213 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SbBS512_E1107 on replicon NC_010658
Organism: Shigella boydii CDC 3083-94



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_01836  dATP pyrophosphohydrolase  100 
 
 		 150 aa  312  9.999999999999999e-85  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.618356  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1107  dATP pyrophosphohydrolase  100 
 
 		 150 aa  312  9.999999999999999e-85  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01824  hypothetical protein  100 
 
 		 150 aa  312  9.999999999999999e-85  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.452157  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2095  dATP pyrophosphohydrolase  100 
 
 		 150 aa  312  9.999999999999999e-85  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0764827  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1958  dATP pyrophosphohydrolase  100 
 
 		 150 aa  312  9.999999999999999e-85  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.683601  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1775  NUDIX hydrolase  99.33 
 
 		 169 aa  311  1.9999999999999998e-84  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00597986  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2601  dATP pyrophosphohydrolase  99.33 
 
 		 169 aa  311  1.9999999999999998e-84  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.110942  normal  0.760647 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1767  dATP pyrophosphohydrolase  98.67 
 
 		 169 aa  311  2.9999999999999996e-84  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.502024  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1321  dATP pyrophosphohydrolase  98.62 
 
 		 147 aa  297  3e-80  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.832088  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1347  dATP pyrophosphohydrolase  90 
 
 		 150 aa  287  4e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00224987 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1223  dATP pyrophosphohydrolase  89.33 
 
 		 150 aa  285  1e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.315157  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2114  dATP pyrophosphohydrolase  89.33 
 
 		 150 aa  285  1e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00720061 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2054  dATP pyrophosphohydrolase  89.33 
 
 		 150 aa  285  1e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.830611 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2059  dATP pyrophosphohydrolase  88.36 
 
 		 146 aa  275  1e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0369752 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2433  dATP pyrophosphohydrolase  84.62 
 
 		 147 aa  260  4e-69  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0218705  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1816  dATP pyrophosphohydrolase  76.71 
 
 		 147 aa  242  1.9999999999999999e-63  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.825247  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2100  dATP pyrophosphohydrolase  75.34 
 
 		 147 aa  239  1e-62  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2159  dATP pyrophosphohydrolase  76.55 
 
 		 154 aa  235  1e-61  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2261  dATP pyrophosphohydrolase  75.86 
 
 		 149 aa  232  2.0000000000000002e-60  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.995735  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2034  dATP pyrophosphohydrolase  73.94 
 
 		 147 aa  229  8.000000000000001e-60  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0350059  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2425  dATP pyrophosphohydrolase  73.94 
 
 		 147 aa  229  8.000000000000001e-60  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.135739  normal  0.252272 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2147  dATP pyrophosphohydrolase  73.94 
 
 		 147 aa  229  8.000000000000001e-60  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2780  NUDIX hydrolase  72.22 
 
 		 148 aa  217  6e-56  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0389222  normal  0.0318131 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0507  dATP pyrophosphohydrolase  55.71 
 
 		 150 aa  165  2e-40  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01728  dATP pyrophosphohydrolase  46.81 
 
 		 146 aa  124  6e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00223975  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0380  dATP pyrophosphohydrolase  45.95 
 
 		 173 aa  122  1e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.1829 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0444  dATP pyrophosphohydrolase  51.8 
 
 		 146 aa  121  4e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.847222 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0604  dATP pyrophosphohydrolase  46.53 
 
 		 157 aa  111  4.0000000000000004e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0468  dATP pyrophosphohydrolase  48.25 
 
 		 162 aa  110  5e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.379603  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0631  dATP pyrophosphohydrolase  47.83 
 
 		 150 aa  110  5e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.12041  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2382  dATP pyrophosphohydrolase  44.59 
 
 		 159 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.830787  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0441  dATP pyrophosphohydrolase  46.62 
 
 		 163 aa  108  2.0000000000000002e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2239  dATP pyrophosphohydrolase  43.84 
 
 		 148 aa  108  2.0000000000000002e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0561  dATP pyrophosphohydrolase  45.27 
 
 		 158 aa  107  5e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0343  dATP pyrophosphohydrolase  46.85 
 
 		 161 aa  107  5e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0358  dATP pyrophosphohydrolase  47.55 
 
 		 161 aa  107  5e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2751  dATP pyrophosphohydrolase  44.59 
 
 		 164 aa  106  1e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0575  dATP pyrophosphohydrolase  43.79 
 
 		 164 aa  106  1e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.725095  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2112  dATP pyrophosphohydrolase  44.59 
 
 		 164 aa  106  1e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2724  dATP pyrophosphohydrolase  44.59 
 
 		 164 aa  106  1e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0331777  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6051  dATP pyrophosphohydrolase  44.59 
 
 		 164 aa  105  2e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2642  dATP pyrophosphohydrolase  42.48 
 
 		 164 aa  104  4e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.187691 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2947  dATP pyrophosphohydrolase  45.53 
 
 		 127 aa  103  9e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.214504  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0194  dATP pyrophosphohydrolase  44.59 
 
 		 158 aa  102  1e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0853  dATP pyrophosphohydrolase  44.59 
 
 		 158 aa  102  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2751  dATP pyrophosphohydrolase  44.59 
 
 		 158 aa  102  1e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2327  dATP pyrophosphohydrolase  44.59 
 
 		 158 aa  102  1e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0677  dATP pyrophosphohydrolase  44.59 
 
 		 158 aa  102  1e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.22126  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0692  dATP pyrophosphohydrolase  44.59 
 
 		 158 aa  102  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2407  dATP pyrophosphohydrolase  44.59 
 
 		 158 aa  102  1e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2775  dATP pyrophosphohydrolase  41.83 
 
 		 170 aa  101  4e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0382  NUDIX hydrolase  43.24 
 
 		 158 aa  99.8  1e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.120045  normal  0.571576 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1891  NUDIX hydrolase  42.96 
 
 		 152 aa  99  2e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000678046  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0867  dATP pyrophosphohydrolase  45.07 
 
 		 148 aa  95.9  1e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.198511 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4042  dATP pyrophosphohydrolase  41.89 
 
 		 192 aa  95.1  3e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.258324  normal  0.25029 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1596  NUDIX hydrolase  44.29 
 
 		 147 aa  94.7  4e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.159893  normal  0.642184 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1071  putative dATP pyrophosphohydrolase  42.28 
 
 		 160 aa  94.7  4e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.284114  normal  0.221269 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0657  dATP pyrophosphohydrolase  41.89 
 
 		 171 aa  94.4  5e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1298  dATP pyrophosphohydrolase  44.44 
 
 		 170 aa  92.8  2e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0910  dATP pyrophosphohydrolase  41.67 
 
 		 154 aa  92  2e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.429333  normal  0.400014 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4015  NUDIX hydrolase  42.76 
 
 		 163 aa  89.7  1e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000561567 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0805  NUDIX hydrolase  41.55 
 
 		 156 aa  84.3  5e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.826654  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0876  NUDIX hydrolase  40.85 
 
 		 156 aa  82.8  0.000000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0246946  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5451  NUDIX hydrolase  42.07 
 
 		 161 aa  82.8  0.000000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4121  NUDIX hydrolase  42.28 
 
 		 157 aa  80.1  0.00000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3635  NUDIX hydrolase  41.43 
 
 		 174 aa  76.3  0.0000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2461  MutT/Nudix family protein  39.29 
 
 		 170 aa  50.4  0.000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000020561  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2500  mutT/nudix family protein  39.29 
 
 		 170 aa  50.1  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0522279  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2685  mutT/nudix family protein  39.29 
 
 		 170 aa  50.1  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.345064  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2700  mutT/nudix family protein  39.29 
 
 		 170 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000999675 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2721  mutT/nudix family protein  39.29 
 
 		 170 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00212915  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2751  MutT/Nudix family protein  37.5 
 
 		 194 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000576438  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2931  dinucleoside polyphosphate hydrolase  31.5 
 
 		 175 aa  48.5  0.00003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2785  dinucleoside polyphosphate hydrolase  31.5 
 
 		 175 aa  48.5  0.00003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4065  NUDIX hydrolase  45 
 
 		 143 aa  48.9  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2431  MutT/Nudix family protein  37.5 
 
 		 172 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000214023  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_25489  predicted protein  29.41 
 
 		 274 aa  48.1  0.00004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0283789 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27463  predicted protein  29.41 
 
 		 274 aa  48.1  0.00004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00352572 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2861  NUDIX hydrolase  29.93 
 
 		 142 aa  47.4  0.00007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.510666  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2065  nucleotide phosphate derivative pyrophosphohydrolases, MutT/nudix family protein  30.77 
 
 		 156 aa  47  0.00009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1472  NUDIX hydrolase  27.64 
 
 		 150 aa  46.6  0.0001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.181973  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4857  NUDIX hydrolase  37.33 
 
 		 158 aa  46.6  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1031  putative mutator mutT protein  29.32 
 
 		 131 aa  46.6  0.0001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0898  mutator MutT protein, putative  29.32 
 
 		 131 aa  46.6  0.0001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0730911  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0997  NUDIX hydrolase  28.99 
 
 		 153 aa  46.2  0.0001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.665088  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0237  NUDIX hydrolase  30.66 
 
 		 146 aa  46.2  0.0001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.135862 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0537  NUDIX hydrolase  40.3 
 
 		 190 aa  46.2  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.572946  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1412  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  41.38 
 
 		 138 aa  45.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.559865  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2287  mutT/nudix family protein  36.07 
 
 		 156 aa  45.8  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1821  lipoate-protein ligase B  40.68 
 
 		 365 aa  45.8  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0885  NUDIX hydrolase  26.28 
 
 		 145 aa  45.1  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1603  NUDIX hydrolase  31.94 
 
 		 157 aa  45.1  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0283951  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2899  NUDIX hydrolase  41.07 
 
 		 153 aa  45.1  0.0003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2603  mutT/nudix family protein  44.68 
 
 		 154 aa  45.1  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.643872  hitchhiker  0.0000289813 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2109  lipoate-protein ligase B  42.59 
 
 		 365 aa  44.7  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0939106  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2039  lipoate-protein ligase B  42.59 
 
 		 365 aa  44.7  0.0004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.237895  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1617  NUDIX hydrolase  31.78 
 
 		 132 aa  45.1  0.0004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000267139  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0883  NUDIX hydrolase  35.29 
 
 		 151 aa  44.7  0.0005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2639  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 148 aa  44.3  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1687  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  38.1 
 
 		 140 aa  44.7  0.0005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>