205 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_2239 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_2239  dATP pyrophosphohydrolase  100 
 
 		 148 aa  301  1.0000000000000001e-81  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2425  dATP pyrophosphohydrolase  51.37 
 
 		 147 aa  128  2.0000000000000002e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.135739  normal  0.252272 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2147  dATP pyrophosphohydrolase  51.37 
 
 		 147 aa  128  2.0000000000000002e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0444  dATP pyrophosphohydrolase  54.41 
 
 		 146 aa  129  2.0000000000000002e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.847222 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2034  dATP pyrophosphohydrolase  51.37 
 
 		 147 aa  128  2.0000000000000002e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0350059  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0631  dATP pyrophosphohydrolase  47.41 
 
 		 150 aa  128  3e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.12041  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1891  NUDIX hydrolase  44.68 
 
 		 152 aa  122  2e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000678046  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0194  dATP pyrophosphohydrolase  47.18 
 
 		 158 aa  121  3e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0441  dATP pyrophosphohydrolase  47.97 
 
 		 163 aa  121  3e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0853  dATP pyrophosphohydrolase  47.18 
 
 		 158 aa  121  3e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2751  dATP pyrophosphohydrolase  47.18 
 
 		 158 aa  121  3e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2327  dATP pyrophosphohydrolase  47.18 
 
 		 158 aa  121  3e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0677  dATP pyrophosphohydrolase  47.18 
 
 		 158 aa  121  3e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.22126  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0692  dATP pyrophosphohydrolase  47.18 
 
 		 158 aa  121  3e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2407  dATP pyrophosphohydrolase  47.18 
 
 		 158 aa  121  3e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4015  NUDIX hydrolase  47.89 
 
 		 163 aa  120  4e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000561567 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1298  dATP pyrophosphohydrolase  49.28 
 
 		 170 aa  120  5e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0561  dATP pyrophosphohydrolase  47.89 
 
 		 158 aa  120  7e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2751  dATP pyrophosphohydrolase  47.18 
 
 		 164 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2112  dATP pyrophosphohydrolase  47.18 
 
 		 164 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2775  dATP pyrophosphohydrolase  47.18 
 
 		 170 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2724  dATP pyrophosphohydrolase  47.18 
 
 		 164 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0331777  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2642  dATP pyrophosphohydrolase  47.18 
 
 		 164 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.187691 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0867  dATP pyrophosphohydrolase  50.74 
 
 		 148 aa  119  1.9999999999999998e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.198511 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0604  dATP pyrophosphohydrolase  47.79 
 
 		 157 aa  118  3e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2382  dATP pyrophosphohydrolase  46.94 
 
 		 159 aa  118  3e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.830787  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2780  NUDIX hydrolase  46.26 
 
 		 148 aa  116  9.999999999999999e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0389222  normal  0.0318131 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0380  dATP pyrophosphohydrolase  47.83 
 
 		 173 aa  116  9.999999999999999e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.1829 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2261  dATP pyrophosphohydrolase  47.95 
 
 		 149 aa  115  1.9999999999999998e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.995735  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0382  NUDIX hydrolase  48.59 
 
 		 158 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.120045  normal  0.571576 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6051  dATP pyrophosphohydrolase  46.48 
 
 		 164 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0575  dATP pyrophosphohydrolase  47.18 
 
 		 164 aa  115  3e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.725095  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0910  dATP pyrophosphohydrolase  50 
 
 		 154 aa  114  6.9999999999999995e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.429333  normal  0.400014 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4121  NUDIX hydrolase  46.81 
 
 		 157 aa  113  7.999999999999999e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1071  putative dATP pyrophosphohydrolase  45.39 
 
 		 160 aa  113  7.999999999999999e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.284114  normal  0.221269 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0358  dATP pyrophosphohydrolase  47.79 
 
 		 161 aa  112  1.0000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1223  dATP pyrophosphohydrolase  45.83 
 
 		 150 aa  112  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.315157  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2054  dATP pyrophosphohydrolase  45.83 
 
 		 150 aa  112  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.830611 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2114  dATP pyrophosphohydrolase  45.83 
 
 		 150 aa  112  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00720061 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1596  NUDIX hydrolase  46.04 
 
 		 147 aa  112  2.0000000000000002e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.159893  normal  0.642184 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1347  dATP pyrophosphohydrolase  45.83 
 
 		 150 aa  112  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00224987 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2059  dATP pyrophosphohydrolase  45.83 
 
 		 146 aa  112  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0369752 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2159  dATP pyrophosphohydrolase  46.58 
 
 		 154 aa  111  3e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0805  NUDIX hydrolase  48.92 
 
 		 156 aa  111  4.0000000000000004e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.826654  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0343  dATP pyrophosphohydrolase  46.32 
 
 		 161 aa  109  1.0000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1321  dATP pyrophosphohydrolase  43.62 
 
 		 147 aa  109  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.832088  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2433  dATP pyrophosphohydrolase  45.58 
 
 		 147 aa  109  1.0000000000000001e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0218705  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01836  dATP pyrophosphohydrolase  43.84 
 
 		 150 aa  108  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.618356  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1775  NUDIX hydrolase  44.44 
 
 		 169 aa  108  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00597986  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01824  hypothetical protein  43.84 
 
 		 150 aa  108  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.452157  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2095  dATP pyrophosphohydrolase  43.84 
 
 		 150 aa  108  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0764827  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1958  dATP pyrophosphohydrolase  43.84 
 
 		 150 aa  108  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.683601  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2601  dATP pyrophosphohydrolase  44.44 
 
 		 169 aa  108  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.110942  normal  0.760647 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1107  dATP pyrophosphohydrolase  43.84 
 
 		 150 aa  108  2.0000000000000002e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1767  dATP pyrophosphohydrolase  44.44 
 
 		 169 aa  108  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.502024  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4042  dATP pyrophosphohydrolase  43.66 
 
 		 192 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.258324  normal  0.25029 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0657  dATP pyrophosphohydrolase  44.37 
 
 		 171 aa  107  5e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3635  NUDIX hydrolase  47.79 
 
 		 174 aa  106  1e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1816  dATP pyrophosphohydrolase  43.84 
 
 		 147 aa  105  2e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.825247  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2100  dATP pyrophosphohydrolase  43.15 
 
 		 147 aa  105  3e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0876  NUDIX hydrolase  47.48 
 
 		 156 aa  104  4e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0246946  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0468  dATP pyrophosphohydrolase  44.85 
 
 		 162 aa  103  7e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.379603  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5451  NUDIX hydrolase  46.48 
 
 		 161 aa  103  8e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0507  dATP pyrophosphohydrolase  39.16 
 
 		 150 aa  102  1e-21  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01728  dATP pyrophosphohydrolase  40.71 
 
 		 146 aa  101  3e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00223975  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2947  dATP pyrophosphohydrolase  36.89 
 
 		 127 aa  79.3  0.00000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.214504  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2065  nucleotide phosphate derivative pyrophosphohydrolases, MutT/nudix family protein  39.06 
 
 		 156 aa  79  0.00000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2109  lipoate-protein ligase B  41.73 
 
 		 365 aa  59.7  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0939106  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1821  lipoate-protein ligase B  40.62 
 
 		 365 aa  60.1  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2039  lipoate-protein ligase B  41.73 
 
 		 365 aa  59.7  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.237895  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4065  NUDIX hydrolase  36.07 
 
 		 143 aa  58.9  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4857  NUDIX hydrolase  32.79 
 
 		 158 aa  54.7  0.0000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1999  lipoate-protein ligase B  41.74 
 
 		 383 aa  53.9  0.0000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1523  NUDIX hydrolase  35.29 
 
 		 158 aa  51.6  0.000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2017  dinucleoside polyphosphate hydrolase  29.51 
 
 		 154 aa  50.4  0.000009  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00712308  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1506  NUDIX hydrolase  47.06 
 
 		 390 aa  49.7  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1656  NUDIX hydrolase  39.06 
 
 		 152 aa  47.8  0.00005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.632067  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8698  ADP-ribose pyrophosphatase-like protein  29.08 
 
 		 159 aa  47.4  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0105  NUDIX hydrolase  46.15 
 
 		 154 aa  47  0.00008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0885  NUDIX hydrolase  26.83 
 
 		 145 aa  47  0.00008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2528  mutT/nudix family protein  25 
 
 		 145 aa  46.6  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0638585  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2713  mutT/nudix family protein  25 
 
 		 145 aa  46.6  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2616  NUDIX hydrolase  45.9 
 
 		 146 aa  46.2  0.0001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2202  NUDIX hydrolase  30.95 
 
 		 143 aa  46.6  0.0001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3131  NUDIX hydrolase  26.83 
 
 		 145 aa  46.2  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.278733  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1428  NUDIX hydrolase  44.83 
 
 		 170 aa  45.8  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.516023  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1757  NUDIX hydrolase  45.45 
 
 		 144 aa  45.4  0.0002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.207601  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2741  mutT/nudix family protein  25 
 
 		 146 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0191847  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2453  dATP pyrophosphohydrolase  25 
 
 		 145 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.401359  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5518  NUDIX hydrolase  33.86 
 
 		 183 aa  45.4  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.434768 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1466  ADP-Ribose Pyrophosphatase  36.36 
 
 		 146 aa  45.1  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0519  NUDIX family hydrolase  29.55 
 
 		 168 aa  45.4  0.0003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.259714  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1099  7,8-dihydro-8-oxoguanine-triphosphatase  32.2 
 
 		 160 aa  45.1  0.0003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00000230167  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2852  NUDIX hydrolase  38.33 
 
 		 157 aa  45.4  0.0003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000177474  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2834  NUDIX hydrolase  32.05 
 
 		 169 aa  45.1  0.0004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0461367 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2534  NUDIX hydrolase  40.68 
 
 		 153 aa  44.7  0.0004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1935  NUDIX hydrolase  38.6 
 
 		 142 aa  44.3  0.0005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2509  dinucleoside polyphosphate hydrolase  32.33 
 
 		 163 aa  44.3  0.0005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.815631  normal  0.83484 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2607  NUDIX hydrolase  34.44 
 
 		 157 aa  44.7  0.0005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0976086 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1059  NUDIX hydrolase  30.28 
 
 		 156 aa  44.7  0.0005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.891979  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>