6  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.116101  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0503  putative mutator mutt protein (7,8-dihydro-8-oxoguanine-triphosphatase)  40.74 
 
 
137 aa  46.6  0.0001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.213775 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0513  NUDIX hydrolase  30.91 
 
 
138 aa  46.6  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.117627  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0403  mutator MutT protein  39.58 
 
 
329 aa  45.4  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0220424 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1689  NUDIX hydrolase  26.09 
 
 
140 aa  45.4  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3337  mutT/nudix family protein  39.06 
 
 
131 aa  45.8  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000000625808  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1183  NUDIX hydrolase  43.18 
 
 
130 aa  45.4  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3252  MutT/Nudix family protein  39.06 
 
 
129 aa  45.4  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000005811  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0877  MutT-like protein  33.77 
 
 
144 aa  46.2  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2635  hypothetical protein  35.29 
 
 
313 aa  45.8  0.0002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1340  NUDIX hydrolase  34.44 
 
 
171 aa  45.8  0.0002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.902443 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0613  NUDIX hydrolase  35.56 
 
 
171 aa  46.2  0.0002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3598  mutT/nudix family protein  39.06 
 
 
131 aa  45.8  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000783119  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1123  NUDIX hydrolase  35.94 
 
 
140 aa  45.8  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.824308  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0227  mutator mutT protein/thiamine-phosphate pyrophosphorylase family protein  39.58 
 
 
329 aa  45.4  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.199837  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6646  NUDIX hydrolase  50 
 
 
155 aa  45.4  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6519  NUDIX hydrolase  34.92 
 
 
159 aa  45.8  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.170326  normal  0.052102 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1097  NUDIX hydrolase  27.27 
 
 
305 aa  45.8  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.183195  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1163  NUDIX hydrolase  35.48 
 
 
140 aa  45.4  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0715  NUDIX hydrolase  23.77 
 
 
299 aa  45.4  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0096  NUDIX hydrolase  38.36 
 
 
141 aa  45.4  0.0003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0757202  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0465  NUDIX hydrolase  24.55 
 
 
137 aa  45.1  0.0003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2643  NUDIX hydrolase  40.98 
 
 
149 aa  45.1  0.0003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2360  putative mutator MutT protein  23.93 
 
 
150 aa  45.4  0.0003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0088  NUDIX hydrolase  28.41 
 
 
140 aa  45.4  0.0003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.856049  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1251  NUDIX hydrolase  34.38 
 
 
140 aa  45.1  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00542238  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3582  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  24.79 
 
 
131 aa  44.7  0.0004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000334964  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0997  NUDIX hydrolase  31.94 
 
 
153 aa  44.7  0.0004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.665088  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1666  mutT/nudix family protein  50 
 
 
132 aa  45.1  0.0004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000030835  hitchhiker  1.00436e-21 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4321  NUDIX hydrolase  24.35 
 
 
291 aa  45.1  0.0004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1487  NUDIX hydrolase  30.11 
 
 
147 aa  45.1  0.0004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000137627 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2017  dinucleoside polyphosphate hydrolase  28.1 
 
 
154 aa  45.1  0.0004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00712308  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0467  NUDIX hydrolase  45 
 
 
135 aa  44.7  0.0004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3562  NUDIX hydrolase  45 
 
 
135 aa  44.7  0.0004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5733  NUDIX hydrolase  35 
 
 
218 aa  44.7  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2414  NUDIX hydrolase  28.72 
 
 
126 aa  45.1  0.0004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.143725  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2147  dATP pyrophosphohydrolase  33.7 
 
 
147 aa  44.7  0.0005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0755  NUDIX hydrolase  26.42 
 
 
267 aa  44.7  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0414471  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1573  hypothetical protein  44.19 
 
 
160 aa  44.3  0.0005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1931  NUDIX hydrolase  27.66 
 
 
133 aa  44.7  0.0005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000285208  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0697  MutT related protein  30 
 
 
145 aa  44.7  0.0005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.382229  normal  0.361701 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4880  NUDIX hydrolase  39.29 
 
 
117 aa  44.7  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1020  NUDIX hydrolase  31.82 
 
 
139 aa  44.7  0.0005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.720434  hitchhiker  0.00107083 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2425  dATP pyrophosphohydrolase  33.7 
 
 
147 aa  44.7  0.0005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.135739  normal  0.252272 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1911  NUDIX hydrolase  50 
 
 
167 aa  44.7  0.0005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.276369  normal  0.389177 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2406  NUDIX hydrolase  30.63 
 
 
148 aa  44.3  0.0005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0882  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  46.34 
 
 
216 aa  44.7  0.0005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0864  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  46.34 
 
 
216 aa  44.3  0.0005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000108978  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3552  mutT/nudix family protein  36.36 
 
 
131 aa  44.7  0.0005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.6173699999999999e-43 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2034  dATP pyrophosphohydrolase  33.7 
 
 
147 aa  44.7  0.0005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0350059  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0565  NUDIX hydrolase  36.36 
 
 
177 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0596  mutT/nudix family protein  26.72 
 
 
153 aa  44.3  0.0006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000504952  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17300  ADP-ribose pyrophosphatase  32.88 
 
 
172 aa  44.3  0.0006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.197919  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0741  NUDIX hydrolase  39.66 
 
 
151 aa  44.3  0.0006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0431808 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0504  NUDIX hydrolase  33.73 
 
 
101 aa  44.3  0.0006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.163605  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0131  NUDIX hydrolase  37.5 
 
 
156 aa  44.3  0.0006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0292  mutator mutT protein  51.28 
 
 
128 aa  44.3  0.0006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.476279 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2448  NUDIX hydrolase  64.52 
 
 
137 aa  44.3  0.0006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0479485  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0604  NUDIX hydrolase  36.36 
 
 
177 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1486  NUDIX hydrolase  25.22 
 
 
131 aa  44.3  0.0006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00282357  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>