61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_11440 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_11440  NTP pyrophosphohydrolase  100 
 
 		 215 aa  419  1e-116  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.178204  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0711  NUDIX hydrolase  51.64 
 
 		 197 aa  99.8  3e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.267482 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13930  NTP pyrophosphohydrolase  49.59 
 
 		 181 aa  96.7  2e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.57247  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3734  NUDIX hydrolase  42.96 
 
 		 171 aa  95.1  7e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.056814  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1731  NUDIX hydrolase  41.27 
 
 		 190 aa  88.6  7e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.993062  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0535  hypothetical protein  45.52 
 
 		 185 aa  88.2  9e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.523865  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4732  NUDIX hydrolase  36.91 
 
 		 179 aa  84.3  0.000000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.382396  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06220  NUDIX family protein  37.67 
 
 		 181 aa  84  0.000000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.755665  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6335  NUDIX hydrolase  38.93 
 
 		 181 aa  83.6  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2957  NUDIX hydrolase  41.01 
 
 		 188 aa  80.1  0.00000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0330064  normal  0.14207 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0941  NUDIX hydrolase  41.98 
 
 		 199 aa  79  0.00000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0785282  normal  0.918248 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8348  hypothetical protein  37.78 
 
 		 181 aa  76.3  0.0000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.359922  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0883  NUDIX hydrolase  40.29 
 
 		 199 aa  75.9  0.0000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.402979  normal  0.0136644 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1181  NUDIX hydrolase  35.86 
 
 		 185 aa  75.1  0.0000000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3304  NUDIX hydrolase  35.25 
 
 		 187 aa  73.9  0.000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.360239  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3801  NUDIX hydrolase  37.04 
 
 		 196 aa  73.6  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.225828  normal  0.040121 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1524  NUDIX hydrolase  36.31 
 
 		 188 aa  73.2  0.000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.533164  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1339  NUDIX hydrolase  37.59 
 
 		 184 aa  71.6  0.000000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1358  NUDIX hydrolase  37.59 
 
 		 184 aa  71.6  0.000000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.097904  normal  0.32724 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1322  NUDIX hydrolase  37.59 
 
 		 184 aa  71.6  0.000000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.245288  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4177  NUDIX hydrolase  36.11 
 
 		 170 aa  70.9  0.00000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.086433  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00851  hydrolase, nudix family protein  36.42 
 
 		 182 aa  64.7  0.000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.0000243046  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06076  hydrolase, nudix family protein  36.42 
 
 		 182 aa  64.7  0.000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.0000965129  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5005  NUDIX hydrolase  34.09 
 
 		 184 aa  63.5  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0781982  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1646  NUDIX hydrolase  31.37 
 
 		 178 aa  59.7  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.637473  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1786  NUDIX hydrolase  32.89 
 
 		 204 aa  58.5  0.00000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.346997 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0504  NUDIX hydrolase  36.13 
 
 		 163 aa  56.6  0.0000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.316146  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2393  NUDIX hydrolase  35.11 
 
 		 181 aa  54.7  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.53348 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1658  NUDIX hydrolase  32.09 
 
 		 190 aa  54.3  0.000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1047  NUDIX hydrolase  32.86 
 
 		 186 aa  54.3  0.000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0665722  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3483  NUDIX hydrolase  28.7 
 
 		 186 aa  53.9  0.000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2190  hypothetical protein  30.58 
 
 		 185 aa  52.4  0.000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2862  NUDIX hydrolase  37.61 
 
 		 210 aa  52  0.000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00008626  normal  0.0453514 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0336  NUDIX family hydrolase  36.23 
 
 		 548 aa  51.6  0.00001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4916  NUDIX hydrolase  33.64 
 
 		 283 aa  50.8  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.933953  hitchhiker  0.00516547 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0632  NUDIX hydrolase  33.74 
 
 		 205 aa  50.1  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.224471 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1014  NUDIX hydrolase  34.31 
 
 		 195 aa  49.7  0.00003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.226826  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4093  NUDIX hydrolase  32.06 
 
 		 187 aa  50.1  0.00003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.331104  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3204  NUDIX hydrolase  30.53 
 
 		 191 aa  48.9  0.00006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11570  NUDIX family protein  43.33 
 
 		 194 aa  48.5  0.00007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0581  NUDIX hydrolase  40 
 
 		 185 aa  45.4  0.0006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.664417 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4848  NUDIX hydrolase  28.68 
 
 		 198 aa  45.4  0.0006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00240786  normal  0.150096 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1924  NUDIX hydrolase  40.24 
 
 		 340 aa  45.1  0.0007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3967  MutT/nudix family protein  35.14 
 
 		 146 aa  45.1  0.0009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.447658  normal  0.0696331 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1608  NUDIX hydrolase  52.83 
 
 		 137 aa  44.7  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.996665 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1034  NUDIX hydrolase  26.28 
 
 		 185 aa  44.7  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2288  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 456 aa  43.9  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.514522  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5809  NUDIX hydrolase  35.54 
 
 		 143 aa  43.1  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.180379  decreased coverage  0.0027447 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1980  NUDIX hydrolase  30.22 
 
 		 194 aa  42.7  0.004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.130683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1496  NUDIX hydrolase  48.48 
 
 		 174 aa  42.4  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.174494 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0662  NUDIX family hydrolase  24.83 
 
 		 188 aa  42.4  0.006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0202176  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1905  NUDIX hydrolase  36.46 
 
 		 377 aa  42  0.007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.173427  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4860  NUDIX hydrolase  40.91 
 
 		 163 aa  42  0.007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2784  NUDIX hydrolase  49.06 
 
 		 141 aa  42  0.007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.801073  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0927  NUDIX hydrolase  51.92 
 
 		 129 aa  42  0.007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.227585 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2044  NUDIX hydrolase  43.75 
 
 		 147 aa  42  0.008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00490099 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2164  NUDIX hydrolase  38.46 
 
 		 143 aa  41.6  0.009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.019865 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1525  NUDIX hydrolase  35.96 
 
 		 179 aa  41.6  0.009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.2695  normal  0.533617 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0164  NUDIX hydrolase  33.87 
 
 		 145 aa  41.6  0.01  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.860889  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1718  NUDIX hydrolase  42.37 
 
 		 142 aa  41.6  0.01  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1525  NUDIX hydrolase  35.96 
 
 		 441 aa  41.6  0.01  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.103483 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>