184 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_1059 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008789  Hhal_1059  NUDIX hydrolase  100 
 
 
156 aa  310  3.9999999999999997e-84  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.891979  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2766  NUDIX hydrolase  61.31 
 
 
144 aa  160  5.0000000000000005e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1415  NUDIX hydrolase  57.48 
 
 
151 aa  146  1.0000000000000001e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2635  hypothetical protein  53.68 
 
 
313 aa  142  2e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1417  NUDIX hydrolase  32.62 
 
 
139 aa  68.2  0.00000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0905  NUDIX hydrolase  39.02 
 
 
139 aa  58.2  0.00000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.729176  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2202  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  34.11 
 
 
583 aa  53.9  0.0000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0878  NUDIX hydrolase  36.94 
 
 
140 aa  52.8  0.000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1911  NUDIX hydrolase  34.06 
 
 
167 aa  51.2  0.000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.276369  normal  0.389177 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2787  NUDIX hydrolase  35.9 
 
 
293 aa  49.7  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.306567  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1020  NUDIX hydrolase  36.28 
 
 
139 aa  48.9  0.00002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.720434  hitchhiker  0.00107083 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1300  NUDIX family hydrolase  37.65 
 
 
118 aa  48.9  0.00002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.898276  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2202  NUDIX hydrolase  35.38 
 
 
143 aa  49.3  0.00002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3865  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
156 aa  49.7  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.63405  normal  0.664134 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0037  NUDIX hydrolase  37.08 
 
 
229 aa  48.5  0.00003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2233  NUDIX hydrolase  29.87 
 
 
199 aa  48.5  0.00003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3070  NUDIX hydrolase  33.83 
 
 
141 aa  48.5  0.00003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.973852  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1382  NUDIX hydrolase  33.83 
 
 
144 aa  48.5  0.00003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2758  NUDIX hydrolase  35.14 
 
 
142 aa  48.1  0.00004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0433  NUDIX hydrolase  47.27 
 
 
140 aa  48.5  0.00004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.942987  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1315  NUDIX hydrolase  31.85 
 
 
156 aa  47.8  0.00005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.511776  normal  0.0806389 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0237  NUDIX hydrolase  38.93 
 
 
146 aa  48.1  0.00005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.135862 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5641  NUDIX hydrolase  34.06 
 
 
146 aa  47.8  0.00005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1281  NUDIX hydrolase  31.85 
 
 
156 aa  47.8  0.00006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0891  NUDIX domain-containing protein  32.33 
 
 
157 aa  47.4  0.00007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1402  NUDIX hydrolase  40.7 
 
 
148 aa  47.4  0.00008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1418  NUDIX domain-containing protein  32.33 
 
 
160 aa  47.4  0.00008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0460  NUDIX domain-containing protein  32.33 
 
 
160 aa  47.4  0.00008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.080692  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0700  NUDIX domain-containing protein  32.33 
 
 
160 aa  47.4  0.00008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0069  NUDIX hydrolase  30.53 
 
 
147 aa  47  0.00009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.806669  hitchhiker  0.0000000185063 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1821  lipoate-protein ligase B  38.52 
 
 
365 aa  46.6  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4185  NUDIX hydrolase  24.63 
 
 
154 aa  46.6  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3106  NUDIX hydrolase  38.71 
 
 
153 aa  46.6  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0830625 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2189  NUDIX hydrolase  45 
 
 
201 aa  46.6  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2017  dinucleoside polyphosphate hydrolase  28.72 
 
 
154 aa  46.6  0.0001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00712308  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0152  mutT/Nudix family protein  27.7 
 
 
150 aa  46.2  0.0002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8547  NUDIX hydrolase  45.07 
 
 
156 aa  45.8  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00677981  hitchhiker  0.000239658 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1810  NUDIX family hydrolase  33.83 
 
 
160 aa  46.2  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.610714  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4548  NUDIX hydrolase  32.33 
 
 
156 aa  45.8  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0927  NUDIX hydrolase  48.33 
 
 
129 aa  46.2  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.227585 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4436  NUDIX hydrolase  35.79 
 
 
180 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3407  NUDIX hydrolase  39.13 
 
 
140 aa  46.2  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.107532 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0791  NUDIX family hydrolase  29.08 
 
 
142 aa  45.8  0.0002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000502884  hitchhiker  6.80479e-24 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3914  NUDIX hydrolase  39.13 
 
 
140 aa  46.2  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.434564 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2109  lipoate-protein ligase B  37.7 
 
 
365 aa  45.8  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0939106  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2039  lipoate-protein ligase B  37.7 
 
 
365 aa  45.8  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.237895  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0922  NUDIX hydrolase  46.43 
 
 
156 aa  45.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1155  hypothetical protein  33.87 
 
 
231 aa  45.1  0.0003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1404  NUDIX hydrolase  46.43 
 
 
157 aa  45.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.567181  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17440  ADP-ribose pyrophosphatase  33.81 
 
 
336 aa  45.4  0.0003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.303863  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0017  MutT/nudix family protein  30.09 
 
 
133 aa  45.4  0.0003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0025421 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1382  NUDIX hydrolase  46.43 
 
 
156 aa  45.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.162154 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2333  NUDIX hydrolase  31.03 
 
 
143 aa  45.4  0.0003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2125  NUDIX hydrolase  35.29 
 
 
143 aa  45.4  0.0003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00520  ADP-ribose pyrophosphatase  39.77 
 
 
145 aa  45.4  0.0003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.129301 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1651  dinucleoside polyphosphate hydrolase  28.44 
 
 
156 aa  45.1  0.0004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.057152  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4727  dinucleoside polyphosphate hydrolase  40.85 
 
 
170 aa  45.1  0.0004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.78787  normal  0.0128864 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0268  NUDIX hydrolase  44.83 
 
 
165 aa  45.1  0.0004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.880251  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1428  NUDIX hydrolase  39.76 
 
 
170 aa  44.7  0.0005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.516023  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1632  NUDIX family hydrolase  32.58 
 
 
160 aa  44.7  0.0005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.081171  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1653  NUDIX family hydrolase  32.58 
 
 
160 aa  44.7  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.186511  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1993  NUDIX hydrolase  35.54 
 
 
142 aa  44.3  0.0006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2415  NUDIX hydrolase  31.3 
 
 
169 aa  44.3  0.0006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000842745  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0507  dATP pyrophosphohydrolase  22.67 
 
 
150 aa  44.3  0.0006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3773  NUDIX hydrolase  29.1 
 
 
161 aa  44.3  0.0006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  unclonable  0.00000523575 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2239  dATP pyrophosphohydrolase  30.5 
 
 
148 aa  43.9  0.0007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2175  NUDIX hydrolase  33.98 
 
 
133 aa  43.9  0.0008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.523963 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3404  NUDIX hydrolase  42.86 
 
 
174 aa  43.9  0.0008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.321528  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4365  NUDIX hydrolase  36.76 
 
 
141 aa  43.9  0.0008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4001  NUDIX hydrolase  36.76 
 
 
141 aa  43.9  0.0008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.543097  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1132  dinucleoside polyphosphate hydrolase  27.84 
 
 
172 aa  43.9  0.0008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000912913  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1465  NUDIX hydrolase  51.16 
 
 
207 aa  43.9  0.0008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.650531 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8400  ADP-ribose pyrophosphatase-like protein  33.06 
 
 
139 aa  43.9  0.0008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.24066 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0325  NUDIX hydrolase  28.36 
 
 
138 aa  43.5  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.414078  normal  0.0748688 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2371  mutT/nudix family protein  49.02 
 
 
149 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0511564  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2666  NUDIX domain-containing protein  33.08 
 
 
158 aa  43.9  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.661502  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3866  NUDIX hydrolase  36.78 
 
 
167 aa  43.1  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.190486  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1651  NUDIX hydrolase  33.68 
 
 
194 aa  43.5  0.001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3522  NUDIX hydrolase  40 
 
 
141 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.478841 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26900  ADP-ribose pyrophosphatase  30 
 
 
160 aa  43.5  0.001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2380  NUDIX hydrolase  29.67 
 
 
169 aa  43.1  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2263  NUDIX hydrolase  32.97 
 
 
186 aa  43.5  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0088  NUDIX hydrolase  43.4 
 
 
140 aa  43.5  0.001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.856049  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0673  NUDIX hydrolase  36.36 
 
 
141 aa  43.1  0.001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.51908 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1608  NUDIX hydrolase  42.86 
 
 
137 aa  43.1  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.996665 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1261  NUDIX hydrolase  35.05 
 
 
289 aa  43.1  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0352792  normal  0.942746 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3049  NUDIX hydrolase  35.62 
 
 
182 aa  43.5  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02246  hypothetical protein  34.44 
 
 
136 aa  43.9  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7955  hypothetical protein  36.47 
 
 
172 aa  43.1  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0011  NUDIX hydrolase  32.56 
 
 
144 aa  42.4  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.695589  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2021  NUDIX hydrolase  30.51 
 
 
158 aa  42.4  0.002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00226256 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7346  hypothetical protein  32.21 
 
 
173 aa  42.4  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3170  NUDIX hydrolase  29.2 
 
 
179 aa  42.7  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0325  dinucleoside polyphosphate hydrolase  51.52 
 
 
170 aa  42.7  0.002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2482  NUDIX hydrolase  29.91 
 
 
138 aa  42.7  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1237  NUDIX hydrolase  33.08 
 
 
137 aa  42.7  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1227  dinucleoside polyphosphate hydrolase  26.8 
 
 
173 aa  43.1  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000249848  hitchhiker  0.00278569 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1350  NUDIX hydrolase  42.37 
 
 
143 aa  42.7  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.246365  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1639  NUDIX hydrolase  29.55 
 
 
136 aa  42.7  0.002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000053664  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1064  dinucleoside polyphosphate hydrolase  51.35 
 
 
174 aa  42.7  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.772748  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>