105 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_1891 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009379  Pnuc_1891  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 152 aa  317  3e-86  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000678046  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1596  NUDIX hydrolase  79.59 
 
 		 147 aa  235  2e-61  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.159893  normal  0.642184 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0561  dATP pyrophosphohydrolase  61.11 
 
 		 158 aa  179  2e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4042  dATP pyrophosphohydrolase  62.5 
 
 		 192 aa  176  7e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.258324  normal  0.25029 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2112  dATP pyrophosphohydrolase  60.42 
 
 		 164 aa  176  1e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2775  dATP pyrophosphohydrolase  61.11 
 
 		 170 aa  176  1e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2724  dATP pyrophosphohydrolase  60.42 
 
 		 164 aa  176  1e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0331777  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0575  dATP pyrophosphohydrolase  61.11 
 
 		 164 aa  176  1e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.725095  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2751  dATP pyrophosphohydrolase  60.42 
 
 		 164 aa  176  1e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2642  dATP pyrophosphohydrolase  60.42 
 
 		 164 aa  174  3e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.187691 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0657  dATP pyrophosphohydrolase  60.93 
 
 		 171 aa  174  3e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0194  dATP pyrophosphohydrolase  60.42 
 
 		 158 aa  172  9.999999999999999e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0853  dATP pyrophosphohydrolase  60.42 
 
 		 158 aa  172  9.999999999999999e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2751  dATP pyrophosphohydrolase  60.42 
 
 		 158 aa  172  9.999999999999999e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2327  dATP pyrophosphohydrolase  60.42 
 
 		 158 aa  172  9.999999999999999e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0692  dATP pyrophosphohydrolase  60.42 
 
 		 158 aa  172  9.999999999999999e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2407  dATP pyrophosphohydrolase  60.42 
 
 		 158 aa  172  9.999999999999999e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6051  dATP pyrophosphohydrolase  59.03 
 
 		 164 aa  172  1.9999999999999998e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0380  dATP pyrophosphohydrolase  58.45 
 
 		 173 aa  171  1.9999999999999998e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.1829 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0677  dATP pyrophosphohydrolase  60.42 
 
 		 158 aa  172  1.9999999999999998e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.22126  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0468  dATP pyrophosphohydrolase  59.03 
 
 		 162 aa  169  2e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.379603  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0343  dATP pyrophosphohydrolase  58.45 
 
 		 161 aa  165  2e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0358  dATP pyrophosphohydrolase  57.75 
 
 		 161 aa  165  2e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0382  NUDIX hydrolase  58.33 
 
 		 158 aa  164  5.9999999999999996e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.120045  normal  0.571576 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0441  dATP pyrophosphohydrolase  55.63 
 
 		 163 aa  163  1.0000000000000001e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4015  NUDIX hydrolase  58.33 
 
 		 163 aa  162  1.0000000000000001e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000561567 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1071  putative dATP pyrophosphohydrolase  57.64 
 
 		 160 aa  162  2.0000000000000002e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.284114  normal  0.221269 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1298  dATP pyrophosphohydrolase  57.53 
 
 		 170 aa  156  9e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0867  dATP pyrophosphohydrolase  57.04 
 
 		 148 aa  153  9e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.198511 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4121  NUDIX hydrolase  54.79 
 
 		 157 aa  148  2e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0910  dATP pyrophosphohydrolase  55.32 
 
 		 154 aa  148  3e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.429333  normal  0.400014 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0444  dATP pyrophosphohydrolase  53.52 
 
 		 146 aa  147  7e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.847222 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3635  NUDIX hydrolase  52.14 
 
 		 174 aa  142  2e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0876  NUDIX hydrolase  53.57 
 
 		 156 aa  142  2e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0246946  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2382  dATP pyrophosphohydrolase  48 
 
 		 159 aa  141  3e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.830787  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0604  dATP pyrophosphohydrolase  50.7 
 
 		 157 aa  140  5e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0805  NUDIX hydrolase  53.57 
 
 		 156 aa  140  5e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.826654  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0631  dATP pyrophosphohydrolase  52.48 
 
 		 150 aa  132  9.999999999999999e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.12041  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5451  NUDIX hydrolase  49.66 
 
 		 161 aa  130  3.9999999999999996e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0507  dATP pyrophosphohydrolase  47.3 
 
 		 150 aa  123  1e-27  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2239  dATP pyrophosphohydrolase  44.68 
 
 		 148 aa  122  2e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2261  dATP pyrophosphohydrolase  46 
 
 		 149 aa  120  7e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.995735  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2159  dATP pyrophosphohydrolase  46.53 
 
 		 154 aa  117  3.9999999999999996e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1816  dATP pyrophosphohydrolase  45.77 
 
 		 147 aa  113  7.999999999999999e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.825247  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2100  dATP pyrophosphohydrolase  45.77 
 
 		 147 aa  113  8.999999999999998e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2034  dATP pyrophosphohydrolase  46.48 
 
 		 147 aa  110  6e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0350059  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2425  dATP pyrophosphohydrolase  46.48 
 
 		 147 aa  110  6e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.135739  normal  0.252272 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2147  dATP pyrophosphohydrolase  46.48 
 
 		 147 aa  110  6e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2780  NUDIX hydrolase  46.53 
 
 		 148 aa  108  2.0000000000000002e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0389222  normal  0.0318131 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2433  dATP pyrophosphohydrolase  45.52 
 
 		 147 aa  105  2e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0218705  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2059  dATP pyrophosphohydrolase  42.96 
 
 		 146 aa  104  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0369752 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2114  dATP pyrophosphohydrolase  42.96 
 
 		 150 aa  105  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00720061 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2054  dATP pyrophosphohydrolase  42.96 
 
 		 150 aa  105  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.830611 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1223  dATP pyrophosphohydrolase  42.96 
 
 		 150 aa  105  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.315157  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1347  dATP pyrophosphohydrolase  42.96 
 
 		 150 aa  104  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00224987 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01728  dATP pyrophosphohydrolase  42.45 
 
 		 146 aa  104  5e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00223975  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1321  dATP pyrophosphohydrolase  42.25 
 
 		 147 aa  99.4  1e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.832088  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01836  dATP pyrophosphohydrolase  42.96 
 
 		 150 aa  99  2e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.618356  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1775  NUDIX hydrolase  43.06 
 
 		 169 aa  99  2e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00597986  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1958  dATP pyrophosphohydrolase  42.96 
 
 		 150 aa  99  2e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.683601  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2095  dATP pyrophosphohydrolase  42.96 
 
 		 150 aa  99  2e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0764827  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1107  dATP pyrophosphohydrolase  42.96 
 
 		 150 aa  99  2e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2601  dATP pyrophosphohydrolase  43.06 
 
 		 169 aa  99  2e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.110942  normal  0.760647 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01824  hypothetical protein  42.96 
 
 		 150 aa  99  2e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.452157  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1767  dATP pyrophosphohydrolase  42.36 
 
 		 169 aa  98.2  3e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.502024  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2947  dATP pyrophosphohydrolase  43.44 
 
 		 127 aa  85.9  2e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.214504  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2065  nucleotide phosphate derivative pyrophosphohydrolases, MutT/nudix family protein  33.77 
 
 		 156 aa  71.6  0.000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1821  lipoate-protein ligase B  34.51 
 
 		 365 aa  61.6  0.000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2039  lipoate-protein ligase B  33.33 
 
 		 365 aa  57  0.00000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.237895  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2109  lipoate-protein ligase B  33.33 
 
 		 365 aa  57  0.00000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0939106  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1999  lipoate-protein ligase B  34.92 
 
 		 383 aa  54.7  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4065  NUDIX hydrolase  30.07 
 
 		 143 aa  55.1  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0730  NUDIX hydrolase  33.06 
 
 		 153 aa  49.3  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.189359  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0237  NUDIX hydrolase  30.34 
 
 		 146 aa  45.4  0.0003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.135862 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2202  NUDIX hydrolase  30.5 
 
 		 143 aa  45.1  0.0003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3063  NUDIX hydrolase  49.09 
 
 		 165 aa  44.7  0.0005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.253855  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3131  NUDIX hydrolase  28.08 
 
 		 145 aa  44.3  0.0006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.278733  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2912  NUDIX hydrolase  56.52 
 
 		 149 aa  43.9  0.0007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0415  NUDIX hydrolase  41.07 
 
 		 154 aa  43.9  0.0007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_26314  predicted protein  42 
 
 		 243 aa  43.9  0.0008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1681  mutT/nudix family protein  32.14 
 
 		 144 aa  43.9  0.0009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000627508  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1816  mutT/nudix family protein  32.14 
 
 		 144 aa  43.9  0.0009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000181059  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2453  dATP pyrophosphohydrolase  29.05 
 
 		 145 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.401359  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0885  NUDIX hydrolase  28.08 
 
 		 145 aa  43.1  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1861  mutT/nudix family protein  32.14 
 
 		 161 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.01503e-50 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1946  NUDIX hydrolase  48.15 
 
 		 162 aa  43.5  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.97992  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1888  mutT/nudix family protein  30.56 
 
 		 161 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0131213  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0336  NUDIX family hydrolase  27.12 
 
 		 548 aa  42.4  0.002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1639  NUDIX hydrolase  25.34 
 
 		 136 aa  42.4  0.002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000053664  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1523  NUDIX hydrolase  30.16 
 
 		 158 aa  42.7  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2899  NUDIX hydrolase  32.84 
 
 		 153 aa  42.4  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2976  NUDIX hydrolase  43.4 
 
 		 162 aa  42.4  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2488  dATP pyrophosphohydrolase  28.38 
 
 		 145 aa  42  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000650379  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4857  NUDIX hydrolase  38.1 
 
 		 158 aa  42  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2528  mutT/nudix family protein  28.38 
 
 		 145 aa  40.8  0.006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0638585  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2713  mutT/nudix family protein  28.38 
 
 		 145 aa  40.8  0.006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1807  mutator MutT-like  45.16 
 
 		 148 aa  41.2  0.006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.829238  normal  0.287731 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1943  NUDIX hydrolase  35.23 
 
 		 152 aa  40.8  0.006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.639742  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0473  protein of unknown function DUF1152  33.33 
 
 		 530 aa  40.8  0.006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0589  NUDIX hydrolase  46.43 
 
 		 141 aa  40.8  0.007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.000226266  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>