55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_3801 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_3801  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 196 aa  387  1e-107  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.225828  normal  0.040121 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0535  hypothetical protein  72.94 
 
 		 185 aa  244  6e-64  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.523865  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3734  NUDIX hydrolase  59.41 
 
 		 171 aa  195  4.0000000000000005e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.056814  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2957  NUDIX hydrolase  59.64 
 
 		 188 aa  184  6e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0330064  normal  0.14207 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8348  hypothetical protein  59.64 
 
 		 181 aa  182  2.0000000000000003e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.359922  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1524  NUDIX hydrolase  53.76 
 
 		 188 aa  165  5e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.533164  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4732  NUDIX hydrolase  53.93 
 
 		 179 aa  159  2e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.382396  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06220  NUDIX family protein  53.93 
 
 		 181 aa  159  3e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.755665  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0883  NUDIX hydrolase  52.17 
 
 		 199 aa  148  5e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.402979  normal  0.0136644 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1731  NUDIX hydrolase  48.96 
 
 		 190 aa  147  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.993062  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0941  NUDIX hydrolase  48.04 
 
 		 199 aa  145  3e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0785282  normal  0.918248 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6335  NUDIX hydrolase  51.72 
 
 		 181 aa  142  3e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4177  NUDIX hydrolase  49.4 
 
 		 170 aa  133  1.9999999999999998e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.086433  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3304  NUDIX hydrolase  47.31 
 
 		 187 aa  129  4.0000000000000003e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.360239  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1339  NUDIX hydrolase  49.16 
 
 		 184 aa  127  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1358  NUDIX hydrolase  49.16 
 
 		 184 aa  127  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.097904  normal  0.32724 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1322  NUDIX hydrolase  49.16 
 
 		 184 aa  127  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.245288  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1181  NUDIX hydrolase  43.2 
 
 		 185 aa  106  2e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0711  NUDIX hydrolase  45.28 
 
 		 197 aa  99.8  2e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.267482 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13930  NTP pyrophosphohydrolase  42.35 
 
 		 181 aa  86.3  3e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.57247  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1786  NUDIX hydrolase  42 
 
 		 204 aa  83.2  0.000000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.346997 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06076  hydrolase, nudix family protein  41.3 
 
 		 182 aa  81.6  0.000000000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.0000965129  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00851  hydrolase, nudix family protein  41.3 
 
 		 182 aa  81.6  0.000000000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.0000243046  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2393  NUDIX hydrolase  37.91 
 
 		 181 aa  81.6  0.000000000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.53348 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5005  NUDIX hydrolase  32.28 
 
 		 184 aa  77  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0781982  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11440  NTP pyrophosphohydrolase  37.04 
 
 		 215 aa  73.6  0.000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.178204  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2190  hypothetical protein  27.33 
 
 		 185 aa  71.2  0.000000000009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0336  NUDIX family hydrolase  23.81 
 
 		 548 aa  70.1  0.00000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3483  NUDIX hydrolase  27.81 
 
 		 186 aa  69.7  0.00000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1658  NUDIX hydrolase  34.55 
 
 		 190 aa  68.6  0.00000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4093  NUDIX hydrolase  37.12 
 
 		 187 aa  66.2  0.0000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.331104  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0632  NUDIX hydrolase  34.15 
 
 		 205 aa  66.2  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.224471 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1646  NUDIX hydrolase  29.01 
 
 		 178 aa  65.5  0.0000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.637473  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1014  NUDIX hydrolase  36.02 
 
 		 195 aa  63.9  0.000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.226826  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0662  NUDIX family hydrolase  26.58 
 
 		 188 aa  61.6  0.000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0202176  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0661  NUDIX domain-containing protein  25.95 
 
 		 186 aa  61.2  0.000000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00385243  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4916  NUDIX hydrolase  36.36 
 
 		 283 aa  58.9  0.00000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.933953  hitchhiker  0.00516547 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4848  NUDIX hydrolase  35.88 
 
 		 198 aa  58.2  0.00000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00240786  normal  0.150096 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4860  NUDIX hydrolase  36.09 
 
 		 163 aa  57.4  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22390  ADP-ribose pyrophosphatase  29.77 
 
 		 196 aa  55.5  0.0000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1034  NUDIX hydrolase  25.32 
 
 		 185 aa  55.8  0.0000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0504  NUDIX hydrolase  27.7 
 
 		 163 aa  50.8  0.00001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.316146  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11570  NUDIX family protein  34.57 
 
 		 194 aa  50.8  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1047  NUDIX hydrolase  30.36 
 
 		 186 aa  50.8  0.00001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0665722  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3204  NUDIX hydrolase  26.5 
 
 		 191 aa  48.9  0.00005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1980  NUDIX hydrolase  27.22 
 
 		 194 aa  47  0.0002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.130683  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1185  ADP-ribose pyrophosphatase  32.48 
 
 		 164 aa  47  0.0002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.792217  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0841  NUDIX hydrolase  38.27 
 
 		 201 aa  47  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0581  NUDIX hydrolase  30.83 
 
 		 185 aa  45.4  0.0005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.664417 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0900  NUDIX hydrolase  34.74 
 
 		 145 aa  45.1  0.0007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2121  NUDIX hydrolase  30.56 
 
 		 140 aa  43.5  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.575199  decreased coverage  0.00514227 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1946  NUDIX hydrolase  32.09 
 
 		 162 aa  43.9  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.97992  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2246  NUDIX hydrolase  34.78 
 
 		 168 aa  43.9  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.171331  decreased coverage  0.0000730626 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8438  NUDIX hydrolase  30.47 
 
 		 157 aa  42.7  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.370098 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1033  NUDIX hydrolase  31.58 
 
 		 542 aa  42.4  0.004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0906744 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>