More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_0193 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007484  Noc_0193  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 136 aa  277  3e-74  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0937  mutator MutT protein  38.14 
 
 		 134 aa  63.2  0.000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.655368 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0533  NUDIX hydrolase  35.9 
 
 		 140 aa  62.4  0.000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0228598  normal  0.521082 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0697  MutT related protein  31.67 
 
 		 145 aa  60.1  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.382229  normal  0.361701 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1821  lipoate-protein ligase B  35.11 
 
 		 365 aa  59.3  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1689  NUDIX hydrolase  29.75 
 
 		 140 aa  57.8  0.00000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2940  mutT-like protein  37.29 
 
 		 155 aa  57.8  0.00000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.703961  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2109  lipoate-protein ligase B  33.33 
 
 		 365 aa  57.4  0.00000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0939106  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2039  lipoate-protein ligase B  33.33 
 
 		 365 aa  57.4  0.00000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.237895  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0356  mutator MutT protein  31.62 
 
 		 136 aa  56.6  0.0000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3010  mutator MutT protein  36.04 
 
 		 137 aa  56.6  0.0000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0428  NUDIX hydrolase  37.5 
 
 		 138 aa  55.8  0.0000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.834318  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0513  NUDIX hydrolase  34.58 
 
 		 138 aa  55.8  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.117627  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3838  NUDIX hydrolase  32.48 
 
 		 144 aa  54.3  0.0000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0218718  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00520  ADP-ribose pyrophosphatase  32.23 
 
 		 145 aa  53.9  0.0000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.129301 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0397  mutator MutT protein  34.51 
 
 		 347 aa  53.1  0.000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.527818 
 
 
-
 
NC_004310  BR1939  mutator mutT protein, putative  33.93 
 
 		 138 aa  52.8  0.000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1866  putative mutator mutT protein  33.93 
 
 		 138 aa  52.8  0.000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.452444  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2053  MutT/nudix family protein  28.32 
 
 		 132 aa  52.8  0.000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.381111  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1678  hypothetical protein  33.59 
 
 		 306 aa  52.8  0.000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.552334  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3039  Protein of unknown function DUF2029  32.08 
 
 		 570 aa  52.8  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8672  ADP-ribose pyrophosphatase-like protein  30.71 
 
 		 158 aa  52.4  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8698  ADP-ribose pyrophosphatase-like protein  30.71 
 
 		 159 aa  52.4  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3976  NTP pyrophosphohydrolase MutT family  34.58 
 
 		 135 aa  52.4  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.495493  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1128  NUDIX hydrolase  33.64 
 
 		 141 aa  52.4  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0349929  normal  0.45534 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1733  mutator MutT protein  36.45 
 
 		 144 aa  52.4  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1025  mutator MutT protein  36.45 
 
 		 138 aa  52.8  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17300  ADP-ribose pyrophosphatase  35.9 
 
 		 172 aa  52  0.000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.197919  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0325  NUDIX hydrolase  37.17 
 
 		 129 aa  52  0.000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.849393  normal  0.626146 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0364  mutator mutT protein  32.08 
 
 		 137 aa  51.6  0.000004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3827  mutator MutT protein  33.64 
 
 		 137 aa  51.2  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.9578  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3536  mutator MutT protein  33.64 
 
 		 142 aa  51.2  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0614  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 135 aa  51.2  0.000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0852421  normal  0.976562 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2514  NUDIX hydrolase  34.82 
 
 		 135 aa  50.8  0.000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.348957 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0523  NUDIX hydrolase  34.82 
 
 		 133 aa  50.4  0.000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.23727 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1097  NUDIX hydrolase  39.47 
 
 		 305 aa  50.4  0.000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.183195  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1417  NUDIX hydrolase  33.73 
 
 		 139 aa  50.4  0.000009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0990  NUDIX hydrolase  30.58 
 
 		 173 aa  50.1  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000363849  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0742  NUDIX hydrolase  33.04 
 
 		 169 aa  49.7  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.478674 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4152  NUDIX hydrolase  32.08 
 
 		 128 aa  49.7  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0641206  decreased coverage  0.0000968848 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0029  NUDIX hydrolase  33.05 
 
 		 137 aa  50.1  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.999066 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3770  NUDIX hydrolase  31.48 
 
 		 200 aa  49.7  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.288059 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2787  NUDIX hydrolase  32.14 
 
 		 293 aa  49.7  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.306567  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1154  NUDIX hydrolase  33.96 
 
 		 124 aa  48.9  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.271981  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7592  putative mutator protein mutT  34.82 
 
 		 136 aa  49.3  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0886771 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1427  NUDIX hydrolase  39.62 
 
 		 151 aa  49.3  0.00002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0388  mutator MutT protein  40 
 
 		 138 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.616604 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1486  NUDIX hydrolase  29.27 
 
 		 131 aa  48.9  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00282357  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2516  NUDIX hydrolase  27.97 
 
 		 130 aa  49.3  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2568  NUDIX hydrolase  27.97 
 
 		 130 aa  49.3  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57190  hypothetical protein  35.2 
 
 		 315 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1033  mutT/nudix family protein  33.64 
 
 		 179 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.851694  normal  0.721154 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4163  mutT/nudix family protein  33.64 
 
 		 179 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0412  NUDIX hydrolase  35.29 
 
 		 174 aa  48.5  0.00003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0161756  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4118  mutT/nudix family protein  33.64 
 
 		 179 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000177311 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4004  mutT/nudix family protein  33.64 
 
 		 179 aa  48.5  0.00003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.731081  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3837  ADP-ribose diphosphatase  33.64 
 
 		 179 aa  48.5  0.00003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3851  ADP-ribose diphosphatase  33.64 
 
 		 179 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2586  NUDIX hydrolase  34.51 
 
 		 138 aa  48.5  0.00003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1856  NUDIX hydrolase  43.4 
 
 		 166 aa  48.1  0.00003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.015208  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4316  mutT/nudix family protein  33.64 
 
 		 179 aa  48.5  0.00003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.875524  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4227  mutT/nudix family protein  33.64 
 
 		 179 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.057791  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0482  NUDIX hydrolase  34.23 
 
 		 150 aa  48.5  0.00003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0830  NUDIX hydrolase  37.72 
 
 		 291 aa  48.9  0.00003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1099  7,8-dihydro-8-oxoguanine-triphosphatase  27.82 
 
 		 160 aa  48.1  0.00003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00000230167  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1131  NUDIX hydrolase  32.74 
 
 		 132 aa  48.9  0.00003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0202346 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3925  NUDIX hydrolase  33.64 
 
 		 179 aa  48.1  0.00004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.161416  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3582  NUDIX hydrolase  26.56 
 
 		 154 aa  48.1  0.00004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1890  Mutator MutT  28.81 
 
 		 142 aa  48.1  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.620209 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4529  A/G-specific adenine glycosylase  30.63 
 
 		 363 aa  48.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.593144 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2984  NUDIX hydrolase  33.04 
 
 		 136 aa  48.1  0.00004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000021571  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0787  NUDIX hydrolase  35.71 
 
 		 128 aa  47.8  0.00005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.585292  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0292  hypothetical protein  24.81 
 
 		 147 aa  47.8  0.00005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0394428 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2650  hypothetical protein  35.34 
 
 		 315 aa  47.8  0.00005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13370  hypothetical protein  36.11 
 
 		 313 aa  47.8  0.00005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4321  NUDIX hydrolase  34.55 
 
 		 291 aa  47.8  0.00005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4204  mutT/nudix family protein  33.64 
 
 		 179 aa  47.8  0.00005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.365752  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4056  mutator MutT protein  31.25 
 
 		 131 aa  47.8  0.00006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.640988  normal  0.0322443 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1300  NUDIX family hydrolase  35 
 
 		 118 aa  47.4  0.00006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.898276  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3053  NUDIX hydrolase  32.41 
 
 		 128 aa  47.4  0.00007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0321786  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2639  NUDIX family hydrolase  26.5 
 
 		 141 aa  47.4  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0356  mutator MutT protein  39.36 
 
 		 138 aa  47  0.00008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0223709  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1790  NUDIX hydrolase  33.98 
 
 		 154 aa  47  0.00008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2523  hydrolase, nudix family  26.5 
 
 		 141 aa  47  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.464819  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1907  NUDIX hydrolase  34.74 
 
 		 149 aa  47  0.00008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.397506  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0312  mutator MutT protein  39.36 
 
 		 138 aa  47  0.00008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.672809  normal  0.370797 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0969  NUDIX hydrolase  39.25 
 
 		 158 aa  47  0.00008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.767014  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0934  hypothetical protein  34.26 
 
 		 313 aa  47  0.00008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.268176 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2431  hydrolase, nudix family  26.5 
 
 		 141 aa  47  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1999  lipoate-protein ligase B  31.78 
 
 		 383 aa  47.4  0.00008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0544  NUDIX hydrolase  35.78 
 
 		 166 aa  47  0.00009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2480  NUDIX family hydrolase  26.5 
 
 		 141 aa  47  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0387  NUDIX hydrolase  35.14 
 
 		 129 aa  47  0.00009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.724674  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0741  NUDIX hydrolase  45.76 
 
 		 151 aa  47  0.00009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0431808 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0096  NUDIX hydrolase  28.45 
 
 		 141 aa  46.2  0.0001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0757202  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1261  NUDIX hydrolase  27.41 
 
 		 147 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.394929  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0597  NUDIX hydrolase  33.93 
 
 		 133 aa  46.2  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0955  hypothetical protein  34.55 
 
 		 314 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1106  NUDIX hydrolase  30.39 
 
 		 139 aa  46.2  0.0001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000361121  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0181  NUDIX hydrolase  40 
 
 		 138 aa  46.6  0.0001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.463444  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>