69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_0883 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_0883  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 199 aa  393  1e-109  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.402979  normal  0.0136644 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0941  NUDIX hydrolase  83.92 
 
 		 199 aa  317  6e-86  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0785282  normal  0.918248 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06220  NUDIX family protein  55.68 
 
 		 181 aa  179  2.9999999999999997e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.755665  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0535  hypothetical protein  57.14 
 
 		 185 aa  167  9e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.523865  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6335  NUDIX hydrolase  51.12 
 
 		 181 aa  160  1e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3734  NUDIX hydrolase  51.46 
 
 		 171 aa  159  4e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.056814  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4732  NUDIX hydrolase  49.43 
 
 		 179 aa  150  1e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.382396  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3801  NUDIX hydrolase  49.16 
 
 		 196 aa  149  3e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.225828  normal  0.040121 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4177  NUDIX hydrolase  49.11 
 
 		 170 aa  144  7.0000000000000006e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.086433  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1524  NUDIX hydrolase  50.29 
 
 		 188 aa  144  7.0000000000000006e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.533164  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1731  NUDIX hydrolase  48.24 
 
 		 190 aa  140  9.999999999999999e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.993062  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2957  NUDIX hydrolase  48.75 
 
 		 188 aa  135  4e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0330064  normal  0.14207 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1358  NUDIX hydrolase  48.85 
 
 		 184 aa  125  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.097904  normal  0.32724 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1322  NUDIX hydrolase  48.85 
 
 		 184 aa  125  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.245288  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1339  NUDIX hydrolase  48.85 
 
 		 184 aa  125  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8348  hypothetical protein  43.75 
 
 		 181 aa  119  3.9999999999999996e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.359922  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3304  NUDIX hydrolase  39.34 
 
 		 187 aa  116  3e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.360239  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1181  NUDIX hydrolase  36.81 
 
 		 185 aa  102  5e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1786  NUDIX hydrolase  41.78 
 
 		 204 aa  97.8  8e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.346997 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06076  hydrolase, nudix family protein  44.36 
 
 		 182 aa  97.4  1e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.0000965129  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00851  hydrolase, nudix family protein  44.36 
 
 		 182 aa  97.4  1e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.0000243046  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5005  NUDIX hydrolase  34.19 
 
 		 184 aa  94.7  8e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0781982  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2393  NUDIX hydrolase  47.75 
 
 		 181 aa  94  1e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.53348 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1646  NUDIX hydrolase  33.13 
 
 		 178 aa  92.8  3e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.637473  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0711  NUDIX hydrolase  38.95 
 
 		 197 aa  89.4  3e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.267482 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1014  NUDIX hydrolase  43.08 
 
 		 195 aa  84.7  7e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.226826  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13930  NTP pyrophosphohydrolase  42.11 
 
 		 181 aa  81.6  0.000000000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.57247  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11440  NTP pyrophosphohydrolase  37.87 
 
 		 215 aa  76.3  0.0000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.178204  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0504  NUDIX hydrolase  35.16 
 
 		 163 aa  72  0.000000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.316146  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4093  NUDIX hydrolase  34.93 
 
 		 187 aa  70.9  0.00000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.331104  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3483  NUDIX hydrolase  30.61 
 
 		 186 aa  68.9  0.00000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4848  NUDIX hydrolase  36.81 
 
 		 198 aa  68.2  0.00000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00240786  normal  0.150096 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0336  NUDIX family hydrolase  22.78 
 
 		 548 aa  65.5  0.0000000005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2190  hypothetical protein  27.14 
 
 		 185 aa  61.2  0.00000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4916  NUDIX hydrolase  39.22 
 
 		 283 aa  61.2  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.933953  hitchhiker  0.00516547 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1047  NUDIX hydrolase  39.17 
 
 		 186 aa  60.1  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0665722  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1034  NUDIX hydrolase  24.34 
 
 		 185 aa  59.7  0.00000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1946  NUDIX hydrolase  36.57 
 
 		 162 aa  58.9  0.00000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.97992  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1658  NUDIX hydrolase  38.33 
 
 		 190 aa  57  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0632  NUDIX hydrolase  39.39 
 
 		 205 aa  57  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.224471 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0581  NUDIX hydrolase  33.04 
 
 		 185 aa  57  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.664417 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11570  NUDIX family protein  39.13 
 
 		 194 aa  54.3  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0145  NUDIX hydrolase  34.92 
 
 		 252 aa  53.9  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.658574  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2246  NUDIX hydrolase  40 
 
 		 168 aa  52.4  0.000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.171331  decreased coverage  0.0000730626 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1980  NUDIX hydrolase  28.3 
 
 		 194 aa  49.7  0.00003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.130683  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0661  NUDIX domain-containing protein  24.75 
 
 		 186 aa  49.7  0.00003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00385243  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0662  NUDIX family hydrolase  19.75 
 
 		 188 aa  49.7  0.00003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0202176  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4860  NUDIX hydrolase  33.08 
 
 		 163 aa  47.4  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0922  NUDIX hydrolase  37.98 
 
 		 136 aa  47.8  0.0001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0673  NUDIX hydrolase  32.31 
 
 		 158 aa  47.4  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.612507  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22390  ADP-ribose pyrophosphatase  33.33 
 
 		 196 aa  47.8  0.0001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3543  NUDIX hydrolase  32.03 
 
 		 160 aa  47.4  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.291144  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4342  NUDIX hydrolase  32 
 
 		 156 aa  46.6  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.87034 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8438  NUDIX hydrolase  35.96 
 
 		 157 aa  46.2  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.370098 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0215  ADP-ribose pyrophosphatase  33.33 
 
 		 173 aa  45.4  0.0005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0696282  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0387  NUDIX hydrolase  32.8 
 
 		 252 aa  45.4  0.0006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.231232 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0575  NUDIX hydrolase  31.97 
 
 		 161 aa  45.1  0.0007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0841  NUDIX hydrolase  35.63 
 
 		 201 aa  43.5  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1402  NUDIX hydrolase  30.19 
 
 		 148 aa  43.9  0.002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1103  nudix hydrolase  29.51 
 
 		 524 aa  43.5  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.426954 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4359  NUDIX hydrolase  28.35 
 
 		 163 aa  42.7  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0292579 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13970  NUDIX hydrolase  23.62 
 
 		 146 aa  43.1  0.003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0294014  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0305  NUDIX hydrolase  54.05 
 
 		 239 aa  42.4  0.004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1062  NUDIX family hydrolase  25.38 
 
 		 149 aa  42  0.005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0194838  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3974  NUDIX hydrolase  28.35 
 
 		 169 aa  42  0.006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3070  NUDIX hydrolase  31.13 
 
 		 141 aa  42  0.006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.973852  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3204  NUDIX hydrolase  32.2 
 
 		 191 aa  42  0.006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09350  dihydrofolate reductase  36.76 
 
 		 337 aa  41.6  0.008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.32591  normal  0.990964 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1382  NUDIX hydrolase  31.13 
 
 		 144 aa  41.2  0.01  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>