273 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_0444 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_0444  dATP pyrophosphohydrolase  100 
 
 		 146 aa  296  6e-80  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.847222 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0604  dATP pyrophosphohydrolase  69.34 
 
 		 157 aa  196  1.0000000000000001e-49  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1071  putative dATP pyrophosphohydrolase  61.49 
 
 		 160 aa  176  9e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.284114  normal  0.221269 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0358  dATP pyrophosphohydrolase  62.76 
 
 		 161 aa  174  3e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0343  dATP pyrophosphohydrolase  62.07 
 
 		 161 aa  174  4e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0380  dATP pyrophosphohydrolase  61.81 
 
 		 173 aa  173  5e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.1829 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0867  dATP pyrophosphohydrolase  60.54 
 
 		 148 aa  170  5.999999999999999e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.198511 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1298  dATP pyrophosphohydrolase  59.18 
 
 		 170 aa  169  7.999999999999999e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4015  NUDIX hydrolase  60.81 
 
 		 163 aa  168  3e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000561567 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0468  dATP pyrophosphohydrolase  61.11 
 
 		 162 aa  166  9e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.379603  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0441  dATP pyrophosphohydrolase  60.69 
 
 		 163 aa  164  2.9999999999999998e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0910  dATP pyrophosphohydrolase  59.44 
 
 		 154 aa  164  5e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.429333  normal  0.400014 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0631  dATP pyrophosphohydrolase  54.79 
 
 		 150 aa  160  5.0000000000000005e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.12041  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5451  NUDIX hydrolase  58.94 
 
 		 161 aa  156  1e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4121  NUDIX hydrolase  57.82 
 
 		 157 aa  154  4e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4042  dATP pyrophosphohydrolase  56 
 
 		 192 aa  153  9e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.258324  normal  0.25029 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2382  dATP pyrophosphohydrolase  55.41 
 
 		 159 aa  152  1e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.830787  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0575  dATP pyrophosphohydrolase  55.7 
 
 		 164 aa  150  7e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.725095  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2751  dATP pyrophosphohydrolase  54.67 
 
 		 164 aa  148  2e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6051  dATP pyrophosphohydrolase  54.67 
 
 		 164 aa  149  2e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0805  NUDIX hydrolase  56.55 
 
 		 156 aa  148  2e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.826654  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0382  NUDIX hydrolase  56 
 
 		 158 aa  149  2e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.120045  normal  0.571576 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2112  dATP pyrophosphohydrolase  54.67 
 
 		 164 aa  148  2e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2724  dATP pyrophosphohydrolase  54.67 
 
 		 164 aa  148  2e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0331777  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0657  dATP pyrophosphohydrolase  56 
 
 		 171 aa  147  6e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0194  dATP pyrophosphohydrolase  53.33 
 
 		 158 aa  147  6e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0853  dATP pyrophosphohydrolase  53.33 
 
 		 158 aa  147  6e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0677  dATP pyrophosphohydrolase  53.33 
 
 		 158 aa  147  6e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.22126  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2407  dATP pyrophosphohydrolase  53.33 
 
 		 158 aa  147  6e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0692  dATP pyrophosphohydrolase  53.33 
 
 		 158 aa  147  6e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0876  NUDIX hydrolase  55.86 
 
 		 156 aa  147  6e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0246946  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2751  dATP pyrophosphohydrolase  53.33 
 
 		 158 aa  147  6e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2327  dATP pyrophosphohydrolase  53.33 
 
 		 158 aa  147  6e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1891  NUDIX hydrolase  53.52 
 
 		 152 aa  147  7e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000678046  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0561  dATP pyrophosphohydrolase  52.67 
 
 		 158 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2642  dATP pyrophosphohydrolase  52.67 
 
 		 164 aa  144  3e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.187691 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2775  dATP pyrophosphohydrolase  52.67 
 
 		 170 aa  144  3e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1596  NUDIX hydrolase  54.93 
 
 		 147 aa  136  1e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.159893  normal  0.642184 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3635  NUDIX hydrolase  51.72 
 
 		 174 aa  130  6e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2239  dATP pyrophosphohydrolase  54.41 
 
 		 148 aa  129  2.0000000000000002e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01728  dATP pyrophosphohydrolase  49.29 
 
 		 146 aa  127  7.000000000000001e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00223975  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2054  dATP pyrophosphohydrolase  52.52 
 
 		 150 aa  123  8.000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.830611 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1223  dATP pyrophosphohydrolase  52.52 
 
 		 150 aa  123  8.000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.315157  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2114  dATP pyrophosphohydrolase  52.52 
 
 		 150 aa  123  8.000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00720061 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2059  dATP pyrophosphohydrolase  52.52 
 
 		 146 aa  123  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0369752 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1816  dATP pyrophosphohydrolase  53.24 
 
 		 147 aa  122  2e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.825247  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1347  dATP pyrophosphohydrolase  51.8 
 
 		 150 aa  121  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00224987 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1767  dATP pyrophosphohydrolase  52.52 
 
 		 169 aa  121  3e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.502024  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01836  dATP pyrophosphohydrolase  51.8 
 
 		 150 aa  121  4e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.618356  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1775  NUDIX hydrolase  51.8 
 
 		 169 aa  121  4e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00597986  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2601  dATP pyrophosphohydrolase  51.8 
 
 		 169 aa  121  4e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.110942  normal  0.760647 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2095  dATP pyrophosphohydrolase  51.8 
 
 		 150 aa  121  4e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0764827  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1958  dATP pyrophosphohydrolase  51.8 
 
 		 150 aa  121  4e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.683601  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01824  hypothetical protein  51.8 
 
 		 150 aa  121  4e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.452157  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1107  dATP pyrophosphohydrolase  51.8 
 
 		 150 aa  121  4e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2159  dATP pyrophosphohydrolase  51.8 
 
 		 154 aa  119  9.999999999999999e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2100  dATP pyrophosphohydrolase  51.8 
 
 		 147 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1321  dATP pyrophosphohydrolase  51.8 
 
 		 147 aa  118  3e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.832088  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2261  dATP pyrophosphohydrolase  51.8 
 
 		 149 aa  117  7.999999999999999e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.995735  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2433  dATP pyrophosphohydrolase  49.28 
 
 		 147 aa  112  2.0000000000000002e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0218705  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2034  dATP pyrophosphohydrolase  49.64 
 
 		 147 aa  110  7.000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0350059  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2147  dATP pyrophosphohydrolase  49.64 
 
 		 147 aa  110  7.000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2425  dATP pyrophosphohydrolase  49.64 
 
 		 147 aa  110  7.000000000000001e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.135739  normal  0.252272 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0507  dATP pyrophosphohydrolase  45.71 
 
 		 150 aa  103  8e-22  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2780  NUDIX hydrolase  46.43 
 
 		 148 aa  96.3  1e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0389222  normal  0.0318131 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2947  dATP pyrophosphohydrolase  42.02 
 
 		 127 aa  96.3  1e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.214504  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4065  NUDIX hydrolase  34.85 
 
 		 143 aa  64.3  0.0000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2065  nucleotide phosphate derivative pyrophosphohydrolases, MutT/nudix family protein  34.87 
 
 		 156 aa  63.9  0.0000000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1821  lipoate-protein ligase B  36.03 
 
 		 365 aa  55.1  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2616  NUDIX hydrolase  45.31 
 
 		 146 aa  53.9  0.0000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2039  lipoate-protein ligase B  33.79 
 
 		 365 aa  52.4  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.237895  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2109  lipoate-protein ligase B  33.79 
 
 		 365 aa  52.4  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0939106  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1999  lipoate-protein ligase B  33.33 
 
 		 383 aa  52.4  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0927  NUDIX hydrolase  53.45 
 
 		 129 aa  51.6  0.000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.227585 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1074  NUDIX hydrolase  41.18 
 
 		 261 aa  48.9  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1412  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  44.83 
 
 		 138 aa  49.3  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.559865  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1807  mutator MutT-like  50.94 
 
 		 148 aa  48.9  0.00002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.829238  normal  0.287731 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1417  NUDIX hydrolase  28.24 
 
 		 139 aa  48.9  0.00002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1020  NUDIX hydrolase  35.29 
 
 		 139 aa  48.5  0.00003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.720434  hitchhiker  0.00107083 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1428  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  43.1 
 
 		 138 aa  48.5  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.522134  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2045  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  43.1 
 
 		 138 aa  48.5  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1935  NUDIX hydrolase  42.62 
 
 		 142 aa  48.1  0.00004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1163  NUDIX hydrolase  45.16 
 
 		 140 aa  48.1  0.00004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000271  NUDIX hydrolase domain-containing protein  33.59 
 
 		 152 aa  48.1  0.00004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1903  NUDIX hydrolase  45.16 
 
 		 178 aa  48.1  0.00004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.772083  normal  0.185103 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1639  NUDIX hydrolase  31.82 
 
 		 136 aa  47.8  0.00006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000053664  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0237  NUDIX hydrolase  33.8 
 
 		 146 aa  47.4  0.00007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.135862 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1874  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  43.1 
 
 		 138 aa  47  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.400032  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2202  NUDIX hydrolase  27.86 
 
 		 143 aa  47  0.00008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1687  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  41.38 
 
 		 140 aa  46.6  0.0001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1395  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  41.38 
 
 		 138 aa  46.6  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0511972 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2287  mutT/nudix family protein  41.94 
 
 		 156 aa  46.6  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2650  hypothetical protein  34.29 
 
 		 315 aa  46.2  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4123  NUDIX hydrolase  39.47 
 
 		 181 aa  46.6  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0088  NUDIX hydrolase  35.77 
 
 		 140 aa  46.6  0.0001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.856049  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1603  NUDIX hydrolase  35.94 
 
 		 157 aa  46.2  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0283951  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3031  NUDIX hydrolase  40.68 
 
 		 155 aa  45.4  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0080  NUDIX hydrolase  46.55 
 
 		 195 aa  45.4  0.0002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0730  NUDIX hydrolase  46.43 
 
 		 153 aa  46.2  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.189359  n/a   
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5996  NUDIX hydrolase  40.68 
 
 		 155 aa  45.4  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000245318 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>