74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A0441 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007347  Reut_A0441  dATP pyrophosphohydrolase  100 
 
 
163 aa  335  1.9999999999999998e-91  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0380  dATP pyrophosphohydrolase  80.41 
 
 
173 aa  253  7e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.1829 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0358  dATP pyrophosphohydrolase  70.27 
 
 
161 aa  219  9.999999999999999e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0343  dATP pyrophosphohydrolase  68.92 
 
 
161 aa  218  3e-56  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0468  dATP pyrophosphohydrolase  71.13 
 
 
162 aa  208  3e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.379603  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2724  dATP pyrophosphohydrolase  66.67 
 
 
164 aa  203  7e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0331777  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2751  dATP pyrophosphohydrolase  66.67 
 
 
164 aa  203  7e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2112  dATP pyrophosphohydrolase  66.67 
 
 
164 aa  203  7e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2642  dATP pyrophosphohydrolase  65.36 
 
 
164 aa  203  8e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.187691 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6051  dATP pyrophosphohydrolase  65.36 
 
 
164 aa  203  1e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0575  dATP pyrophosphohydrolase  64.71 
 
 
164 aa  201  3e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.725095  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2775  dATP pyrophosphohydrolase  64.71 
 
 
170 aa  201  3e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4042  dATP pyrophosphohydrolase  64.56 
 
 
192 aa  196  9e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.258324  normal  0.25029 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0867  dATP pyrophosphohydrolase  69.34 
 
 
148 aa  188  2.9999999999999997e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.198511 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4015  NUDIX hydrolase  65.75 
 
 
163 aa  187  5e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000561567 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0561  dATP pyrophosphohydrolase  60.51 
 
 
158 aa  187  5.999999999999999e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0657  dATP pyrophosphohydrolase  62.75 
 
 
171 aa  186  2e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0382  NUDIX hydrolase  62.75 
 
 
158 aa  185  3e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.120045  normal  0.571576 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2407  dATP pyrophosphohydrolase  60.51 
 
 
158 aa  184  4e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0853  dATP pyrophosphohydrolase  60.51 
 
 
158 aa  184  4e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0194  dATP pyrophosphohydrolase  60.51 
 
 
158 aa  184  4e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0692  dATP pyrophosphohydrolase  60.51 
 
 
158 aa  184  4e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2327  dATP pyrophosphohydrolase  60.51 
 
 
158 aa  184  4e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2751  dATP pyrophosphohydrolase  60.51 
 
 
158 aa  184  4e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0910  dATP pyrophosphohydrolase  65 
 
 
154 aa  183  9e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.429333  normal  0.400014 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0677  dATP pyrophosphohydrolase  60.51 
 
 
158 aa  183  1.0000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.22126  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1071  putative dATP pyrophosphohydrolase  63.51 
 
 
160 aa  178  2.9999999999999997e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.284114  normal  0.221269 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4121  NUDIX hydrolase  64.43 
 
 
157 aa  177  4.999999999999999e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0604  dATP pyrophosphohydrolase  62.41 
 
 
157 aa  172  9.999999999999999e-43  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1298  dATP pyrophosphohydrolase  57.42 
 
 
170 aa  167  6e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0444  dATP pyrophosphohydrolase  60.69 
 
 
146 aa  164  2.9999999999999998e-40  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.847222 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1891  NUDIX hydrolase  55.63 
 
 
152 aa  163  1.0000000000000001e-39  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000678046  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1596  NUDIX hydrolase  61.97 
 
 
147 aa  162  2.0000000000000002e-39  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.159893  normal  0.642184 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2382  dATP pyrophosphohydrolase  51.61 
 
 
159 aa  151  4e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.830787  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0805  NUDIX hydrolase  57.79 
 
 
156 aa  150  8e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.826654  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0876  NUDIX hydrolase  57.14 
 
 
156 aa  148  3e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0246946  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0631  dATP pyrophosphohydrolase  53.42 
 
 
150 aa  144  4.0000000000000006e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.12041  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3635  NUDIX hydrolase  57.34 
 
 
174 aa  141  3e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5451  NUDIX hydrolase  51.97 
 
 
161 aa  123  8.000000000000001e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2239  dATP pyrophosphohydrolase  47.97 
 
 
148 aa  121  4e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01728  dATP pyrophosphohydrolase  48.94 
 
 
146 aa  114  3.9999999999999997e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00223975  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2034  dATP pyrophosphohydrolase  48.61 
 
 
147 aa  111  4.0000000000000004e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0350059  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2425  dATP pyrophosphohydrolase  48.61 
 
 
147 aa  111  4.0000000000000004e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.135739  normal  0.252272 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2147  dATP pyrophosphohydrolase  48.61 
 
 
147 aa  111  4.0000000000000004e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1321  dATP pyrophosphohydrolase  46.67 
 
 
147 aa  111  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.832088  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2601  dATP pyrophosphohydrolase  46.62 
 
 
169 aa  109  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.110942  normal  0.760647 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1775  NUDIX hydrolase  46.62 
 
 
169 aa  109  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00597986  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1107  dATP pyrophosphohydrolase  46.62 
 
 
150 aa  108  2.0000000000000002e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01824  hypothetical protein  46.62 
 
 
150 aa  108  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.452157  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2095  dATP pyrophosphohydrolase  46.62 
 
 
150 aa  108  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0764827  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1767  dATP pyrophosphohydrolase  46.62 
 
 
169 aa  109  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.502024  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1958  dATP pyrophosphohydrolase  46.62 
 
 
150 aa  108  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.683601  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01836  dATP pyrophosphohydrolase  46.62 
 
 
150 aa  108  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.618356  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2261  dATP pyrophosphohydrolase  46.9 
 
 
149 aa  107  9.000000000000001e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.995735  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2433  dATP pyrophosphohydrolase  43.62 
 
 
147 aa  105  3e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0218705  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2114  dATP pyrophosphohydrolase  43.14 
 
 
150 aa  102  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00720061 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2054  dATP pyrophosphohydrolase  43.14 
 
 
150 aa  102  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.830611 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1223  dATP pyrophosphohydrolase  43.14 
 
 
150 aa  102  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.315157  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1347  dATP pyrophosphohydrolase  43.14 
 
 
150 aa  102  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00224987 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2159  dATP pyrophosphohydrolase  44.08 
 
 
154 aa  102  2e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2059  dATP pyrophosphohydrolase  44.59 
 
 
146 aa  102  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0369752 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1816  dATP pyrophosphohydrolase  46.9 
 
 
147 aa  102  3e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.825247  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2100  dATP pyrophosphohydrolase  45.52 
 
 
147 aa  99  3e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2780  NUDIX hydrolase  44.83 
 
 
148 aa  97.4  7e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0389222  normal  0.0318131 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0507  dATP pyrophosphohydrolase  40.28 
 
 
150 aa  96.7  1e-19  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2947  dATP pyrophosphohydrolase  41.32 
 
 
127 aa  78.2  0.00000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.214504  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2065  nucleotide phosphate derivative pyrophosphohydrolases, MutT/nudix family protein  36.09 
 
 
156 aa  55.1  0.0000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0730  NUDIX hydrolase  39.66 
 
 
153 aa  53.5  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.189359  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4065  NUDIX hydrolase  30.77 
 
 
143 aa  51.2  0.000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2976  NUDIX hydrolase  45 
 
 
162 aa  42.7  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1821  lipoate-protein ligase B  31.39 
 
 
365 aa  41.2  0.007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11440  NTP pyrophosphohydrolase  30.47 
 
 
215 aa  40.8  0.007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.178204  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2109  lipoate-protein ligase B  47.17 
 
 
365 aa  40.8  0.008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0939106  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2039  lipoate-protein ligase B  47.17 
 
 
365 aa  40.8  0.008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.237895  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>